MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013959	CGAA	2	8	23659	23666	50 %	0 %	25 %	25 %	291612490
502	NC_013959	GCC	2	6	23750	23755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612490
503	NC_013959	ATC	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612490
504	NC_013959	TCG	2	6	23923	23928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612490
505	NC_013959	ACC	2	6	24057	24062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612490
506	NC_013959	TGAAC	2	10	24176	24185	40 %	20 %	20 %	20 %	291612490
507	NC_013959	GCA	2	6	24204	24209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013959	GGC	2	6	24226	24231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013959	TTTG	2	8	24245	24252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013959	GGCA	2	8	24259	24266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_013959	GATC	2	8	24294	24301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_013959	ATT	2	6	24319	24324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013959	CTT	2	6	24341	24346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013959	CGTGC	2	10	24403	24412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
515	NC_013959	GAA	2	6	24418	24423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013959	AATTA	2	10	24473	24482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013959	CAG	4	12	24524	24535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612491
518	NC_013959	AAC	2	6	24592	24597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612491
519	NC_013959	AAG	2	6	24622	24627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612491
520	NC_013959	AAG	2	6	24658	24663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612491
521	NC_013959	ACC	2	6	24676	24681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612491
522	NC_013959	TGA	2	6	24725	24730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612491
523	NC_013959	GGT	2	6	24742	24747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612491
524	NC_013959	CTG	2	6	24788	24793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612491
525	NC_013959	GTTG	2	8	24819	24826	0 %	50 %	50 %	0 %	291612491
526	NC_013959	AAGT	2	8	24847	24854	50 %	25 %	25 %	0 %	291612491
527	NC_013959	A	6	6	24868	24873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013959	T	7	7	24890	24896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013959	TTG	2	6	24918	24923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612492
530	NC_013959	AGG	2	6	24978	24983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612492
531	NC_013959	GCCA	2	8	24986	24993	25 %	0 %	25 %	50 %	291612492
532	NC_013959	GGA	2	6	25031	25036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612492
533	NC_013959	CCA	2	6	25045	25050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612492
534	NC_013959	AG	3	6	25067	25072	50 %	0 %	50 %	0 %	291612492
535	NC_013959	CAGG	2	8	25083	25090	25 %	0 %	50 %	25 %	291612492
536	NC_013959	TGA	2	6	25138	25143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612492
537	NC_013959	GGCAC	2	10	25227	25236	20 %	0 %	40 %	40 %	291612492
538	NC_013959	CTG	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612492
539	NC_013959	GCT	2	6	25364	25369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612492
540	NC_013959	CAG	2	6	25394	25399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612492
541	NC_013959	GGCCA	2	10	25464	25473	20 %	0 %	40 %	40 %	291612492
542	NC_013959	AGC	2	6	25476	25481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612492
543	NC_013959	CGG	2	6	25510	25515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612492
544	NC_013959	CCA	2	6	25534	25539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612492
545	NC_013959	ACA	2	6	25555	25560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612492
546	NC_013959	GCC	2	6	25624	25629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612492
547	NC_013959	TGCT	2	8	25715	25722	0 %	50 %	25 %	25 %	291612492
548	NC_013959	CTA	2	6	25726	25731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612492
549	NC_013959	TGAC	2	8	25814	25821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_013959	AGA	2	6	25915	25920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013959	AT	3	6	25922	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013959	GAC	2	6	25929	25934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_013959	CAT	2	6	25979	25984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612493
554	NC_013959	TTC	2	6	25994	25999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612493
555	NC_013959	CAG	2	6	26000	26005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
556	NC_013959	CAA	2	6	26104	26109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612493
557	NC_013959	TGCC	2	8	26167	26174	0 %	25 %	25 %	50 %	291612493
558	NC_013959	GCAG	2	8	26220	26227	25 %	0 %	50 %	25 %	291612493
559	NC_013959	A	6	6	26246	26251	100 %	0 %	0 %	0 %	291612493
560	NC_013959	CAA	2	6	26257	26262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612493
