MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 38561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014205	CTC	2	6	103211	103216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526138
2502	NC_014205	TG	3	6	103243	103248	0 %	50 %	50 %	0 %	297526138
2503	NC_014205	GTT	2	6	103332	103337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526138
2504	NC_014205	A	8	8	103375	103382	100 %	0 %	0 %	0 %	297526138
2505	NC_014205	AGTA	2	8	103457	103464	50 %	25 %	25 %	0 %	297526139
2506	NC_014205	TAC	2	6	103505	103510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526139
2507	NC_014205	CAATA	2	10	103622	103631	60 %	20 %	0 %	20 %	297526139
2508	NC_014205	TAA	2	6	103674	103679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526139
2509	NC_014205	GTG	2	6	103710	103715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526139
2510	NC_014205	T	6	6	103833	103838	0 %	100 %	0 %	0 %	297526139
2511	NC_014205	T	6	6	103850	103855	0 %	100 %	0 %	0 %	297526139
2512	NC_014205	A	6	6	103964	103969	100 %	0 %	0 %	0 %	297526139
2513	NC_014205	AAG	2	6	104045	104050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526139
2514	NC_014205	ATTT	2	8	104051	104058	25 %	75 %	0 %	0 %	297526139
2515	NC_014205	AAGG	2	8	104063	104070	50 %	0 %	50 %	0 %	297526139
2516	NC_014205	GAA	2	6	104098	104103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_014205	CTT	2	6	104148	104153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526140
2518	NC_014205	AGG	2	6	104176	104181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526140
2519	NC_014205	TCC	2	6	104200	104205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526140
2520	NC_014205	CA	3	6	104230	104235	50 %	0 %	0 %	50 %	297526140
2521	NC_014205	TCT	2	6	104238	104243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526140
2522	NC_014205	TCG	2	6	104267	104272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526140
2523	NC_014205	CAA	2	6	104276	104281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526140
2524	NC_014205	ATTC	2	8	104374	104381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_014205	ACA	2	6	104404	104409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_014205	ACT	2	6	104411	104416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_014205	TCA	2	6	104480	104485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_014205	CAAGT	2	10	104516	104525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2529	NC_014205	CAT	2	6	104565	104570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_014205	TTA	2	6	104592	104597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_014205	TA	3	6	104596	104601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_014205	TGCAG	2	10	104611	104620	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2533	NC_014205	CTG	2	6	104655	104660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_014205	TGA	2	6	104689	104694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_014205	TAG	2	6	104749	104754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_014205	TA	3	6	104761	104766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_014205	GTA	2	6	104767	104772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_014205	AT	3	6	104778	104783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_014205	TCT	2	6	104784	104789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_014205	ATT	2	6	104795	104800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_014205	TA	3	6	104897	104902	50 %	50 %	0 %	0 %	297526141
2542	NC_014205	TGA	2	6	104904	104909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526141
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2544	NC_014205	TAA	2	6	105023	105028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526141
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2546	NC_014205	CTT	2	6	105053	105058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526141
2547	NC_014205	A	6	6	105109	105114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_014205	TC	3	6	105116	105121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_014205	TCC	2	6	105139	105144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_014205	CAT	2	6	105173	105178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_014205	AAC	2	6	105192	105197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_014205	T	6	6	105229	105234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_014205	TGTT	2	8	105245	105252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_014205	TGGC	2	8	105282	105289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_014205	CTC	2	6	105306	105311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_014205	GCTTA	2	10	105348	105357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2557	NC_014205	TCA	3	9	105386	105394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_014205	ATA	2	6	105418	105423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_014205	TTAC	2	8	105530	105537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2560	NC_014205	CTTT	2	8	105552	105559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_014205	ATT	2	6	105622	105627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_014205	TAA	2	6	105655	105660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_014205	ATT	2	6	105677	105682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_014205	ATT	2	6	105686	105691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_014205	AGT	2	6	105698	105703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_014205	TAT	2	6	105713	105718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_014205	TAAT	2	8	105774	105781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_014205	TA	3	6	105849	105854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_014205	ATT	3	9	105912	105920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_014205	AATA	2	8	105936	105943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_014205	TTG	2	6	105986	105991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526142
2572	NC_014205	CTAG	2	8	106024	106031	25 %	25 %	25 %	25 %	297526142
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2574	NC_014205	T	6	6	106199	106204	0 %	100 %	0 %	0 %	297526142
2575	NC_014205	ATA	2	6	106237	106242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526142
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2579	NC_014205	CAT	2	6	106358	106363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526142
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2595	NC_014205	AAC	2	6	106872	106877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526142
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2598	NC_014205	ATT	2	6	107046	107051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526142
2599	NC_014205	ATT	2	6	107058	107063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526142
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2602	NC_014205	TAG	2	6	107106	107111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526142
2603	NC_014205	TACC	2	8	107124	107131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_014205	TA	3	6	107140	107145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_014205	AT	3	6	107180	107185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_014205	AGA	2	6	107240	107245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_014205	TTAGG	2	10	107258	107267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_014205	ATT	2	6	107355	107360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526143
2609	NC_014205	ATG	2	6	107426	107431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526143
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2612	NC_014205	TCT	2	6	107494	107499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526143
2613	NC_014205	CTT	2	6	107534	107539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526143
2614	NC_014205	ATA	2	6	107576	107581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526143
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2616	NC_014205	TCC	2	6	107655	107660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526143
2617	NC_014205	ATT	2	6	107696	107701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2619	NC_014205	TAAA	2	8	107769	107776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_014205	CTTA	2	8	107801	107808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2621	NC_014205	AAT	2	6	107820	107825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014205	ATT	2	6	107829	107834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_014205	A	7	7	107840	107846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_014205	TTTA	2	8	107851	107858	25 %	75 %	0 %	0 %	297526144
2625	NC_014205	CTT	3	9	107873	107881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526144
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2627	NC_014205	TTC	2	6	107913	107918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526144
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