MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014012	ACCAC	2	10	333025	333034	40 %	0 %	0 %	60 %	294139047
6002	NC_014012	GCC	2	6	333229	333234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139047
6003	NC_014012	CCG	2	6	333259	333264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139047
6004	NC_014012	GAC	2	6	333327	333332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139047
6005	NC_014012	TTG	2	6	333511	333516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139047
6006	NC_014012	TAC	2	6	333543	333548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139047
6007	NC_014012	TTC	2	6	333573	333578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139047
6008	NC_014012	TCG	2	6	333583	333588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139047
6009	NC_014012	GCG	2	6	333601	333606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139047
6010	NC_014012	TAC	2	6	333765	333770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139047
6011	NC_014012	AAT	2	6	333780	333785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139047
6012	NC_014012	TGC	2	6	333856	333861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139047
6013	NC_014012	TGC	2	6	333897	333902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139047
6014	NC_014012	GAA	2	6	333936	333941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139047
6015	NC_014012	AGGC	2	8	333993	334000	25 %	0 %	50 %	25 %	294139047
6016	NC_014012	CAT	2	6	334056	334061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139047
6017	NC_014012	TAG	2	6	334070	334075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139047
6018	NC_014012	TTG	2	6	334149	334154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139047
6019	NC_014012	TACT	2	8	334220	334227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_014012	TGG	2	6	334272	334277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014012	CAG	2	6	334342	334347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139048
6022	NC_014012	AGGCA	2	10	334411	334420	40 %	0 %	40 %	20 %	294139048
6023	NC_014012	GCA	2	6	334437	334442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139048
6024	NC_014012	T	6	6	334492	334497	0 %	100 %	0 %	0 %	294139048
6025	NC_014012	GAAA	2	8	334568	334575	75 %	0 %	25 %	0 %	294139048
6026	NC_014012	TGG	2	6	334633	334638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
6027	NC_014012	CTA	2	6	334866	334871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139048
6028	NC_014012	GTG	2	6	334888	334893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
6029	NC_014012	ATGG	2	8	334942	334949	25 %	25 %	50 %	0 %	294139048
6030	NC_014012	CTG	2	6	334979	334984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139048
6031	NC_014012	CGAT	2	8	334994	335001	25 %	25 %	25 %	25 %	294139048
6032	NC_014012	GCT	2	6	335049	335054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139048
6033	NC_014012	TGC	2	6	335085	335090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139048
6034	NC_014012	GTG	2	6	335134	335139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
6035	NC_014012	TC	3	6	335148	335153	0 %	50 %	0 %	50 %	294139048
6036	NC_014012	AAG	2	6	335174	335179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139048
6037	NC_014012	ATG	2	6	335448	335453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
6038	NC_014012	TGT	2	6	335540	335545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139048
6039	NC_014012	CTC	2	6	335563	335568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139048
6040	NC_014012	ATT	2	6	335576	335581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139048
6041	NC_014012	ATG	3	9	335627	335635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
6042	NC_014012	CTTGC	2	10	335791	335800	0 %	40 %	20 %	40 %	294139048
6043	NC_014012	CTGC	2	8	335913	335920	0 %	25 %	25 %	50 %	294139048
6044	NC_014012	TTC	2	6	335941	335946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139048
6045	NC_014012	ATCT	2	8	335977	335984	25 %	50 %	0 %	25 %	294139048
6046	NC_014012	CTT	2	6	336069	336074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139048
6047	NC_014012	ATG	2	6	336144	336149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
6048	NC_014012	GGT	2	6	336163	336168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
6049	NC_014012	A	6	6	336177	336182	100 %	0 %	0 %	0 %	294139048
6050	NC_014012	GTG	2	6	336185	336190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
6051	NC_014012	ATA	2	6	336265	336270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139048
6052	NC_014012	TA	3	6	336294	336299	50 %	50 %	0 %	0 %	294139048
6053	NC_014012	GTA	2	6	336309	336314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
6054	NC_014012	TGC	2	6	336407	336412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139048
6055	NC_014012	CAA	2	6	336519	336524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139048
6056	NC_014012	CAGG	2	8	336538	336545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_014012	TTAA	2	8	336547	336554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014012	GAAT	2	8	336556	336563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014012	GCT	2	6	336584	336589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_014012	TA	3	6	336606	336611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_014012	A	6	6	336626	336631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014012	CGC	2	6	336688	336693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139049
