MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 11981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TACT	2	8	787	794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014012	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014012	AGCT	2	8	1291	1298	25 %	25 %	25 %	25 %	294138773
4	NC_014012	TGAG	2	8	1537	1544	25 %	25 %	50 %	0 %	294138774
5	NC_014012	TGCT	2	8	1666	1673	0 %	50 %	25 %	25 %	294138774
6	NC_014012	GAGT	2	8	2501	2508	25 %	25 %	50 %	0 %	294138775
7	NC_014012	CCTG	2	8	3093	3100	0 %	25 %	25 %	50 %	294138775
8	NC_014012	CATG	2	8	3895	3902	25 %	25 %	25 %	25 %	294138776
9	NC_014012	ATCT	2	8	3917	3924	25 %	50 %	0 %	25 %	294138776
10	NC_014012	GCTG	2	8	4091	4098	0 %	25 %	50 %	25 %	294138776
11	NC_014012	ATGT	2	8	4628	4635	25 %	50 %	25 %	0 %	294138776
12	NC_014012	CTGG	2	8	5689	5696	0 %	25 %	50 %	25 %	294138777
13	NC_014012	GTGA	2	8	5794	5801	25 %	25 %	50 %	0 %	294138777
14	NC_014012	GAGT	2	8	6229	6236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014012	GTGA	2	8	6308	6315	25 %	25 %	50 %	0 %	294138778
16	NC_014012	TTGT	2	8	7150	7157	0 %	75 %	25 %	0 %	294138779
17	NC_014012	TTAT	2	8	7228	7235	25 %	75 %	0 %	0 %	294138779
18	NC_014012	TAGT	2	8	7555	7562	25 %	50 %	25 %	0 %	294138780
19	NC_014012	CAGA	2	8	7849	7856	50 %	0 %	25 %	25 %	294138780
20	NC_014012	ATCT	2	8	8043	8050	25 %	50 %	0 %	25 %	294138780
21	NC_014012	CGTC	2	8	8539	8546	0 %	25 %	25 %	50 %	294138781
22	NC_014012	CGTG	2	8	9117	9124	0 %	25 %	50 %	25 %	294138781
23	NC_014012	TTAG	2	8	9379	9386	25 %	50 %	25 %	0 %	294138782
24	NC_014012	AAAC	2	8	9610	9617	75 %	0 %	0 %	25 %	294138782
25	NC_014012	GATC	2	8	10015	10022	25 %	25 %	25 %	25 %	294138782
26	NC_014012	TGAG	2	8	10167	10174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014012	GTTA	2	8	10363	10370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014012	ATTA	2	8	10498	10505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014012	GTTA	2	8	10563	10570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014012	TGTT	2	8	10818	10825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014012	CAGT	2	8	11059	11066	25 %	25 %	25 %	25 %	294138783
32	NC_014012	AGTA	2	8	11148	11155	50 %	25 %	25 %	0 %	294138783
33	NC_014012	TCTG	2	8	11658	11665	0 %	50 %	25 %	25 %	294138784
34	NC_014012	ATCG	2	8	11669	11676	25 %	25 %	25 %	25 %	294138784
35	NC_014012	AGTT	2	8	12042	12049	25 %	50 %	25 %	0 %	294138784
36	NC_014012	ATGA	2	8	12221	12228	50 %	25 %	25 %	0 %	294138784
37	NC_014012	AGTA	2	8	12786	12793	50 %	25 %	25 %	0 %	294138786
38	NC_014012	TTTC	2	8	12799	12806	0 %	75 %	0 %	25 %	294138786
39	NC_014012	CCAT	2	8	13245	13252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014012	CCTA	2	8	13294	13301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014012	AAGT	2	8	13865	13872	50 %	25 %	25 %	0 %	294138788
42	NC_014012	CCAC	2	8	14029	14036	25 %	0 %	0 %	75 %	294138788
43	NC_014012	TCCA	2	8	14188	14195	25 %	25 %	0 %	50 %	294138788
44	NC_014012	GCTT	2	8	14340	14347	0 %	50 %	25 %	25 %	294138788
45	NC_014012	GTCG	2	8	14601	14608	0 %	25 %	50 %	25 %	294138788
46	NC_014012	ACTC	2	8	14914	14921	25 %	25 %	0 %	50 %	294138788
47	NC_014012	AGTA	2	8	16211	16218	50 %	25 %	25 %	0 %	294138788
48	NC_014012	AATA	2	8	16282	16289	75 %	25 %	0 %	0 %	294138788
