MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 89433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014032	GAA	2	6	21461	21466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505836
502	NC_014032	CGG	2	6	21518	21523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505836
503	NC_014032	TCC	2	6	21544	21549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505836
504	NC_014032	CGA	2	6	21560	21565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505836
505	NC_014032	CGC	2	6	21570	21575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505836
506	NC_014032	CTC	2	6	21576	21581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505836
507	NC_014032	GAC	2	6	21582	21587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505836
508	NC_014032	CAC	2	6	21597	21602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505836
509	NC_014032	CCG	2	6	21613	21618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505836
510	NC_014032	CGT	2	6	21683	21688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505836
511	NC_014032	GGC	2	6	21764	21769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505836
512	NC_014032	CCG	2	6	21787	21792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505836
513	NC_014032	CCG	2	6	21811	21816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505836
514	NC_014032	CAT	2	6	21890	21895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505836
515	NC_014032	CAA	2	6	21908	21913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505836
516	NC_014032	AGC	2	6	21916	21921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505836
517	NC_014032	TCA	2	6	21931	21936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505836
518	NC_014032	GTC	2	6	21984	21989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505836
519	NC_014032	CGG	2	6	22070	22075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505836
520	NC_014032	GCC	2	6	22190	22195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505837
521	NC_014032	CGT	2	6	22241	22246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505837
522	NC_014032	ACG	2	6	22253	22258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505837
523	NC_014032	AGA	2	6	22364	22369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505837
524	NC_014032	CCG	2	6	22374	22379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505837
525	NC_014032	CAA	2	6	22473	22478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505837
526	NC_014032	GGA	2	6	22500	22505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505837
527	NC_014032	GCAA	2	8	22511	22518	50 %	0 %	25 %	25 %	294505837
528	NC_014032	ACG	2	6	22523	22528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505837
529	NC_014032	CAAC	3	12	22586	22597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_014032	GGA	2	6	22649	22654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505838
531	NC_014032	ACG	2	6	22677	22682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505838
532	NC_014032	GAA	2	6	22691	22696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505838
533	NC_014032	GA	3	6	22759	22764	50 %	0 %	50 %	0 %	294505838
534	NC_014032	AGA	2	6	22838	22843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505839
535	NC_014032	CGA	2	6	22880	22885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505839
536	NC_014032	GAG	3	9	22890	22898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505839
537	NC_014032	ACC	2	6	22933	22938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_014032	GGT	2	6	22987	22992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014032	GCC	2	6	23009	23014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_014032	ACCC	2	8	23020	23027	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
541	NC_014032	AGC	2	6	23096	23101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014032	GAC	2	6	23197	23202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014032	AGC	2	6	23294	23299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014032	CGT	2	6	23367	23372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014032	GAG	2	6	23382	23387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014032	ACA	2	6	23415	23420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014032	AC	3	6	23426	23431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_014032	CCT	2	6	23473	23478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_014032	CGG	2	6	23480	23485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014032	CCT	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_014032	CGG	2	6	23531	23536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014032	TCG	2	6	23544	23549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014032	CGCGGC	2	12	23607	23618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_014032	AG	4	8	23622	23629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014032	CGC	2	6	23664	23669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_014032	CGT	2	6	23696	23701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
557	NC_014032	GCCCCC	2	12	23715	23726	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	294505840
558	NC_014032	G	6	6	23742	23747	0 %	0 %	100 %	0 %	294505840
559	NC_014032	GCC	2	6	23778	23783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505840
560	NC_014032	GTG	2	6	23803	23808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505840
561	NC_014032	CGA	2	6	23834	23839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505840
562	NC_014032	GCT	2	6	23873	23878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
