MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	TGCCTT	2	12	10214	10225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014157	CGGCCT	2	12	11199	11210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137692
3	NC_014157	TGCCCT	2	12	12578	12589	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296137693
4	NC_014157	ACCGTC	2	12	13461	13472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296137693
5	NC_014157	GCCTCC	2	12	14143	14154	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296137694
6	NC_014157	GCAACC	2	12	14327	14338	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296137694
7	NC_014157	GAACGG	2	12	14487	14498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296137694
8	NC_014157	ACCCTC	2	12	15054	15065	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	296137695
9	NC_014157	GCCATA	2	12	16658	16669	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014157	ATCCCG	2	12	18787	18798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296137697
11	NC_014157	CGCCTC	2	12	21243	21254	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296137697
12	NC_014157	ACCTGG	2	12	24554	24565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296137698
13	NC_014157	GGAGCG	2	12	25248	25259	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296137698
14	NC_014157	ATCCCG	2	12	28152	28163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296137700
15	NC_014157	TTTCCT	2	12	28405	28416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137700
16	NC_014157	CTCCAT	2	12	28481	28492	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296137700
17	NC_014157	CCGCCC	2	12	36163	36174	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	296137704
18	NC_014157	CGGGAC	2	12	36276	36287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137704
19	NC_014157	AGGCGG	2	12	36465	36476	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296137705
20	NC_014157	TGCGGG	2	12	37356	37367	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296137705
21	NC_014157	AGAACG	2	12	38608	38619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014157	TGGCGT	2	12	40386	40397	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296137709
23	NC_014157	CGGTCG	2	12	41310	41321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296137710
24	NC_014157	CGATGC	2	12	42022	42033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296137710
25	NC_014157	GGCCCC	2	12	44283	44294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137713
26	NC_014157	CGTGAG	2	12	47126	47137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296137716
27	NC_014157	GGCGAG	2	12	49169	49180	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296137717
28	NC_014157	CCAGCA	2	12	49570	49581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296137717
29	NC_014157	ACGGCG	2	12	52592	52603	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137719
30	NC_014157	CGTCTC	2	12	52869	52880	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014157	GACCCA	2	12	53759	53770	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296137720
32	NC_014157	CGTCCC	2	12	54282	54293	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296137721
33	NC_014157	TCCTGC	2	12	54524	54535	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296137721
34	NC_014157	GGCGCC	2	12	54800	54811	0 %	0 %	50 %	50 %	296137721
35	NC_014157	GATGGC	2	12	54957	54968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296137721
36	NC_014157	GGGCTG	2	12	55252	55263	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296137721
37	NC_014157	GAGGCC	2	12	56907	56918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137723
38	NC_014157	CCAGCC	2	12	58347	58358	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296137724
39	NC_014157	GTGTCG	2	12	58394	58405	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296137724
40	NC_014157	ATGCCG	2	12	58451	58462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296137724
41	NC_014157	CCCTCC	2	12	61628	61639	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	296137724
42	NC_014157	GAGGCG	2	12	62749	62760	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296137725
43	NC_014157	GAACCG	2	12	62825	62836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137725
44	NC_014157	CGGTTC	2	12	63319	63330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014157	GAGATC	2	12	63572	63583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296137726
46	NC_014157	TCTGGC	2	12	71803	71814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137736
47	NC_014157	CGACGT	2	12	73635	73646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296137738
48	NC_014157	CAGTCG	2	12	80643	80654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296137745

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.