MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 38561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014205	TA	3	6	20660	20665	50 %	50 %	0 %	0 %	297526050
502	NC_014205	CCTC	2	8	20695	20702	0 %	25 %	0 %	75 %	297526050
503	NC_014205	CTA	2	6	20797	20802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526050
504	NC_014205	AT	3	6	20890	20895	50 %	50 %	0 %	0 %	297526050
505	NC_014205	AT	3	6	20924	20929	50 %	50 %	0 %	0 %	297526050
506	NC_014205	CT	3	6	21058	21063	0 %	50 %	0 %	50 %	297526050
507	NC_014205	TTC	2	6	21069	21074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526050
508	NC_014205	ATG	2	6	21113	21118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526050
509	NC_014205	TTC	2	6	21191	21196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526050
510	NC_014205	AATG	2	8	21252	21259	50 %	25 %	25 %	0 %	297526051
511	NC_014205	ATT	2	6	21337	21342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526051
512	NC_014205	AT	3	6	21344	21349	50 %	50 %	0 %	0 %	297526051
513	NC_014205	ATA	2	6	21353	21358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526051
514	NC_014205	ATT	2	6	21382	21387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526051
515	NC_014205	AAT	2	6	21398	21403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526051
516	NC_014205	TAG	2	6	21413	21418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526051
517	NC_014205	TGT	2	6	21437	21442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526051
518	NC_014205	CAA	2	6	21482	21487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526051
519	NC_014205	TTC	2	6	21537	21542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526051
520	NC_014205	TAT	2	6	21603	21608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526051
521	NC_014205	GTA	2	6	21616	21621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526051
522	NC_014205	T	6	6	21667	21672	0 %	100 %	0 %	0 %	297526051
523	NC_014205	ATT	2	6	21684	21689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526051
524	NC_014205	ATT	2	6	21696	21701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526051
525	NC_014205	AAT	2	6	21711	21716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526051
526	NC_014205	T	6	6	21761	21766	0 %	100 %	0 %	0 %	297526052
527	NC_014205	AGG	2	6	21768	21773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526052
528	NC_014205	GTT	2	6	21790	21795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526052
529	NC_014205	CTT	2	6	21803	21808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
530	NC_014205	CAT	2	6	21809	21814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526052
531	NC_014205	CAG	2	6	21827	21832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526052
532	NC_014205	CACG	2	8	21835	21842	25 %	0 %	25 %	50 %	297526052
533	NC_014205	TTC	2	6	21883	21888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
534	NC_014205	ATT	2	6	21897	21902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526052
535	NC_014205	TTC	2	6	21917	21922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
536	NC_014205	TAT	2	6	21938	21943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526052
537	NC_014205	GTT	2	6	22069	22074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526052
538	NC_014205	CTC	2	6	22112	22117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526052
539	NC_014205	CAA	2	6	22201	22206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526052
540	NC_014205	CCA	2	6	22302	22307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526052
541	NC_014205	ATT	2	6	22338	22343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526052
542	NC_014205	TTC	2	6	22371	22376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
543	NC_014205	TGCT	2	8	22388	22395	0 %	50 %	25 %	25 %	297526052
544	NC_014205	TCT	3	9	22476	22484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
545	NC_014205	ATG	2	6	22487	22492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526052
546	NC_014205	CGG	2	6	22498	22503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297526052
547	NC_014205	CAA	2	6	22507	22512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526052
548	NC_014205	CG	3	6	22528	22533	0 %	0 %	50 %	50 %	297526052
549	NC_014205	CCT	2	6	22553	22558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526052
550	NC_014205	TGC	2	6	22643	22648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526052
551	NC_014205	AGC	2	6	22718	22723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526052
552	NC_014205	GTT	2	6	22725	22730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526052
553	NC_014205	CTT	3	9	22775	22783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
554	NC_014205	CCG	2	6	22809	22814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297526052
555	NC_014205	CTC	2	6	22829	22834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526052
556	NC_014205	CGG	2	6	22874	22879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297526052
557	NC_014205	CTT	2	6	22885	22890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
558	NC_014205	CT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	0 %	50 %	297526052
559	NC_014205	TCT	2	6	22909	22914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
560	NC_014205	TAA	2	6	22978	22983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526052
561	NC_014205	ATCA	2	8	23063	23070	50 %	25 %	0 %	25 %	297526052
