MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	TC	3	6	75	80	0 %	50 %	0 %	50 %	296137680
2	NC_014157	AG	3	6	1059	1064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014157	CT	3	6	1194	1199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014157	TC	3	6	1756	1761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014157	CT	3	6	2253	2258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014157	CG	4	8	2479	2486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014157	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014157	GC	3	6	2622	2627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014157	GC	4	8	2641	2648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014157	GA	3	6	4535	4540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014157	CT	3	6	5518	5523	0 %	50 %	0 %	50 %	296137684
12	NC_014157	GA	3	6	6108	6113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014157	GA	3	6	6126	6131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014157	GA	3	6	6144	6149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014157	GC	3	6	6825	6830	0 %	0 %	50 %	50 %	296137685
16	NC_014157	CT	3	6	7551	7556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014157	TC	3	6	8830	8835	0 %	50 %	0 %	50 %	296137690
18	NC_014157	CT	3	6	9372	9377	0 %	50 %	0 %	50 %	296137690
19	NC_014157	GT	3	6	9956	9961	0 %	50 %	50 %	0 %	296137691
20	NC_014157	GC	3	6	10093	10098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014157	CT	3	6	10143	10148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014157	GC	3	6	10857	10862	0 %	0 %	50 %	50 %	296137692
23	NC_014157	TC	3	6	12518	12523	0 %	50 %	0 %	50 %	296137693
24	NC_014157	CA	3	6	12995	13000	50 %	0 %	0 %	50 %	296137693
25	NC_014157	TC	3	6	14934	14939	0 %	50 %	0 %	50 %	296137695
26	NC_014157	CA	3	6	15163	15168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014157	CT	3	6	15247	15252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014157	GC	3	6	15414	15419	0 %	0 %	50 %	50 %	296137696
29	NC_014157	CT	3	6	15637	15642	0 %	50 %	0 %	50 %	296137696
30	NC_014157	TC	3	6	15972	15977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014157	TC	4	8	15984	15991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014157	CT	3	6	16081	16086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014157	CT	3	6	16227	16232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014157	TC	3	6	18884	18889	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
35	NC_014157	CT	3	6	18915	18920	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
36	NC_014157	TC	3	6	20874	20879	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
37	NC_014157	AG	3	6	22560	22565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014157	CA	3	6	22685	22690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014157	GA	3	6	23220	23225	50 %	0 %	50 %	0 %	296137698
40	NC_014157	CG	3	6	24124	24129	0 %	0 %	50 %	50 %	296137698
41	NC_014157	CG	3	6	24394	24399	0 %	0 %	50 %	50 %	296137698
42	NC_014157	GT	3	6	25165	25170	0 %	50 %	50 %	0 %	296137698
43	NC_014157	AG	3	6	26347	26352	50 %	0 %	50 %	0 %	296137698
44	NC_014157	GA	3	6	26774	26779	50 %	0 %	50 %	0 %	296137698
45	NC_014157	CG	3	6	27114	27119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014157	CG	3	6	27132	27137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014157	CG	3	6	27350	27355	0 %	0 %	50 %	50 %	296137699
48	NC_014157	TC	3	6	27955	27960	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
49	NC_014157	CG	3	6	28847	28852	0 %	0 %	50 %	50 %	296137700
50	NC_014157	TC	3	6	30061	30066	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
51	NC_014157	TC	3	6	30496	30501	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
52	NC_014157	CT	3	6	30774	30779	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
53	NC_014157	TC	3	6	30939	30944	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
54	NC_014157	TC	3	6	31770	31775	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
55	NC_014157	CT	3	6	31875	31880	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
56	NC_014157	CT	3	6	32110	32115	0 %	50 %	0 %	50 %	296137700
57	NC_014157	AG	3	6	33585	33590	50 %	0 %	50 %	0 %	296137701
58	NC_014157	CT	3	6	34545	34550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014157	GA	3	6	34637	34642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014157	CT	3	6	34802	34807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014157	CG	3	6	34957	34962	0 %	0 %	50 %	50 %	296137703
62	NC_014157	GC	3	6	35517	35522	0 %	0 %	50 %	50 %	296137703
63	NC_014157	CG	3	6	36114	36119	0 %	0 %	50 %	50 %	296137704
64	NC_014157	AG	3	6	36411	36416	50 %	0 %	50 %	0 %	296137704
65	NC_014157	GC	4	8	36494	36501	0 %	0 %	50 %	50 %	296137705
66	NC_014157	GC	3	6	36631	36636	0 %	0 %	50 %	50 %	296137705
67	NC_014157	AC	3	6	37051	37056	50 %	0 %	0 %	50 %	296137705
68	NC_014157	CA	3	6	39709	39714	50 %	0 %	0 %	50 %	296137708
69	NC_014157	AG	3	6	40161	40166	50 %	0 %	50 %	0 %	296137708
70	NC_014157	GA	3	6	40793	40798	50 %	0 %	50 %	0 %	296137709
71	NC_014157	GC	3	6	41070	41075	0 %	0 %	50 %	50 %	296137710
72	NC_014157	GC	3	6	42178	42183	0 %	0 %	50 %	50 %	296137711
73	NC_014157	GC	4	8	42374	42381	0 %	0 %	50 %	50 %	296137711
74	NC_014157	GC	3	6	42713	42718	0 %	0 %	50 %	50 %	296137711
75	NC_014157	CG	3	6	43198	43203	0 %	0 %	50 %	50 %	296137711
76	NC_014157	GC	3	6	43593	43598	0 %	0 %	50 %	50 %	296137712
