MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2005	NC_014012	TGC	3	9	111055	111063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138865
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2009	NC_014012	CATA	2	8	111122	111129	50 %	25 %	0 %	25 %	294138865
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2126	NC_014012	TCGAT	2	10	118444	118453	20 %	40 %	20 %	20 %	294138873
2127	NC_014012	AT	3	6	118490	118495	50 %	50 %	0 %	0 %	294138873
2128	NC_014012	AGC	2	6	118527	118532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138873
2129	NC_014012	CT	3	6	118539	118544	0 %	50 %	0 %	50 %	294138873
2130	NC_014012	TA	3	6	118581	118586	50 %	50 %	0 %	0 %	294138873
2131	NC_014012	A	6	6	118612	118617	100 %	0 %	0 %	0 %	294138873
2132	NC_014012	TTA	2	6	118770	118775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138873
2133	NC_014012	CTGG	2	8	118781	118788	0 %	25 %	50 %	25 %	294138873
2134	NC_014012	GCT	2	6	118796	118801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138873
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2137	NC_014012	T	6	6	119205	119210	0 %	100 %	0 %	0 %	294138874
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2143	NC_014012	TAGT	3	12	119521	119532	25 %	50 %	25 %	0 %	294138874
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2145	NC_014012	AAC	2	6	119620	119625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138874
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2148	NC_014012	TA	3	6	119749	119754	50 %	50 %	0 %	0 %	294138874
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2157	NC_014012	TTGA	2	8	120132	120139	25 %	50 %	25 %	0 %	294138875
2158	NC_014012	CTTG	2	8	120168	120175	0 %	50 %	25 %	25 %	294138875
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2167	NC_014012	TTTC	2	8	120425	120432	0 %	75 %	0 %	25 %	294138875
2168	NC_014012	AATT	2	8	120474	120481	50 %	50 %	0 %	0 %	294138875
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2204	NC_014012	TAAGC	2	10	122433	122442	40 %	20 %	20 %	20 %	294138877
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2211	NC_014012	AAT	2	6	122690	122695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138877
2212	NC_014012	TCA	2	6	122700	122705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138877
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2215	NC_014012	AC	3	6	122866	122871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2216	NC_014012	TTG	2	6	122872	122877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2217	NC_014012	ATG	2	6	122962	122967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2218	NC_014012	TCA	2	6	123004	123009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2220	NC_014012	TAT	2	6	123122	123127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138878
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2223	NC_014012	A	6	6	123298	123303	100 %	0 %	0 %	0 %	294138878
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2230	NC_014012	A	6	6	123639	123644	100 %	0 %	0 %	0 %	294138878
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2240	NC_014012	AT	3	6	124081	124086	50 %	50 %	0 %	0 %	294138878
2241	NC_014012	TGA	2	6	124150	124155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138878
2242	NC_014012	GAGT	2	8	124156	124163	25 %	25 %	50 %	0 %	294138878
2243	NC_014012	AAT	2	6	124186	124191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_014012	ATT	2	6	124222	124227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138879
2245	NC_014012	TGCT	2	8	124274	124281	0 %	50 %	25 %	25 %	294138879
2246	NC_014012	TCA	2	6	124401	124406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138879
2247	NC_014012	ATT	2	6	124616	124621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138879
2248	NC_014012	CTG	2	6	124718	124723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138879
2249	NC_014012	GTT	2	6	124789	124794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138879
2250	NC_014012	CCA	2	6	124812	124817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138879
2251	NC_014012	ATAA	2	8	124838	124845	75 %	25 %	0 %	0 %	294138879
2252	NC_014012	AAT	2	6	124867	124872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138879
2253	NC_014012	CAT	2	6	124907	124912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138879
2254	NC_014012	ATC	2	6	125012	125017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138879
2255	NC_014012	TG	3	6	125064	125069	0 %	50 %	50 %	0 %	294138879
2256	NC_014012	ATG	2	6	125094	125099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138879
2257	NC_014012	T	6	6	125190	125195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2258	NC_014012	TGAGC	2	10	125203	125212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2259	NC_014012	ATA	2	6	125223	125228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_014012	CCA	2	6	125273	125278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138880
2261	NC_014012	GCA	2	6	125494	125499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138880
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2263	NC_014012	TTAA	2	8	125662	125669	50 %	50 %	0 %	0 %	294138880
