MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014168	CTT	2	6	119378	119383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392569
3002	NC_014168	AGA	2	6	119469	119474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392569
3003	NC_014168	GCC	2	6	119478	119483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392569
3004	NC_014168	TCG	2	6	119484	119489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3005	NC_014168	CGG	2	6	119518	119523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392569
3006	NC_014168	GTC	2	6	119540	119545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3007	NC_014168	GCA	2	6	119602	119607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3008	NC_014168	CAG	2	6	119615	119620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3009	NC_014168	CAGCGG	2	12	119648	119659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392569
3010	NC_014168	GAC	2	6	119669	119674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3011	NC_014168	CGG	2	6	119697	119702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392569
3012	NC_014168	CGTC	2	8	119706	119713	0 %	25 %	25 %	50 %	296392569
3013	NC_014168	ACA	2	6	119737	119742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392569
3014	NC_014168	GCA	2	6	119830	119835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3015	NC_014168	CG	3	6	119900	119905	0 %	0 %	50 %	50 %	296392569
3016	NC_014168	CAG	2	6	119906	119911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3017	NC_014168	GTA	2	6	119918	119923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392569
3018	NC_014168	CTC	2	6	119948	119953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392569
3019	NC_014168	GGGGA	2	10	119958	119967	20 %	0 %	80 %	0 %	296392569
3020	NC_014168	ATG	2	6	120177	120182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392569
3021	NC_014168	AGGCC	2	10	120205	120214	20 %	0 %	40 %	40 %	296392569
3022	NC_014168	GCG	2	6	120290	120295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392569
3023	NC_014168	C	7	7	120301	120307	0 %	0 %	0 %	100 %	296392569
3024	NC_014168	GCG	2	6	120310	120315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392569
3025	NC_014168	CCG	2	6	120360	120365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392569
3026	NC_014168	CG	3	6	120483	120488	0 %	0 %	50 %	50 %	296392569
3027	NC_014168	CAC	2	6	120533	120538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392569
3028	NC_014168	TCC	2	6	120561	120566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392569
3029	NC_014168	GCC	2	6	120587	120592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392569
3030	NC_014168	CGA	2	6	120628	120633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3031	NC_014168	GTC	2	6	120710	120715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3032	NC_014168	CAG	2	6	120750	120755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3033	NC_014168	GAGG	2	8	120797	120804	25 %	0 %	75 %	0 %	296392569
3034	NC_014168	GCC	3	9	120839	120847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392569
3035	NC_014168	ACGGTG	2	12	120870	120881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296392569
3036	NC_014168	GCT	2	6	120905	120910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392569
3037	NC_014168	GTG	2	6	120939	120944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392569
3038	NC_014168	CGG	2	6	120946	120951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392569
3039	NC_014168	CCAGCG	2	12	120996	121007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_014168	GCC	2	6	121029	121034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_014168	CGCC	2	8	121047	121054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3042	NC_014168	CG	3	6	121067	121072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_014168	CTC	2	6	121101	121106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392570
3044	NC_014168	G	6	6	121129	121134	0 %	0 %	100 %	0 %	296392570
3045	NC_014168	GAT	2	6	121206	121211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392570
3046	NC_014168	TTG	2	6	121213	121218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392570
3047	NC_014168	ACC	2	6	121219	121224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392570
3048	NC_014168	TTG	2	6	121371	121376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392570
3049	NC_014168	CGA	2	6	121382	121387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392570
3050	NC_014168	GTG	3	9	121402	121410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392570
3051	NC_014168	TGG	2	6	121438	121443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392570
3052	NC_014168	CCG	2	6	121454	121459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392570
3053	NC_014168	GTG	2	6	121516	121521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392570
3054	NC_014168	GGTC	2	8	121553	121560	0 %	25 %	50 %	25 %	296392570
3055	NC_014168	TGA	2	6	121622	121627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392570
3056	NC_014168	CGA	2	6	121671	121676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392570
3057	NC_014168	GAT	2	6	121677	121682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392570
3058	NC_014168	CGA	3	9	121814	121822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392570
3059	NC_014168	GCC	2	6	121854	121859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392570
