MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 89433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014032	CGG	2	6	244440	244445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506013
6002	NC_014032	AG	4	8	244490	244497	50 %	0 %	50 %	0 %	294506013
6003	NC_014032	GTC	2	6	244501	244506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506013
6004	NC_014032	CGT	2	6	244515	244520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506013
6005	NC_014032	CGT	2	6	244539	244544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506013
6006	NC_014032	GCG	2	6	244618	244623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506013
6007	NC_014032	CCG	2	6	244647	244652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506013
6008	NC_014032	AGC	2	6	244700	244705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506013
6009	NC_014032	C	6	6	244717	244722	0 %	0 %	0 %	100 %	294506013
6010	NC_014032	CGG	2	6	244733	244738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506013
6011	NC_014032	TTG	2	6	244748	244753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294506013
6012	NC_014032	ACC	2	6	244763	244768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506013
6013	NC_014032	CCG	2	6	244781	244786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506013
6014	NC_014032	GAA	2	6	244852	244857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506013
6015	NC_014032	GAA	2	6	244861	244866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506013
6016	NC_014032	TGGGT	2	10	244868	244877	0 %	40 %	60 %	0 %	294506013
6017	NC_014032	GTG	2	6	244886	244891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506013
6018	NC_014032	CGC	2	6	244926	244931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506013
6019	NC_014032	AGT	2	6	244950	244955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506013
6020	NC_014032	AGC	2	6	244979	244984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506013
6021	NC_014032	CTC	2	6	245071	245076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506013
6022	NC_014032	ACG	2	6	245096	245101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506013
6023	NC_014032	CCT	2	6	245103	245108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506013
6024	NC_014032	CGCC	2	8	245109	245116	0 %	0 %	25 %	75 %	294506013
6025	NC_014032	CGCC	2	8	245118	245125	0 %	0 %	25 %	75 %	294506013
6026	NC_014032	GC	3	6	245149	245154	0 %	0 %	50 %	50 %	294506013
6027	NC_014032	GCCG	2	8	245158	245165	0 %	0 %	50 %	50 %	294506013
6028	NC_014032	TCT	2	6	245175	245180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294506013
6029	NC_014032	CGG	2	6	245229	245234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506013
6030	NC_014032	GTA	2	6	245251	245256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506013
6031	NC_014032	TGG	2	6	245268	245273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506013
6032	NC_014032	CGG	2	6	245379	245384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506013
6033	NC_014032	GGC	2	6	245510	245515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014032	CGG	3	9	245521	245529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_014032	CGG	2	6	245594	245599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_014032	CT	3	6	245618	245623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_014032	CGG	2	6	245631	245636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_014032	GCT	2	6	245639	245644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014032	TCCC	2	8	245655	245662	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6040	NC_014032	CGC	2	6	245874	245879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_014032	AGG	2	6	245923	245928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506014
6042	NC_014032	C	6	6	245931	245936	0 %	0 %	0 %	100 %	294506014
6043	NC_014032	GAA	2	6	245953	245958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506014
6044	NC_014032	CGT	2	6	246019	246024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6045	NC_014032	GCA	3	9	246052	246060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6046	NC_014032	CCG	2	6	246091	246096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506014
6047	NC_014032	AG	3	6	246113	246118	50 %	0 %	50 %	0 %	294506014
6048	NC_014032	CGT	2	6	246167	246172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6049	NC_014032	TGG	2	6	246241	246246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506014
6050	NC_014032	TGG	2	6	246319	246324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506014
6051	NC_014032	AGA	2	6	246412	246417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506014
6052	NC_014032	TC	3	6	246418	246423	0 %	50 %	0 %	50 %	294506014
6053	NC_014032	GACC	2	8	246491	246498	25 %	0 %	25 %	50 %	294506014
6054	NC_014032	GTT	2	6	246530	246535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294506014
6055	NC_014032	GAA	2	6	246565	246570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506014
6056	NC_014032	CGT	2	6	246643	246648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6057	NC_014032	CGT	2	6	246665	246670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6058	NC_014032	TCC	2	6	246724	246729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506014
6059	NC_014032	TCA	2	6	246745	246750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294506014
6060	NC_014032	GGCG	2	8	246763	246770	0 %	0 %	75 %	25 %	294506014
6061	NC_014032	GCT	2	6	246795	246800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6062	NC_014032	GAT	2	6	246824	246829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506014
6063	NC_014032	CCT	2	6	246841	246846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506014
6064	NC_014032	GAG	2	6	246859	246864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506014
6065	NC_014032	GCA	2	6	246927	246932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506014
6066	NC_014032	CTA	2	6	246965	246970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014032	AAC	2	6	246994	246999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_014032	GCC	2	6	247002	247007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_014032	GCC	2	6	247024	247029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_014032	AGCCA	2	10	247127	247136	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6071	NC_014032	TCG	2	6	247142	247147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_014032	CCA	2	6	247149	247154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_014032	TTCT	2	8	247195	247202	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_014032	AGGC	2	8	247249	247256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_014032	GA	3	6	247300	247305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_014032	CGTA	2	8	247356	247363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_014032	CGGG	2	8	247409	247416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_014032	CTG	2	6	247549	247554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_014032	TCG	3	9	247677	247685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_014032	CTGACG	2	12	247688	247699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014032	GAC	2	6	247756	247761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_014032	CTT	2	6	247823	247828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294506015
