MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014168	TCG	2	6	214643	214648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5502	NC_014168	TGG	2	6	214671	214676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392673
5503	NC_014168	CGG	2	6	214687	214692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392673
5504	NC_014168	GGCG	2	8	214698	214705	0 %	0 %	75 %	25 %	296392673
5505	NC_014168	CTG	2	6	214753	214758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5506	NC_014168	AGCCGG	2	12	214770	214781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392673
5507	NC_014168	GAC	2	6	214795	214800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5508	NC_014168	GGC	2	6	214824	214829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392673
5509	NC_014168	CAC	2	6	214831	214836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392673
5510	NC_014168	TCG	2	6	214871	214876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5511	NC_014168	GGT	2	6	214893	214898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392673
5512	NC_014168	CGC	2	6	214900	214905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392673
5513	NC_014168	GAA	2	6	214918	214923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392673
5514	NC_014168	CGA	2	6	215010	215015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5515	NC_014168	CAG	2	6	215017	215022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5516	NC_014168	TCG	2	6	215027	215032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5517	NC_014168	GCC	2	6	215118	215123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_014168	CCCG	3	12	215147	215158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5519	NC_014168	AT	3	6	215185	215190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_014168	AGG	2	6	215195	215200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014168	CACGAC	2	12	215212	215223	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296392674
5522	NC_014168	AGC	2	6	215245	215250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392674
5523	NC_014168	CGC	2	6	215268	215273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5524	NC_014168	CCTGCT	2	12	215280	215291	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296392674
5525	NC_014168	GGC	2	6	215298	215303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392674
5526	NC_014168	GCG	3	9	215308	215316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392674
5527	NC_014168	CGC	2	6	215352	215357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5528	NC_014168	CTCG	2	8	215379	215386	0 %	25 %	25 %	50 %	296392674
5529	NC_014168	CGC	2	6	215412	215417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5530	NC_014168	CCGCC	2	10	215418	215427	0 %	0 %	20 %	80 %	296392674
5531	NC_014168	CGG	2	6	215505	215510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392674
5532	NC_014168	CCA	2	6	215550	215555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392674
5533	NC_014168	GTG	3	9	215596	215604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392674
5534	NC_014168	CGC	2	6	215610	215615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5535	NC_014168	CAA	2	6	215628	215633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392674
5536	NC_014168	GTC	2	6	215710	215715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392674
5537	NC_014168	CG	3	6	215749	215754	0 %	0 %	50 %	50 %	296392674
5538	NC_014168	CGC	2	6	215763	215768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5539	NC_014168	TCG	3	9	215771	215779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392674
5540	NC_014168	GC	3	6	215814	215819	0 %	0 %	50 %	50 %	296392674
5541	NC_014168	CGC	2	6	215886	215891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5542	NC_014168	GTC	2	6	215902	215907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392674
5543	NC_014168	TCC	2	6	215938	215943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392674
5544	NC_014168	CGA	2	6	215976	215981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392674
5545	NC_014168	GCG	2	6	216000	216005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392674
5546	NC_014168	GAG	2	6	216031	216036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392674
5547	NC_014168	ACG	2	6	216052	216057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392674
5548	NC_014168	CGC	2	6	216075	216080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392674
5549	NC_014168	GACGA	2	10	216128	216137	40 %	0 %	40 %	20 %	296392674
5550	NC_014168	GTC	2	6	216197	216202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392675
5551	NC_014168	GTC	2	6	216257	216262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392675
5552	NC_014168	GCA	2	6	216289	216294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392675
5553	NC_014168	GC	3	6	216349	216354	0 %	0 %	50 %	50 %	296392675
5554	NC_014168	CGG	2	6	216360	216365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392675
5555	NC_014168	TTC	2	6	216377	216382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392675
5556	NC_014168	CGC	2	6	216387	216392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5557	NC_014168	GCT	2	6	216415	216420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392675
5558	NC_014168	C	6	6	216423	216428	0 %	0 %	0 %	100 %	296392675
5559	NC_014168	G	6	6	216429	216434	0 %	0 %	100 %	0 %	296392675
5560	NC_014168	GAA	2	6	216458	216463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392675
5561	NC_014168	CGA	2	6	216502	216507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392675
5562	NC_014168	AGCA	2	8	216554	216561	50 %	0 %	25 %	25 %	296392675
5563	NC_014168	TGC	2	6	216585	216590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392675
5564	NC_014168	GAA	2	6	216593	216598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392675
5565	NC_014168	CGG	2	6	216607	216612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392675
5566	NC_014168	GGACGT	2	12	216634	216645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296392675
5567	NC_014168	GC	3	6	216683	216688	0 %	0 %	50 %	50 %	296392675
5568	NC_014168	GGC	2	6	216689	216694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392675
5569	NC_014168	CGC	2	6	216718	216723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5570	NC_014168	GCC	2	6	216740	216745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5571	NC_014168	CGC	2	6	216796	216801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5572	NC_014168	CG	3	6	216823	216828	0 %	0 %	50 %	50 %	296392675
