MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 78663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014168	ATC	2	6	195232	195237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392652
5002	NC_014168	AGGCCG	2	12	195250	195261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392652
5003	NC_014168	CACG	2	8	195294	195301	25 %	0 %	25 %	50 %	296392652
5004	NC_014168	GTCG	2	8	195303	195310	0 %	25 %	50 %	25 %	296392652
5005	NC_014168	CTG	2	6	195313	195318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392652
5006	NC_014168	GAA	2	6	195399	195404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392652
5007	NC_014168	GTT	2	6	195432	195437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392652
5008	NC_014168	GGT	2	6	195441	195446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392652
5009	NC_014168	CTC	2	6	195480	195485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392652
5010	NC_014168	GGAAG	2	10	195525	195534	40 %	0 %	60 %	0 %	296392652
5011	NC_014168	CGT	2	6	195620	195625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392652
5012	NC_014168	CGC	2	6	195627	195632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392652
5013	NC_014168	AGC	2	6	195640	195645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392652
5014	NC_014168	GTCT	2	8	195654	195661	0 %	50 %	25 %	25 %	296392652
5015	NC_014168	CGTC	2	8	195699	195706	0 %	25 %	25 %	50 %	296392652
5016	NC_014168	GCG	2	6	195707	195712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392652
5017	NC_014168	AGT	2	6	195776	195781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014168	AGC	2	6	195810	195815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5019	NC_014168	CCG	2	6	195828	195833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392653
5020	NC_014168	CGA	2	6	195844	195849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5021	NC_014168	CGAG	2	8	195880	195887	25 %	0 %	50 %	25 %	296392653
5022	NC_014168	GTC	2	6	195896	195901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5023	NC_014168	CACG	2	8	195908	195915	25 %	0 %	25 %	50 %	296392653
5024	NC_014168	CCG	2	6	195916	195921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392653
5025	NC_014168	CGA	2	6	196054	196059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5026	NC_014168	GC	3	6	196075	196080	0 %	0 %	50 %	50 %	296392653
5027	NC_014168	GGC	2	6	196118	196123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392653
5028	NC_014168	CGG	3	9	196168	196176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392653
5029	NC_014168	CGC	2	6	196183	196188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392653
5030	NC_014168	CGA	2	6	196252	196257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5031	NC_014168	CAC	2	6	196301	196306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392653
5032	NC_014168	GAC	2	6	196331	196336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5033	NC_014168	CCA	2	6	196351	196356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392653
5034	NC_014168	CAC	2	6	196454	196459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392653
5035	NC_014168	ACC	2	6	196524	196529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392653
5036	NC_014168	GCC	2	6	196563	196568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392653
5037	NC_014168	TGC	2	6	196575	196580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5038	NC_014168	CGC	3	9	196585	196593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392653
5039	NC_014168	CACCC	2	10	196612	196621	20 %	0 %	0 %	80 %	296392653
5040	NC_014168	CTG	2	6	196625	196630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5041	NC_014168	CGG	2	6	196669	196674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392653
5042	NC_014168	GGCC	2	8	196675	196682	0 %	0 %	50 %	50 %	296392653
5043	NC_014168	AGA	2	6	196720	196725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392653
5044	NC_014168	CGGCGT	2	12	196801	196812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296392653
5045	NC_014168	AGGT	2	8	196869	196876	25 %	25 %	50 %	0 %	296392653
5046	NC_014168	GC	4	8	196906	196913	0 %	0 %	50 %	50 %	296392653
5047	NC_014168	CAG	2	6	196918	196923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5048	NC_014168	CAC	2	6	196961	196966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392653
5049	NC_014168	GC	3	6	196975	196980	0 %	0 %	50 %	50 %	296392653
5050	NC_014168	GGCTC	2	10	196990	196999	0 %	20 %	40 %	40 %	296392653
5051	NC_014168	CGA	2	6	197002	197007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5052	NC_014168	CGA	2	6	197029	197034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5053	NC_014168	CCA	2	6	197038	197043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392653
5054	NC_014168	CGC	2	6	197096	197101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392653
5055	NC_014168	CGA	2	6	197172	197177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392653
5056	NC_014168	GGCA	2	8	197243	197250	25 %	0 %	50 %	25 %	296392653
5057	NC_014168	GACA	2	8	197267	197274	50 %	0 %	25 %	25 %	296392653
5058	NC_014168	ACT	2	6	197336	197341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392654
5059	NC_014168	GCG	2	6	197379	197384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392654
5060	NC_014168	CGCC	2	8	197400	197407	0 %	0 %	25 %	75 %	296392654
5061	NC_014168	GCG	2	6	197408	197413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392654
5062	NC_014168	GCC	2	6	197447	197452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392654
5063	NC_014168	ACG	2	6	197481	197486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392654
