MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 89117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014006	GT	3	6	157239	157244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014006	GC	3	6	157317	157322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_014006	CGC	2	6	157346	157351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_014006	CTGAA	2	10	157355	157364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_014006	AC	3	6	157370	157375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_014006	GCC	2	6	157381	157386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_014006	GAT	2	6	157553	157558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014006	GCCGAC	2	12	157586	157597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_014006	GCC	2	6	157647	157652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_014006	CTG	2	6	157682	157687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_014006	TGC	2	6	157699	157704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_014006	GCA	2	6	157766	157771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_014006	CGG	2	6	157801	157806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_014006	CCT	2	6	157824	157829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_014006	GGC	2	6	157843	157848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_014006	GCG	2	6	157851	157856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010137
4017	NC_014006	GGGC	2	8	157876	157883	0 %	0 %	75 %	25 %	294010137
4018	NC_014006	CGC	2	6	157948	157953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010137
4019	NC_014006	CG	3	6	157973	157978	0 %	0 %	50 %	50 %	294010137
4020	NC_014006	GAC	2	6	158002	158007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010137
4021	NC_014006	GCC	2	6	158046	158051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4022	NC_014006	CGA	2	6	158089	158094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010138
4023	NC_014006	GC	3	6	158130	158135	0 %	0 %	50 %	50 %	294010138
4024	NC_014006	TAA	2	6	158292	158297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010138
4025	NC_014006	CGC	2	6	158344	158349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4026	NC_014006	GCCC	2	8	158473	158480	0 %	0 %	25 %	75 %	294010138
4027	NC_014006	GC	3	6	158500	158505	0 %	0 %	50 %	50 %	294010138
4028	NC_014006	CTCG	2	8	158558	158565	0 %	25 %	25 %	50 %	294010138
4029	NC_014006	CGATGG	2	12	158572	158583	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294010138
4030	NC_014006	GGT	2	6	158597	158602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010138
4031	NC_014006	GCCC	2	8	158617	158624	0 %	0 %	25 %	75 %	294010138
4032	NC_014006	CAC	2	6	158690	158695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010138
4033	NC_014006	TCC	2	6	158739	158744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010138
4034	NC_014006	AGC	2	6	158745	158750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010138
4035	NC_014006	CGC	3	9	158780	158788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4036	NC_014006	CGC	2	6	158803	158808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4037	NC_014006	GCGCC	2	10	158851	158860	0 %	0 %	40 %	60 %	294010138
4038	NC_014006	GCC	2	6	158874	158879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4039	NC_014006	TTC	2	6	158904	158909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294010138
4040	NC_014006	CCG	2	6	158926	158931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4041	NC_014006	CGC	2	6	158956	158961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4042	NC_014006	GGC	2	6	158984	158989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010138
4043	NC_014006	CCGC	2	8	158992	158999	0 %	0 %	25 %	75 %	294010138
4044	NC_014006	ACC	2	6	159012	159017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010138
4045	NC_014006	TGC	2	6	159090	159095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010138
4046	NC_014006	ACC	2	6	159096	159101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010138
4047	NC_014006	TCG	2	6	159105	159110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010138
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4052	NC_014006	CCG	3	9	159301	159309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4053	NC_014006	CAC	2	6	159335	159340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010138
4054	NC_014006	CCA	2	6	159406	159411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010138
4055	NC_014006	CCGCG	2	10	159415	159424	0 %	0 %	40 %	60 %	294010138
4056	NC_014006	CGCC	2	8	159439	159446	0 %	0 %	25 %	75 %	294010138
4057	NC_014006	GC	3	6	159459	159464	0 %	0 %	50 %	50 %	294010138
4058	NC_014006	GCCC	2	8	159493	159500	0 %	0 %	25 %	75 %	294010138
4059	NC_014006	CCAG	2	8	159517	159524	25 %	0 %	25 %	50 %	294010138
4060	NC_014006	CGC	2	6	159620	159625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4061	NC_014006	TCC	2	6	159627	159632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010138
4062	NC_014006	GCA	2	6	159634	159639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010138
4063	NC_014006	CCG	2	6	159652	159657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010138
4064	NC_014006	GCCAG	2	10	159676	159685	20 %	0 %	40 %	40 %	294010138
4065	NC_014006	TCG	2	6	159723	159728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010138
4066	NC_014006	GC	3	6	159774	159779	0 %	0 %	50 %	50 %	294010138
4067	NC_014006	GCC	2	6	159856	159861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_014006	AAGCA	2	10	159867	159876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4069	NC_014006	CGC	2	6	159931	159936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010139
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4071	NC_014006	CAT	2	6	159959	159964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010139
4072	NC_014006	TGG	2	6	159972	159977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010139
4073	NC_014006	GCG	2	6	160073	160078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
4074	NC_014006	GC	3	6	160186	160191	0 %	0 %	50 %	50 %	294010139
4075	NC_014006	GC	3	6	160203	160208	0 %	0 %	50 %	50 %	294010139
4076	NC_014006	CGC	3	9	160234	160242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010139
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4079	NC_014006	GC	3	6	160320	160325	0 %	0 %	50 %	50 %	294010139
4080	NC_014006	AAT	2	6	160370	160375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010139
4081	NC_014006	ATC	2	6	160436	160441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010139