5573	NC_014168	CGC	2	6	216866	216871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5574	NC_014168	CGC	2	6	216891	216896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5575	NC_014168	CG	3	6	216911	216916	0 %	0 %	50 %	50 %	296392675
5576	NC_014168	CTC	2	6	216974	216979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392675
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5578	NC_014168	CCG	2	6	217025	217030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
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5580	NC_014168	GCC	2	6	217089	217094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5581	NC_014168	GC	3	6	217099	217104	0 %	0 %	50 %	50 %	296392675
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5584	NC_014168	CGG	2	6	217167	217172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392675
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5586	NC_014168	CGC	2	6	217186	217191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
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5588	NC_014168	CCG	2	6	217239	217244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
5589	NC_014168	CGC	2	6	217279	217284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392675
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5592	NC_014168	TTC	2	6	217402	217407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392676
5593	NC_014168	TGC	2	6	217460	217465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392676
5594	NC_014168	GC	3	6	217464	217469	0 %	0 %	50 %	50 %	296392676
5595	NC_014168	TCT	2	6	217505	217510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392676
5596	NC_014168	AAG	2	6	217529	217534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392676
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5598	NC_014168	AGG	2	6	217571	217576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392676
5599	NC_014168	GC	4	8	217591	217598	0 %	0 %	50 %	50 %	296392676
5600	NC_014168	GGC	2	6	217602	217607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392676
5601	NC_014168	GC	3	6	217612	217617	0 %	0 %	50 %	50 %	296392676
5602	NC_014168	GGC	2	6	217623	217628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392676
5603	NC_014168	ACG	3	9	217634	217642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392676
5604	NC_014168	GTT	2	6	217655	217660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392676
5605	NC_014168	CGAAG	2	10	217699	217708	40 %	0 %	40 %	20 %	296392676
5606	NC_014168	CGA	2	6	217740	217745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392676
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5608	NC_014168	C	6	6	217771	217776	0 %	0 %	0 %	100 %	296392676
5609	NC_014168	TGC	2	6	217847	217852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392677
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5611	NC_014168	GCC	2	6	217939	217944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392677
5612	NC_014168	ATC	2	6	217963	217968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392677
5613	NC_014168	CGC	2	6	217973	217978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392677
5614	NC_014168	CGC	2	6	217980	217985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392677
5615	NC_014168	GCG	2	6	218119	218124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392677
5616	NC_014168	GAC	3	9	218151	218159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392677
5617	NC_014168	GCCC	2	8	218187	218194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5618	NC_014168	GGC	2	6	218204	218209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_014168	AGC	2	6	218214	218219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_014168	CGG	2	6	218239	218244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_014168	GAG	2	6	218368	218373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392678
5622	NC_014168	CGGCG	2	10	218445	218454	0 %	0 %	60 %	40 %	296392678
5623	NC_014168	TTC	2	6	218464	218469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392678
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5625	NC_014168	AC	3	6	218647	218652	50 %	0 %	0 %	50 %	296392678
5626	NC_014168	CGG	3	9	218654	218662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392678
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5634	NC_014168	GGC	2	6	218850	218855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392678
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5653	NC_014168	GGT	2	6	219621	219626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392678
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5656	NC_014168	CGAG	2	8	219707	219714	25 %	0 %	50 %	25 %	296392678
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5663	NC_014168	A	6	6	219967	219972	100 %	0 %	0 %	0 %	296392678
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5734	NC_014168	CTG	2	6	222028	222033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392680
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5743	NC_014168	AGC	2	6	222278	222283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392680
5744	NC_014168	GCC	2	6	222304	222309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392680
5745	NC_014168	CG	3	6	222422	222427	0 %	0 %	50 %	50 %	296392680
5746	NC_014168	GCA	2	6	222549	222554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392680
5747	NC_014168	CCA	2	6	222585	222590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392680
5748	NC_014168	GCG	2	6	222651	222656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392680
5749	NC_014168	GTTC	2	8	222660	222667	0 %	50 %	25 %	25 %	296392680
5750	NC_014168	GC	3	6	222715	222720	0 %	0 %	50 %	50 %	296392680
5751	NC_014168	GCC	3	9	222785	222793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392680
5752	NC_014168	CGC	2	6	222826	222831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392680
5753	NC_014168	GCC	2	6	222835	222840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392680
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5759	NC_014168	GCCA	2	8	222971	222978	25 %	0 %	25 %	50 %	296392680
5760	NC_014168	TCCAGG	2	12	222989	223000	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296392680
5761	NC_014168	TCG	2	6	223005	223010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392680
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5763	NC_014168	GCG	2	6	223069	223074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392680
5764	NC_014168	CCG	2	6	223079	223084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392680
