MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014012	T	6	6	83399	83404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014012	TTA	2	6	83433	83438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014012	ACGT	2	8	83484	83491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_014012	GTC	2	6	83510	83515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014012	CCG	2	6	83516	83521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_014012	TAC	2	6	83545	83550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_014012	AGC	2	6	83568	83573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_014012	CTC	2	6	83640	83645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_014012	AGT	2	6	83658	83663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014012	TAA	2	6	83713	83718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014012	TTA	2	6	83741	83746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014012	CGT	2	6	83817	83822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_014012	CAA	2	6	83868	83873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_014012	TAC	2	6	83884	83889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014012	T	6	6	84021	84026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014012	ATT	2	6	84086	84091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014012	TAGTT	2	10	84094	84103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014012	ATT	2	6	84164	84169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138847
1519	NC_014012	ATG	2	6	84228	84233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138847
1520	NC_014012	AAG	2	6	84238	84243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138847
1521	NC_014012	GTTC	2	8	84263	84270	0 %	50 %	25 %	25 %	294138847
1522	NC_014012	TAA	2	6	84276	84281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138847
1523	NC_014012	TTG	2	6	84327	84332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138847
1524	NC_014012	AGT	2	6	84403	84408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138847
1525	NC_014012	ATTGGT	2	12	84431	84442	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294138847
1526	NC_014012	ACA	2	6	84443	84448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138847
1527	NC_014012	TGC	2	6	84450	84455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138847
1528	NC_014012	ATT	2	6	84560	84565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138847
1529	NC_014012	GAG	2	6	84617	84622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138847
1530	NC_014012	CAA	2	6	84642	84647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138847
1531	NC_014012	TGA	2	6	84664	84669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138847
1532	NC_014012	AGC	2	6	84685	84690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138847
1533	NC_014012	AATGC	2	10	84713	84722	40 %	20 %	20 %	20 %	294138847
1534	NC_014012	ATTGAA	2	12	84773	84784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294138847
1535	NC_014012	AAG	2	6	84825	84830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138847
1536	NC_014012	T	6	6	84842	84847	0 %	100 %	0 %	0 %	294138847
1537	NC_014012	GAAAA	2	10	84850	84859	80 %	0 %	20 %	0 %	294138847
1538	NC_014012	ATT	2	6	84874	84879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138847
1539	NC_014012	ATTT	2	8	84927	84934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014012	TTG	2	6	84977	84982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014012	CAA	2	6	85071	85076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_014012	TGTCC	2	10	85194	85203	0 %	40 %	20 %	40 %	294138848
1543	NC_014012	CGC	2	6	85330	85335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138848
1544	NC_014012	TG	3	6	85343	85348	0 %	50 %	50 %	0 %	294138848
1545	NC_014012	GCT	2	6	85398	85403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138848
1546	NC_014012	ATC	2	6	85472	85477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138848
1547	NC_014012	T	6	6	85486	85491	0 %	100 %	0 %	0 %	294138848
1548	NC_014012	CTT	2	6	85495	85500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138848
1549	NC_014012	GTA	2	6	85504	85509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138848
1550	NC_014012	GGA	2	6	85541	85546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138848
1551	NC_014012	TTATTT	2	12	85609	85620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294138848
1552	NC_014012	TA	3	6	85780	85785	50 %	50 %	0 %	0 %	294138848
1553	NC_014012	TTG	2	6	85794	85799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138848
1554	NC_014012	TGA	2	6	85861	85866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138848
1555	NC_014012	AAT	2	6	86007	86012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138848
1556	NC_014012	T	7	7	86021	86027	0 %	100 %	0 %	0 %	294138848
1557	NC_014012	TGC	2	6	86060	86065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138848
1558	NC_014012	TTA	2	6	86070	86075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138848
1559	NC_014012	TCTA	2	8	86272	86279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_014012	TA	3	6	86298	86303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014012	CTAT	2	8	86310	86317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_014012	TGAC	2	8	86409	86416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_014012	TCA	2	6	86478	86483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_014012	TATT	2	8	86525	86532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014012	ATAC	2	8	86654	86661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_014012	AG	3	6	86706	86711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014012	TA	3	6	86747	86752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014012	TA	3	6	86755	86760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014012	AT	3	6	86788	86793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014012	ATG	2	6	86827	86832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014012	AGG	2	6	86843	86848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014012	TAAA	2	8	86929	86936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014012	TCT	2	6	87050	87055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_014012	TAAG	2	8	87085	87092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014012	T	6	6	87106	87111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014012	CCT	2	6	87151	87156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_014012	CGG	2	6	87179	87184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_014012	CAC	2	6	87195	87200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138849
1579	NC_014012	TG	3	6	87229	87234	0 %	50 %	50 %	0 %	294138849
1580	NC_014012	GGC	2	6	87465	87470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_014012	GCG	2	6	87529	87534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014012	AGG	2	6	87624	87629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014012	GGTAA	2	10	87681	87690	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014012	CGA	2	6	87704	87709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_014012	GAT	2	6	87729	87734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014012	GCA	2	6	87778	87783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_014012	GT	3	6	87831	87836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014012	GAA	2	6	87837	87842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_014012	GAG	2	6	87871	87876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014012	AGGT	2	8	87880	87887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014012	TAA	2	6	87891	87896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014012	AGA	2	6	87920	87925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014012	CAG	2	6	87946	87951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_014012	G	6	6	88093	88098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014012	GGC	2	6	88157	88162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_014012	GAA	2	6	88400	88405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014012	TGC	2	6	88476	88481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_014012	GTC	2	6	88488	88493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_014012	CCTTAT	2	12	88540	88551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_014012	TGG	2	6	88566	88571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014012	GGA	2	6	88602	88607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014012	GAC	2	6	88615	88620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014012	TCA	2	6	88627	88632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_014012	AC	3	6	88653	88658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_014012	CGC	2	6	88690	88695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_014012	AC	3	6	88822	88827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_014012	CCT	2	6	88965	88970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_014012	CA	3	6	89006	89011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_014012	CTTGTT	2	12	89017	89028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1610	NC_014012	GTT	2	6	89054	89059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014012	ACTT	2	8	89111	89118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_014012	GTT	2	6	89123	89128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014012	ATAA	3	12	89151	89162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014012	ACA	2	6	89255	89260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_014012	GTA	2	6	89336	89341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_014012	GGA	2	6	89487	89492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014012	TAG	2	6	89516	89521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014012	GCGA	2	8	89524	89531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_014012	G	6	6	89673	89678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014012	TCC	2	6	89683	89688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_014012	CTGA	2	8	89703	89710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_014012	GGA	2	6	89993	89998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014012	TAC	2	6	90197	90202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_014012	AC	3	6	90210	90215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_014012	CGTC	2	8	90228	90235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_014012	AAC	2	6	90247	90252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_014012	AGC	2	6	90337	90342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_014012	AAAG	2	8	90351	90358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014012	AGTCG	2	10	90373	90382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1630	NC_014012	CAGGG	2	10	90598	90607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_014012	CTA	2	6	90675	90680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_014012	GA	3	6	90690	90695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014012	AGGCT	2	10	90702	90711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1634	NC_014012	GCG	2	6	90715	90720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_014012	TGA	2	6	90800	90805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1769	NC_014012	A	7	7	98436	98442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1796	NC_014012	ATTT	2	8	100277	100284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1797	NC_014012	TTA	2	6	100326	100331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_014012	TTG	2	6	110645	110650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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