MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013959	GGT	2	6	117283	117288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612584
2502	NC_013959	TGG	2	6	117471	117476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612584
2503	NC_013959	TAA	2	6	117520	117525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612584
2504	NC_013959	CCT	2	6	117526	117531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612584
2505	NC_013959	GCA	2	6	117604	117609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612584
2506	NC_013959	A	6	6	117646	117651	100 %	0 %	0 %	0 %	291612584
2507	NC_013959	CGGATA	2	12	117681	117692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291612584
2508	NC_013959	ACA	2	6	117709	117714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612584
2509	NC_013959	TCGA	2	8	117848	117855	25 %	25 %	25 %	25 %	291612584
2510	NC_013959	ATA	2	6	117894	117899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612584
2511	NC_013959	TCA	2	6	117903	117908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612584
2512	NC_013959	GTA	2	6	117923	117928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612584
2513	NC_013959	CAT	2	6	118129	118134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612584
2514	NC_013959	GAA	2	6	118162	118167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612584
2515	NC_013959	GAA	2	6	118196	118201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612584
2516	NC_013959	AGCTA	2	10	118281	118290	40 %	20 %	20 %	20 %	291612584
2517	NC_013959	GCTT	2	8	118338	118345	0 %	50 %	25 %	25 %	291612584
2518	NC_013959	GAG	2	6	118418	118423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612584
2519	NC_013959	TGA	2	6	118467	118472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612584
2520	NC_013959	GA	3	6	118497	118502	50 %	0 %	50 %	0 %	291612584
2521	NC_013959	GGA	2	6	118565	118570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612584
2522	NC_013959	CAG	2	6	118581	118586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612584
2523	NC_013959	GGC	2	6	118594	118599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612584
2524	NC_013959	GCG	2	6	118670	118675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612584
2525	NC_013959	A	6	6	118729	118734	100 %	0 %	0 %	0 %	291612584
2526	NC_013959	CAG	2	6	118819	118824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612584
2527	NC_013959	AAG	2	6	118847	118852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612584
2528	NC_013959	GGT	2	6	119006	119011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612584
2529	NC_013959	GTA	2	6	119015	119020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612584
2530	NC_013959	TGG	2	6	119023	119028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612584
2531	NC_013959	GCT	2	6	119071	119076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612584
2532	NC_013959	GGCT	2	8	119096	119103	0 %	25 %	50 %	25 %	291612584
2533	NC_013959	AAG	2	6	119132	119137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612584
2534	NC_013959	CTG	2	6	119141	119146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612584
2535	NC_013959	TCA	2	6	119151	119156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612584
2536	NC_013959	CTTTT	2	10	119234	119243	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2537	NC_013959	CAT	2	6	119317	119322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612585
2538	NC_013959	ATG	2	6	119333	119338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612585
2539	NC_013959	TTGC	2	8	119366	119373	0 %	50 %	25 %	25 %	291612585
2540	NC_013959	CGA	2	6	119404	119409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2541	NC_013959	CGA	2	6	119420	119425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2542	NC_013959	AT	3	6	119445	119450	50 %	50 %	0 %	0 %	291612585
2543	NC_013959	GCG	2	6	119490	119495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612585
2544	NC_013959	GAC	2	6	119519	119524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2545	NC_013959	GGC	2	6	119540	119545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612585
2546	NC_013959	TGGTG	2	10	119590	119599	0 %	40 %	60 %	0 %	291612585
2547	NC_013959	AGC	2	6	119612	119617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2548	NC_013959	TGC	2	6	119664	119669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2549	NC_013959	ATC	2	6	119747	119752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612585
2550	NC_013959	CA	3	6	119753	119758	50 %	0 %	0 %	50 %	291612585
2551	NC_013959	CTG	2	6	119780	119785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2552	NC_013959	GAA	2	6	119807	119812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612585
2553	NC_013959	GAT	2	6	119839	119844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612585
