MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014012	GAGT	2	8	26825	26832	25 %	25 %	50 %	0 %	294138797
502	NC_014012	TGG	2	6	26860	26865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138797
503	NC_014012	TCAT	2	8	26913	26920	25 %	50 %	0 %	25 %	294138797
504	NC_014012	GCC	2	6	27011	27016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138797
505	NC_014012	CATAGC	2	12	27161	27172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294138797
506	NC_014012	TCT	2	6	27255	27260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138797
507	NC_014012	TC	3	6	27313	27318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_014012	AAAAAG	2	12	27321	27332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014012	TTC	2	6	27401	27406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138798
510	NC_014012	GAT	2	6	27421	27426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138798
511	NC_014012	CTG	2	6	27430	27435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138798
512	NC_014012	ACCA	3	12	27454	27465	50 %	0 %	0 %	50 %	294138798
513	NC_014012	GAA	2	6	27496	27501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138798
514	NC_014012	CAT	2	6	27529	27534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138798
515	NC_014012	TCT	2	6	27576	27581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138798
516	NC_014012	GTA	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138798
517	NC_014012	CTTTCT	2	12	27768	27779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138798
518	NC_014012	CAT	2	6	27790	27795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138798
519	NC_014012	TCT	2	6	27807	27812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138798
520	NC_014012	TCA	2	6	27818	27823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138798
521	NC_014012	TAA	2	6	27933	27938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138798
522	NC_014012	AAT	2	6	27940	27945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138798
523	NC_014012	GAA	2	6	27976	27981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138798
524	NC_014012	TTG	2	6	27992	27997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138798
525	NC_014012	ACC	2	6	28011	28016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138798
526	NC_014012	TAAGT	2	10	28039	28048	40 %	40 %	20 %	0 %	294138798
527	NC_014012	CAC	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138798
528	NC_014012	GGT	2	6	28217	28222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138798
529	NC_014012	GCA	2	6	28248	28253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138798
530	NC_014012	ACC	2	6	28264	28269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138798
531	NC_014012	TCT	2	6	28275	28280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138798
532	NC_014012	ATC	2	6	28303	28308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138798
533	NC_014012	GGC	2	6	28348	28353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138798
534	NC_014012	TGC	3	9	28377	28385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138798
535	NC_014012	CTG	2	6	28625	28630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138798
536	NC_014012	CCA	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138798
537	NC_014012	TGA	2	6	28782	28787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138798
538	NC_014012	TG	3	6	28875	28880	0 %	50 %	50 %	0 %	294138798
539	NC_014012	AGT	2	6	28885	28890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138798
540	NC_014012	AGT	2	6	28921	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138798
541	NC_014012	A	6	6	28970	28975	100 %	0 %	0 %	0 %	294138798
542	NC_014012	AT	3	6	29001	29006	50 %	50 %	0 %	0 %	294138798
543	NC_014012	TATT	2	8	29027	29034	25 %	75 %	0 %	0 %	294138799
544	NC_014012	T	7	7	29044	29050	0 %	100 %	0 %	0 %	294138799
545	NC_014012	AATG	2	8	29142	29149	50 %	25 %	25 %	0 %	294138799
546	NC_014012	ATA	2	6	29161	29166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138799
547	NC_014012	TTA	2	6	29192	29197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138799
548	NC_014012	AAT	2	6	29236	29241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138799
549	NC_014012	GCG	2	6	29262	29267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138799
550	NC_014012	ACG	2	6	29326	29331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138800
551	NC_014012	AAC	2	6	29346	29351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138800
552	NC_014012	GAT	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138800
553	NC_014012	TGG	2	6	29425	29430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138800
554	NC_014012	TGC	2	6	29476	29481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138800
555	NC_014012	GAA	2	6	29518	29523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138800
556	NC_014012	ACG	3	9	29651	29659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138801
557	NC_014012	CGCTTG	2	12	29715	29726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138801
558	NC_014012	A	7	7	29786	29792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014012	GAA	2	6	29810	29815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014012	A	6	6	29823	29828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014012	CAA	2	6	29863	29868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014012	ATTT	2	8	29899	29906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014012	CCTA	2	8	29912	29919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_014012	CCA	2	6	29927	29932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_014012	TCAT	2	8	29984	29991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_014012	GATC	2	8	30014	30021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_014012	ATC	2	6	30095	30100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_014012	ATCT	2	8	30112	30119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_014012	ATTAT	2	10	30127	30136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014012	GCA	2	6	30222	30227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138802
