MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014012	GATA	2	8	251692	251699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014012	GCA	2	6	251702	251707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_014012	GTCC	2	8	251772	251779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_014012	TAG	2	6	251800	251805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_014012	AAAG	2	8	251827	251834	75 %	0 %	25 %	0 %	294138984
4506	NC_014012	T	6	6	251836	251841	0 %	100 %	0 %	0 %	294138984
4507	NC_014012	AGAGGT	2	12	251887	251898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294138984
4508	NC_014012	GCTG	2	8	251917	251924	0 %	25 %	50 %	25 %	294138984
4509	NC_014012	AAG	2	6	251928	251933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4510	NC_014012	GCG	2	6	251984	251989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138984
4511	NC_014012	AGC	2	6	251995	252000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4512	NC_014012	GCT	2	6	252020	252025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4513	NC_014012	CAAGA	2	10	252063	252072	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
4514	NC_014012	CAAGA	2	10	252087	252096	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
4515	NC_014012	CAAGA	2	10	252111	252120	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
4516	NC_014012	AGC	2	6	252142	252147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4517	NC_014012	AGC	2	6	252166	252171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4518	NC_014012	AGC	2	6	252190	252195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4519	NC_014012	CAAGA	2	10	252207	252216	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
4520	NC_014012	AAG	2	6	252237	252242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4521	NC_014012	AAG	2	6	252261	252266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4522	NC_014012	AAG	2	6	252285	252290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4523	NC_014012	AAG	2	6	252333	252338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4524	NC_014012	CAAG	2	8	252347	252354	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4525	NC_014012	AGC	2	6	252358	252363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4526	NC_014012	CAAG	2	8	252371	252378	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4527	NC_014012	AAG	2	6	252381	252386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4528	NC_014012	CAAG	2	8	252395	252402	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4529	NC_014012	AAG	2	6	252405	252410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4530	NC_014012	AAG	2	6	252429	252434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4531	NC_014012	AAG	2	6	252453	252458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4532	NC_014012	AAG	2	6	252477	252482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4533	NC_014012	CAAGA	2	10	252495	252504	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
4534	NC_014012	AAG	2	6	252525	252530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4535	NC_014012	AAG	2	6	252549	252554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4536	NC_014012	AAG	2	6	252573	252578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4537	NC_014012	CAAG	2	8	252587	252594	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4538	NC_014012	AGC	2	6	252598	252603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4539	NC_014012	CAAG	2	8	252611	252618	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4540	NC_014012	AAG	2	6	252621	252626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4541	NC_014012	CAAG	2	8	252635	252642	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4542	NC_014012	CAAG	2	8	252659	252666	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4543	NC_014012	CAAG	2	8	252683	252690	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4544	NC_014012	AAG	2	6	252741	252746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4545	NC_014012	AAG	2	6	252765	252770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4546	NC_014012	AAG	2	6	252789	252794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4547	NC_014012	GAAGCT	2	12	252815	252826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294138984
4548	NC_014012	CAAG	2	8	252851	252858	50 %	0 %	25 %	25 %	294138984
4549	NC_014012	AGC	2	6	252862	252867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4550	NC_014012	AAG	2	6	252885	252890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4551	NC_014012	AAG	2	6	252909	252914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4552	NC_014012	AGC	2	6	252934	252939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4553	NC_014012	CAA	2	6	252977	252982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138984
4554	NC_014012	AG	3	6	253004	253009	50 %	0 %	50 %	0 %	294138984
4555	NC_014012	GA	3	6	253027	253032	50 %	0 %	50 %	0 %	294138984
4556	NC_014012	AGAA	2	8	253056	253063	75 %	0 %	25 %	0 %	294138984
4557	NC_014012	GCG	2	6	253067	253072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138984
4558	NC_014012	CAA	2	6	253073	253078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138984
4559	NC_014012	AGC	2	6	253089	253094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4560	NC_014012	CTT	2	6	253126	253131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138984
