MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014012	GAT	2	6	195394	195399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138936
3502	NC_014012	TCG	2	6	195416	195421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138936
3503	NC_014012	AC	3	6	195477	195482	50 %	0 %	0 %	50 %	294138936
3504	NC_014012	ATC	2	6	195526	195531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138936
3505	NC_014012	ATT	2	6	195579	195584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138936
3506	NC_014012	CGT	2	6	195640	195645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138936
3507	NC_014012	TAA	2	6	195702	195707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138936
3508	NC_014012	AAG	2	6	195728	195733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138936
3509	NC_014012	AT	3	6	195741	195746	50 %	50 %	0 %	0 %	294138936
3510	NC_014012	ACA	2	6	195852	195857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138936
3511	NC_014012	GAAG	2	8	195906	195913	50 %	0 %	50 %	0 %	294138936
3512	NC_014012	ATT	2	6	196075	196080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138936
3513	NC_014012	TCG	2	6	196358	196363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138936
3514	NC_014012	GTAC	2	8	196414	196421	25 %	25 %	25 %	25 %	294138936
3515	NC_014012	GA	4	8	196485	196492	50 %	0 %	50 %	0 %	294138936
3516	NC_014012	GCTG	2	8	196500	196507	0 %	25 %	50 %	25 %	294138936
3517	NC_014012	ATTG	2	8	196512	196519	25 %	50 %	25 %	0 %	294138936
3518	NC_014012	AGCTG	2	10	196530	196539	20 %	20 %	40 %	20 %	294138936
3519	NC_014012	GACT	2	8	196544	196551	25 %	25 %	25 %	25 %	294138936
3520	NC_014012	GTG	2	6	196640	196645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
3521	NC_014012	ATG	2	6	196733	196738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138936
3522	NC_014012	GAGTCA	2	12	196740	196751	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294138936
3523	NC_014012	GTG	2	6	196774	196779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
3524	NC_014012	TG	3	6	196786	196791	0 %	50 %	50 %	0 %	294138936
3525	NC_014012	TGGC	2	8	196844	196851	0 %	25 %	50 %	25 %	294138936
3526	NC_014012	TTA	2	6	196924	196929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138936
3527	NC_014012	TGG	2	6	197042	197047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
3528	NC_014012	CGG	2	6	197120	197125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138936
3529	NC_014012	TTA	2	6	197132	197137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138936
3530	NC_014012	GTG	2	6	197207	197212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
3531	NC_014012	AAGG	2	8	197233	197240	50 %	0 %	50 %	0 %	294138936
3532	NC_014012	GTG	2	6	197287	197292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
3533	NC_014012	CCATA	2	10	197391	197400	40 %	20 %	0 %	40 %	294138936
3534	NC_014012	AGCGTA	2	12	197450	197461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294138936
3535	NC_014012	CA	3	6	197567	197572	50 %	0 %	0 %	50 %	294138936
3536	NC_014012	AAGC	2	8	197587	197594	50 %	0 %	25 %	25 %	294138936
3537	NC_014012	A	6	6	197641	197646	100 %	0 %	0 %	0 %	294138936
3538	NC_014012	AGATT	2	10	197679	197688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014012	T	8	8	197717	197724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014012	CTTT	2	8	197765	197772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_014012	ATT	2	6	197794	197799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014012	TAA	2	6	197820	197825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014012	ATA	2	6	197834	197839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014012	CAT	2	6	197870	197875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_014012	T	6	6	197987	197992	0 %	100 %	0 %	0 %	294138937
3546	NC_014012	GTTG	2	8	198154	198161	0 %	50 %	50 %	0 %	294138937
3547	NC_014012	GCC	2	6	198171	198176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138937
3548	NC_014012	T	6	6	198190	198195	0 %	100 %	0 %	0 %	294138937
3549	NC_014012	TATC	2	8	198347	198354	25 %	50 %	0 %	25 %	294138937
3550	NC_014012	AAG	2	6	198358	198363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138937
3551	NC_014012	GGGC	2	8	198380	198387	0 %	0 %	75 %	25 %	294138937
3552	NC_014012	GAT	2	6	198398	198403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
3553	NC_014012	TTA	2	6	198415	198420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138937
3554	NC_014012	TTG	2	6	198433	198438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138937
3555	NC_014012	CTG	2	6	198462	198467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138937
3556	NC_014012	GAT	2	6	198597	198602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
3557	NC_014012	CTT	2	6	198644	198649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138937
3558	NC_014012	ATCA	2	8	198654	198661	50 %	25 %	0 %	25 %	294138937
3559	NC_014012	ATC	2	6	198834	198839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138937
3560	NC_014012	AG	3	6	198845	198850	50 %	0 %	50 %	0 %	294138937
3561	NC_014012	GGT	2	6	198879	198884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138937
3562	NC_014012	AAGG	2	8	198918	198925	50 %	0 %	50 %	0 %	294138937
3563	NC_014012	ACT	2	6	198987	198992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138937
3564	NC_014012	TACGCC	2	12	198998	199009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294138937
3565	NC_014012	CTT	2	6	199049	199054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138937
3566	NC_014012	TGG	2	6	199106	199111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138937
3567	NC_014012	AG	3	6	199112	199117	50 %	0 %	50 %	0 %	294138937
3568	NC_014012	ATA	2	6	199126	199131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138937
3569	NC_014012	TTC	2	6	199140	199145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138937
3570	NC_014012	GAT	2	6	199179	199184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
3571	NC_014012	G	6	6	199213	199218	0 %	0 %	100 %	0 %	294138937
3572	NC_014012	TCT	2	6	199232	199237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138937
