MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 2

Total Repeats: 17876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014013	CGG	2	6	55079	55084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146484
1502	NC_014013	GCC	3	9	55111	55119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146484
1503	NC_014013	CCCT	2	8	55205	55212	0 %	25 %	0 %	75 %	294146484
1504	NC_014013	GC	3	6	55213	55218	0 %	0 %	50 %	50 %	294146484
1505	NC_014013	GAT	2	6	55276	55281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146484
1506	NC_014013	TGC	2	6	55296	55301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146484
1507	NC_014013	GCG	2	6	55337	55342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146484
1508	NC_014013	GCG	2	6	55349	55354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146484
1509	NC_014013	GGC	2	6	55357	55362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146484
1510	NC_014013	TGC	2	6	55380	55385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146484
1511	NC_014013	CGG	3	9	55395	55403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146484
1512	NC_014013	CATG	2	8	55468	55475	25 %	25 %	25 %	25 %	294146484
1513	NC_014013	GCGG	2	8	55501	55508	0 %	0 %	75 %	25 %	294146484
1514	NC_014013	CGG	3	9	55506	55514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146484
1515	NC_014013	G	6	6	55536	55541	0 %	0 %	100 %	0 %	294146484
1516	NC_014013	GAGG	2	8	55561	55568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014013	GGA	2	6	55574	55579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014013	CCA	2	6	55610	55615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_014013	GGA	2	6	55654	55659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014013	TGG	2	6	55712	55717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146485
1521	NC_014013	GGTCG	2	10	55797	55806	0 %	20 %	60 %	20 %	294146485
1522	NC_014013	CTG	2	6	55918	55923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146485
1523	NC_014013	CGG	2	6	56008	56013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146485
1524	NC_014013	GGC	2	6	56058	56063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146485
1525	NC_014013	GCGG	2	8	56127	56134	0 %	0 %	75 %	25 %	294146485
1526	NC_014013	GCG	2	6	56226	56231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146485
1527	NC_014013	GAG	2	6	56236	56241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146485
1528	NC_014013	GCC	2	6	56271	56276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146485
1529	NC_014013	GGA	2	6	56326	56331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014013	CCA	2	6	56369	56374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_014013	GGA	2	6	56413	56418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014013	GCA	2	6	56445	56450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146486
1533	NC_014013	G	6	6	56520	56525	0 %	0 %	100 %	0 %	294146486
1534	NC_014013	GGCGAC	2	12	56563	56574	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294146486
1535	NC_014013	GCC	2	6	56602	56607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146486
1536	NC_014013	CCT	2	6	56715	56720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146486
1537	NC_014013	GGCGG	2	10	56722	56731	0 %	0 %	80 %	20 %	294146486
1538	NC_014013	GCGG	2	8	56765	56772	0 %	0 %	75 %	25 %	294146486
1539	NC_014013	GCA	2	6	56796	56801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146486
1540	NC_014013	CGCC	2	8	56835	56842	0 %	0 %	25 %	75 %	294146486
1541	NC_014013	GGC	2	6	56847	56852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146486
1542	NC_014013	CGA	2	6	56928	56933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146486
1543	NC_014013	GC	3	6	56956	56961	0 %	0 %	50 %	50 %	294146486
1544	NC_014013	TCC	3	9	56975	56983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146486
1545	NC_014013	CAG	2	6	56986	56991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146486
1546	NC_014013	CGCC	2	8	57051	57058	0 %	0 %	25 %	75 %	294146486
1547	NC_014013	GCG	2	6	57068	57073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146486
1548	NC_014013	GCTG	2	8	57163	57170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_014013	CGA	2	6	57194	57199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1550	NC_014013	GCC	2	6	57208	57213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146487
1551	NC_014013	CGG	2	6	57218	57223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1552	NC_014013	GGT	2	6	57231	57236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146487
1553	NC_014013	CTT	2	6	57318	57323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146487
1554	NC_014013	G	6	6	57362	57367	0 %	0 %	100 %	0 %	294146487
1555	NC_014013	CAT	2	6	57402	57407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146487
1556	NC_014013	TGA	2	6	57455	57460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146487
1557	NC_014013	TCA	2	6	57479	57484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146487
1558	NC_014013	CGG	2	6	57505	57510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1559	NC_014013	TTG	2	6	57550	57555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294146487
1560	NC_014013	CAG	2	6	57582	57587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1561	NC_014013	CTT	2	6	57615	57620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146487
1562	NC_014013	CCA	2	6	57623	57628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146487
1563	NC_014013	CGG	2	6	57680	57685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1564	NC_014013	GTCG	2	8	57726	57733	0 %	25 %	50 %	25 %	294146487
