MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013959	CAG	3	9	162873	162881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3502	NC_013959	TGG	2	6	162908	162913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612622
3503	NC_013959	TGC	2	6	162923	162928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3504	NC_013959	CAG	2	6	162952	162957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3505	NC_013959	GGC	2	6	162959	162964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612622
3506	NC_013959	ATC	2	6	162967	162972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612622
3507	NC_013959	ATC	2	6	163030	163035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612622
3508	NC_013959	TGC	2	6	163052	163057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3509	NC_013959	GTT	2	6	163119	163124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612622
3510	NC_013959	GC	3	6	163195	163200	0 %	0 %	50 %	50 %	291612622
3511	NC_013959	GAT	2	6	163249	163254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612622
3512	NC_013959	GCA	2	6	163258	163263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3513	NC_013959	CCA	2	6	163281	163286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612622
3514	NC_013959	CG	3	6	163314	163319	0 %	0 %	50 %	50 %	291612622
3515	NC_013959	AGG	2	6	163367	163372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612622
3516	NC_013959	AG	3	6	163461	163466	50 %	0 %	50 %	0 %	291612622
3517	NC_013959	GCA	2	6	163491	163496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3518	NC_013959	G	6	6	163594	163599	0 %	0 %	100 %	0 %	291612622
3519	NC_013959	CAG	2	6	163614	163619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3520	NC_013959	ATA	2	6	163670	163675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612622
3521	NC_013959	GCA	2	6	163732	163737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612622
3522	NC_013959	CCATA	2	10	163771	163780	40 %	20 %	0 %	40 %	291612622
3523	NC_013959	CTG	2	6	163803	163808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612623
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3526	NC_013959	CGG	2	6	163989	163994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612623
3527	NC_013959	CGT	2	6	164024	164029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612623
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3533	NC_013959	GTT	2	6	164222	164227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612623
3534	NC_013959	CACT	2	8	164236	164243	25 %	25 %	0 %	50 %	291612623
3535	NC_013959	GC	3	6	164244	164249	0 %	0 %	50 %	50 %	291612623
3536	NC_013959	GAA	2	6	164250	164255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612623
3537	NC_013959	CTC	2	6	164372	164377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612623
3538	NC_013959	TCGT	2	8	164455	164462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_013959	AC	3	6	164475	164480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_013959	AAT	2	6	164488	164493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013959	CATG	2	8	164514	164521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_013959	AAT	2	6	164537	164542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013959	TAG	2	6	164546	164551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013959	CTTAA	2	10	164554	164563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3545	NC_013959	GAA	2	6	164578	164583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013959	AGC	2	6	164596	164601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013959	GGC	2	6	164711	164716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013959	AAT	2	6	164741	164746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013959	AGAA	2	8	164800	164807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013959	TGA	2	6	164839	164844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013959	TTG	2	6	164900	164905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013959	ATT	2	6	164925	164930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013959	CTA	2	6	164936	164941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013959	TCT	2	6	164958	164963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_013959	CA	3	6	165011	165016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_013959	TCT	2	6	165085	165090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_013959	TC	3	6	165110	165115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_013959	T	6	6	165162	165167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013959	ATT	2	6	165240	165245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_013959	GAA	2	6	165330	165335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013959	TTA	2	6	165357	165362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013959	GCA	2	6	165405	165410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612624
3563	NC_013959	TTA	2	6	165423	165428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612624
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3571	NC_013959	TTAG	2	8	165882	165889	25 %	50 %	25 %	0 %	291612624
3572	NC_013959	AAC	2	6	165914	165919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612624
3573	NC_013959	ATGC	2	8	165961	165968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_013959	A	6	6	166024	166029	100 %	0 %	0 %	0 %	291612625
3575	NC_013959	TACT	2	8	166068	166075	25 %	50 %	0 %	25 %	291612625
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3580	NC_013959	CGG	2	6	166286	166291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612625
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3583	NC_013959	AAG	2	6	166384	166389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612625
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3593	NC_013959	AGAA	2	8	166883	166890	75 %	0 %	25 %	0 %	291612625
3594	NC_013959	TGA	2	6	166970	166975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612625
3595	NC_013959	CGG	2	6	166979	166984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612625
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3597	NC_013959	ATA	3	9	167046	167054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_013959	ATT	2	6	167132	167137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013959	TTA	2	6	167139	167144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_013959	CAC	2	6	167194	167199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_013959	CAT	2	6	167363	167368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013959	AAC	2	6	167423	167428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612626