6083	NC_014032	CTAC	2	8	247849	247856	25 %	25 %	0 %	50 %	294506015
6084	NC_014032	TGG	2	6	247878	247883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506015
6085	NC_014032	CTT	2	6	247901	247906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294506015
6086	NC_014032	GTG	2	6	247916	247921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506015
6087	NC_014032	GAA	2	6	247940	247945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506015
6088	NC_014032	GAAG	2	8	248029	248036	50 %	0 %	50 %	0 %	294506015
6089	NC_014032	ACGCG	2	10	248041	248050	20 %	0 %	40 %	40 %	294506015
6090	NC_014032	GAC	2	6	248054	248059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6091	NC_014032	GTC	2	6	248102	248107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6092	NC_014032	CGGG	2	8	248110	248117	0 %	0 %	75 %	25 %	294506015
6093	NC_014032	TCCG	2	8	248220	248227	0 %	25 %	25 %	50 %	294506015
6094	NC_014032	GAA	2	6	248250	248255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506015
6095	NC_014032	GCCGAG	2	12	248285	248296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294506015
6096	NC_014032	CGGA	2	8	248313	248320	25 %	0 %	50 %	25 %	294506015
6097	NC_014032	AAGCGG	2	12	248402	248413	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294506015
6098	NC_014032	GAG	2	6	248417	248422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506015
6099	NC_014032	CGA	2	6	248503	248508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6100	NC_014032	G	6	6	248555	248560	0 %	0 %	100 %	0 %	294506015
6101	NC_014032	GAT	2	6	248603	248608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506015
6102	NC_014032	GGA	2	6	248623	248628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506015
6103	NC_014032	AGCA	2	8	248634	248641	50 %	0 %	25 %	25 %	294506015
6104	NC_014032	GGT	2	6	248690	248695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506015
6105	NC_014032	AAG	2	6	248792	248797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506015
6106	NC_014032	AAAG	2	8	248822	248829	75 %	0 %	25 %	0 %	294506015
6107	NC_014032	AGG	2	6	248835	248840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506015
6108	NC_014032	CCA	2	6	248964	248969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506015
6109	NC_014032	TC	3	6	249022	249027	0 %	50 %	0 %	50 %	294506015
6110	NC_014032	GAG	2	6	249062	249067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506015
6111	NC_014032	GTC	2	6	249083	249088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6112	NC_014032	GAC	2	6	249113	249118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6113	NC_014032	CGG	2	6	249243	249248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506015
6114	NC_014032	CCT	2	6	249268	249273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506015
6115	NC_014032	CGA	2	6	249436	249441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6116	NC_014032	CGA	2	6	249514	249519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6117	NC_014032	CGA	2	6	249535	249540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506015
6118	NC_014032	G	8	8	249557	249564	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014032	CGCTC	2	10	249749	249758	0 %	20 %	20 %	60 %	294506016
6120	NC_014032	GCT	2	6	249780	249785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506016
6121	NC_014032	GAA	2	6	249822	249827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294506016
6122	NC_014032	CGG	2	6	249832	249837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506016
6123	NC_014032	CCG	2	6	249907	249912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506016
6124	NC_014032	GGA	2	6	250001	250006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506016
6125	NC_014032	AAACGA	2	12	250032	250043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294506016
6126	NC_014032	CCA	2	6	250047	250052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506016
6127	NC_014032	GAG	2	6	250065	250070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506016
6128	NC_014032	GGC	2	6	250080	250085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506016
6129	NC_014032	GCCAGT	2	12	250100	250111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294506016
6130	NC_014032	CCG	2	6	250119	250124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506016
6131	NC_014032	GGTC	2	8	250157	250164	0 %	25 %	50 %	25 %	294506016
6132	NC_014032	AGGCCG	2	12	250165	250176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294506016
6133	NC_014032	CGC	2	6	250311	250316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_014032	GCT	2	6	250325	250330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_014032	CGGT	2	8	250460	250467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6136	NC_014032	AGCG	2	8	250468	250475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6137	NC_014032	AGCG	2	8	250484	250491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6138	NC_014032	G	6	6	250504	250509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_014032	G	6	6	250556	250561	0 %	0 %	100 %	0 %	294506017
6140	NC_014032	ACG	2	6	250631	250636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506017
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6142	NC_014032	AAAG	2	8	250898	250905	75 %	0 %	25 %	0 %	294506018
6143	NC_014032	CGC	2	6	251179	251184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506019
6144	NC_014032	GAC	2	6	251190	251195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506019
6145	NC_014032	CGAC	3	12	251192	251203	25 %	0 %	25 %	50 %	294506019
6146	NC_014032	CGA	2	6	251244	251249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506019
6147	NC_014032	TGG	2	6	251279	251284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506019
