MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014012	TCT	2	6	361688	361693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139072
6502	NC_014012	GGTCG	2	10	361707	361716	0 %	20 %	60 %	20 %	294139072
6503	NC_014012	TGA	2	6	361750	361755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139072
6504	NC_014012	TGAG	2	8	361794	361801	25 %	25 %	50 %	0 %	294139072
6505	NC_014012	CTG	3	9	361803	361811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139072
6506	NC_014012	TGG	2	6	361822	361827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139072
6507	NC_014012	ATT	2	6	361836	361841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139072
6508	NC_014012	GCT	2	6	361898	361903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139072
6509	NC_014012	ATA	2	6	361920	361925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139072
6510	NC_014012	CTTTAC	2	12	361963	361974	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294139072
6511	NC_014012	CAA	2	6	362000	362005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139072
6512	NC_014012	TTG	2	6	362022	362027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139072
6513	NC_014012	AG	3	6	362050	362055	50 %	0 %	50 %	0 %	294139072
6514	NC_014012	AGA	2	6	362128	362133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139072
6515	NC_014012	CGG	2	6	362163	362168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139072
6516	NC_014012	ACT	2	6	362186	362191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139072
6517	NC_014012	ATA	2	6	362238	362243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139072
6518	NC_014012	CAC	2	6	362304	362309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139072
6519	NC_014012	TTAAGC	2	12	362334	362345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139072
6520	NC_014012	ATG	2	6	362382	362387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139072
6521	NC_014012	CTT	2	6	362428	362433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139072
6522	NC_014012	ATC	2	6	362612	362617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_014012	A	7	7	362655	362661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_014012	TTC	2	6	362662	362667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_014012	A	6	6	362739	362744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_014012	GGA	2	6	362784	362789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_014012	AATA	2	8	362853	362860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_014012	ATT	2	6	362960	362965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139073
6529	NC_014012	GTA	2	6	362970	362975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6530	NC_014012	GTT	2	6	363057	363062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139073
6531	NC_014012	TCA	2	6	363068	363073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139073
6532	NC_014012	AAT	2	6	363078	363083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139073
6533	NC_014012	GTA	2	6	363175	363180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6534	NC_014012	ATG	2	6	363205	363210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6535	NC_014012	TGG	2	6	363317	363322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139073
6536	NC_014012	CTTG	2	8	363356	363363	0 %	50 %	25 %	25 %	294139073
6537	NC_014012	TGA	2	6	363365	363370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6538	NC_014012	CTAG	2	8	363462	363469	25 %	25 %	25 %	25 %	294139073
6539	NC_014012	GCG	2	6	363472	363477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139073
6540	NC_014012	CAA	2	6	363478	363483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139073
6541	NC_014012	ATT	2	6	363502	363507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139073
6542	NC_014012	AGA	2	6	363512	363517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139073
6543	NC_014012	GGC	2	6	363621	363626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139073
6544	NC_014012	CGA	2	6	363670	363675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6545	NC_014012	ATCGA	2	10	363823	363832	40 %	20 %	20 %	20 %	294139073
6546	NC_014012	TGCTGA	2	12	363887	363898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139073
6547	NC_014012	TGAGC	2	10	363908	363917	20 %	20 %	40 %	20 %	294139073
6548	NC_014012	AAT	2	6	363963	363968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139073
6549	NC_014012	CGG	2	6	364006	364011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139073
6550	NC_014012	GCA	2	6	364036	364041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6551	NC_014012	ATGCCG	2	12	364114	364125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6552	NC_014012	AAG	2	6	364168	364173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139073
6553	NC_014012	TG	4	8	364216	364223	0 %	50 %	50 %	0 %	294139073
6554	NC_014012	GAT	2	6	364320	364325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6555	NC_014012	GAT	2	6	364377	364382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6556	NC_014012	CGA	2	6	364463	364468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6557	NC_014012	TAA	2	6	364559	364564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139073
6558	NC_014012	CT	3	6	364749	364754	0 %	50 %	0 %	50 %	294139073
6559	NC_014012	CTG	2	6	364791	364796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6560	NC_014012	CGA	2	6	364808	364813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6561	NC_014012	TCT	2	6	364822	364827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139073
6562	NC_014012	ACC	2	6	364841	364846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139073
6563	NC_014012	TTTC	2	8	364907	364914	0 %	75 %	0 %	25 %	294139073
6564	NC_014012	CAT	2	6	364943	364948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139073