3604	NC_013959	GAG	2	6	167437	167442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612626
3605	NC_013959	TCG	2	6	167471	167476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612626
3606	NC_013959	CCTCG	2	10	167535	167544	0 %	20 %	20 %	60 %	291612626
3607	NC_013959	GCA	2	6	167764	167769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612626
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3609	NC_013959	TTG	2	6	167848	167853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612626
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3611	NC_013959	GGCA	2	8	167889	167896	25 %	0 %	50 %	25 %	291612626
3612	NC_013959	CGA	2	6	167940	167945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612626
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3617	NC_013959	ACC	2	6	168115	168120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612626
3618	NC_013959	AGCG	2	8	168163	168170	25 %	0 %	50 %	25 %	291612626
3619	NC_013959	TGG	2	6	168203	168208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612626
3620	NC_013959	GAA	2	6	168217	168222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612626
3621	NC_013959	CCCG	2	8	168300	168307	0 %	0 %	25 %	75 %	291612626
3622	NC_013959	GGT	2	6	168385	168390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612626
3623	NC_013959	TGC	2	6	168422	168427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612626
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3625	NC_013959	GC	3	6	168532	168537	0 %	0 %	50 %	50 %	291612626
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3748	NC_013959	GTG	2	6	174978	174983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612630
3749	NC_013959	CGG	2	6	174997	175002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
3750	NC_013959	TCG	2	6	175051	175056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612630
3751	NC_013959	GAA	2	6	175077	175082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612630
3752	NC_013959	GTGC	2	8	175083	175090	0 %	25 %	50 %	25 %	291612630
3753	NC_013959	TGG	2	6	175132	175137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612630
3754	NC_013959	GCT	2	6	175142	175147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612630
3755	NC_013959	GCG	2	6	175162	175167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
3756	NC_013959	ATT	2	6	175168	175173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612630
3757	NC_013959	GTC	2	6	175321	175326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612630
3758	NC_013959	ACT	2	6	175336	175341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612630
3759	NC_013959	GCA	2	6	175350	175355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612630
3760	NC_013959	GAC	2	6	175374	175379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612630
3761	NC_013959	TCA	2	6	175393	175398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612630
3762	NC_013959	GCG	2	6	175462	175467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
3763	NC_013959	GCCG	2	8	175475	175482	0 %	0 %	50 %	50 %	291612630
3764	NC_013959	CGG	2	6	175541	175546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
3765	NC_013959	CA	3	6	175697	175702	50 %	0 %	0 %	50 %	291612630
3766	NC_013959	CCA	2	6	175810	175815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612630
3767	NC_013959	GGTGT	2	10	175827	175836	0 %	40 %	60 %	0 %	291612630
3768	NC_013959	CGG	2	6	175874	175879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
3769	NC_013959	CCGAGG	2	12	175921	175932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291612630
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3771	NC_013959	GAAGG	2	10	176136	176145	40 %	0 %	60 %	0 %	291612630
3772	NC_013959	CGC	2	6	176159	176164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612630
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3774	NC_013959	GGA	2	6	176220	176225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612631
3775	NC_013959	CG	3	6	176243	176248	0 %	0 %	50 %	50 %	291612631
3776	NC_013959	GCA	2	6	176285	176290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612631
3777	NC_013959	CAA	2	6	176313	176318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612631
3778	NC_013959	GCA	2	6	176523	176528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3779	NC_013959	GCA	2	6	176539	176544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3780	NC_013959	GCGCT	2	10	176659	176668	0 %	20 %	40 %	40 %	291612632
3781	NC_013959	AC	3	6	176674	176679	50 %	0 %	0 %	50 %	291612632
3782	NC_013959	ATC	2	6	176775	176780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3783	NC_013959	CTG	2	6	176826	176831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3784	NC_013959	ATT	2	6	176839	176844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612632
3785	NC_013959	CAA	2	6	176852	176857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612632
3786	NC_013959	TGA	2	6	176860	176865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612632
3787	NC_013959	GTC	2	6	176915	176920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3788	NC_013959	TG	3	6	176966	176971	0 %	50 %	50 %	0 %	291612632
3789	NC_013959	GTG	2	6	177000	177005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3790	NC_013959	CGG	2	6	177058	177063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
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3792	NC_013959	GTG	2	6	177093	177098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3793	NC_013959	GCT	2	6	177185	177190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3794	NC_013959	CGAT	2	8	177214	177221	25 %	25 %	25 %	25 %	291612632
3795	NC_013959	GGC	2	6	177269	177274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
3796	NC_013959	GGCT	2	8	177281	177288	0 %	25 %	50 %	25 %	291612632
3797	NC_013959	TTC	2	6	177342	177347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612632
3798	NC_013959	ATC	2	6	177435	177440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3799	NC_013959	CGGGT	2	10	177457	177466	0 %	20 %	60 %	20 %	291612632
3800	NC_013959	GGC	2	6	177554	177559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