5064	NC_014168	CAT	2	6	197554	197559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392654
5065	NC_014168	GTC	2	6	197624	197629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392654
5066	NC_014168	GCC	2	6	197675	197680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392654
5067	NC_014168	ATC	2	6	197684	197689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392654
5068	NC_014168	GGCG	2	8	197739	197746	0 %	0 %	75 %	25 %	296392654
5069	NC_014168	GC	3	6	197747	197752	0 %	0 %	50 %	50 %	296392654
5070	NC_014168	CG	3	6	197784	197789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_014168	GGGC	2	8	197807	197814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_014168	GCA	2	6	197864	197869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5073	NC_014168	CGC	2	6	197880	197885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392655
5074	NC_014168	AACG	2	8	197901	197908	50 %	0 %	25 %	25 %	296392655
5075	NC_014168	GTT	2	6	197930	197935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392655
5076	NC_014168	GAA	2	6	197940	197945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392655
5077	NC_014168	GCG	2	6	197952	197957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392655
5078	NC_014168	CCGAC	2	10	197959	197968	20 %	0 %	20 %	60 %	296392655
5079	NC_014168	TGC	2	6	197971	197976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5080	NC_014168	GC	3	6	197992	197997	0 %	0 %	50 %	50 %	296392655
5081	NC_014168	GAG	2	6	198027	198032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392655
5082	NC_014168	CGCC	2	8	198035	198042	0 %	0 %	25 %	75 %	296392655
5083	NC_014168	GTC	2	6	198054	198059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5084	NC_014168	TCCAA	2	10	198106	198115	40 %	20 %	0 %	40 %	296392655
5085	NC_014168	CG	3	6	198232	198237	0 %	0 %	50 %	50 %	296392655
5086	NC_014168	GTC	2	6	198243	198248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5087	NC_014168	GAT	2	6	198266	198271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392655
5088	NC_014168	CTC	2	6	198279	198284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392655
5089	NC_014168	GCC	2	6	198285	198290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392655
5090	NC_014168	ACC	2	6	198292	198297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392655
5091	NC_014168	TTC	2	6	198381	198386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392655
5092	NC_014168	CGA	2	6	198409	198414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5093	NC_014168	GA	3	6	198413	198418	50 %	0 %	50 %	0 %	296392655
5094	NC_014168	GTT	2	6	198488	198493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392655
5095	NC_014168	GCG	2	6	198494	198499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392655
5096	NC_014168	ATC	2	6	198564	198569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392655
5097	NC_014168	GCA	2	6	198577	198582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5098	NC_014168	CGC	2	6	198584	198589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392655
5099	NC_014168	CCG	2	6	198592	198597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392655
5100	NC_014168	TCA	2	6	198619	198624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392655
5101	NC_014168	GAC	2	6	198636	198641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5102	NC_014168	GCG	2	6	198661	198666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392655
5103	NC_014168	CGT	2	6	198704	198709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392655
5104	NC_014168	CA	3	6	198723	198728	50 %	0 %	0 %	50 %	296392655
5105	NC_014168	CTT	2	6	198749	198754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392655
5106	NC_014168	GAG	2	6	198759	198764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392655
5107	NC_014168	CG	5	10	198779	198788	0 %	0 %	50 %	50 %	296392655
5108	NC_014168	CGC	2	6	198850	198855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392656
5109	NC_014168	GCCC	2	8	198866	198873	0 %	0 %	25 %	75 %	296392656
5110	NC_014168	TCA	2	6	198933	198938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392656
5111	NC_014168	A	6	6	199061	199066	100 %	0 %	0 %	0 %	296392656
5112	NC_014168	TTC	3	9	199097	199105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392656
5113	NC_014168	GCT	2	6	199165	199170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392656
5114	NC_014168	TCG	2	6	199200	199205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392656
5115	NC_014168	GGC	2	6	199217	199222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392656
5116	NC_014168	TCG	2	6	199236	199241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392656
5117	NC_014168	CGC	2	6	199290	199295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392656
5118	NC_014168	CGTT	2	8	199302	199309	0 %	50 %	25 %	25 %	296392656
5119	NC_014168	TTC	2	6	199310	199315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392656
5120	NC_014168	C	6	6	199352	199357	0 %	0 %	0 %	100 %	296392656
5121	NC_014168	CGAA	2	8	199359	199366	50 %	0 %	25 %	25 %	296392656
5122	NC_014168	GCG	2	6	199416	199421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392656
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5247	NC_014168	GCA	2	6	204743	204748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392661
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5254	NC_014168	CGG	2	6	204958	204963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392662
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5278	NC_014168	CGG	2	6	205956	205961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392663