4082	NC_014006	GTC	2	6	160453	160458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010139
4083	NC_014006	GCT	2	6	160486	160491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010139
4084	NC_014006	CTGG	2	8	160540	160547	0 %	25 %	50 %	25 %	294010139
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4090	NC_014006	CGC	2	6	160707	160712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010139
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4094	NC_014006	GGC	2	6	160923	160928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
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4105	NC_014006	GGC	2	6	161381	161386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
4106	NC_014006	GAC	2	6	161387	161392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010139
4107	NC_014006	CGG	2	6	161518	161523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
4108	NC_014006	CGG	2	6	161526	161531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
4109	NC_014006	GCG	2	6	161532	161537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
4110	NC_014006	TCA	2	6	161553	161558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010139
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4114	NC_014006	GC	3	6	161739	161744	0 %	0 %	50 %	50 %	294010139
4115	NC_014006	CCG	2	6	161753	161758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010139
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4118	NC_014006	GACG	2	8	161842	161849	25 %	0 %	50 %	25 %	294010139
4119	NC_014006	CTG	2	6	161858	161863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010139
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4121	NC_014006	CGG	2	6	161928	161933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010139
4122	NC_014006	CTCCC	2	10	161978	161987	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4123	NC_014006	AGGG	2	8	161992	161999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014006	GCGA	2	8	162012	162019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_014006	TCC	2	6	162050	162055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010140
4126	NC_014006	CCG	2	6	162075	162080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010140
4127	NC_014006	AAC	2	6	162113	162118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010140
4128	NC_014006	TGGA	2	8	162134	162141	25 %	25 %	50 %	0 %	294010140
4129	NC_014006	GC	3	6	162164	162169	0 %	0 %	50 %	50 %	294010140
4130	NC_014006	CGC	2	6	162172	162177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010140
4131	NC_014006	ATC	2	6	162183	162188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010140
4132	NC_014006	CCGC	2	8	162264	162271	0 %	0 %	25 %	75 %	294010140
4133	NC_014006	CG	3	6	162291	162296	0 %	0 %	50 %	50 %	294010140
4134	NC_014006	AAGGTG	2	12	162341	162352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294010140
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4140	NC_014006	CGC	2	6	162735	162740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010141
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4163	NC_014006	CTC	2	6	163523	163528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4164	NC_014006	GCCA	2	8	163565	163572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4165	NC_014006	GGGGA	2	10	163575	163584	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_014006	A	6	6	163641	163646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_014006	GC	3	6	163647	163652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4168	NC_014006	AGGAT	2	10	163678	163687	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4169	NC_014006	AATC	2	8	163701	163708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4172	NC_014006	CCTG	2	8	163811	163818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4173	NC_014006	CCCCT	2	10	163841	163850	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4174	NC_014006	AGGGG	2	10	163853	163862	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4175	NC_014006	AACC	2	8	163885	163892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4234	NC_014006	CGC	2	6	165695	165700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010142
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4237	NC_014006	CCCCT	2	10	165797	165806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4238	NC_014006	AGGGG	2	10	165809	165818	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_014006	TGGGG	2	10	165820	165829	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_014006	G	6	6	165826	165831	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_014006	GC	3	6	165856	165861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4242	NC_014006	CCCCT	2	10	165874	165883	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4243	NC_014006	AGGGG	2	10	165886	165895	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_014006	CAA	2	6	165918	165923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010143
4245	NC_014006	CAC	3	9	166041	166049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010143
4246	NC_014006	GGC	2	6	166057	166062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010143
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4248	NC_014006	CCA	2	6	166169	166174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010143
4249	NC_014006	GAT	2	6	166209	166214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010143
4250	NC_014006	CGC	2	6	166244	166249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010143
4251	NC_014006	CGC	2	6	166259	166264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010143
4252	NC_014006	GC	3	6	166292	166297	0 %	0 %	50 %	50 %	294010143
4253	NC_014006	TTC	2	6	166384	166389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294010143
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4275	NC_014006	CGG	2	6	167524	167529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_014006	CGAG	2	8	167631	167638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4277	NC_014006	GCC	2	6	167695	167700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010145
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4282	NC_014006	GCT	2	6	167951	167956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010145
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4314	NC_014006	CCGAG	2	10	169292	169301	20 %	0 %	40 %	40 %	294010146
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4321	NC_014006	GTG	2	6	169633	169638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010146
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4344	NC_014006	CGA	2	6	170418	170423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010147