563	NC_014032	GAT	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
564	NC_014032	TCG	2	6	23923	23928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
565	NC_014032	TCGA	2	8	23986	23993	25 %	25 %	25 %	25 %	294505840
566	NC_014032	CGC	2	6	24032	24037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505840
567	NC_014032	GTTGA	2	10	24057	24066	20 %	40 %	40 %	0 %	294505840
568	NC_014032	GA	3	6	24065	24070	50 %	0 %	50 %	0 %	294505840
569	NC_014032	GAGC	2	8	24111	24118	25 %	0 %	50 %	25 %	294505840
570	NC_014032	ACC	2	6	24202	24207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505840
571	NC_014032	GGC	3	9	24236	24244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
572	NC_014032	GTC	2	6	24282	24287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
573	NC_014032	GCCG	2	8	24315	24322	0 %	0 %	50 %	50 %	294505840
574	NC_014032	GTC	3	9	24342	24350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
575	NC_014032	TGC	2	6	24421	24426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
576	NC_014032	GC	3	6	24425	24430	0 %	0 %	50 %	50 %	294505840
577	NC_014032	GGC	2	6	24480	24485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
578	NC_014032	T	6	6	24654	24659	0 %	100 %	0 %	0 %	294505840
579	NC_014032	AG	3	6	24763	24768	50 %	0 %	50 %	0 %	294505840
580	NC_014032	CGT	2	6	24857	24862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
581	NC_014032	AGA	2	6	24895	24900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505840
582	NC_014032	GCG	2	6	25050	25055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
583	NC_014032	TGA	2	6	25115	25120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
584	NC_014032	CCT	2	6	25121	25126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505840
585	NC_014032	GTG	2	6	25132	25137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505840
586	NC_014032	TTG	2	6	25243	25248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294505840
587	NC_014032	C	6	6	25307	25312	0 %	0 %	0 %	100 %	294505840
588	NC_014032	CG	3	6	25316	25321	0 %	0 %	50 %	50 %	294505840
589	NC_014032	CTT	2	6	25338	25343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505840
590	NC_014032	CGT	2	6	25454	25459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
591	NC_014032	CGTC	2	8	25507	25514	0 %	25 %	25 %	50 %	294505840
592	NC_014032	CAT	2	6	25518	25523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505840
593	NC_014032	CG	3	6	25564	25569	0 %	0 %	50 %	50 %	294505840
594	NC_014032	GAT	3	9	25572	25580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
595	NC_014032	GTC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
596	NC_014032	GCC	2	6	25650	25655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505840
597	NC_014032	CAC	2	6	25698	25703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505840
598	NC_014032	GCG	2	6	25717	25722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
599	NC_014032	TCG	2	6	25771	25776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
600	NC_014032	CGT	2	6	25824	25829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
601	NC_014032	GCG	2	6	25845	25850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
602	NC_014032	AGC	2	6	25852	25857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505840
603	NC_014032	GAT	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
604	NC_014032	CGC	2	6	25896	25901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505840
605	NC_014032	GTG	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505840
606	NC_014032	GTA	2	6	25932	25937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
607	NC_014032	TCC	2	6	25951	25956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505840
608	NC_014032	CTC	2	6	25977	25982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505840
609	NC_014032	TGCT	2	8	26053	26060	0 %	50 %	25 %	25 %	294505840
610	NC_014032	GGAC	2	8	26135	26142	25 %	0 %	50 %	25 %	294505840
611	NC_014032	GCG	2	6	26162	26167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
612	NC_014032	GCT	3	9	26210	26218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
613	NC_014032	GCC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505840
614	NC_014032	TCT	2	6	26237	26242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505840
615	NC_014032	GAC	2	6	26254	26259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505840
616	NC_014032	GAC	2	6	26263	26268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505840
617	NC_014032	GTC	2	6	26292	26297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
618	NC_014032	GGAA	2	8	26314	26321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014032	GAA	2	6	26335	26340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014032	AAG	2	6	26388	26393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014032	CGTC	2	8	26418	26425	0 %	25 %	25 %	50 %	294505841
622	NC_014032	CGTC	2	8	26432	26439	0 %	25 %	25 %	50 %	294505841
623	NC_014032	TCC	2	6	26473	26478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505841
624	NC_014032	AGG	2	6	26509	26514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505841
625	NC_014032	GGT	2	6	26522	26527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505841
626	NC_014032	GAGG	2	8	26583	26590	25 %	0 %	75 %	0 %	294505841
627	NC_014032	CGGA	2	8	26646	26653	25 %	0 %	50 %	25 %	294505841
628	NC_014032	TTC	2	6	26697	26702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505841
629	NC_014032	GTTGCG	2	12	26712	26723	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294505841
630	NC_014032	G	6	6	26725	26730	0 %	0 %	100 %	0 %	294505841