4561	NC_014012	AAG	2	6	253205	253210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4562	NC_014012	GAT	3	9	253214	253222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138984
4563	NC_014012	AGC	2	6	253242	253247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4564	NC_014012	ACT	3	9	253274	253282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138984
4565	NC_014012	AGC	2	6	253320	253325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138984
4566	NC_014012	ACT	2	6	253351	253356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138984
4567	NC_014012	AGA	2	6	253371	253376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4568	NC_014012	TGG	2	6	253440	253445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138984
4569	NC_014012	CCGCG	2	10	253543	253552	0 %	0 %	40 %	60 %	294138984
4570	NC_014012	GTG	2	6	253634	253639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138984
4571	NC_014012	GAA	2	6	253759	253764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4572	NC_014012	CTC	2	6	253779	253784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138984
4573	NC_014012	TTC	2	6	253844	253849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138984
4574	NC_014012	AAGA	2	8	253850	253857	75 %	0 %	25 %	0 %	294138984
4575	NC_014012	AGAT	2	8	253974	253981	50 %	25 %	25 %	0 %	294138984
4576	NC_014012	GAA	2	6	254039	254044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138984
4577	NC_014012	AAT	2	6	254086	254091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_014012	GAA	2	6	254113	254118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014012	GAT	2	6	254176	254181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138985
4580	NC_014012	AAGT	2	8	254193	254200	50 %	25 %	25 %	0 %	294138985
4581	NC_014012	CGA	2	6	254408	254413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138985
4582	NC_014012	A	6	6	254518	254523	100 %	0 %	0 %	0 %	294138985
4583	NC_014012	GCG	2	6	254534	254539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138985
4584	NC_014012	CCA	2	6	254572	254577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138985
4585	NC_014012	TGG	2	6	254593	254598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138985
4586	NC_014012	CAA	2	6	254603	254608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138985
4587	NC_014012	CCT	2	6	254642	254647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138985
4588	NC_014012	ACT	2	6	254738	254743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138985
4589	NC_014012	AC	3	6	254756	254761	50 %	0 %	0 %	50 %	294138985
4590	NC_014012	AGG	2	6	254824	254829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138985
4591	NC_014012	GGA	2	6	254830	254835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138985
4592	NC_014012	ATG	2	6	254879	254884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014012	CA	3	6	254893	254898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_014012	AAG	2	6	254914	254919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138986
4595	NC_014012	AAG	2	6	254931	254936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138986
4596	NC_014012	TTC	2	6	254968	254973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138986
4597	NC_014012	ACA	2	6	254985	254990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138986
4598	NC_014012	GCA	2	6	255079	255084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138986
4599	NC_014012	GCC	2	6	255136	255141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138986
4600	NC_014012	GA	3	6	255175	255180	50 %	0 %	50 %	0 %	294138986
4601	NC_014012	CAG	2	6	255326	255331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138986
4602	NC_014012	AAG	2	6	255391	255396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138986
4603	NC_014012	GTG	2	6	255463	255468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138986
4604	NC_014012	GCC	2	6	255499	255504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138986
4605	NC_014012	TCG	2	6	255564	255569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138986
4606	NC_014012	TGA	2	6	255584	255589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138986
4607	NC_014012	GGT	2	6	255661	255666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138986
4608	NC_014012	CTTGG	2	10	255669	255678	0 %	40 %	40 %	20 %	294138986
4609	NC_014012	GTCTTG	2	12	255691	255702	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294138986
4610	NC_014012	TGG	2	6	255773	255778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138986
4611	NC_014012	GGTT	2	8	255814	255821	0 %	50 %	50 %	0 %	294138986
4612	NC_014012	CCA	2	6	255843	255848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138986
4613	NC_014012	AGTA	2	8	256007	256014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014012	A	7	7	256060	256066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014012	AAG	2	6	256074	256079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014012	ATT	2	6	256106	256111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014012	GT	3	6	256121	256126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_014012	TCA	2	6	256155	256160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_014012	CGC	2	6	256197	256202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_014012	TTG	2	6	256218	256223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014012	CAAT	2	8	256334	256341	50 %	25 %	0 %	25 %	294138987