562	NC_014205	TATTG	2	10	23147	23156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014205	ATA	2	6	23217	23222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014205	AAT	2	6	23256	23261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014205	AT	3	6	23260	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014205	GAA	2	6	23320	23325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526053
567	NC_014205	ACT	2	6	23335	23340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
568	NC_014205	AGT	2	6	23353	23358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526053
569	NC_014205	TCA	2	6	23383	23388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
570	NC_014205	CTA	2	6	23642	23647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
571	NC_014205	TG	3	6	23719	23724	0 %	50 %	50 %	0 %	297526053
572	NC_014205	AAACT	2	10	23729	23738	60 %	20 %	0 %	20 %	297526053
573	NC_014205	TTC	2	6	23740	23745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526053
574	NC_014205	ACTG	2	8	23753	23760	25 %	25 %	25 %	25 %	297526053
575	NC_014205	CTA	2	6	23777	23782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
576	NC_014205	ACT	2	6	23803	23808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
577	NC_014205	TCAT	2	8	23837	23844	25 %	50 %	0 %	25 %	297526053
578	NC_014205	ATT	2	6	23929	23934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526053
579	NC_014205	AT	3	6	23936	23941	50 %	50 %	0 %	0 %	297526053
580	NC_014205	ATT	2	6	24017	24022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526053
581	NC_014205	CA	3	6	24056	24061	50 %	0 %	0 %	50 %	297526053
582	NC_014205	GA	3	6	24081	24086	50 %	0 %	50 %	0 %	297526053
583	NC_014205	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	297526053
584	NC_014205	ATA	2	6	24161	24166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526053
585	NC_014205	TTG	2	6	24259	24264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014205	TAA	2	6	24289	24294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014205	AT	3	6	24303	24308	50 %	50 %	0 %	0 %	297526054
588	NC_014205	TTG	2	6	24325	24330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526054
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590	NC_014205	ATT	2	6	24378	24383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526054
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593	NC_014205	CTT	2	6	24418	24423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526054
594	NC_014205	CTA	2	6	24433	24438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526054
595	NC_014205	TTTCC	2	10	24447	24456	0 %	60 %	0 %	40 %	297526054
596	NC_014205	TAT	2	6	24521	24526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526054
597	NC_014205	ATA	2	6	24634	24639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526054
598	NC_014205	CT	4	8	24682	24689	0 %	50 %	0 %	50 %	297526054
599	NC_014205	TCT	2	6	24702	24707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526054
600	NC_014205	ACC	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526054
601	NC_014205	AT	3	6	24714	24719	50 %	50 %	0 %	0 %	297526054
602	NC_014205	T	6	6	24745	24750	0 %	100 %	0 %	0 %	297526055
603	NC_014205	CTC	2	6	24766	24771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526055
604	NC_014205	TCA	2	6	24781	24786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526055
605	NC_014205	GAG	2	6	24797	24802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526055
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607	NC_014205	TAA	2	6	24870	24875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526055
608	NC_014205	T	7	7	24896	24902	0 %	100 %	0 %	0 %	297526055
609	NC_014205	ATA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526055
610	NC_014205	TGA	2	6	24997	25002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526055
611	NC_014205	TC	3	6	25031	25036	0 %	50 %	0 %	50 %	297526055
612	NC_014205	TCA	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526055
613	NC_014205	AT	3	6	25177	25182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014205	GA	3	6	25251	25256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014205	G	6	6	25269	25274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014205	CTC	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_014205	TTG	2	6	25406	25411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014205	CTT	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
619	NC_014205	TTC	2	6	25554	25559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
620	NC_014205	AGT	2	6	25577	25582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526056
621	NC_014205	TTAT	2	8	25585	25592	25 %	75 %	0 %	0 %	297526056
622	NC_014205	GTTT	2	8	25625	25632	0 %	75 %	25 %	0 %	297526056
623	NC_014205	TCT	2	6	25633	25638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
624	NC_014205	CTT	2	6	25676	25681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
625	NC_014205	TTA	2	6	25703	25708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526056
626	NC_014205	ATA	2	6	25732	25737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526056
627	NC_014205	TCT	2	6	25813	25818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
628	NC_014205	TG	3	6	25844	25849	0 %	50 %	50 %	0 %	297526056
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630	NC_014205	ACT	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526056
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632	NC_014205	ACT	2	6	26001	26006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526056
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