MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014168	CTC	2	6	138144	138149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392585
3502	NC_014168	CGG	2	6	138176	138181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392585
3503	NC_014168	TCCGC	2	10	138193	138202	0 %	20 %	20 %	60 %	296392585
3504	NC_014168	GAA	2	6	138206	138211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392585
3505	NC_014168	CGC	2	6	138247	138252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392586
3506	NC_014168	CCG	2	6	138285	138290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392586
3507	NC_014168	GGT	2	6	138331	138336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392586
3508	NC_014168	CGC	2	6	138349	138354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392586
3509	NC_014168	CGG	3	9	138400	138408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392586
3510	NC_014168	CGG	3	9	138478	138486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392586
3511	NC_014168	CG	3	6	138507	138512	0 %	0 %	50 %	50 %	296392586
3512	NC_014168	ACT	2	6	138513	138518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392586
3513	NC_014168	GAA	2	6	138532	138537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392586
3514	NC_014168	GCC	3	9	138545	138553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392586
3515	NC_014168	GCG	2	6	138558	138563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392586
3516	NC_014168	GC	3	6	138578	138583	0 %	0 %	50 %	50 %	296392586
3517	NC_014168	GGCG	2	8	138584	138591	0 %	0 %	75 %	25 %	296392586
3518	NC_014168	TCG	2	6	138612	138617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392586
3519	NC_014168	AAG	2	6	138638	138643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392586
3520	NC_014168	CTCGA	2	10	138656	138665	20 %	20 %	20 %	40 %	296392586
3521	NC_014168	TGG	2	6	138687	138692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392586
3522	NC_014168	CGA	2	6	138706	138711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392586
3523	NC_014168	ACG	2	6	138780	138785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392586
3524	NC_014168	CGA	2	6	138796	138801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392586
3525	NC_014168	CAC	2	6	138842	138847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392586
3526	NC_014168	CAA	2	6	138853	138858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392586
3527	NC_014168	GAAG	2	8	138859	138866	50 %	0 %	50 %	0 %	296392586
3528	NC_014168	ACG	2	6	138908	138913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392587
3529	NC_014168	AGA	2	6	138962	138967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392587
3530	NC_014168	TCG	2	6	138977	138982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392587
3531	NC_014168	CAA	2	6	138996	139001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392587
3532	NC_014168	CAT	2	6	139059	139064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392587
3533	NC_014168	GCAAGC	2	12	139076	139087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392587
3534	NC_014168	GC	3	6	139110	139115	0 %	0 %	50 %	50 %	296392587
3535	NC_014168	ACG	2	6	139174	139179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392587
3536	NC_014168	GTC	2	6	139243	139248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392588
3537	NC_014168	GCT	2	6	139304	139309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392588
3538	NC_014168	CAA	2	6	139322	139327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392588
3539	NC_014168	GGC	2	6	139329	139334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392588
3540	NC_014168	CCA	2	6	139364	139369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392588
3541	NC_014168	GCG	2	6	139372	139377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392588
3542	NC_014168	CCG	2	6	139409	139414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392588
3543	NC_014168	CG	3	6	139413	139418	0 %	0 %	50 %	50 %	296392588
3544	NC_014168	CAT	2	6	139520	139525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392588
3545	NC_014168	GTC	2	6	139554	139559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392588
3546	NC_014168	CAA	2	6	139592	139597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392588
3547	NC_014168	GAA	2	6	139607	139612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392588
3548	NC_014168	GGT	2	6	139628	139633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392588
3549	NC_014168	GCG	3	9	139657	139665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392588
3550	NC_014168	CGGC	2	8	139681	139688	0 %	0 %	50 %	50 %	296392588
3551	NC_014168	CG	3	6	139766	139771	0 %	0 %	50 %	50 %	296392588
3552	NC_014168	TCGG	2	8	139782	139789	0 %	25 %	50 %	25 %	296392588
3553	NC_014168	ACC	2	6	139897	139902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392588
3554	NC_014168	CGG	3	9	139907	139915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392588
3555	NC_014168	CGG	2	6	139931	139936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392588
3556	NC_014168	CCG	2	6	139979	139984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392588
3557	NC_014168	CAA	2	6	139988	139993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392588
3558	NC_014168	AG	3	6	139994	139999	50 %	0 %	50 %	0 %	296392588
3559	NC_014168	CCG	2	6	140015	140020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392588
3560	NC_014168	TCG	2	6	140021	140026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392588
3561	NC_014168	GAA	2	6	140033	140038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392588
3562	NC_014168	ACTG	2	8	140052	140059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_014168	GAA	2	6	140074	140079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392589
3564	NC_014168	TCG	2	6	140088	140093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392589
3565	NC_014168	ACC	2	6	140097	140102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392589
3566	NC_014168	TCA	2	6	140148	140153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392589
3567	NC_014168	CGT	2	6	140165	140170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392589
3568	NC_014168	TCC	2	6	140178	140183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392589
3569	NC_014168	TCG	2	6	140190	140195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392589
3570	NC_014168	ACG	2	6	140214	140219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392589
3571	NC_014168	GGTC	2	8	140257	140264	0 %	25 %	50 %	25 %	296392589
3572	NC_014168	GC	3	6	140384	140389	0 %	0 %	50 %	50 %	296392590