631	NC_014032	TCC	2	6	26761	26766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505841
632	NC_014032	GAG	2	6	26799	26804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505841
633	NC_014032	GCCCG	2	10	26807	26816	0 %	0 %	40 %	60 %	294505841
634	NC_014032	CGA	2	6	26819	26824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505841
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637	NC_014032	CCT	2	6	26969	26974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505841
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647	NC_014032	TCC	2	6	27460	27465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505842
648	NC_014032	TTC	2	6	27496	27501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505842
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650	NC_014032	GTC	2	6	27534	27539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505842
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652	NC_014032	GTC	3	9	27636	27644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505842
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659	NC_014032	CGG	2	6	27938	27943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505842
660	NC_014032	CGT	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505842
661	NC_014032	GCCCG	2	10	27959	27968	0 %	0 %	40 %	60 %	294505842
662	NC_014032	CTCGGG	2	12	28029	28040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294505842
663	NC_014032	GCG	2	6	28084	28089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505842
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678	NC_014032	GAG	2	6	28562	28567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
679	NC_014032	GAA	2	6	28572	28577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_014032	G	7	7	28619	28625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
682	NC_014032	CGA	2	6	28654	28659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_014032	GTCC	2	8	28696	28703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
684	NC_014032	C	6	6	28702	28707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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741	NC_014032	CGGG	2	8	30922	30929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
742	NC_014032	GCC	2	6	30948	30953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
743	NC_014032	CAA	2	6	31106	31111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505846
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746	NC_014032	CGT	2	6	31253	31258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505846
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750	NC_014032	G	6	6	31385	31390	0 %	0 %	100 %	0 %	294505846
751	NC_014032	GTA	2	6	31401	31406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505846
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755	NC_014032	AG	3	6	31572	31577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
756	NC_014032	GAG	2	6	31668	31673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505847
757	NC_014032	GTT	2	6	31683	31688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294505847
758	NC_014032	ACG	2	6	31708	31713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505847
759	NC_014032	CGAT	2	8	31774	31781	25 %	25 %	25 %	25 %	294505847
760	NC_014032	CCT	2	6	31784	31789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505847
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762	NC_014032	TCC	2	6	31825	31830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505847
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765	NC_014032	TGCCGG	2	12	31940	31951	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294505847
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771	NC_014032	GCC	2	6	32184	32189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505847
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778	NC_014032	GAC	2	6	32424	32429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_014032	GGC	2	6	32459	32464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_014032	GC	3	6	32483	32488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
781	NC_014032	TGG	2	6	32496	32501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
782	NC_014032	CGA	2	6	32534	32539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
783	NC_014032	CGT	2	6	32607	32612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505848
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875	NC_014032	GGA	2	6	35623	35628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
876	NC_014032	GTG	2	6	35646	35651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
877	NC_014032	CCG	2	6	35696	35701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
878	NC_014032	G	9	9	35857	35865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
879	NC_014032	CCG	2	6	35882	35887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
880	NC_014032	G	7	7	35916	35922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
881	NC_014032	CTGA	2	8	35948	35955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
882	NC_014032	CCA	2	6	36012	36017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505852
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884	NC_014032	ACGGCC	2	12	36136	36147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294505852
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999	NC_014032	CCG	2	6	40298	40303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505857
1000	NC_014032	GCC	2	6	40328	40333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505857

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