6063	NC_014012	CA	3	6	336723	336728	50 %	0 %	0 %	50 %	294139049
6064	NC_014012	AGC	2	6	336750	336755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139049
6065	NC_014012	ATTT	2	8	336757	336764	25 %	75 %	0 %	0 %	294139049
6066	NC_014012	GAA	2	6	336854	336859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139049
6067	NC_014012	TAA	2	6	336880	336885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139049
6068	NC_014012	TAG	2	6	336939	336944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139049
6069	NC_014012	AG	3	6	336947	336952	50 %	0 %	50 %	0 %	294139049
6070	NC_014012	GCC	2	6	337025	337030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139049
6071	NC_014012	GCT	2	6	337040	337045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139049
6072	NC_014012	AG	3	6	337057	337062	50 %	0 %	50 %	0 %	294139049
6073	NC_014012	TAGC	2	8	337098	337105	25 %	25 %	25 %	25 %	294139049
6074	NC_014012	AGTC	2	8	337109	337116	25 %	25 %	25 %	25 %	294139049
6075	NC_014012	GCG	2	6	337435	337440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_014012	TTC	2	6	337443	337448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_014012	T	7	7	337541	337547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_014012	GTA	2	6	337555	337560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014012	ACTTGT	2	12	337690	337701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294139050
6080	NC_014012	CTG	2	6	337727	337732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139050
6081	NC_014012	TGG	2	6	337806	337811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139050
6082	NC_014012	CAA	2	6	337827	337832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139050
6083	NC_014012	AAG	2	6	337852	337857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139050
6084	NC_014012	TTTA	2	8	337863	337870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014012	T	6	6	337913	337918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014012	TTA	2	6	337933	337938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014012	TG	3	6	337956	337961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014012	CTG	2	6	338092	338097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_014012	AAAG	2	8	338130	338137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014012	GAT	2	6	338191	338196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014012	TAT	2	6	338265	338270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014012	A	6	6	338277	338282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014012	AAGTT	2	10	338310	338319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014012	A	7	7	338505	338511	100 %	0 %	0 %	0 %	294139051
6095	NC_014012	CAA	2	6	338526	338531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139051
6096	NC_014012	CTTAGG	2	12	338735	338746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139051
6097	NC_014012	GCT	2	6	338792	338797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139051
6098	NC_014012	TCA	2	6	338863	338868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139051
6099	NC_014012	GCG	2	6	339096	339101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139051
6100	NC_014012	ATG	2	6	339120	339125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139051
6101	NC_014012	CTT	2	6	339278	339283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139051
6102	NC_014012	AGA	2	6	339314	339319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139051
6103	NC_014012	ATCCTG	2	12	339364	339375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139051
6104	NC_014012	GTG	2	6	339487	339492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139051
6105	NC_014012	ATG	2	6	339520	339525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139051
6106	NC_014012	GTTT	2	8	339759	339766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_014012	T	6	6	339797	339802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014012	ATT	2	6	339856	339861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_014012	TTTG	2	8	339883	339890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_014012	TAGA	2	8	339904	339911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014012	TCT	2	6	339924	339929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014012	ATA	2	6	339988	339993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_014012	CTAA	2	8	340031	340038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_014012	CAA	2	6	340139	340144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_014012	TTAT	2	8	340170	340177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_014012	ATG	2	6	340188	340193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_014012	CT	3	6	340205	340210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_014012	TGC	2	6	340335	340340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139052
6119	NC_014012	AGA	2	6	340345	340350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139052
6120	NC_014012	TTC	2	6	340460	340465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139052
6121	NC_014012	GCT	2	6	340489	340494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139052
6122	NC_014012	AGA	2	6	340501	340506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139052
6123	NC_014012	GA	3	6	340562	340567	50 %	0 %	50 %	0 %	294139052
6124	NC_014012	GCTAGA	2	12	340615	340626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294139052
6125	NC_014012	AG	3	6	340641	340646	50 %	0 %	50 %	0 %	294139052
6126	NC_014012	ATG	2	6	340757	340762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139052