2554	NC_013959	ATCCA	2	10	119880	119889	40 %	20 %	0 %	40 %	291612585
2555	NC_013959	AGC	2	6	119897	119902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2556	NC_013959	GC	3	6	119947	119952	0 %	0 %	50 %	50 %	291612585
2557	NC_013959	GCA	2	6	119992	119997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2558	NC_013959	AG	3	6	120004	120009	50 %	0 %	50 %	0 %	291612585
2559	NC_013959	CA	3	6	120114	120119	50 %	0 %	0 %	50 %	291612585
2560	NC_013959	GCA	2	6	120126	120131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2561	NC_013959	GAG	2	6	120150	120155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612585
2562	NC_013959	ACCT	2	8	120191	120198	25 %	25 %	0 %	50 %	291612585
2563	NC_013959	ATCA	2	8	120275	120282	50 %	25 %	0 %	25 %	291612585
2564	NC_013959	TGG	2	6	120324	120329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612585
2565	NC_013959	TGCG	2	8	120375	120382	0 %	25 %	50 %	25 %	291612585
2566	NC_013959	TCA	2	6	120396	120401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612585
2567	NC_013959	CGG	2	6	120477	120482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612585
2568	NC_013959	GCG	2	6	120552	120557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612585
2569	NC_013959	CTG	2	6	120566	120571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2570	NC_013959	ATGGG	2	10	120606	120615	20 %	20 %	60 %	0 %	291612585
2571	NC_013959	GCC	2	6	120647	120652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612585
2572	NC_013959	CAG	2	6	120785	120790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612585
2573	NC_013959	A	6	6	120806	120811	100 %	0 %	0 %	0 %	291612585
2574	NC_013959	CCT	2	6	120937	120942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612586
2575	NC_013959	CAT	2	6	121028	121033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612586
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2577	NC_013959	CTCA	2	8	121113	121120	25 %	25 %	0 %	50 %	291612586
2578	NC_013959	CG	3	6	121154	121159	0 %	0 %	50 %	50 %	291612586
2579	NC_013959	TGAA	2	8	121171	121178	50 %	25 %	25 %	0 %	291612586
2580	NC_013959	CGG	2	6	121274	121279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612586
2581	NC_013959	CGT	2	6	121307	121312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612586
2582	NC_013959	GAA	2	6	121323	121328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612586
2583	NC_013959	CG	3	6	121369	121374	0 %	0 %	50 %	50 %	291612586
2584	NC_013959	GCC	2	6	121407	121412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612586
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2586	NC_013959	ATG	2	6	121510	121515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612586
2587	NC_013959	CTG	2	6	121539	121544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612586
2588	NC_013959	GCC	2	6	121748	121753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612586
2589	NC_013959	GC	3	6	121860	121865	0 %	0 %	50 %	50 %	291612586
2590	NC_013959	CAT	2	6	121868	121873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612586
2591	NC_013959	ATT	2	6	121910	121915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612586
2592	NC_013959	GCC	2	6	121916	121921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612586
2593	NC_013959	CCG	2	6	122012	122017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612586
2594	NC_013959	AGA	2	6	122030	122035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612586
2595	NC_013959	GGC	2	6	122108	122113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_013959	GCC	2	6	122118	122123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612587
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2599	NC_013959	AAT	2	6	122158	122163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612587
2600	NC_013959	ATG	2	6	122210	122215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612587
2601	NC_013959	AAAAG	2	10	122397	122406	80 %	0 %	20 %	0 %	291612587
2602	NC_013959	CG	3	6	122456	122461	0 %	0 %	50 %	50 %	291612587
2603	NC_013959	GCC	2	6	122476	122481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612587
2604	NC_013959	CTG	2	6	122527	122532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2605	NC_013959	TCGC	2	8	122615	122622	0 %	25 %	25 %	50 %	291612587
2606	NC_013959	AAG	2	6	122626	122631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612587
2607	NC_013959	CAAGG	2	10	122716	122725	40 %	0 %	40 %	20 %	291612587
2608	NC_013959	GTC	2	6	122745	122750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2609	NC_013959	CCA	2	6	122864	122869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612587
2610	NC_013959	GGC	2	6	122961	122966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612587
2611	NC_013959	GC	3	6	122965	122970	0 %	0 %	50 %	50 %	291612587