2264	NC_014012	CTG	2	6	125684	125689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138880
2265	NC_014012	CCT	2	6	125710	125715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138880
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2273	NC_014012	ATC	2	6	125983	125988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138880
2274	NC_014012	TCA	2	6	126067	126072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138880
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2280	NC_014012	ATT	2	6	126278	126283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2281	NC_014012	ATA	2	6	126359	126364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_014012	TGT	2	6	126466	126471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2283	NC_014012	AGCT	2	8	126526	126533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2284	NC_014012	GTC	2	6	126659	126664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138881
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2286	NC_014012	AATC	2	8	126742	126749	50 %	25 %	0 %	25 %	294138881
2287	NC_014012	TGG	2	6	126766	126771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138881
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2290	NC_014012	TTG	2	6	126906	126911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138881
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2313	NC_014012	ATC	2	6	128056	128061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2314	NC_014012	GT	3	6	128073	128078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2315	NC_014012	GCTA	2	8	128155	128162	25 %	25 %	25 %	25 %	294138882
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2321	NC_014012	CGT	2	6	128480	128485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138882
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2323	NC_014012	CAG	2	6	128520	128525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138882
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2325	NC_014012	TGG	2	6	128575	128580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138882
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2328	NC_014012	AGT	2	6	128656	128661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138883
2329	NC_014012	GATT	2	8	128685	128692	25 %	50 %	25 %	0 %	294138883
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2349	NC_014012	A	6	6	129615	129620	100 %	0 %	0 %	0 %	294138883
2350	NC_014012	TCG	2	6	129657	129662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138883
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2357	NC_014012	TAAA	2	8	129942	129949	75 %	25 %	0 %	0 %	294138883
2358	NC_014012	GTGG	2	8	129973	129980	0 %	25 %	75 %	0 %	294138883
2359	NC_014012	AAG	2	6	129993	129998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138883
2360	NC_014012	CTG	2	6	130001	130006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138883
2361	NC_014012	ATG	2	6	130046	130051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138883
2362	NC_014012	GGT	2	6	130058	130063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138883
2363	NC_014012	AG	3	6	130093	130098	50 %	0 %	50 %	0 %	294138883
2364	NC_014012	AGG	2	6	130160	130165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_014012	AGC	2	6	130214	130219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2366	NC_014012	GTA	2	6	130459	130464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138884
2367	NC_014012	CTTG	2	8	130469	130476	0 %	50 %	25 %	25 %	294138884
2368	NC_014012	GGAT	2	8	130558	130565	25 %	25 %	50 %	0 %	294138884
2369	NC_014012	ACCA	2	8	130608	130615	50 %	0 %	0 %	50 %	294138884
2370	NC_014012	TCT	2	6	130652	130657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138884
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2372	NC_014012	CTT	2	6	130742	130747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138884
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2386	NC_014012	ATG	2	6	131886	131891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138886
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2426	NC_014012	TCTA	2	8	134266	134273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2427	NC_014012	AGC	2	6	134293	134298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2435	NC_014012	ATA	2	6	134742	134747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2439	NC_014012	TGT	2	6	134845	134850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2452	NC_014012	ATT	2	6	135352	135357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2482	NC_014012	TA	3	6	136795	136800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2496	NC_014012	AAAT	2	8	137866	137873	75 %	25 %	0 %	0 %	294138891
2497	NC_014012	CTT	2	6	137979	137984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138891
2498	NC_014012	GCC	2	6	138005	138010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138891
2499	NC_014012	ACCG	2	8	138025	138032	25 %	0 %	25 %	50 %	294138891
2500	NC_014012	TAA	2	6	138055	138060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138891

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