3573	NC_014012	AAG	2	6	199273	199278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138937
3574	NC_014012	T	6	6	199287	199292	0 %	100 %	0 %	0 %	294138937
3575	NC_014012	TGA	2	6	199337	199342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
3576	NC_014012	AAT	2	6	199380	199385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138937
3577	NC_014012	TGG	3	9	199468	199476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138937
3578	NC_014012	ATT	2	6	199542	199547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138937
3579	NC_014012	AAGA	2	8	199569	199576	75 %	0 %	25 %	0 %	294138937
3580	NC_014012	GTG	2	6	199584	199589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138937
3581	NC_014012	GAGT	2	8	199672	199679	25 %	25 %	50 %	0 %	294138937
3582	NC_014012	GAT	2	6	199680	199685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
3583	NC_014012	TGGCC	2	10	199686	199695	0 %	20 %	40 %	40 %	294138937
3584	NC_014012	TGA	2	6	199739	199744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
3585	NC_014012	GTG	3	9	199746	199754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138937
3586	NC_014012	GATGA	2	10	199830	199839	40 %	20 %	40 %	0 %	294138937
3587	NC_014012	AAG	2	6	199912	199917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138937
3588	NC_014012	AG	3	6	199916	199921	50 %	0 %	50 %	0 %	294138937
3589	NC_014012	TGC	2	6	199946	199951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138937
3590	NC_014012	GCT	3	9	199955	199963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138937
3591	NC_014012	ATA	2	6	199984	199989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138937
3592	NC_014012	CTA	2	6	199993	199998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138937
3593	NC_014012	AAAC	2	8	200026	200033	75 %	0 %	0 %	25 %	294138937
3594	NC_014012	CTA	2	6	200128	200133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138938
3595	NC_014012	GTTT	2	8	200154	200161	0 %	75 %	25 %	0 %	294138938
3596	NC_014012	TTAC	2	8	200166	200173	25 %	50 %	0 %	25 %	294138938
3597	NC_014012	TTG	2	6	200183	200188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138938
3598	NC_014012	TGC	2	6	200248	200253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138938
3599	NC_014012	TGT	2	6	200283	200288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138938
3600	NC_014012	TCT	2	6	200292	200297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138938
3601	NC_014012	GGT	2	6	200442	200447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138938
3602	NC_014012	CG	4	8	200464	200471	0 %	0 %	50 %	50 %	294138938
3603	NC_014012	GCG	2	6	200481	200486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138938
3604	NC_014012	GTC	2	6	200490	200495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138938
3605	NC_014012	ATA	2	6	200562	200567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014012	TCT	2	6	200626	200631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138939
3607	NC_014012	TG	3	6	200664	200669	0 %	50 %	50 %	0 %	294138939
3608	NC_014012	T	7	7	200901	200907	0 %	100 %	0 %	0 %	294138939
3609	NC_014012	TCT	2	6	200920	200925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138939
3610	NC_014012	CAG	2	6	201135	201140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138939
3611	NC_014012	TCC	2	6	201141	201146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138939
3612	NC_014012	CAGA	2	8	201278	201285	50 %	0 %	25 %	25 %	294138939
3613	NC_014012	TTA	2	6	201399	201404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014012	ATG	2	6	201457	201462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014012	CTG	2	6	201687	201692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138940
3616	NC_014012	TCAA	2	8	201741	201748	50 %	25 %	0 %	25 %	294138940
3617	NC_014012	TAG	2	6	201793	201798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138940
3618	NC_014012	CAGG	2	8	201990	201997	25 %	0 %	50 %	25 %	294138940
3619	NC_014012	TGA	2	6	202046	202051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138940
3620	NC_014012	GAT	2	6	202083	202088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138940
3621	NC_014012	GTG	2	6	202089	202094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138940
3622	NC_014012	ACG	2	6	202095	202100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138940
3623	NC_014012	TAC	2	6	202103	202108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138940
3624	NC_014012	GCA	2	6	202285	202290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_014012	CTA	2	6	202320	202325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_014012	CGG	2	6	202343	202348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_014012	CCA	2	6	202360	202365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_014012	TTA	2	6	202431	202436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138941
3629	NC_014012	TTA	2	6	202570	202575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138941
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3642	NC_014012	TTGA	2	8	203652	203659	25 %	50 %	25 %	0 %	294138941
3643	NC_014012	TCT	2	6	203767	203772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138941
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3645	NC_014012	TGGCT	2	10	203939	203948	0 %	40 %	40 %	20 %	294138941
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3661	NC_014012	TACTGC	2	12	205330	205341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294138942
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3675	NC_014012	TTACC	2	10	206099	206108	20 %	40 %	0 %	40 %	294138943
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3702	NC_014012	ATC	2	6	207267	207272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3742	NC_014012	T	7	7	209520	209526	0 %	100 %	0 %	0 %	294138946
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3747	NC_014012	GCT	2	6	209777	209782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138946
3748	NC_014012	TA	3	6	209841	209846	50 %	50 %	0 %	0 %	294138946
3749	NC_014012	CGT	2	6	210058	210063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138946