77	NC_014157	CG	3	6	43786	43791	0 %	0 %	50 %	50 %	296137712
78	NC_014157	GA	3	6	44138	44143	50 %	0 %	50 %	0 %	296137713
79	NC_014157	CG	3	6	44255	44260	0 %	0 %	50 %	50 %	296137713
80	NC_014157	GC	3	6	46164	46169	0 %	0 %	50 %	50 %	296137714
81	NC_014157	GA	3	6	46877	46882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014157	AG	3	6	48034	48039	50 %	0 %	50 %	0 %	296137716
83	NC_014157	CG	3	6	48119	48124	0 %	0 %	50 %	50 %	296137716
84	NC_014157	GC	3	6	49254	49259	0 %	0 %	50 %	50 %	296137717
85	NC_014157	AG	3	6	49817	49822	50 %	0 %	50 %	0 %	296137718
86	NC_014157	GC	3	6	50542	50547	0 %	0 %	50 %	50 %	296137718
87	NC_014157	CG	3	6	51033	51038	0 %	0 %	50 %	50 %	296137718
88	NC_014157	TG	3	6	51734	51739	0 %	50 %	50 %	0 %	296137718
89	NC_014157	GA	3	6	51843	51848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014157	GC	3	6	53040	53045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014157	CG	3	6	53827	53832	0 %	0 %	50 %	50 %	296137720
92	NC_014157	CG	3	6	54060	54065	0 %	0 %	50 %	50 %	296137721
93	NC_014157	CG	3	6	54082	54087	0 %	0 %	50 %	50 %	296137721
94	NC_014157	TG	3	6	54134	54139	0 %	50 %	50 %	0 %	296137721
95	NC_014157	GC	3	6	54215	54220	0 %	0 %	50 %	50 %	296137721
96	NC_014157	TC	3	6	54582	54587	0 %	50 %	0 %	50 %	296137721
97	NC_014157	TC	3	6	54792	54797	0 %	50 %	0 %	50 %	296137721
98	NC_014157	GC	3	6	54930	54935	0 %	0 %	50 %	50 %	296137721
99	NC_014157	GC	3	6	55846	55851	0 %	0 %	50 %	50 %	296137722
100	NC_014157	CT	3	6	56781	56786	0 %	50 %	0 %	50 %	296137723
101	NC_014157	CG	3	6	58368	58373	0 %	0 %	50 %	50 %	296137724
102	NC_014157	TC	3	6	58386	58391	0 %	50 %	0 %	50 %	296137724
103	NC_014157	CT	3	6	58682	58687	0 %	50 %	0 %	50 %	296137724
104	NC_014157	GC	3	6	58879	58884	0 %	0 %	50 %	50 %	296137724
105	NC_014157	CG	3	6	60141	60146	0 %	0 %	50 %	50 %	296137724
106	NC_014157	CG	3	6	60155	60160	0 %	0 %	50 %	50 %	296137724
107	NC_014157	GC	3	6	60235	60240	0 %	0 %	50 %	50 %	296137724
108	NC_014157	GC	3	6	62411	62416	0 %	0 %	50 %	50 %	296137725
109	NC_014157	CA	3	6	62658	62663	50 %	0 %	0 %	50 %	296137725
110	NC_014157	AG	3	6	62721	62726	50 %	0 %	50 %	0 %	296137725
111	NC_014157	GC	3	6	62867	62872	0 %	0 %	50 %	50 %	296137725
112	NC_014157	TC	3	6	63212	63217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014157	CT	3	6	63394	63399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014157	TC	3	6	64218	64223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014157	AC	3	6	65270	65275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014157	CT	3	6	66045	66050	0 %	50 %	0 %	50 %	296137731
117	NC_014157	TC	3	6	66357	66362	0 %	50 %	0 %	50 %	296137731
118	NC_014157	GC	3	6	66546	66551	0 %	0 %	50 %	50 %	296137731
119	NC_014157	AC	3	6	67060	67065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014157	TC	3	6	67583	67588	0 %	50 %	0 %	50 %	296137732
121	NC_014157	CT	3	6	69220	69225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014157	CT	3	6	70219	70224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014157	AT	3	6	70235	70240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014157	TC	3	6	70386	70391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014157	AT	3	6	70678	70683	50 %	50 %	0 %	0 %	296137735
126	NC_014157	AG	3	6	71316	71321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014157	TC	3	6	71327	71332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014157	GA	3	6	71708	71713	50 %	0 %	50 %	0 %	296137736
129	NC_014157	AT	3	6	71915	71920	50 %	50 %	0 %	0 %	296137736
130	NC_014157	GC	3	6	71947	71952	0 %	0 %	50 %	50 %	296137736
131	NC_014157	AC	3	6	72248	72253	50 %	0 %	0 %	50 %	296137736
132	NC_014157	AT	3	6	72946	72951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014157	GC	4	8	73319	73326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014157	AG	3	6	73404	73409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014157	GA	3	6	74186	74191	50 %	0 %	50 %	0 %	296137739
136	NC_014157	AG	3	6	74327	74332	50 %	0 %	50 %	0 %	296137739
137	NC_014157	AG	3	6	75512	75517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014157	GA	3	6	76291	76296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014157	TC	3	6	76377	76382	0 %	50 %	0 %	50 %	296137742
140	NC_014157	TC	3	6	77364	77369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014157	GC	3	6	78566	78571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014157	AC	3	6	78957	78962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014157	TC	3	6	79288	79293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014157	TG	3	6	81078	81083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014157	CT	3	6	81186	81191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014157	AG	3	6	81693	81698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014157	CT	3	6	81757	81762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014157	CT	3	6	81775	81780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014157	AG	3	6	82034	82039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014157	GC	3	6	82108	82113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014157	GA	3	6	82335	82340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014157	CG	3	6	82503	82508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014157	CT	3	6	82549	82554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014157	AG	3	6	84199	84204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.