MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014012	TGT	2	6	54407	54412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138823
1002	NC_014012	TCT	2	6	54428	54433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138823
1003	NC_014012	AGC	2	6	54469	54474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138823
1004	NC_014012	GCTG	2	8	54505	54512	0 %	25 %	50 %	25 %	294138823
1005	NC_014012	ATG	2	6	54577	54582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138823
1006	NC_014012	CTT	2	6	54633	54638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138823
1007	NC_014012	CAT	2	6	54855	54860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138823
1008	NC_014012	GCG	2	6	54903	54908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138823
1009	NC_014012	TCT	2	6	55249	55254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138823
1010	NC_014012	TTA	2	6	55258	55263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138823
1011	NC_014012	AG	3	6	55432	55437	50 %	0 %	50 %	0 %	294138823
1012	NC_014012	TCTA	2	8	55449	55456	25 %	50 %	0 %	25 %	294138823
1013	NC_014012	TTG	2	6	55459	55464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138823
1014	NC_014012	TTGC	2	8	55547	55554	0 %	50 %	25 %	25 %	294138823
1015	NC_014012	CGT	2	6	55573	55578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014012	TCA	2	6	55601	55606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014012	CGA	2	6	55631	55636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014012	ACA	2	6	55650	55655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014012	TTAT	2	8	55784	55791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014012	TAA	2	6	55803	55808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014012	AAC	2	6	55817	55822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014012	CGT	2	6	55883	55888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138824
1023	NC_014012	CTG	2	6	56035	56040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138824
1024	NC_014012	TCT	2	6	56076	56081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138824
1025	NC_014012	GTT	2	6	56185	56190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138824
1026	NC_014012	TA	3	6	56216	56221	50 %	50 %	0 %	0 %	294138824
1027	NC_014012	TGA	2	6	56280	56285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138824
1028	NC_014012	GCT	2	6	56375	56380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138824
1029	NC_014012	CGG	2	6	56398	56403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138824
1030	NC_014012	CAG	2	6	56420	56425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138824
1031	NC_014012	CTT	2	6	56439	56444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138824
1032	NC_014012	T	7	7	56578	56584	0 %	100 %	0 %	0 %	294138824
1033	NC_014012	TTGA	2	8	56642	56649	25 %	50 %	25 %	0 %	294138824
1034	NC_014012	ATG	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138824
1035	NC_014012	A	7	7	56732	56738	100 %	0 %	0 %	0 %	294138824
1036	NC_014012	ATG	2	6	56880	56885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138824
1037	NC_014012	CT	3	6	56995	57000	0 %	50 %	0 %	50 %	294138824
1038	NC_014012	GGC	2	6	57074	57079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138824
1039	NC_014012	CAC	2	6	57160	57165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_014012	ATTT	2	8	57171	57178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014012	ATTG	2	8	57247	57254	25 %	50 %	25 %	0 %	294138825
1042	NC_014012	AGA	3	9	57289	57297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138825
1043	NC_014012	TCTTT	2	10	57320	57329	0 %	80 %	0 %	20 %	294138825
1044	NC_014012	GT	3	6	57358	57363	0 %	50 %	50 %	0 %	294138825
1045	NC_014012	ATT	2	6	57402	57407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138825
1046	NC_014012	GAT	2	6	57461	57466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138825
1047	NC_014012	AGCC	2	8	57471	57478	25 %	0 %	25 %	50 %	294138825
1048	NC_014012	GTG	2	6	57545	57550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138825
1049	NC_014012	CGG	2	6	57559	57564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138825
1050	NC_014012	GGT	2	6	57581	57586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138825
1051	NC_014012	TG	3	6	57720	57725	0 %	50 %	50 %	0 %	294138825
1052	NC_014012	CCA	2	6	57819	57824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138825
1053	NC_014012	GAT	2	6	57890	57895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014012	GAT	2	6	57903	57908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014012	AAT	2	6	58002	58007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014012	ATA	2	6	58035	58040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138826
1057	NC_014012	GCC	2	6	58085	58090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138826
1058	NC_014012	TGG	2	6	58096	58101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138826
