MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 89433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014032	CGG	2	6	182662	182667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4502	NC_014032	CCA	2	6	182704	182709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505963
4503	NC_014032	CCCG	2	8	182757	182764	0 %	0 %	25 %	75 %	294505963
4504	NC_014032	CGG	2	6	182792	182797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4505	NC_014032	CGT	2	6	182808	182813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505963
4506	NC_014032	CCCG	2	8	182862	182869	0 %	0 %	25 %	75 %	294505963
4507	NC_014032	CGAAA	2	10	182908	182917	60 %	0 %	20 %	20 %	294505963
4508	NC_014032	CCG	2	6	182988	182993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505963
4509	NC_014032	TGG	2	6	183043	183048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505963
4510	NC_014032	G	6	6	183120	183125	0 %	0 %	100 %	0 %	294505963
4511	NC_014032	GAC	2	6	183163	183168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505963
4512	NC_014032	GGC	2	6	183180	183185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4513	NC_014032	CTG	2	6	183226	183231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505963
4514	NC_014032	GGC	2	6	183234	183239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4515	NC_014032	ACG	2	6	183269	183274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505963
4516	NC_014032	CGG	2	6	183296	183301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4517	NC_014032	CGG	2	6	183313	183318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4518	NC_014032	CGG	2	6	183358	183363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505963
4519	NC_014032	CGC	2	6	183375	183380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505963
4520	NC_014032	CGCCGA	2	12	183426	183437	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294505963
4521	NC_014032	GAG	2	6	183454	183459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505963
4522	NC_014032	CAG	2	6	183494	183499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_014032	AAG	2	6	183508	183513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_014032	GGA	2	6	183614	183619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505964
4525	NC_014032	CTT	2	6	183662	183667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505964
4526	NC_014032	CTT	2	6	183711	183716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505964
4527	NC_014032	TGTC	2	8	183750	183757	0 %	50 %	25 %	25 %	294505964
4528	NC_014032	GCC	2	6	183836	183841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_014032	GAT	2	6	183892	183897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_014032	GCCT	2	8	183936	183943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_014032	GGC	2	6	183949	183954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_014032	CGCTCT	2	12	184002	184013	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294505965
4533	NC_014032	CCT	2	6	184050	184055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505965
4534	NC_014032	GCC	2	6	184081	184086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4535	NC_014032	CAT	2	6	184149	184154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505965
4536	NC_014032	CGA	2	6	184158	184163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505965
4537	NC_014032	GCCG	2	8	184183	184190	0 %	0 %	50 %	50 %	294505965
4538	NC_014032	CGC	2	6	184198	184203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4539	NC_014032	GATC	2	8	184215	184222	25 %	25 %	25 %	25 %	294505965
4540	NC_014032	GGA	2	6	184230	184235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505965
4541	NC_014032	GCT	2	6	184248	184253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505965
4542	NC_014032	GGC	2	6	184257	184262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505965
4543	NC_014032	GAG	2	6	184298	184303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505965
4544	NC_014032	CCG	2	6	184347	184352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4545	NC_014032	AATCG	2	10	184391	184400	40 %	20 %	20 %	20 %	294505965
4546	NC_014032	GTC	2	6	184408	184413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505965
4547	NC_014032	GGGCCA	2	12	184437	184448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294505965
4548	NC_014032	TGA	2	6	184458	184463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505965
4549	NC_014032	GCCCCG	2	12	184538	184549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4550	NC_014032	CCT	2	6	184560	184565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505965
4551	NC_014032	CGC	2	6	184566	184571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4552	NC_014032	TCG	2	6	184604	184609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505965
4553	NC_014032	CCA	2	6	184758	184763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505965
4554	NC_014032	CCT	3	9	184767	184775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505965
4555	NC_014032	GAG	2	6	184797	184802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505965
4556	NC_014032	CAAAA	2	10	184812	184821	80 %	0 %	0 %	20 %	294505965
4557	NC_014032	CCG	2	6	184899	184904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4558	NC_014032	CAG	2	6	184936	184941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505965
4559	NC_014032	CTC	2	6	184942	184947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505965
4560	NC_014032	GGT	2	6	185013	185018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505965
4561	NC_014032	T	6	6	185037	185042	0 %	100 %	0 %	0 %	294505965
4562	NC_014032	CTT	2	6	185049	185054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505965
4563	NC_014032	CTC	2	6	185068	185073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505965
4564	NC_014032	CGA	2	6	185074	185079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505965
4565	NC_014032	GCG	2	6	185108	185113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505965
4566	NC_014032	GCC	2	6	185163	185168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505965
4567	NC_014032	GGC	2	6	185184	185189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505965
4568	NC_014032	T	6	6	185193	185198	0 %	100 %	0 %	0 %	294505965
4569	NC_014032	AG	3	6	185339	185344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014032	AGG	2	6	185380	185385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_014032	CGCC	2	8	185386	185393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4572	NC_014032	TTC	2	6	185404	185409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_014032	G	6	6	185429	185434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014032	GTCG	2	8	185448	185455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_014032	CAA	2	6	185510	185515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505966