4622	NC_014012	CA	3	6	256395	256400	50 %	0 %	0 %	50 %	294138987
4623	NC_014012	TTCGT	2	10	256500	256509	0 %	60 %	20 %	20 %	294138987
4624	NC_014012	AAG	2	6	256566	256571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138987
4625	NC_014012	TGA	2	6	256584	256589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138987
4626	NC_014012	TTC	2	6	256733	256738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138987
4627	NC_014012	GAA	2	6	256753	256758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138987
4628	NC_014012	TTGG	2	8	256764	256771	0 %	50 %	50 %	0 %	294138987
4629	NC_014012	GCT	2	6	256853	256858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138987
4630	NC_014012	TCT	2	6	256999	257004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138987
4631	NC_014012	TGA	2	6	257023	257028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138987
4632	NC_014012	TTC	2	6	257043	257048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138987
4633	NC_014012	GTTG	2	8	257055	257062	0 %	50 %	50 %	0 %	294138987
4634	NC_014012	GAA	2	6	257137	257142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138987
4635	NC_014012	CTG	2	6	257211	257216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_014012	T	7	7	257224	257230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_014012	ATGG	2	8	257259	257266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_014012	TTCC	2	8	257529	257536	0 %	50 %	0 %	50 %	294138988
4639	NC_014012	GCGG	2	8	257628	257635	0 %	0 %	75 %	25 %	294138988
4640	NC_014012	TGC	2	6	257668	257673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138988
4641	NC_014012	TGA	2	6	257687	257692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138988
4642	NC_014012	GGCA	2	8	257697	257704	25 %	0 %	50 %	25 %	294138988
4643	NC_014012	GAT	2	6	257736	257741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138988
4644	NC_014012	TGC	2	6	257761	257766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138988
4645	NC_014012	TCT	2	6	257785	257790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138988
4646	NC_014012	CAC	2	6	257804	257809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138988
4647	NC_014012	TGT	2	6	257822	257827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138988
4648	NC_014012	TCA	2	6	257857	257862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138988
4649	NC_014012	A	6	6	257886	257891	100 %	0 %	0 %	0 %	294138988
4650	NC_014012	AGG	2	6	257976	257981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138988
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4655	NC_014012	GA	3	6	258283	258288	50 %	0 %	50 %	0 %	294138988
4656	NC_014012	CT	3	6	258330	258335	0 %	50 %	0 %	50 %	294138988
4657	NC_014012	TGA	2	6	258377	258382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138988
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4661	NC_014012	TAG	2	6	258630	258635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138988
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4663	NC_014012	TC	3	6	258693	258698	0 %	50 %	0 %	50 %	294138988
4664	NC_014012	GTG	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138988
4665	NC_014012	TGC	2	6	258920	258925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138988
4666	NC_014012	GA	3	6	258977	258982	50 %	0 %	50 %	0 %	294138988
4667	NC_014012	CCT	2	6	259006	259011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4668	NC_014012	ATC	2	6	259040	259045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138989
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4675	NC_014012	ATC	2	6	259697	259702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138989
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4679	NC_014012	AACT	2	8	259919	259926	50 %	25 %	0 %	25 %	294138989
4680	NC_014012	CTG	2	6	259939	259944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138989
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4689	NC_014012	TGC	2	6	260352	260357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138990
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4704	NC_014012	CTG	2	6	261384	261389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138991
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4715	NC_014012	A	6	6	262184	262189	100 %	0 %	0 %	0 %	294138991
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4727	NC_014012	G	6	6	262616	262621	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4728	NC_014012	TTAG	2	8	262652	262659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4729	NC_014012	AATT	2	8	262695	262702	50 %	50 %	0 %	0 %	294138992
4730	NC_014012	TATC	2	8	262716	262723	25 %	50 %	0 %	25 %	294138992
4731	NC_014012	CACT	2	8	262724	262731	25 %	25 %	0 %	50 %	294138992
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4734	NC_014012	GAATG	2	10	262878	262887	40 %	20 %	40 %	0 %	294138992
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4740	NC_014012	AAT	2	6	263199	263204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4741	NC_014012	GTTG	2	8	263244	263251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_014012	CAAT	2	8	263399	263406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4743	NC_014012	GCT	2	6	263415	263420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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