3060	NC_014168	GCAGCG	2	12	121892	121903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392570
3061	NC_014168	GCG	3	9	121901	121909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392570
3062	NC_014168	CTCGCT	2	12	121923	121934	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296392570
3063	NC_014168	CGG	2	6	121940	121945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392570
3064	NC_014168	AGC	2	6	121951	121956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392570
3065	NC_014168	GCA	2	6	121970	121975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392570
3066	NC_014168	CGG	2	6	121977	121982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392570
3067	NC_014168	AC	3	6	121988	121993	50 %	0 %	0 %	50 %	296392570
3068	NC_014168	CCG	2	6	122009	122014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392570
3069	NC_014168	AGC	2	6	122027	122032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392570
3070	NC_014168	GGC	2	6	122058	122063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392570
3071	NC_014168	GCG	2	6	122083	122088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392570
3072	NC_014168	CGA	3	9	122128	122136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3073	NC_014168	GCC	2	6	122139	122144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3074	NC_014168	CGG	2	6	122161	122166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3075	NC_014168	GGCG	2	8	122168	122175	0 %	0 %	75 %	25 %	296392571
3076	NC_014168	CG	4	8	122194	122201	0 %	0 %	50 %	50 %	296392571
3077	NC_014168	CCG	2	6	122225	122230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3078	NC_014168	GCG	2	6	122280	122285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3079	NC_014168	CGA	2	6	122341	122346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3080	NC_014168	GCT	2	6	122359	122364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3081	NC_014168	GCC	2	6	122388	122393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3082	NC_014168	GGC	2	6	122396	122401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3083	NC_014168	GC	3	6	122428	122433	0 %	0 %	50 %	50 %	296392571
3084	NC_014168	TCG	2	6	122442	122447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3085	NC_014168	GCG	2	6	122460	122465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3086	NC_014168	TCG	2	6	122502	122507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3087	NC_014168	CGG	2	6	122511	122516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3088	NC_014168	AGC	2	6	122517	122522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3089	NC_014168	TTG	2	6	122546	122551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392571
3090	NC_014168	CGC	2	6	122611	122616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3091	NC_014168	CGA	2	6	122641	122646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3092	NC_014168	CAG	2	6	122660	122665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3093	NC_014168	CAG	2	6	122771	122776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3094	NC_014168	TGC	3	9	122805	122813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3095	NC_014168	GCG	2	6	122856	122861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3096	NC_014168	GGC	2	6	122906	122911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3097	NC_014168	GCCC	2	8	122924	122931	0 %	0 %	25 %	75 %	296392571
3098	NC_014168	CGC	2	6	123017	123022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3099	NC_014168	CGC	2	6	123035	123040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3100	NC_014168	CGC	3	9	123044	123052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3101	NC_014168	CG	3	6	123182	123187	0 %	0 %	50 %	50 %	296392571
3102	NC_014168	CGT	2	6	123194	123199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3103	NC_014168	TG	3	6	123210	123215	0 %	50 %	50 %	0 %	296392571
3104	NC_014168	GAT	3	9	123251	123259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392571
3105	NC_014168	GGC	2	6	123284	123289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392571
3106	NC_014168	TCG	2	6	123348	123353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3107	NC_014168	CGT	2	6	123356	123361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3108	NC_014168	CGC	2	6	123372	123377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392571
3109	NC_014168	ACG	2	6	123379	123384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392571
3110	NC_014168	TC	3	6	123463	123468	0 %	50 %	0 %	50 %	296392572
3111	NC_014168	ATG	2	6	123566	123571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392572
3112	NC_014168	GCC	2	6	123589	123594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392572
3113	NC_014168	GT	3	6	123599	123604	0 %	50 %	50 %	0 %	296392572
3114	NC_014168	CCT	2	6	123608	123613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392572
3115	NC_014168	CCG	2	6	123625	123630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392572
3116	NC_014168	CGG	2	6	123633	123638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392572
3117	NC_014168	T	6	6	123647	123652	0 %	100 %	0 %	0 %	296392572
3118	NC_014168	TCG	2	6	123681	123686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392572
3119	NC_014168	CTG	2	6	123695	123700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392572