3750	NC_014012	TCC	2	6	210112	210117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138946
3751	NC_014012	AAAG	2	8	210120	210127	75 %	0 %	25 %	0 %	294138946
3752	NC_014012	TGG	2	6	210137	210142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138946
3753	NC_014012	TTC	2	6	210265	210270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138946
3754	NC_014012	GAA	2	6	210278	210283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138946
3755	NC_014012	TGAA	2	8	210313	210320	50 %	25 %	25 %	0 %	294138946
3756	NC_014012	T	6	6	210351	210356	0 %	100 %	0 %	0 %	294138946
3757	NC_014012	AGAC	2	8	210428	210435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3758	NC_014012	ATGCA	2	10	210474	210483	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3759	NC_014012	CTC	2	6	210508	210513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138947
3760	NC_014012	GAA	2	6	210604	210609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138947
3761	NC_014012	CTG	2	6	210657	210662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
3762	NC_014012	CAGCG	2	10	210679	210688	20 %	0 %	40 %	40 %	294138947
3763	NC_014012	TCATC	2	10	210699	210708	20 %	40 %	0 %	40 %	294138947
3764	NC_014012	TTG	2	6	210725	210730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138947
3765	NC_014012	CTT	2	6	210732	210737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138947
3766	NC_014012	CTG	2	6	210751	210756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
3767	NC_014012	GGC	2	6	210907	210912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138947
3768	NC_014012	TGC	2	6	210988	210993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
3769	NC_014012	CGG	2	6	210999	211004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138947
3770	NC_014012	TCG	2	6	211040	211045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
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3776	NC_014012	TCTG	2	8	211385	211392	0 %	50 %	25 %	25 %	294138947
3777	NC_014012	AG	3	6	211525	211530	50 %	0 %	50 %	0 %	294138947
3778	NC_014012	GAA	2	6	211537	211542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138947
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3780	NC_014012	CGA	2	6	211656	211661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138947
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3782	NC_014012	CCA	2	6	211724	211729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138947
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3786	NC_014012	CCA	2	6	211935	211940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138947
3787	NC_014012	GCT	3	9	211998	212006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
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3789	NC_014012	TGA	2	6	212171	212176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138947
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3802	NC_014012	GAT	2	6	212692	212697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138947
3803	NC_014012	CAT	2	6	212716	212721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138947
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3825	NC_014012	GATTA	2	10	213655	213664	40 %	40 %	20 %	0 %	294138947
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3828	NC_014012	AT	3	6	213753	213758	50 %	50 %	0 %	0 %	294138947
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3831	NC_014012	CAT	2	6	213886	213891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138947
3832	NC_014012	TCG	2	6	213932	213937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
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3834	NC_014012	TAT	2	6	214114	214119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3835	NC_014012	TGC	2	6	214135	214140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3836	NC_014012	CCTG	2	8	214151	214158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3837	NC_014012	ACC	2	6	214193	214198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3838	NC_014012	TGC	2	6	214294	214299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138948
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3840	NC_014012	TGA	2	6	214424	214429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138948
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3850	NC_014012	TGT	2	6	214989	214994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3851	NC_014012	GCCA	2	8	215066	215073	25 %	0 %	25 %	50 %	294138949
3852	NC_014012	ATG	2	6	215097	215102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138949
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3857	NC_014012	AGGT	2	8	215321	215328	25 %	25 %	50 %	0 %	294138949
3858	NC_014012	TGGA	2	8	215517	215524	25 %	25 %	50 %	0 %	294138949
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3869	NC_014012	CGA	2	6	215890	215895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138949
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3982	NC_014012	TTTG	2	8	221625	221632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3983	NC_014012	CTT	2	6	221636	221641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3990	NC_014012	CAG	2	6	222233	222238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138956
3991	NC_014012	GA	3	6	222273	222278	50 %	0 %	50 %	0 %	294138956
3992	NC_014012	AGC	2	6	222299	222304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138956
3993	NC_014012	GAT	2	6	222342	222347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138956
3994	NC_014012	TGC	2	6	222458	222463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138956
3995	NC_014012	TGG	2	6	222466	222471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138956
3996	NC_014012	GA	3	6	222496	222501	50 %	0 %	50 %	0 %	294138956
3997	NC_014012	ATT	2	6	222510	222515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138956
3998	NC_014012	A	6	6	222551	222556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_014012	GAT	2	6	222571	222576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138957
4000	NC_014012	TGC	2	6	222604	222609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138957

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