1565	NC_014013	GCA	2	6	57773	57778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1566	NC_014013	CGC	2	6	57783	57788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146487
1567	NC_014013	GCC	2	6	57825	57830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146487
1568	NC_014013	GC	3	6	57833	57838	0 %	0 %	50 %	50 %	294146487
1569	NC_014013	CGGT	2	8	57871	57878	0 %	25 %	50 %	25 %	294146487
1570	NC_014013	CGC	2	6	57921	57926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146487
1571	NC_014013	GTTGAC	2	12	57942	57953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294146487
1572	NC_014013	GCT	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1573	NC_014013	GGC	2	6	58016	58021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1574	NC_014013	GCA	2	6	58025	58030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1575	NC_014013	CGG	2	6	58073	58078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1576	NC_014013	CGC	2	6	58112	58117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146487
1577	NC_014013	CGG	2	6	58169	58174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1578	NC_014013	ATCGGG	2	12	58465	58476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294146487
1579	NC_014013	ATGCCG	2	12	58489	58500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1580	NC_014013	GGC	2	6	58625	58630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1581	NC_014013	GC	3	6	58653	58658	0 %	0 %	50 %	50 %	294146487
1582	NC_014013	CGG	2	6	58682	58687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1583	NC_014013	CGA	2	6	58742	58747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1584	NC_014013	GAA	2	6	58770	58775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294146487
1585	NC_014013	CAG	2	6	58833	58838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1586	NC_014013	CTG	2	6	58876	58881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1587	NC_014013	GGC	2	6	58893	58898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1588	NC_014013	ATC	2	6	58915	58920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146487
1589	NC_014013	GGC	2	6	58937	58942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146487
1590	NC_014013	CGT	2	6	58961	58966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1591	NC_014013	TGA	2	6	58982	58987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146487
1592	NC_014013	GCA	2	6	58991	58996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1593	NC_014013	TCC	2	6	59035	59040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146487
1594	NC_014013	GTC	2	6	59070	59075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146487
1595	NC_014013	TCT	2	6	59133	59138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_014013	GGA	2	6	59180	59185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014013	CTT	3	9	59212	59220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146488
1598	NC_014013	CGC	2	6	59232	59237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146488
1599	NC_014013	GGT	3	9	59275	59283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146488
1600	NC_014013	AGC	2	6	59352	59357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1601	NC_014013	CTC	2	6	59392	59397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146488
1602	NC_014013	TCG	3	9	59420	59428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1603	NC_014013	CAG	2	6	59434	59439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1604	NC_014013	TCC	2	6	59468	59473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294146488
1605	NC_014013	CGT	2	6	59499	59504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1606	NC_014013	AT	3	6	59513	59518	50 %	50 %	0 %	0 %	294146488
1607	NC_014013	TGGC	2	8	59639	59646	0 %	25 %	50 %	25 %	294146488
1608	NC_014013	TCG	2	6	59690	59695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1609	NC_014013	CGG	2	6	59696	59701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146488
1610	NC_014013	GCC	2	6	59704	59709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146488
1611	NC_014013	CAG	2	6	59839	59844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1612	NC_014013	GGT	2	6	59905	59910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146488
1613	NC_014013	GCA	2	6	59919	59924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1614	NC_014013	GCG	3	9	59934	59942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146488
1615	NC_014013	GC	3	6	59959	59964	0 %	0 %	50 %	50 %	294146488
1616	NC_014013	GCA	2	6	59970	59975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146488
1617	NC_014013	CCG	2	6	59979	59984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146488
1618	NC_014013	CCA	2	6	60030	60035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146488
1619	NC_014013	GGGA	2	8	60146	60153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014013	GGA	2	6	60170	60175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014013	GAC	2	6	60199	60204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_014013	ATT	2	6	60210	60215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014013	GGC	2	6	60216	60221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_014013	GGC	2	6	60291	60296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146489
1625	NC_014013	GCCGG	2	10	60352	60361	0 %	0 %	60 %	40 %	294146489
1626	NC_014013	CGG	2	6	60424	60429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146489
1627	NC_014013	GCG	2	6	60481	60486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146489
1628	NC_014013	CGGT	2	8	60538	60545	0 %	25 %	50 %	25 %	294146489
1629	NC_014013	GCGG	3	12	60589	60600	0 %	0 %	75 %	25 %	294146489