6565	NC_014012	TGGC	2	8	364960	364967	0 %	25 %	50 %	25 %	294139073
6566	NC_014012	AT	3	6	364976	364981	50 %	50 %	0 %	0 %	294139073
6567	NC_014012	ATT	2	6	365047	365052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139073
6568	NC_014012	GAT	2	6	365055	365060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6569	NC_014012	TGG	2	6	365083	365088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139073
6570	NC_014012	AGACT	2	10	365119	365128	40 %	20 %	20 %	20 %	294139073
6571	NC_014012	CT	3	6	365127	365132	0 %	50 %	0 %	50 %	294139073
6572	NC_014012	GAC	2	6	365187	365192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6573	NC_014012	T	6	6	365197	365202	0 %	100 %	0 %	0 %	294139073
6574	NC_014012	GGC	2	6	365206	365211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139073
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6576	NC_014012	GAT	3	9	365268	365276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
6577	NC_014012	TTGA	2	8	365283	365290	25 %	50 %	25 %	0 %	294139073
6578	NC_014012	GTT	2	6	365535	365540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139073
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6580	NC_014012	TGC	2	6	365585	365590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139073
6581	NC_014012	CTAGTG	2	12	365599	365610	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139073
6582	NC_014012	TTC	2	6	365766	365771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139073
6583	NC_014012	ATAG	2	8	365819	365826	50 %	25 %	25 %	0 %	294139073
6584	NC_014012	TAGC	2	8	365886	365893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6585	NC_014012	GTT	2	6	365960	365965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_014012	TCACCT	2	12	365971	365982	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6587	NC_014012	AAAT	2	8	366091	366098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_014012	GTT	2	6	366149	366154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_014012	T	6	6	366167	366172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_014012	AAG	2	6	366212	366217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139074
6591	NC_014012	T	6	6	366228	366233	0 %	100 %	0 %	0 %	294139074
6592	NC_014012	TCGA	2	8	366245	366252	25 %	25 %	25 %	25 %	294139074
6593	NC_014012	GGC	2	6	366364	366369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139074
6594	NC_014012	CAAG	2	8	366493	366500	50 %	0 %	25 %	25 %	294139074
6595	NC_014012	GT	3	6	366513	366518	0 %	50 %	50 %	0 %	294139074
6596	NC_014012	TG	3	6	366545	366550	0 %	50 %	50 %	0 %	294139074
6597	NC_014012	CGT	2	6	366575	366580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139074
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6599	NC_014012	GCT	2	6	366644	366649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139074
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6602	NC_014012	TGGTG	2	10	366745	366754	0 %	40 %	60 %	0 %	294139074
6603	NC_014012	TCA	2	6	366758	366763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139074
6604	NC_014012	GGT	2	6	366776	366781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139074
6605	NC_014012	TGA	2	6	366790	366795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139074
6606	NC_014012	ATC	2	6	366800	366805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139074
6607	NC_014012	CGT	2	6	366815	366820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139074
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6609	NC_014012	GGT	3	9	367190	367198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139074
6610	NC_014012	GAT	2	6	367210	367215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139074
6611	NC_014012	GGC	2	6	367226	367231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139074
6612	NC_014012	TCT	2	6	367236	367241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139074
6613	NC_014012	GAA	2	6	367244	367249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139074
6614	NC_014012	T	6	6	367290	367295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014012	GTT	2	6	367318	367323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_014012	T	7	7	367335	367341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_014012	T	6	6	367385	367390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_014012	TAT	2	6	367444	367449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139075
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6620	NC_014012	GCT	2	6	367633	367638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139075
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6622	NC_014012	ATC	2	6	367773	367778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139075
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6990	NC_014012	TGA	2	6	389882	389887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139091
6991	NC_014012	AGG	2	6	389960	389965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139091
6992	NC_014012	TCAA	2	8	389990	389997	50 %	25 %	0 %	25 %	294139091
6993	NC_014012	CAG	2	6	390032	390037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139091
6994	NC_014012	ACC	2	6	390046	390051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139091
6995	NC_014012	GCGCC	2	10	390174	390183	0 %	0 %	40 %	60 %	294139091
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6997	NC_014012	GCA	2	6	390338	390343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139091
6998	NC_014012	AGA	2	6	390348	390353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139091
6999	NC_014012	AGG	2	6	390374	390379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139091
7000	NC_014012	GCG	2	6	390382	390387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139091

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