6127	NC_014012	TGC	2	6	340806	340811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139052
6128	NC_014012	AGATG	2	10	340837	340846	40 %	20 %	40 %	0 %	294139052
6129	NC_014012	T	6	6	340902	340907	0 %	100 %	0 %	0 %	294139052
6130	NC_014012	CGA	2	6	340910	340915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139052
6131	NC_014012	GTG	2	6	340937	340942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139052
6132	NC_014012	T	7	7	341038	341044	0 %	100 %	0 %	0 %	294139052
6133	NC_014012	GCT	2	6	341089	341094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139052
6134	NC_014012	AG	4	8	341104	341111	50 %	0 %	50 %	0 %	294139052
6135	NC_014012	TGGT	2	8	341143	341150	0 %	50 %	50 %	0 %	294139052
6136	NC_014012	TATG	2	8	341152	341159	25 %	50 %	25 %	0 %	294139052
6137	NC_014012	TCT	2	6	341250	341255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139052
6138	NC_014012	TCA	2	6	341287	341292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139052
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6140	NC_014012	AAC	2	6	341327	341332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139052
6141	NC_014012	ACTGT	2	10	341411	341420	20 %	40 %	20 %	20 %	294139052
6142	NC_014012	TCTCC	2	10	341425	341434	0 %	40 %	0 %	60 %	294139052
6143	NC_014012	CTTAG	2	10	341471	341480	20 %	40 %	20 %	20 %	294139052
6144	NC_014012	TGA	2	6	341487	341492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139052
6145	NC_014012	TAG	2	6	341580	341585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139052
6146	NC_014012	GAG	2	6	341843	341848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139052
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6148	NC_014012	CTC	3	9	341961	341969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6149	NC_014012	ATG	2	6	342031	342036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_014012	T	7	7	342066	342072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_014012	TAAGTG	2	12	342102	342113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_014012	TTG	2	6	342132	342137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_014012	CTT	2	6	342152	342157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6154	NC_014012	ATT	2	6	342247	342252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6155	NC_014012	CAA	2	6	342360	342365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139053
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6157	NC_014012	ATT	2	6	342650	342655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139053
6158	NC_014012	TAAGT	2	10	342681	342690	40 %	40 %	20 %	0 %	294139053
6159	NC_014012	GCT	2	6	342733	342738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139053
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6162	NC_014012	GTA	2	6	342865	342870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139053
6163	NC_014012	ACG	2	6	342894	342899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139053
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6179	NC_014012	TTG	2	6	343928	343933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139055
6180	NC_014012	GCA	2	6	343996	344001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139055
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6182	NC_014012	ATG	2	6	344040	344045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139055
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6184	NC_014012	GGAA	2	8	344352	344359	50 %	0 %	50 %	0 %	294139055
6185	NC_014012	ATTGC	2	10	344469	344478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6186	NC_014012	TTAT	2	8	344484	344491	25 %	75 %	0 %	0 %	294139056
6187	NC_014012	CCGAC	2	10	344523	344532	20 %	0 %	20 %	60 %	294139056
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6190	NC_014012	AAAT	2	8	344771	344778	75 %	25 %	0 %	0 %	294139056
6191	NC_014012	TGT	2	6	344814	344819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139057
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6194	NC_014012	CTG	2	6	344961	344966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139057
6195	NC_014012	CGT	2	6	345005	345010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139057
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6199	NC_014012	GTCT	2	8	345276	345283	0 %	50 %	25 %	25 %	294139057
6200	NC_014012	TTCGAG	2	12	345325	345336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139057
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6490	NC_014012	GCT	2	6	361039	361044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139072
6491	NC_014012	GAT	2	6	361058	361063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139072
6492	NC_014012	CTG	2	6	361077	361082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139072
6493	NC_014012	GTA	2	6	361119	361124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139072
6494	NC_014012	GCG	2	6	361125	361130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139072
6495	NC_014012	TGCT	2	8	361155	361162	0 %	50 %	25 %	25 %	294139072
6496	NC_014012	TTG	2	6	361201	361206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139072
6497	NC_014012	TTC	2	6	361330	361335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139072
6498	NC_014012	ACTC	2	8	361417	361424	25 %	25 %	0 %	50 %	294139072
6499	NC_014012	GTA	2	6	361545	361550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139072
6500	NC_014012	TGG	2	6	361664	361669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139072

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