MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 89433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014032	CTC	2	6	40340	40345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505857
1002	NC_014032	CTC	2	6	40356	40361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505857
1003	NC_014032	CGC	2	6	40373	40378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505857
1004	NC_014032	GCG	2	6	40396	40401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505857
1005	NC_014032	CGA	2	6	40421	40426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505857
1006	NC_014032	GAAC	2	8	40458	40465	50 %	0 %	25 %	25 %	294505857
1007	NC_014032	GCG	2	6	40506	40511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505857
1008	NC_014032	G	6	6	40675	40680	0 %	0 %	100 %	0 %	294505857
1009	NC_014032	GAG	2	6	40695	40700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505857
1010	NC_014032	CGA	2	6	40718	40723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505857
1011	NC_014032	GCG	2	6	40724	40729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505857
1012	NC_014032	TCG	2	6	40771	40776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505857
1013	NC_014032	CAT	2	6	40793	40798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505857
1014	NC_014032	GGCG	2	8	40892	40899	0 %	0 %	75 %	25 %	294505857
1015	NC_014032	CGC	2	6	40917	40922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505857
1016	NC_014032	CGG	2	6	40941	40946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505857
1017	NC_014032	CCG	2	6	40997	41002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505857
1018	NC_014032	CGGG	2	8	41005	41012	0 %	0 %	75 %	25 %	294505857
1019	NC_014032	CGC	3	9	41087	41095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505857
1020	NC_014032	CTC	2	6	41102	41107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505857
1021	NC_014032	TTC	2	6	41127	41132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014032	CGG	2	6	41154	41159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014032	CGAC	2	8	41186	41193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_014032	TG	3	6	41194	41199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014032	GCCTT	2	10	41211	41220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_014032	CAC	2	6	41266	41271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_014032	TCC	2	6	41290	41295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_014032	CGG	2	6	41339	41344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505858
1029	NC_014032	CG	3	6	41347	41352	0 %	0 %	50 %	50 %	294505858
1030	NC_014032	TCG	2	6	41368	41373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1031	NC_014032	TCG	2	6	41418	41423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1032	NC_014032	CGG	3	9	41431	41439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505858
1033	NC_014032	TCG	2	6	41443	41448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1034	NC_014032	GAA	2	6	41457	41462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505858
1035	NC_014032	CGC	2	6	41510	41515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505858
1036	NC_014032	CAA	2	6	41570	41575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505858
1037	NC_014032	GAC	2	6	41619	41624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1038	NC_014032	GAC	2	6	41628	41633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1039	NC_014032	GGC	2	6	41675	41680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505858
1040	NC_014032	ATG	2	6	41691	41696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505858
1041	NC_014032	CAG	2	6	41700	41705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1042	NC_014032	TCC	2	6	41727	41732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505858
1043	NC_014032	CAC	2	6	41741	41746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505858
1044	NC_014032	CGC	2	6	41771	41776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505858
1045	NC_014032	TCG	2	6	41791	41796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1046	NC_014032	GTG	2	6	41850	41855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505858
1047	NC_014032	CGA	2	6	41885	41890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1048	NC_014032	CGA	2	6	41894	41899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505858
1049	NC_014032	GAA	2	6	41955	41960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505858
1050	NC_014032	GGC	2	6	41984	41989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505858
1051	NC_014032	CGC	3	9	42060	42068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_014032	GATC	2	8	42105	42112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_014032	CCGG	2	8	42200	42207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014032	GCG	3	9	42335	42343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505859
1055	NC_014032	CGA	2	6	42344	42349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1056	NC_014032	CGC	2	6	42437	42442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505859
1057	NC_014032	CTG	2	6	42552	42557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1058	NC_014032	AGG	2	6	42586	42591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505859
1059	NC_014032	CAG	2	6	42594	42599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1060	NC_014032	GAG	2	6	42645	42650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505859
1061	NC_014032	CGC	2	6	42673	42678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505859
1062	NC_014032	CGG	2	6	42710	42715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505859
1063	NC_014032	GAA	2	6	42746	42751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505859
1064	NC_014032	GC	3	6	42754	42759	0 %	0 %	50 %	50 %	294505859
1065	NC_014032	GTC	2	6	42762	42767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1066	NC_014032	AAG	2	6	42801	42806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505859
1067	NC_014032	TGCTCG	2	12	42835	42846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1068	NC_014032	CGA	2	6	42854	42859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1069	NC_014032	TCG	2	6	42898	42903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1070	NC_014032	CCA	2	6	42943	42948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505859