4576	NC_014032	CCA	2	6	185518	185523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505966
4577	NC_014032	ACG	2	6	185538	185543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505966
4578	NC_014032	GCCCC	2	10	185545	185554	0 %	0 %	20 %	80 %	294505966
4579	NC_014032	ATC	2	6	185562	185567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505966
4580	NC_014032	CGTTC	2	10	185617	185626	0 %	40 %	20 %	40 %	294505966
4581	NC_014032	CGT	2	6	185656	185661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505966
4582	NC_014032	CAT	2	6	185678	185683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505966
4583	NC_014032	TTC	2	6	185684	185689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505966
4584	NC_014032	CGGTC	2	10	185746	185755	0 %	20 %	40 %	40 %	294505966
4585	NC_014032	CTT	2	6	185759	185764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505966
4586	NC_014032	CCT	2	6	185785	185790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505966
4587	NC_014032	GTC	2	6	185807	185812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505966
4588	NC_014032	CTC	2	6	185828	185833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505966
4589	NC_014032	CTT	2	6	185867	185872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505966
4590	NC_014032	AAG	2	6	185883	185888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505966
4591	NC_014032	TCT	2	6	186004	186009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505966
4592	NC_014032	CTT	2	6	186053	186058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505966
4593	NC_014032	CGG	2	6	186071	186076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505966
4594	NC_014032	CCT	2	6	186199	186204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505966
4595	NC_014032	TCA	2	6	186208	186213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505966
4596	NC_014032	CGA	2	6	186226	186231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505966
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4600	NC_014032	CGGA	2	8	186492	186499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_014032	GGT	2	6	186509	186514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014032	G	7	7	186526	186532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014032	ACGA	2	8	186649	186656	50 %	0 %	25 %	25 %	294505967
4604	NC_014032	GGAT	2	8	186666	186673	25 %	25 %	50 %	0 %	294505967
4605	NC_014032	GTC	2	6	186691	186696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505967
4606	NC_014032	G	6	6	186708	186713	0 %	0 %	100 %	0 %	294505967
4607	NC_014032	TTC	2	6	186716	186721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505967
4608	NC_014032	CAT	2	6	186746	186751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014032	ACT	2	6	186756	186761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_014032	TGT	2	6	186773	186778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014032	TCC	2	6	186789	186794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_014032	CGTGG	2	10	186810	186819	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4613	NC_014032	GGTGC	2	10	186825	186834	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4614	NC_014032	GAG	2	6	186919	186924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014032	TGG	2	6	187028	187033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014032	CGG	2	6	187070	187075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_014032	GCC	2	6	187112	187117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_014032	GC	3	6	187163	187168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_014032	CCG	2	6	187214	187219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_014032	GTC	2	6	187261	187266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_014032	GCCT	2	8	187272	187279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_014032	GCC	2	6	187287	187292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_014032	GGAGC	2	10	187385	187394	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4624	NC_014032	TCC	2	6	187411	187416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_014032	TTC	2	6	187429	187434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_014032	CGA	2	6	187448	187453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505968
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4746	NC_014032	CATTGC	2	12	192326	192337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4747	NC_014032	TCT	2	6	192345	192350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4748	NC_014032	GAT	2	6	192416	192421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_014032	TCG	2	6	192659	192664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4754	NC_014032	GAGT	2	8	192867	192874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_014032	TGGCC	2	10	192919	192928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4860	NC_014032	GCAC	2	8	197023	197030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4861	NC_014032	CTGC	2	8	197041	197048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4862	NC_014032	GAA	2	6	197070	197075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4864	NC_014032	AGC	2	6	197150	197155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4866	NC_014032	G	6	6	197212	197217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4867	NC_014032	T	6	6	197234	197239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4868	NC_014032	GGA	2	6	197318	197323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4869	NC_014032	TGG	2	6	197470	197475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505975
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4873	NC_014032	CTC	2	6	197714	197719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505975
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4878	NC_014032	GCA	2	6	197916	197921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505975
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4885	NC_014032	AAAG	2	8	198191	198198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4894	NC_014032	C	6	6	198500	198505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4996	NC_014032	CGA	3	9	202949	202957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505980
4997	NC_014032	CGT	2	6	203050	203055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505980
4998	NC_014032	TCCG	2	8	203072	203079	0 %	25 %	25 %	50 %	294505980
4999	NC_014032	TCC	2	6	203221	203226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505980
5000	NC_014032	CCT	2	6	203230	203235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505980

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