1059	NC_014012	TGG	2	6	58118	58123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138826
1060	NC_014012	AAGA	2	8	58200	58207	75 %	0 %	25 %	0 %	294138826
1061	NC_014012	TCC	2	6	58228	58233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138826
1062	NC_014012	TAG	2	6	58234	58239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138826
1063	NC_014012	T	6	6	58243	58248	0 %	100 %	0 %	0 %	294138826
1064	NC_014012	ATTT	2	8	58280	58287	25 %	75 %	0 %	0 %	294138826
1065	NC_014012	T	6	6	58285	58290	0 %	100 %	0 %	0 %	294138826
1066	NC_014012	CCAG	2	8	58291	58298	25 %	0 %	25 %	50 %	294138826
1067	NC_014012	CTT	2	6	58322	58327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138826
1068	NC_014012	ACC	2	6	58347	58352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138826
1069	NC_014012	AGG	2	6	58430	58435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138826
1070	NC_014012	T	6	6	58586	58591	0 %	100 %	0 %	0 %	294138826
1071	NC_014012	GAAT	2	8	58630	58637	50 %	25 %	25 %	0 %	294138826
1072	NC_014012	ATG	2	6	58696	58701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138826
1073	NC_014012	TG	3	6	58743	58748	0 %	50 %	50 %	0 %	294138826
1074	NC_014012	TGC	2	6	58790	58795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138826
1075	NC_014012	CGC	2	6	58803	58808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138826
1076	NC_014012	CTG	2	6	58978	58983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138826
1077	NC_014012	TCT	2	6	59038	59043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138826
1078	NC_014012	TGG	2	6	59063	59068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138826
1079	NC_014012	GGT	2	6	59079	59084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138826
1080	NC_014012	GAT	2	6	59099	59104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138826
1081	NC_014012	TAA	2	6	59180	59185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138826
1082	NC_014012	TG	3	6	59213	59218	0 %	50 %	50 %	0 %	294138826
1083	NC_014012	ATT	2	6	59267	59272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138826
1084	NC_014012	ATA	2	6	59287	59292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138826
1085	NC_014012	GCT	2	6	59313	59318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138826
1086	NC_014012	ATG	2	6	59377	59382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138826
1087	NC_014012	TTTA	2	8	59520	59527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014012	ATT	2	6	59573	59578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014012	ATG	2	6	59587	59592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138827
1090	NC_014012	CAAA	2	8	59629	59636	75 %	0 %	0 %	25 %	294138827
1091	NC_014012	TGACTT	2	12	59687	59698	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294138827
1092	NC_014012	CT	3	6	59725	59730	0 %	50 %	0 %	50 %	294138827
1093	NC_014012	T	6	6	59842	59847	0 %	100 %	0 %	0 %	294138827
1094	NC_014012	TGT	2	6	59856	59861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138827
1095	NC_014012	GAA	2	6	59877	59882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138827
1096	NC_014012	AACC	2	8	59892	59899	50 %	0 %	0 %	50 %	294138827
1097	NC_014012	GAA	2	6	59907	59912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138827
1098	NC_014012	CTTT	2	8	59923	59930	0 %	75 %	0 %	25 %	294138827
1099	NC_014012	CAG	2	6	59941	59946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138827
1100	NC_014012	GATT	2	8	59967	59974	25 %	50 %	25 %	0 %	294138827
1101	NC_014012	CTT	2	6	59988	59993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138827
1102	NC_014012	TCA	2	6	60014	60019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138827
1103	NC_014012	TCG	2	6	60343	60348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138828
1104	NC_014012	TGA	2	6	60366	60371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138828
1105	NC_014012	GA	3	6	60390	60395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014012	TGC	2	6	60405	60410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_014012	GT	3	6	60489	60494	0 %	50 %	50 %	0 %	294138829
1108	NC_014012	ATC	2	6	60641	60646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138829
1109	NC_014012	ACTC	2	8	60742	60749	25 %	25 %	0 %	50 %	294138829
1110	NC_014012	TC	3	6	60748	60753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_014012	TTAA	2	8	60820	60827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014012	GCA	2	6	60843	60848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014012	GAC	2	6	60938	60943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014012	ATCA	2	8	60971	60978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_014012	T	6	6	61106	61111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014012	T	6	6	61116	61121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014012	TTAT	2	8	61123	61130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014012	GTT	2	6	61302	61307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014012	TAAT	2	8	61332	