571	NC_014012	CAA	2	6	30262	30267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138802
572	NC_014012	ATGG	2	8	30301	30308	25 %	25 %	50 %	0 %	294138802
573	NC_014012	AC	3	6	30311	30316	50 %	0 %	0 %	50 %	294138802
574	NC_014012	CAT	2	6	30375	30380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138802
575	NC_014012	T	6	6	30388	30393	0 %	100 %	0 %	0 %	294138802
576	NC_014012	CG	3	6	30494	30499	0 %	0 %	50 %	50 %	294138802
577	NC_014012	TGG	2	6	30672	30677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138802
578	NC_014012	CAT	2	6	30753	30758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138802
579	NC_014012	AAT	2	6	30763	30768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138802
580	NC_014012	AAT	2	6	30835	30840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138802
581	NC_014012	TTA	2	6	30861	30866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138802
582	NC_014012	CGTAG	2	10	30868	30877	20 %	20 %	40 %	20 %	294138802
583	NC_014012	ATT	2	6	30882	30887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138802
584	NC_014012	GAT	2	6	30892	30897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138802
585	NC_014012	T	6	6	30904	30909	0 %	100 %	0 %	0 %	294138802
586	NC_014012	TTC	2	6	30937	30942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138802
587	NC_014012	ATC	2	6	30971	30976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138802
588	NC_014012	AGA	2	6	31023	31028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138802
589	NC_014012	CCT	2	6	31075	31080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138802
590	NC_014012	AG	3	6	31122	31127	50 %	0 %	50 %	0 %	294138802
591	NC_014012	TTC	2	6	31156	31161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138802
592	NC_014012	GCTAAC	2	12	31222	31233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294138802
593	NC_014012	ATA	2	6	31319	31324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138802
594	NC_014012	AGA	2	6	31328	31333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138802
595	NC_014012	TAAGAT	2	12	31350	31361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294138802
596	NC_014012	CGT	2	6	31381	31386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138802
597	NC_014012	AACC	2	8	31440	31447	50 %	0 %	0 %	50 %	294138802
598	NC_014012	TGG	2	6	31476	31481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138802
599	NC_014012	GAA	2	6	31534	31539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138802
600	NC_014012	AGA	2	6	31554	31559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138802
601	NC_014012	TGA	2	6	31611	31616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138803
602	NC_014012	GA	3	6	31676	31681	50 %	0 %	50 %	0 %	294138803
603	NC_014012	AGTG	2	8	31720	31727	25 %	25 %	50 %	0 %	294138803
604	NC_014012	TGT	2	6	31798	31803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138803
605	NC_014012	TACCG	2	10	31816	31825	20 %	20 %	20 %	40 %	294138803
606	NC_014012	GAA	2	6	31828	31833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138803
607	NC_014012	AAC	2	6	31884	31889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138803
608	NC_014012	CGG	2	6	31947	31952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138803
609	NC_014012	CAAG	2	8	32002	32009	50 %	0 %	25 %	25 %	294138803
610	NC_014012	TTA	2	6	32068	32073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138803
611	NC_014012	CTA	2	6	32084	32089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138803
612	NC_014012	ACA	2	6	32288	32293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138803
613	NC_014012	TCG	2	6	32344	32349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138803
614	NC_014012	GTG	2	6	32448	32453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138803
615	NC_014012	AAT	2	6	32471	32476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138803
616	NC_014012	TAA	2	6	32494	32499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138803
617	NC_014012	GAA	2	6	32510	32515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138803
618	NC_014012	GAG	2	6	32519	32524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138803
619	NC_014012	GAA	2	6	32672	32677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138803
620	NC_014012	TATG	2	8	32683	32690	25 %	50 %	25 %	0 %	294138803
621	NC_014012	GCT	2	6	32754	32759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014012	T	6	6	32769	32774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014012	ATGG	2	8	32854	32861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014012	TCT	2	6	33004	33009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014012	TAA	2	6	33032	33037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014012	CTAT	2	8	33235	33242	25 %	50 %	0 %	25 %	294138804
627	NC_014012	GAT	2	6	33303	33308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138804
628	NC_014012	AG	3	6	33347	33352	50 %	0 %	50 %	0 %	294138804
629	NC_014012	GCG	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138804
630	NC_014012	TCTA	2	8	33422	33429	25 %	50 %	0 %	25 %	294138804
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