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4350	NC_014006	CCAG	2	8	170703	170710	25 %	0 %	25 %	50 %	294010147
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4357	NC_014006	GATT	2	8	171076	171083	25 %	50 %	25 %	0 %	294010148
4358	NC_014006	G	6	6	171103	171108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4359	NC_014006	GCG	2	6	171156	171161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010149
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4361	NC_014006	GGA	2	6	171270	171275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010149
4362	NC_014006	CCGG	2	8	171309	171316	0 %	0 %	50 %	50 %	294010149
4363	NC_014006	CGG	2	6	171344	171349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010149
4364	NC_014006	GCAT	2	8	171388	171395	25 %	25 %	25 %	25 %	294010150
4365	NC_014006	CAT	2	6	171414	171419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010150
4366	NC_014006	GAG	2	6	171423	171428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010150
4367	NC_014006	GAG	2	6	171474	171479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010150
4368	NC_014006	ATT	2	6	171484	171489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294010150
4369	NC_014006	ATCT	2	8	171498	171505	25 %	50 %	0 %	25 %	294010150
4370	NC_014006	CGG	2	6	171559	171564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010150
4371	NC_014006	TGG	3	9	171571	171579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010150
4372	NC_014006	GGCT	2	8	171591	171598	0 %	25 %	50 %	25 %	294010150
4373	NC_014006	GCT	2	6	171614	171619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010150
4374	NC_014006	GC	3	6	171652	171657	0 %	0 %	50 %	50 %	294010150
4375	NC_014006	TGGCGG	2	12	171658	171669	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294010150
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4378	NC_014006	TGG	2	6	171856	171861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010150
4379	NC_014006	TCA	2	6	171877	171882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010150
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4383	NC_014006	GCT	2	6	172043	172048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010150
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4385	NC_014006	CTG	2	6	172095	172100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010150
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4391	NC_014006	TGG	2	6	172204	172209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010150
4392	NC_014006	CATGCC	2	12	172260	172271	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294010150
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4395	NC_014006	ATGC	2	8	172384	172391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4396	NC_014006	C	10	10	172488	172497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4397	NC_014006	CCG	2	6	172500	172505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4398	NC_014006	GCT	2	6	172547	172552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4399	NC_014006	T	6	6	172552	172557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_014006	CGCCCA	2	12	172595	172606	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	294010151
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4403	NC_014006	GC	3	6	172679	172684	0 %	0 %	50 %	50 %	294010151
4404	NC_014006	GCC	2	6	172721	172726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010151
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4443	NC_014006	GAT	2	6	174082	174087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010152
4444	NC_014006	GCG	2	6	174214	174219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4445	NC_014006	CAT	2	6	174338	174343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4447	NC_014006	GCCCA	2	10	174395	174404	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4448	NC_014006	TCAG	2	8	174473	174480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4449	NC_014006	CGC	2	6	174564	174569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010153
4450	NC_014006	GCT	2	6	174650	174655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010153
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4454	NC_014006	GCG	3	9	174801	174809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010153
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4475	NC_014006	CGA	2	6	175427	175432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010153
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4479	NC_014006	GGC	2	6	175568	175573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010153
4480	NC_014006	CGCGG	2	10	175608	175617	0 %	0 %	60 %	40 %	294010153
4481	NC_014006	GGCCA	2	10	175677	175686	20 %	0 %	40 %	40 %	294010153
4482	NC_014006	GAT	2	6	175734	175739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010153
4483	NC_014006	ATG	2	6	175788	175793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010153
4484	NC_014006	CAG	2	6	175842	175847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010153
4485	NC_014006	GCA	2	6	175853	175858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010153
4486	NC_014006	GC	3	6	175939	175944	0 %	0 %	50 %	50 %	294010153
4487	NC_014006	AGG	2	6	175945	175950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010153
4488	NC_014006	GC	3	6	175972	175977	0 %	0 %	50 %	50 %	294010153
4489	NC_014006	GGC	2	6	176064	176069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010153
4490	NC_014006	ACCG	2	8	176076	176083	25 %	0 %	25 %	50 %	294010153
4491	NC_014006	GCG	2	6	176089	176094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010153
4492	NC_014006	GAC	3	9	176130	176138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010153
4493	NC_014006	GCA	2	6	176139	176144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010153
4494	NC_014006	CGG	2	6	176159	176164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010153
4495	NC_014006	ATG	2	6	176230	176235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010153
4496	NC_014006	ACC	2	6	176242	176247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010153
4497	NC_014006	GGC	2	6	176414	176419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4498	NC_014006	CAG	2	6	176490	176495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010154
4499	NC_014006	CAGCCC	2	12	176497	176508	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	294010154
4500	NC_014006	GC	3	6	176517	176522	0 %	0 %	50 %	50 %	294010154

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