3801	NC_013959	TTGG	2	8	177594	177601	0 %	50 %	50 %	0 %	291612632
3802	NC_013959	AGC	2	6	177614	177619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3803	NC_013959	CG	3	6	177626	177631	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
3804	NC_013959	GGT	2	6	177716	177721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3805	NC_013959	GTGC	2	8	177744	177751	0 %	25 %	50 %	25 %	291612632
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3807	NC_013959	AC	3	6	177797	177802	50 %	0 %	0 %	50 %	291612632
3808	NC_013959	ACG	2	6	177807	177812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
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3810	NC_013959	GC	3	6	177899	177904	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
3811	NC_013959	TGG	2	6	177939	177944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3812	NC_013959	ATC	2	6	177945	177950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3813	NC_013959	GCGCA	2	10	177960	177969	20 %	0 %	40 %	40 %	291612632
3814	NC_013959	TGGA	2	8	178174	178181	25 %	25 %	50 %	0 %	291612632
3815	NC_013959	GAT	2	6	178251	178256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612632
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3817	NC_013959	GC	3	6	178416	178421	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
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3819	NC_013959	ATG	2	6	178510	178515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612632
3820	NC_013959	GCCT	2	8	178622	178629	0 %	25 %	25 %	50 %	291612632
3821	NC_013959	ACT	2	6	178767	178772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3822	NC_013959	CTGC	2	8	178831	178838	0 %	25 %	25 %	50 %	291612632
3823	NC_013959	ACC	2	6	178882	178887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612632
3824	NC_013959	GCTG	2	8	178961	178968	0 %	25 %	50 %	25 %	291612632
3825	NC_013959	CGCC	2	8	178971	178978	0 %	0 %	25 %	75 %	291612632
3826	NC_013959	CGAC	2	8	178990	178997	25 %	0 %	25 %	50 %	291612632
3827	NC_013959	TG	3	6	179009	179014	0 %	50 %	50 %	0 %	291612632
3828	NC_013959	A	6	6	179035	179040	100 %	0 %	0 %	0 %	291612632
3829	NC_013959	GGCA	2	8	179105	179112	25 %	0 %	50 %	25 %	291612632
3830	NC_013959	GAA	2	6	179194	179199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3831	NC_013959	GGC	2	6	179383	179388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
3832	NC_013959	A	6	6	179411	179416	100 %	0 %	0 %	0 %	291612633
3833	NC_013959	CGA	2	6	179418	179423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
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3835	NC_013959	CAG	3	9	179446	179454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3836	NC_013959	A	6	6	179523	179528	100 %	0 %	0 %	0 %	291612633
3837	NC_013959	A	6	6	179593	179598	100 %	0 %	0 %	0 %	291612633
3838	NC_013959	CAGCAC	2	12	179617	179628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291612633
3839	NC_013959	GC	4	8	179681	179688	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3840	NC_013959	CAG	3	9	179740	179748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3841	NC_013959	TGA	2	6	179829	179834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612633
3842	NC_013959	CTG	2	6	179876	179881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3843	NC_013959	CTG	2	6	179889	179894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3844	NC_013959	TC	3	6	179903	179908	0 %	50 %	0 %	50 %	291612633
3845	NC_013959	GGC	2	6	179935	179940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
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3847	NC_013959	TGC	2	6	180050	180055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3848	NC_013959	AC	3	6	180090	180095	50 %	0 %	0 %	50 %	291612633
3849	NC_013959	CGT	2	6	180105	180110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3850	NC_013959	GCA	2	6	180134	180139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3851	NC_013959	CCA	2	6	180167	180172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612633
3852	NC_013959	CG	3	6	180193	180198	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3853	NC_013959	ATC	2	6	180277	180282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612633
3854	NC_013959	CCA	2	6	180303	180308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612633
3855	NC_013959	CGT	2	6	180327	180332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3856	NC_013959	CGG	2	6	180342	180347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
3857	NC_013959	GCCC	2	8	180408	180415	0 %	0 %	25 %	75 %	291612633
3858	NC_013959	GCA	2	6	180425	180430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3859	NC_013959	CG	3	6	180435	180440	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3860	NC_013959	GCC	2	6	180466	180471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612633
3861	NC_013959	CG	3	6	180558	180563	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3862	NC_013959	GCG	2	6	180569	180574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
3863	NC_013959	GCA	2	6	180636	180641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3864	NC_013959	GC	3	6	180660	180665	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3865	NC_013959	GCT	2	6	180743	180748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3866	NC_013959	GC	3	6	180801	180806	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3867	NC_013959	CCA	2	6	180858	180863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612633
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3991	NC_013959	GC	3	6	186114	186119	0 %	0 %	50 %	50 %	291612638
3992	NC_013959	CGTG	2	8	186200	186207	0 %	25 %	50 %	25 %	291612638
3993	NC_013959	GAA	2	6	186225	186230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612638
3994	NC_013959	GCT	2	6	186276	186281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612638
3995	NC_013959	GATG	2	8	186364	186371	25 %	25 %	50 %	0 %	291612638
3996	NC_013959	TGGG	2	8	186414	186421	0 %	25 %	75 %	0 %	291612638
3997	NC_013959	TGC	2	6	186433	186438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612638
3998	NC_013959	TGC	2	6	186461	186466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612638
3999	NC_013959	CAG	2	6	186543	186548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612639
4000	NC_013959	CGC	2	6	186560	186565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612639

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