61339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014012	CTA	2	6	61368	61373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014012	TCA	2	6	61464	61469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014012	GCT	2	6	61522	61527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014012	T	6	6	61541	61546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014012	TGA	2	6	61553	61558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014012	CTAG	2	8	61577	61584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_014012	GGCA	2	8	61625	61632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_014012	GC	3	6	61663	61668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_014012	A	6	6	61722	61727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014012	ATA	2	6	61779	61784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014012	ACCA	2	8	62004	62011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_014012	TGGA	2	8	62141	62148	25 %	25 %	50 %	0 %	294138830
1132	NC_014012	CAA	2	6	62183	62188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138830
1133	NC_014012	CTG	2	6	62242	62247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138830
1134	NC_014012	ATG	2	6	62253	62258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138830
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1138	NC_014012	TTA	2	6	62427	62432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138830
1139	NC_014012	ATG	2	6	62487	62492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138830
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1142	NC_014012	GTG	2	6	62631	62636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138830
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1151	NC_014012	TGCC	2	8	62962	62969	0 %	25 %	25 %	50 %	294138830
1152	NC_014012	AGATAT	2	12	63004	63015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294138830
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1161	NC_014012	AATA	2	8	63619	63626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_014012	AGA	2	6	63648	63653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138831
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1186	NC_014012	CCA	2	6	64608	64613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138831
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1229	NC_014012	TCTT	2	8	67612	67619	0 %	75 %	0 %	25 %	294138834
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1232	NC_014012	CT	3	6	67922	67927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1237	NC_014012	CATCT	2	10	68213	68222	20 %	40 %	0 %	40 %	294138835
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1242	NC_014012	AGTTA	2	10	68617	68626	40 %	40 %	20 %	0 %	294138835
1243	NC_014012	TGC	2	6	68664	68669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138835
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1248	NC_014012	TCA	2	6	69024	69029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138835
1249	NC_014012	GA	3	6	69038	69043	50 %	0 %	50 %	0 %	294138835
1250	NC_014012	GTT	2	6	69238	69243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_014012	CCCG	2	8	69265	69272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1252	NC_014012	AGA	2	6	69303	69308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138836
1253	NC_014012	TCAC	2	8	69373	69380	25 %	25 %	0 %	50 %	294138836
1254	NC_014012	TGT	2	6	69410	69415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138836
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1256	NC_014012	TA	3	6	69439	69444	50 %	50 %	0 %	0 %	294138836
1257	NC_014012	GCTT	2	8	69606	69613	0 %	50 %	25 %	25 %	294138836
1258	NC_014012	AGTG	2	8	69642	69649	25 %	25 %	50 %	0 %	294138836
1259	NC_014012	GGCTC	2	10	69670	69679	0 %	20 %	40 %	40 %	294138836
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1284	NC_014012	AGG	2	6	70821	70826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1285	NC_014012	CCT	2	6	70832	70837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1288	NC_014012	AAAT	2	8	70879	70886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1289	NC_014012	ATGG	2	8	70987	70994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1332	NC_014012	TAAA	2	8	74235	74242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1333	NC_014012	AGA	2	6	74268	74273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1361	NC_014012	AT	3	6	75503	75508	50 %	50 %	0 %	0 %	294138843
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1363	NC_014012	GCTTT	2	10	75537	75546	0 %	60 %	20 %	20 %	294138843
1364	NC_014012	GA	3	6	75566	75571	50 %	0 %	50 %	0 %	294138843
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1370	NC_014012	ATTCT	2	10	75805	75814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1371	NC_014012	TGAC	2	8	75827	75834	25 %	25 %	25 %	25 %	294138844
1372	NC_014012	CA	3	6	75863	75868	50 %	0 %	0 %	50 %	294138844
1373	NC_014012	A	6	6	75959	75964	100 %	0 %	0 %	0 %	294138844
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