1630	NC_014013	CGG	2	6	60611	60616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146489
1631	NC_014013	GC	3	6	60620	60625	0 %	0 %	50 %	50 %	294146489
1632	NC_014013	TCG	2	6	60671	60676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146489
1633	NC_014013	GTC	2	6	60699	60704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146489
1634	NC_014013	GGC	2	6	60725	60730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146489
1635	NC_014013	GCTG	2	8	60740	60747	0 %	25 %	50 %	25 %	294146489
1636	NC_014013	TCG	2	6	60770	60775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146489
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1642	NC_014013	CTG	2	6	61087	61092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146489
1643	NC_014013	GGC	2	6	61146	61151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146489
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1646	NC_014013	TGGCTT	2	12	61265	61276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294146489
1647	NC_014013	ATC	2	6	61348	61353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1648	NC_014013	TCT	2	6	61426	61431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146490
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1651	NC_014013	GCG	2	6	61548	61553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146490
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1655	NC_014013	CCG	2	6	61634	61639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146491
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1659	NC_014013	GAT	2	6	61815	61820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146491
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1664	NC_014013	GCCT	2	8	61905	61912	0 %	25 %	25 %	50 %	294146491
1665	NC_014013	GCCCAG	2	12	61962	61973	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294146491
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1675	NC_014013	ATGGCG	2	12	62242	62253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294146491
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1681	NC_014013	GGC	2	6	62483	62488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146491
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1685	NC_014013	GCC	3	9	62592	62600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146491
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1696	NC_014013	GAA	2	6	62957	62962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1697	NC_014013	AGCG	2	8	63050	63057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1698	NC_014013	CGCA	2	8	63058	63065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1699	NC_014013	TCG	2	6	63095	63100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1700	NC_014013	GCGG	2	8	63133	63140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1701	NC_014013	CGGAC	2	10	63154	63163	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1702	NC_014013	TCCC	2	8	63166	63173	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1703	NC_014013	CTT	2	6	63196	63201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1706	NC_014013	TGAA	2	8	63470	63477	50 %	25 %	25 %	0 %	294146492
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1714	NC_014013	TGA	2	6	63661	63666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146493
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1720	NC_014013	TTC	2	6	63915	63920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146493
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1722	NC_014013	CGG	2	6	64019	64024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146493
1723	NC_014013	ACA	2	6	64042	64047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294146493
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1732	NC_014013	GC	3	6	64853	64858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1733	NC_014013	CGG	3	9	64859	64867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1734	NC_014013	CGC	2	6	64878	64883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1735	NC_014013	GGCG	2	8	64950	64957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1736	NC_014013	CTG	2	6	64960	64965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1737	NC_014013	GGC	2	6	65007	65012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1738	NC_014013	ACA	2	6	65096	65101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1739	NC_014013	CTG	2	6	65139	65144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146494
1740	NC_014013	GCC	2	6	65151	65156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146494
1741	NC_014013	CTG	2	6	65179	65184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146494
1742	NC_014013	GGC	2	6	65186	65191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146494
1743	NC_014013	CAT	2	6	65222	65227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146494
1744	NC_014013	TGC	2	6	65257	65262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146494
1745	NC_014013	GAAGGT	2	12	65279	65290	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294146494
1746	NC_014013	CGA	2	6	65291	65296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146494
1747	NC_014013	CGAC	2	8	65332	65339	25 %	0 %	25 %	50 %	294146494
1748	NC_014013	CGC	2	6	65360	65365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146494
1749	NC_014013	ACC	2	6	65367	65372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294146494
1750	NC_014013	GCGG	2	8	65386	65393	0 %	0 %	75 %	25 %	294146494
1751	NC_014013	CGG	2	6	65405	65410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146494
1752	NC_014013	TGC	2	6	65437	65442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146494
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