6148	NC_014032	CGT	2	6	251308	251313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_014032	GC	3	6	251337	251342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6150	NC_014032	GCCTG	2	10	251365	251374	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6151	NC_014032	CCA	2	6	251392	251397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6152	NC_014032	TGC	2	6	251426	251431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6153	NC_014032	GGC	2	6	251435	251440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6154	NC_014032	CCG	2	6	251498	251503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6155	NC_014032	CG	3	6	251585	251590	0 %	0 %	50 %	50 %	294506020
6156	NC_014032	GAC	2	6	251596	251601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506020
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6163	NC_014032	CGG	2	6	251946	251951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506020
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6173	NC_014032	TCG	2	6	252293	252298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506020
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6175	NC_014032	GCC	2	6	252355	252360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506020
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6177	NC_014032	GCG	2	6	252480	252485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6178	NC_014032	GGGGC	2	10	252531	252540	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6179	NC_014032	C	6	6	252551	252556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6180	NC_014032	ACG	2	6	252598	252603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506021
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6231	NC_014032	CGGG	2	8	254723	254730	0 %	0 %	75 %	25 %	294506021
6232	NC_014032	CGA	2	6	254750	254755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506021
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6246	NC_014032	GGC	2	6	255265	255270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294506021
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6251	NC_014032	CTA	2	6	255515	255520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294506021
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6352	NC_014032	AAAAT	2	10	261260	261269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6353	NC_014032	ATA	3	9	261273	261281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6355	NC_014032	ATT	2	6	261340	261345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6368	NC_014032	GA	5	10	261764	261773	50 %	0 %	50 %	0 %	294506029
6369	NC_014032	GC	3	6	261806	261811	0 %	0 %	50 %	50 %	294506029
6370	NC_014032	GC	3	6	261885	261890	0 %	0 %	50 %	50 %	294506029
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6372	NC_014032	GGA	2	6	261917	261922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506029
6373	NC_014032	A	8	8	261922	261929	100 %	0 %	0 %	0 %	294506029
6374	NC_014032	TGG	2	6	261933	261938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506029
6375	NC_014032	CAT	2	6	262010	262015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294506029
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6377	NC_014032	GGA	2	6	262055	262060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294506029
6378	NC_014032	GCT	2	6	262109	262114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506029
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6381	NC_014032	ATA	2	6	262329	262334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294506029
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6392	NC_014032	AGC	2	6	262882	262887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506030
6393	NC_014032	G	6	6	262940	262945	0 %	0 %	100 %	0 %	294506030
6394	NC_014032	ACC	2	6	262958	262963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506030
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6400	NC_014032	TCG	2	6	263257	263262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506030
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6402	NC_014032	GCAG	2	8	263352	263359	25 %	0 %	50 %	25 %	294506030
6403	NC_014032	GCA	2	6	263375	263380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506030
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6405	NC_014032	GA	3	6	263452	263457	50 %	0 %	50 %	0 %	294506030
6406	NC_014032	CTCA	2	8	263499	263506	25 %	25 %	0 %	50 %	294506030
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6411	NC_014032	GC	3	6	263698	263703	0 %	0 %	50 %	50 %	294506030
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6426	NC_014032	GAC	3	9	264389	264397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294506030
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6435	NC_014032	CGA	2	6	265064	265069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6436	NC_014032	CGC	2	6	265102	265107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6437	NC_014032	CCT	2	6	265159	265164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6441	NC_014032	GCC	2	6	265290	265295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6442	NC_014032	CGG	2	6	265322	265327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6443	NC_014032	GCC	2	6	265459	265464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6444	NC_014032	GACCG	2	10	265494	265503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6445	NC_014032	TCGG	2	8	265643	265650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6446	NC_014032	TTC	2	6	265670	265675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6447	NC_014032	TGA	2	6	265683	265688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294506031
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6453	NC_014032	ACA	2	6	266059	266064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6454	NC_014032	CTGAC	2	10	266146	266155	20 %	20 %	20 %	40 %	294506032
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6481	NC_014032	CCG	2	6	267179	267184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506034
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6483	NC_014032	TGG	2	6	267256	267261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294506034
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6487	NC_014032	CCTC	2	8	267503	267510	0 %	25 %	0 %	75 %	294506034
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6494	NC_014032	CCG	2	6	267788	267793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294506034
6495	NC_014032	GATC	2	8	267803	267810	25 %	25 %	25 %	25 %	294506034
6496	NC_014032	CCT	2	6	267848	267853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506034
6497	NC_014032	CCT	2	6	267866	267871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294506034
6498	NC_014032	T	6	6	267939	267944	0 %	100 %	0 %	0 %	294506034
6499	NC_014032	TGC	2	6	267994	267999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294506034
6500	NC_014032	CAC	2	6	268066	268071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294506034

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