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5769	NC_014168	GC	3	6	223267	223272	0 %	0 %	50 %	50 %	296392680
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5772	NC_014168	GCC	2	6	223540	223545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5773	NC_014168	CTG	2	6	223553	223558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5774	NC_014168	GCA	2	6	223587	223592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392681
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5776	NC_014168	GCC	2	6	223627	223632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392681
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5779	NC_014168	GGC	2	6	223800	223805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392681
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5782	NC_014168	CAG	2	6	223899	223904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392681
5783	NC_014168	CG	3	6	223953	223958	0 %	0 %	50 %	50 %	296392681
5784	NC_014168	CGGA	2	8	223972	223979	25 %	0 %	50 %	25 %	296392681
5785	NC_014168	TCG	2	6	223982	223987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392681
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5798	NC_014168	CG	3	6	224417	224422	0 %	0 %	50 %	50 %	296392682
5799	NC_014168	GCC	2	6	224426	224431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392682
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5804	NC_014168	GAC	2	6	224626	224631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392682
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5809	NC_014168	CGA	2	6	224836	224841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392682
5810	NC_014168	CG	3	6	224909	224914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5811	NC_014168	TGGC	2	8	224942	224949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5812	NC_014168	GCG	2	6	224963	224968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5813	NC_014168	CGG	2	6	224996	225001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392683
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5815	NC_014168	GCG	2	6	225133	225138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392683
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5817	NC_014168	GCT	2	6	225289	225294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392683
5818	NC_014168	GAC	2	6	225297	225302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392683
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5821	NC_014168	GCG	2	6	225423	225428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5822	NC_014168	CG	3	6	225450	225455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5823	NC_014168	TGC	2	6	225462	225467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5824	NC_014168	GT	3	6	225479	225484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5825	NC_014168	GCG	2	6	225490	225495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5827	NC_014168	TGC	3	9	225527	225535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5828	NC_014168	GCG	2	6	225564	225569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5829	NC_014168	GGA	2	6	225611	225616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392684
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5832	NC_014168	CGT	2	6	225808	225813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392684
5833	NC_014168	GGA	2	6	225884	225889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392684
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5835	NC_014168	GCACG	2	10	226013	226022	20 %	0 %	40 %	40 %	296392684
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5842	NC_014168	GC	3	6	226388	226393	0 %	0 %	50 %	50 %	296392684
5843	NC_014168	CG	4	8	226403	226410	0 %	0 %	50 %	50 %	296392684
5844	NC_014168	GGC	2	6	226415	226420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392684
5845	NC_014168	CGC	2	6	226433	226438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392684
5846	NC_014168	GAG	2	6	226479	226484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392684
5847	NC_014168	ACCGCG	2	12	226486	226497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296392684
5848	NC_014168	CGC	2	6	226540	226545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392684
5849	NC_014168	CG	3	6	226580	226585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5850	NC_014168	GC	3	6	226591	226596	0 %	0 %	50 %	50 %	296392685
5851	NC_014168	GCG	2	6	226637	226642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392685
5852	NC_014168	ACG	2	6	226660	226665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392685
5853	NC_014168	CGC	2	6	226692	226697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392685
5854	NC_014168	GGC	2	6	226713	226718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392685
5855	NC_014168	GC	3	6	226717	226722	0 %	0 %	50 %	50 %	296392685
5856	NC_014168	CCG	2	6	226726	226731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392685
5857	NC_014168	AGC	2	6	226783	226788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392685
5858	NC_014168	GCT	2	6	226823	226828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392685
5859	NC_014168	CG	3	6	226842	226847	0 %	0 %	50 %	50 %	296392685
5860	NC_014168	CGT	2	6	226862	226867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392685
5861	NC_014168	CCA	3	9	226871	226879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392685
5862	NC_014168	GC	3	6	226902	226907	0 %	0 %	50 %	50 %	296392685
5863	NC_014168	AGC	2	6	226957	226962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392685
5864	NC_014168	CGG	2	6	227060	227065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392685
5865	NC_014168	GGGT	2	8	227071	227078	0 %	25 %	75 %	0 %	296392685
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5992	NC_014168	GCG	2	6	231715	231720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392688
5993	NC_014168	CAT	2	6	231734	231739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392688
5994	NC_014168	CAG	2	6	231741	231746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392688
5995	NC_014168	CGG	2	6	231761	231766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392688
5996	NC_014168	AAG	2	6	231825	231830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392688
5997	NC_014168	GTTA	2	8	231893	231900	25 %	50 %	25 %	0 %	296392688
5998	NC_014168	GATG	2	8	231906	231913	25 %	25 %	50 %	0 %	296392688
5999	NC_014168	G	6	6	231919	231924	0 %	0 %	100 %	0 %	296392688
6000	NC_014168	TGC	2	6	232130	232135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392688

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