2612	NC_013959	GTC	2	6	122982	122987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2613	NC_013959	TCG	2	6	123029	123034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2614	NC_013959	CTG	2	6	123076	123081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2615	NC_013959	ATG	2	6	123112	123117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612587
2616	NC_013959	CTG	2	6	123118	123123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2617	NC_013959	GATG	2	8	123153	123160	25 %	25 %	50 %	0 %	291612587
2618	NC_013959	CGC	2	6	123166	123171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612587
2619	NC_013959	GC	3	6	123286	123291	0 %	0 %	50 %	50 %	291612587
2620	NC_013959	CGA	2	6	123303	123308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612587
2621	NC_013959	GCA	2	6	123354	123359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612587
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2623	NC_013959	GAC	2	6	123433	123438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612587
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2742	NC_013959	CCGA	2	8	128340	128347	25 %	0 %	25 %	50 %	291612589
2743	NC_013959	GAT	2	6	128363	128368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612589
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2760	NC_013959	TTCTG	2	10	129431	129440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2761	NC_013959	TGT	2	6	129450	129455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2763	NC_013959	CAG	2	6	129494	129499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2861	NC_013959	GC	3	6	133407	133412	0 %	0 %	50 %	50 %	291612592
2862	NC_013959	GTG	2	6	133434	133439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612592
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2864	NC_013959	CAT	2	6	133541	133546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612592
2865	NC_013959	CCG	3	9	133549	133557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612592
2866	NC_013959	CGG	2	6	133618	133623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612592
2867	NC_013959	GC	3	6	133649	133654	0 %	0 %	50 %	50 %	291612592
2868	NC_013959	GCG	2	6	133660	133665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612592
2869	NC_013959	TCA	2	6	133771	133776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612592
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2871	NC_013959	CGC	2	6	133801	133806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612592
2872	NC_013959	TTCG	2	8	133835	133842	0 %	50 %	25 %	25 %	291612592
2873	NC_013959	TCG	2	6	133852	133857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612592
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2884	NC_013959	TCAC	2	8	134233	134240	25 %	25 %	0 %	50 %	291612592
2885	NC_013959	GAGCTG	2	12	134250	134261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291612592
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2967	NC_013959	GCGG	2	8	138307	138314	0 %	0 %	75 %	25 %	291612597
2968	NC_013959	GATTTC	2	12	138373	138384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291612597
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2977	NC_013959	CGG	2	6	138746	138751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2984	NC_013959	CGGC	2	8	139259	139266	0 %	0 %	50 %	50 %	291612598
2985	NC_013959	CG	3	6	139277	139282	0 %	0 %	50 %	50 %	291612598
2986	NC_013959	CTA	2	6	139287	139292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612598
2987	NC_013959	CT	3	6	139325	139330	0 %	50 %	0 %	50 %	291612598
2988	NC_013959	TCG	2	6	139406	139411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612598
2989	NC_013959	CGA	2	6	139452	139457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612598
2990	NC_013959	GGATCT	2	12	139539	139550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291612598
2991	NC_013959	CGG	2	6	139734	139739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612598
2992	NC_013959	GGC	2	6	139784	139789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612598
2993	NC_013959	TCA	2	6	139805	139810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612598
2994	NC_013959	ACC	2	6	139826	139831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612598
2995	NC_013959	GTGC	2	8	139849	139856	0 %	25 %	50 %	25 %	291612598
2996	NC_013959	TGC	2	6	139907	139912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612598
2997	NC_013959	GAA	2	6	139932	139937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612598
2998	NC_013959	CGA	2	6	139998	140003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612598
2999	NC_013959	GC	3	6	140038	140043	0 %	0 %	50 %	50 %	291612598
3000	NC_013959	TAC	2	6	140110	140115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612598

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