49	NC_014012	TAGC	2	8	16297	16304	25 %	25 %	25 %	25 %	294138788
50	NC_014012	TTTC	2	8	16416	16423	0 %	75 %	0 %	25 %	294138788
51	NC_014012	CGAG	2	8	16669	16676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014012	ATGC	2	8	16867	16874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014012	GCTA	2	8	17014	17021	25 %	25 %	25 %	25 %	294138789
54	NC_014012	GACT	2	8	17112	17119	25 %	25 %	25 %	25 %	294138789
55	NC_014012	TAGT	2	8	17237	17244	25 %	50 %	25 %	0 %	294138789
56	NC_014012	AGTG	2	8	17517	17524	25 %	25 %	50 %	0 %	294138789
57	NC_014012	GAAT	2	8	17936	17943	50 %	25 %	25 %	0 %	294138789
58	NC_014012	ATGC	2	8	18468	18475	25 %	25 %	25 %	25 %	294138790
59	NC_014012	GTAG	2	8	19075	19082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014012	ATGG	2	8	19125	19132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014012	AAGT	2	8	19302	19309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014012	CAAA	2	8	19743	19750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014012	CTAA	2	8	20058	20065	50 %	25 %	0 %	25 %	294138793
64	NC_014012	TGTC	2	8	20299	20306	0 %	50 %	25 %	25 %	294138793
65	NC_014012	CAGT	2	8	20467	20474	25 %	25 %	25 %	25 %	294138793
66	NC_014012	GCAA	2	8	20812	20819	50 %	0 %	25 %	25 %	294138793
67	NC_014012	CTCA	2	8	20949	20956	25 %	25 %	0 %	50 %	294138793
68	NC_014012	CAAT	2	8	21142	21149	50 %	25 %	0 %	25 %	294138794
69	NC_014012	AGTA	2	8	21830	21837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014012	GAAG	2	8	22354	22361	50 %	0 %	50 %	0 %	294138795
71	NC_014012	TCCT	2	8	22881	22888	0 %	50 %	0 %	50 %	294138795
72	NC_014012	GCCG	2	8	23195	23202	0 %	0 %	50 %	50 %	294138795
73	NC_014012	GATA	2	8	23464	23471	50 %	25 %	25 %	0 %	294138795
74	NC_014012	AAAC	2	8	24029	24036	75 %	0 %	0 %	25 %	294138795
75	NC_014012	GTCG	2	8	24245	24252	0 %	25 %	50 %	25 %	294138795
76	NC_014012	TTTA	2	8	25181	25188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014012	TTTA	2	8	25835	25842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014012	AGAA	2	8	25918	25925	75 %	0 %	25 %	0 %	294138797
79	NC_014012	ATAA	2	8	26364	26371	75 %	25 %	0 %	0 %	294138797
80	NC_014012	ATGT	2	8	26489	26496	25 %	50 %	25 %	0 %	294138797
81	NC_014012	GAGT	2	8	26825	26832	25 %	25 %	50 %	0 %	294138797
82	NC_014012	TCAT	2	8	26913	26920	25 %	50 %	0 %	25 %	294138797
83	NC_014012	ACCA	3	12	27454	27465	50 %	0 %	0 %	50 %	294138798
84	NC_014012	TATT	2	8	29027	29034	25 %	75 %	0 %	0 %	294138799
85	NC_014012	AATG	2	8	29142	29149	50 %	25 %	25 %	0 %	294138799
86	NC_014012	ATTT	2	8	29899	29906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014012	CCTA	2	8	29912	29919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014012	TCAT	2	8	29984	29991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014012	GATC	2	8	30014	30021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014012	ATCT	2	8	30112	30119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014012	ATGG	2	8	30301	30308	25 %	25 %	50 %	0 %	294138802
92	NC_014012	AACC	2	8	31440	31447	50 %	0 %	0 %	50 %	294138802
93	NC_014012	AGTG	2	8	31720	31727	25 %	25 %	50 %	0 %	294138803
94	NC_014012	CAAG	2	8	32002	32009	50 %	0 %	25 %	25 %	294138803
95	NC_014012	TATG	2	8	32683	32690	25 %	50 %	25 %	0 %	294138803