3120	NC_014168	GGC	2	6	123781	123786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392572
3121	NC_014168	CGC	2	6	123787	123792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392572
3122	NC_014168	CAA	2	6	123812	123817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392572
3123	NC_014168	GCTCA	2	10	123822	123831	20 %	20 %	20 %	40 %	296392572
3124	NC_014168	GTCG	2	8	123859	123866	0 %	25 %	50 %	25 %	296392572
3125	NC_014168	CG	4	8	123880	123887	0 %	0 %	50 %	50 %	296392572
3126	NC_014168	CCA	2	6	123888	123893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392572
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3128	NC_014168	TCG	2	6	123936	123941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392572
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3130	NC_014168	CGG	2	6	123982	123987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392572
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3152	NC_014168	CGG	2	6	124723	124728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392572
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3225	NC_014168	GCGCTC	2	12	127022	127033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296392574
3226	NC_014168	CG	3	6	127039	127044	0 %	0 %	50 %	50 %	296392574
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3229	NC_014168	ATC	2	6	127211	127216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392574
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3231	NC_014168	TTC	2	6	127295	127300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392574
3232	NC_014168	ATC	2	6	127328	127333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392574
3233	NC_014168	G	7	7	127334	127340	0 %	0 %	100 %	0 %	296392574
3234	NC_014168	GCG	2	6	127422	127427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392574
3235	NC_014168	TCG	3	9	127443	127451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392574
3236	NC_014168	GC	3	6	127452	127457	0 %	0 %	50 %	50 %	296392574
3237	NC_014168	GGGC	2	8	127470	127477	0 %	0 %	75 %	25 %	296392574
3238	NC_014168	GC	3	6	127486	127491	0 %	0 %	50 %	50 %	296392574
3239	NC_014168	TGC	2	6	127557	127562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392574
3240	NC_014168	GCC	2	6	127608	127613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3241	NC_014168	CGC	2	6	127619	127624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3243	NC_014168	GTC	2	6	127751	127756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392575
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3352	NC_014168	AGG	2	6	131645	131650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_014168	CGT	2	6	131951	131956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392579
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3364	NC_014168	GCTG	2	8	132194	132201	0 %	25 %	50 %	25 %	296392579
3365	NC_014168	GCC	2	6	132210	132215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392579
3366	NC_014168	TCGT	2	8	132343	132350	0 %	50 %	25 %	25 %	296392579
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3368	NC_014168	GCG	2	6	132410	132415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392579
3369	NC_014168	GCG	2	6	132448	132453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392579
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3371	NC_014168	GAC	2	6	132581	132586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3398	NC_014168	TCG	2	6	133508	133513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3467	NC_014168	GGAC	2	8	136818	136825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3468	NC_014168	ATA	2	6	136831	136836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3472	NC_014168	GCT	2	6	136952	136957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3480	NC_014168	GC	3	6	137194	137199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3481	NC_014168	CG	3	6	137308	137313	0 %	0 %	50 %	50 %	296392584
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3486	NC_014168	CCTG	2	8	137518	137525	0 %	25 %	25 %	50 %	296392584
3487	NC_014168	TGA	2	6	137560	137565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392585
3488	NC_014168	CTT	2	6	137566	137571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392585
3489	NC_014168	CGA	2	6	137630	137635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392585
3490	NC_014168	CGT	2	6	137645	137650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392585
3491	NC_014168	CGT	2	6	137681	137686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392585
3492	NC_014168	GGCC	2	8	137777	137784	0 %	0 %	50 %	50 %	296392585
3493	NC_014168	CGC	2	6	137811	137816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392585
3494	NC_014168	CGA	2	6	137837	137842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392585
3495	NC_014168	CAG	2	6	137865	137870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392585
3496	NC_014168	CGGC	2	8	137890	137897	0 %	0 %	50 %	50 %	296392585
3497	NC_014168	GCAAGG	2	12	137923	137934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296392585
3498	NC_014168	GC	3	6	137989	137994	0 %	0 %	50 %	50 %	296392585
3499	NC_014168	CCG	2	6	138005	138010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392585
3500	NC_014168	GAC	2	6	138092	138097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392585

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