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5313	NC_014168	CGC	2	6	207170	207175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392664
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5349	NC_014168	GC	3	6	208126	208131	0 %	0 %	50 %	50 %	296392665
5350	NC_014168	CGT	2	6	208158	208163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392665
5351	NC_014168	GTC	2	6	208186	208191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392665
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5353	NC_014168	CGG	2	6	208257	208262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392665
5354	NC_014168	GC	3	6	208293	208298	0 %	0 %	50 %	50 %	296392665
5355	NC_014168	GCA	2	6	208308	208313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392665
5356	NC_014168	GC	3	6	208326	208331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5357	NC_014168	CGG	2	6	208402	208407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392666
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5361	NC_014168	TCG	2	6	208534	208539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5362	NC_014168	TGCG	2	8	208592	208599	0 %	25 %	50 %	25 %	296392666
5363	NC_014168	CGA	2	6	208615	208620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5364	NC_014168	GAC	2	6	208637	208642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5365	NC_014168	TTC	2	6	208662	208667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392666
5366	NC_014168	GTC	2	6	208691	208696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5367	NC_014168	CGT	2	6	208723	208728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5368	NC_014168	CTT	2	6	208771	208776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392666
5369	NC_014168	CTC	2	6	208934	208939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392666
5370	NC_014168	TCG	2	6	208989	208994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5371	NC_014168	CGT	2	6	209053	209058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392666
5372	NC_014168	GAT	2	6	209072	209077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392666
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5383	NC_014168	CGG	2	6	209412	209417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392667
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5388	NC_014168	GTC	2	6	209533	209538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392667
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5397	NC_014168	GCC	2	6	209887	209892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392667
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5399	NC_014168	GCCC	2	8	209941	209948	0 %	0 %	25 %	75 %	296392667
5400	NC_014168	GACGGA	2	12	209998	210009	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296392667
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5402	NC_014168	GCT	2	6	210129	210134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392667
5403	NC_014168	CGAGGG	2	12	210141	210152	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296392667
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5412	NC_014168	A	6	6	210465	210470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5469	NC_014168	CGA	2	6	213253	213258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392671
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5471	NC_014168	CGGCG	2	10	213318	213327	0 %	0 %	60 %	40 %	296392671
5472	NC_014168	CG	3	6	213400	213405	0 %	0 %	50 %	50 %	296392671
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5477	NC_014168	CGC	2	6	213477	213482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392671
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5480	NC_014168	GCT	2	6	213609	213614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392671
5481	NC_014168	CG	3	6	213679	213684	0 %	0 %	50 %	50 %	296392671
5482	NC_014168	CGA	2	6	213713	213718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392671
5483	NC_014168	CCG	2	6	213725	213730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392671
5484	NC_014168	GCT	2	6	213792	213797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392671
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5486	NC_014168	TCG	2	6	213926	213931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392671
5487	NC_014168	GC	5	10	214010	214019	0 %	0 %	50 %	50 %	296392671
5488	NC_014168	CGC	3	9	214072	214080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392672
5489	NC_014168	GGC	2	6	214162	214167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392672
5490	NC_014168	GGC	2	6	214300	214305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392673
5491	NC_014168	GAC	2	6	214306	214311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5492	NC_014168	GTC	2	6	214312	214317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5493	NC_014168	TTGT	2	8	214393	214400	0 %	75 %	25 %	0 %	296392673
5494	NC_014168	CGG	2	6	214422	214427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392673
5495	NC_014168	CGA	2	6	214438	214443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5496	NC_014168	TCG	2	6	214460	214465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392673
5497	NC_014168	CGAATT	2	12	214497	214508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296392673
5498	NC_014168	CCA	2	6	214515	214520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392673
5499	NC_014168	GCC	2	6	214550	214555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392673
5500	NC_014168	GCG	2	6	214574	214579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392673

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