96	NC_014012	ATGG	2	8	32854	32861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014012	CTAT	2	8	33235	33242	25 %	50 %	0 %	25 %	294138804
98	NC_014012	TCTA	2	8	33422	33429	25 %	50 %	0 %	25 %	294138804
99	NC_014012	GGCT	2	8	33614	33621	0 %	25 %	50 %	25 %	294138804
100	NC_014012	GCGG	2	8	34510	34517	0 %	0 %	75 %	25 %	294138805
101	NC_014012	GGGT	2	8	34562	34569	0 %	25 %	75 %	0 %	294138805
102	NC_014012	TTCA	2	8	34939	34946	25 %	50 %	0 %	25 %	294138805
103	NC_014012	AGTC	2	8	37141	37148	25 %	25 %	25 %	25 %	294138806
104	NC_014012	GCCA	2	8	39047	39054	25 %	0 %	25 %	50 %	294138809
105	NC_014012	GAGT	2	8	39299	39306	25 %	25 %	50 %	0 %	294138809
106	NC_014012	TCCA	2	8	39578	39585	25 %	25 %	0 %	50 %	294138810
107	NC_014012	GTAT	2	8	39639	39646	25 %	50 %	25 %	0 %	294138810
108	NC_014012	TTGA	2	8	39791	39798	25 %	50 %	25 %	0 %	294138810
109	NC_014012	TTAC	2	8	40143	40150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014012	TATT	2	8	40730	40737	25 %	75 %	0 %	0 %	294138811
111	NC_014012	TGCT	2	8	41599	41606	0 %	50 %	25 %	25 %	294138812
112	NC_014012	ACCA	2	8	42011	42018	50 %	0 %	0 %	50 %	294138812
113	NC_014012	CAGC	2	8	42034	42041	25 %	0 %	25 %	50 %	294138812
114	NC_014012	AGAT	2	8	42049	42056	50 %	25 %	25 %	0 %	294138812
115	NC_014012	TGCT	2	8	42058	42065	0 %	50 %	25 %	25 %	294138812
116	NC_014012	GCGT	2	8	42146	42153	0 %	25 %	50 %	25 %	294138812
117	NC_014012	ATGC	2	8	42155	42162	25 %	25 %	25 %	25 %	294138812
118	NC_014012	TTTC	2	8	42766	42773	0 %	75 %	0 %	25 %	294138812
119	NC_014012	CGGC	2	8	43080	43087	0 %	0 %	50 %	50 %	294138812
120	NC_014012	GTTG	2	8	43219	43226	0 %	50 %	50 %	0 %	294138812
121	NC_014012	AGCT	2	8	44380	44387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014012	AAGT	2	8	44488	44495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014012	AAAT	2	8	45073	45080	75 %	25 %	0 %	0 %	294138814
124	NC_014012	GAAG	2	8	45140	45147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014012	CTTG	2	8	45617	45624	0 %	50 %	25 %	25 %	294138815
126	NC_014012	TCAT	2	8	45793	45800	25 %	50 %	0 %	25 %	294138815
127	NC_014012	TACA	2	8	45894	45901	50 %	25 %	0 %	25 %	294138815
128	NC_014012	TAGA	2	8	46036	46043	50 %	25 %	25 %	0 %	294138815
129	NC_014012	AGTT	2	8	46751	46758	25 %	50 %	25 %	0 %	294138815
130	NC_014012	GCAC	2	8	46882	46889	25 %	0 %	25 %	50 %	294138815
131	NC_014012	TTTG	2	8	47180	47187	0 %	75 %	25 %	0 %	294138815
132	NC_014012	CTTG	2	8	47609	47616	0 %	50 %	25 %	25 %	294138815
133	NC_014012	AGCT	2	8	47637	47644	25 %	25 %	25 %	25 %	294138815
134	NC_014012	TCTT	2	8	47824	47831	0 %	75 %	0 %	25 %	294138815
135	NC_014012	TCCG	2	8	47901	47908	0 %	25 %	25 %	50 %	294138815
136	NC_014012	GGTC	2	8	47916	47923	0 %	25 %	50 %	25 %	294138815
137	NC_014012	GATA	2	8	48446	48453	50 %	25 %	25 %	0 %	294138815
138	NC_014012	ATTG	2	8	48734	48741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014012	GGAG	2	8	48932	48939	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014012	TCAC	2	8	49827	49834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014012	CTTT	2	8	50414	50421	0 %	75 %	0 %	25 %	294138819
142	NC_014012	ATTG	2	8	50427	50434	25 %	50 %	25 %	0 %	294138819
143	NC_014012	TTGG	2	8	51232	51239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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