3573	NC_014168	CCG	2	6	140409	140414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392590
3574	NC_014168	GCGA	2	8	140485	140492	25 %	0 %	50 %	25 %	296392590
3575	NC_014168	TGG	2	6	140564	140569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392590
3576	NC_014168	CG	3	6	140618	140623	0 %	0 %	50 %	50 %	296392590
3577	NC_014168	GGC	2	6	140679	140684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392590
3578	NC_014168	AAG	2	6	140764	140769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392590
3579	NC_014168	GAG	2	6	140815	140820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392590
3580	NC_014168	ATCC	2	8	140836	140843	25 %	25 %	0 %	50 %	296392591
3581	NC_014168	CAC	2	6	140865	140870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392591
3582	NC_014168	GCT	2	6	140943	140948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392591
3583	NC_014168	GCC	2	6	141053	141058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392591
3584	NC_014168	GCG	2	6	141059	141064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392591
3585	NC_014168	TCG	2	6	141164	141169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392591
3586	NC_014168	AGC	2	6	141185	141190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392591
3587	NC_014168	CG	3	6	141214	141219	0 %	0 %	50 %	50 %	296392591
3588	NC_014168	CCA	2	6	141249	141254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392591
3589	NC_014168	GCG	2	6	141281	141286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392591
3590	NC_014168	CGG	2	6	141294	141299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392591
3591	NC_014168	TAC	2	6	141322	141327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392591
3592	NC_014168	GC	3	6	141357	141362	0 %	0 %	50 %	50 %	296392591
3593	NC_014168	ACC	2	6	141394	141399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392591
3594	NC_014168	TCG	2	6	141443	141448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392591
3595	NC_014168	CGC	2	6	141465	141470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392591
3596	NC_014168	CGC	3	9	141477	141485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392591
3597	NC_014168	GGCG	2	8	141492	141499	0 %	0 %	75 %	25 %	296392591
3598	NC_014168	CGC	2	6	141513	141518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392591
3599	NC_014168	CCGC	3	12	141515	141526	0 %	0 %	25 %	75 %	296392591
3600	NC_014168	CAC	2	6	141546	141551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392591
3601	NC_014168	CGG	3	9	141602	141610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392591
3602	NC_014168	CGG	2	6	141632	141637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392591
3603	NC_014168	TCAGG	2	10	141655	141664	20 %	20 %	40 %	20 %	296392591
3604	NC_014168	AGC	2	6	141707	141712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392592
3605	NC_014168	ACC	2	6	141713	141718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392592
3606	NC_014168	GGC	2	6	141742	141747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392592
3607	NC_014168	CG	3	6	141822	141827	0 %	0 %	50 %	50 %	296392592
3608	NC_014168	CGT	2	6	141850	141855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392592
3609	NC_014168	AAG	2	6	141901	141906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392592
3610	NC_014168	GTG	2	6	141948	141953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392592
3611	NC_014168	GAG	2	6	142006	142011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392592
3612	NC_014168	CCG	2	6	142029	142034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392592
3613	NC_014168	CG	3	6	142033	142038	0 %	0 %	50 %	50 %	296392592
3614	NC_014168	GAG	2	6	142078	142083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392592
3615	NC_014168	GAC	2	6	142137	142142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392593
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3617	NC_014168	CCG	2	6	142297	142302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392593
3618	NC_014168	CCG	2	6	142309	142314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392593
3619	NC_014168	AGGCGA	2	12	142318	142329	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296392593
3620	NC_014168	AGA	2	6	142342	142347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392593
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3622	NC_014168	AAG	2	6	142407	142412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392593
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3742	NC_014168	CGC	2	6	147138	147143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392600
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3863	NC_014168	CCG	2	6	151036	151041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392603
3864	NC_014168	GGCGT	2	10	151054	151063	0 %	20 %	60 %	20 %	296392603
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3866	NC_014168	GTACGG	2	12	151125	151136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296392603
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3868	NC_014168	GC	3	6	151235	151240	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
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3987	NC_014168	CGA	2	6	155783	155788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392607
3988	NC_014168	TAC	2	6	155868	155873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392607
3989	NC_014168	AGG	2	6	155908	155913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392607
3990	NC_014168	GCC	2	6	155920	155925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392607
3991	NC_014168	GTG	2	6	156117	156122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392607
3992	NC_014168	GGC	2	6	156123	156128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392607
3993	NC_014168	CCT	2	6	156161	156166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392607
3994	NC_014168	TGCCGC	2	12	156175	156186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296392607
3995	NC_014168	CGAG	2	8	156187	156194	25 %	0 %	50 %	25 %	296392607
3996	NC_014168	CCG	2	6	156261	156266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392607
3997	NC_014168	CGCC	2	8	156340	156347	0 %	0 %	25 %	75 %	296392607
3998	NC_014168	CTT	2	6	156350	156355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392607
3999	NC_014168	CGG	2	6	156365	156370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392607
4000	NC_014168	CGA	2	6	156392	156397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392607

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