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1072	NC_014032	GC	3	6	42972	42977	0 %	0 %	50 %	50 %	294505859
1073	NC_014032	GAC	2	6	42987	42992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
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1075	NC_014032	CTA	2	6	43049	43054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505859
1076	NC_014032	CTGGAG	2	12	43098	43109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294505859
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1078	NC_014032	CGA	2	6	43196	43201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
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1080	NC_014032	GAG	2	6	43233	43238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505859
1081	NC_014032	TCGA	2	8	43243	43250	25 %	25 %	25 %	25 %	294505859
1082	NC_014032	CTG	2	6	43272	43277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1083	NC_014032	GACG	2	8	43283	43290	25 %	0 %	50 %	25 %	294505859
1084	NC_014032	GGC	2	6	43292	43297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505859
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1087	NC_014032	ACG	2	6	43410	43415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1088	NC_014032	CCAC	2	8	43426	43433	25 %	0 %	0 %	75 %	294505859
1089	NC_014032	GCCG	2	8	43499	43506	0 %	0 %	50 %	50 %	294505859
1090	NC_014032	GCT	2	6	43529	43534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1091	NC_014032	CGA	2	6	43622	43627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1092	NC_014032	CTG	2	6	43638	43643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505859
1093	NC_014032	TCA	2	6	43651	43656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505859
1094	NC_014032	CGAAG	2	10	43670	43679	40 %	0 %	40 %	20 %	294505859
1095	NC_014032	GGA	2	6	43682	43687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505859
1096	NC_014032	GAG	3	9	43689	43697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505859
1097	NC_014032	G	6	6	43742	43747	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014032	C	6	6	43766	43771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1099	NC_014032	GCC	2	6	43856	43861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505860
1100	NC_014032	GA	3	6	43956	43961	50 %	0 %	50 %	0 %	294505860
1101	NC_014032	ACG	2	6	43971	43976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505860
1102	NC_014032	CGA	2	6	44101	44106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505860
1103	NC_014032	GA	3	6	44165	44170	50 %	0 %	50 %	0 %	294505860
1104	NC_014032	AGC	3	9	44181	44189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505860
1105	NC_014032	T	6	6	44208	44213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014032	CT	3	6	44214	44219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_014032	GGC	2	6	44220	44225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_014032	CT	3	6	44356	44361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_014032	GTC	2	6	44399	44404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014032	T	6	6	44454	44459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014032	AGGA	2	8	44601	44608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014032	CCGG	2	8	44649	44656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_014032	G	6	6	44704	44709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014032	GCG	2	6	44753	44758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505861
1115	NC_014032	CGG	2	6	44793	44798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505861
1116	NC_014032	AGCAGA	2	12	44851	44862	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294505861
1117	NC_014032	CCG	2	6	44897	44902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505861
1118	NC_014032	CAG	2	6	44904	44909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505861
1119	NC_014032	CGA	2	6	44942	44947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505861
1120	NC_014032	GCG	2	6	44968	44973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505861
1121	NC_014032	GT	3	6	44978	44983	0 %	50 %	50 %	0 %	294505861
1122	NC_014032	GCC	2	6	45006	45011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505861
1123	NC_014032	CAG	2	6	45078	45083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505861
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1125	NC_014032	CCGT	2	8	45097	45104	0 %	25 %	25 %	50 %	294505861
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1127	NC_014032	A	6	6	45126	45131	100 %	0 %	0 %	0 %	294505861
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1262	NC_014032	GA	3	6	49601	49606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1371	NC_014032	CGA	2	6	53818	53823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505869
1372	NC_014032	CTC	2	6	53834	53839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505869
1373	NC_014032	ACC	2	6	53841	53846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505869
1374	NC_014032	GTC	2	6	53894	53899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505869
1375	NC_014032	GCA	2	6	53947	53952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505869
1376	NC_014032	GC	3	6	54007	54012	0 %	0 %	50 %	50 %	294505869
1377	NC_014032	ACGA	2	8	54050	54057	50 %	0 %	25 %	25 %	294505869
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1379	NC_014032	GCA	2	6	54117	54122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1383	NC_014032	GCC	2	6	54221	54226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1491	NC_014032	CTG	2	6	57576	57581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1492	NC_014032	GA	3	6	57620	57625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1493	NC_014032	GGC	2	6	57649	57654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1494	NC_014032	GGC	2	6	57763	57768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1495	NC_014032	TGG	2	6	57908	57913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505874
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1497	NC_014032	GGCCGC	2	12	57936	57947	0 %	0 %	50 %	50 %	294505874
1498	NC_014032	GGC	2	6	57948	57953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505874
1499	NC_014032	TCA	2	6	57977	57982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505874
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