MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 2927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014007	GCC	2	6	88	93	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023657
2	NC_014007	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023657
3	NC_014007	TCG	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023657
4	NC_014007	TGA	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023657
5	NC_014007	CGC	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023657
6	NC_014007	CGA	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023657
7	NC_014007	AAG	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023657
8	NC_014007	TCG	3	9	391	399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023657
9	NC_014007	AAG	2	6	404	409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023657
10	NC_014007	GGC	2	6	906	911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023657
11	NC_014007	GGC	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023657
12	NC_014007	GGC	2	6	1021	1026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023657
13	NC_014007	ACG	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023657
14	NC_014007	GCG	2	6	1240	1245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014007	CTG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
16	NC_014007	GCG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023658
17	NC_014007	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023658
18	NC_014007	GCC	3	9	1575	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023658
19	NC_014007	AAT	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294023658
20	NC_014007	CTG	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
21	NC_014007	GAG	2	6	1858	1863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023658
22	NC_014007	ACG	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023658
23	NC_014007	TGG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023658
24	NC_014007	TGC	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
25	NC_014007	TGG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023658
26	NC_014007	CCG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023658
27	NC_014007	TCG	2	6	2179	2184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
28	NC_014007	CGG	2	6	2186	2191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023658
29	NC_014007	CTG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
30	NC_014007	CGC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023658
31	NC_014007	TGA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023658
32	NC_014007	AGG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023658
33	NC_014007	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023659
34	NC_014007	AAG	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023659
35	NC_014007	GCG	2	6	2679	2684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
36	NC_014007	CGT	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023659
37	NC_014007	CTC	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023659
38	NC_014007	GAG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023659
39	NC_014007	CGC	2	6	2910	2915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023659
40	NC_014007	GCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
41	NC_014007	TCG	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023659
42	NC_014007	CGA	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023659
43	NC_014007	TAT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294023659
44	NC_014007	CGG	2	6	3229	3234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
45	NC_014007	GGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
46	NC_014007	GGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023659
47	NC_014007	CGG	2	6	3318	3323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
48	NC_014007	GCA	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023659
49	NC_014007	GCC	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023659
50	NC_014007	AAG	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023659
51	NC_014007	GGT	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023659
52	NC_014007	GCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023659
53	NC_014007	ATC	2	6	3727	3732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023660
54	NC_014007	CGT	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023660
55	NC_014007	GGA	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023660
56	NC_014007	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023660
57	NC_014007	TCT	3	9	4094	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023661
58	NC_014007	CGG	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023661
59	NC_014007	TCC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023661
60	NC_014007	TCG	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023661
61	NC_014007	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023661
62	NC_014007	CGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023661
63	NC_014007	CAC	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023662
64	NC_014007	GCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023662
65	NC_014007	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023662
66	NC_014007	CTT	2	6	5175	5180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014007	AAG	2	6	5215	5220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014007	AGC	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
69	NC_014007	CGC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023663
70	NC_014007	TTC	2	6	5390	5395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023663
71	NC_014007	GAC	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
72	NC_014007	CAG	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
73	NC_014007	CCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023663
74	NC_014007	GCG	2	6	5524	5529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
75	NC_014007	GCT	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023663
76	NC_014007	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
77	NC_014007	CGC	2	6	5764	5769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023663
78	NC_014007	CAG	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
79	NC_014007	GGC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
80	NC_014007	GCG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
81	NC_014007	AGC	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
82	NC_014007	CCT	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023663
83	NC_014007	GCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
84	NC_014007	GAT	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023663
85	NC_014007	AGC	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
86	NC_014007	GCA	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
87	NC_014007	TCC	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023663
88	NC_014007	GAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023663
89	NC_014007	CGG	2	6	6400	6405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
90	NC_014007	ACT	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014007	TGG	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014007	GCG	2	6	6548	6553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014007	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014007	TCG	2	6	6858	6863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
95	NC_014007	GAT	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023664
96	NC_014007	GGC	2	6	6920	6925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
97	NC_014007	CCG	2	6	6971	6976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023664
98	NC_014007	GAA	2	6	7001	7006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023664
99	NC_014007	TTG	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294023664
100	NC_014007	GGC	2	6	7117	7122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
101	NC_014007	GGC	2	6	7174	7179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
102	NC_014007	GCA	2	6	7231	7236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023664
103	NC_014007	AGG	2	6	7323	7328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023664
104	NC_014007	ACG	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023664
105	NC_014007	GAA	2	6	7379	7384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023664
106	NC_014007	CTC	2	6	7436	7441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023664
107	NC_014007	CTG	2	6	7457	7462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
108	NC_014007	CGG	2	6	7498	7503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
109	NC_014007	CGC	2	6	7505	7510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023664
110	NC_014007	GCG	2	6	7608	7613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
111	NC_014007	CGA	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023664
112	NC_014007	GGT	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023664
113	NC_014007	GCG	2	6	7677	7682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
114	NC_014007	GGC	2	6	7733	7738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
115	NC_014007	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023664
116	NC_014007	GTC	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
117	NC_014007	GCG	2	6	8023	8028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
118	NC_014007	GAT	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023664
119	NC_014007	CGG	2	6	8207	8212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
120	NC_014007	GGC	2	6	8242	8247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
121	NC_014007	GGC	2	6	8315	8320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
122	NC_014007	CGA	2	6	8326	8331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023664
123	NC_014007	GCC	2	6	8353	8358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023664
124	NC_014007	GAT	2	6	8429	8434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023664
125	NC_014007	TGC	2	6	8770	8775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
126	NC_014007	GCC	2	6	8841	8846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023664
127	NC_014007	GGC	2	6	8857	8862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
128	NC_014007	TCG	2	6	9080	9085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
129	NC_014007	CAG	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023664
130	NC_014007	CTG	2	6	9164	9169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
131	NC_014007	GAA	2	6	9204	9209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023664
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133	NC_014007	TCG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
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136	NC_014007	CGG	2	6	9555	9560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
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383	NC_014007	ACC	2	6	28224	28229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023693
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499	NC_014007	GTG	2	6	35995	36000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014007	CCG	2	6	36235	36240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023707

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