561	NC_013959	CG	3	6	26266	26271	0 %	0 %	50 %	50 %	291612493
562	NC_013959	TGT	2	6	26329	26334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612493
563	NC_013959	GCA	2	6	26361	26366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
564	NC_013959	TGAA	2	8	26526	26533	50 %	25 %	25 %	0 %	291612493
565	NC_013959	CAG	2	6	26540	26545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
566	NC_013959	AAT	2	6	26557	26562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612493
567	NC_013959	TCATC	2	10	26611	26620	20 %	40 %	0 %	40 %	291612493
568	NC_013959	GCCT	2	8	26684	26691	0 %	25 %	25 %	50 %	291612493
569	NC_013959	T	6	6	26705	26710	0 %	100 %	0 %	0 %	291612493
570	NC_013959	GCA	2	6	26869	26874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
571	NC_013959	TA	4	8	26880	26887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013959	TTAT	2	8	26929	26936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013959	TTCGC	2	10	26954	26963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
574	NC_013959	TCAAA	2	10	26982	26991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
575	NC_013959	GCA	2	6	27127	27132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
576	NC_013959	CCA	2	6	27176	27181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612494
577	NC_013959	CGA	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
578	NC_013959	TAC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612494
579	NC_013959	CGA	2	6	27225	27230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
580	NC_013959	TTTC	2	8	27308	27315	0 %	75 %	0 %	25 %	291612494
581	NC_013959	AAC	2	6	27334	27339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612494
582	NC_013959	GC	3	6	27393	27398	0 %	0 %	50 %	50 %	291612494
583	NC_013959	GTC	2	6	27455	27460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612494
584	NC_013959	CGG	2	6	27471	27476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612494
585	NC_013959	CAT	2	6	27492	27497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612494
586	NC_013959	CTGG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	291612494
587	NC_013959	TCA	2	6	27569	27574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612494
588	NC_013959	AAG	2	6	27616	27621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612494
589	NC_013959	TGC	2	6	27623	27628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612494
590	NC_013959	ACG	2	6	27638	27643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
591	NC_013959	GC	3	6	27651	27656	0 %	0 %	50 %	50 %	291612494
592	NC_013959	GGCCA	2	10	27670	27679	20 %	0 %	40 %	40 %	291612494
593	NC_013959	GAC	2	6	27706	27711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
594	NC_013959	TG	3	6	27722	27727	0 %	50 %	50 %	0 %	291612494
595	NC_013959	CGG	2	6	27801	27806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612494
596	NC_013959	ACC	2	6	27820	27825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612494
597	NC_013959	CGC	2	6	27829	27834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612494
598	NC_013959	GAAGGC	2	12	27994	28005	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291612494
599	NC_013959	GAC	2	6	28006	28011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
600	NC_013959	ACC	2	6	28090	28095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612494
601	NC_013959	CGG	2	6	28107	28112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612494
602	NC_013959	CTT	2	6	28137	28142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612494
603	NC_013959	TGG	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612494
604	NC_013959	GCA	2	6	28213	28218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
605	NC_013959	CCGAT	2	10	28265	28274	20 %	20 %	20 %	40 %	291612494
606	NC_013959	AGC	2	6	28286	28291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
607	NC_013959	T	7	7	28430	28436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013959	CGAA	2	8	28475	28482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_013959	ACA	2	6	28496	28501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612495
610	NC_013959	TGC	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612495
611	NC_013959	GC	3	6	28582	28587	0 %	0 %	50 %	50 %	291612495
612	NC_013959	TGG	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612495
613	NC_013959	CGG	2	6	28737	28742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612495
614	NC_013959	GCTG	2	8	28748	28755	0 %	25 %	50 %	25 %	291612495
615	NC_013959	ACC	2	6	28768	28773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612495
616	NC_013959	GC	3	6	28777	28782	0 %	0 %	50 %	50 %	291612495
617	NC_013959	GGT	2	6	28809	28814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612495
618	NC_013959	GGT	2	6	28836	28841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612495
619	NC_013959	ATCC	2	8	28843	28850	25 %	25 %	0 %	50 %	291612495
620	NC_013959	CCG	2	6	28863	28868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612495
621	NC_013959	TGA	2	6	28958	28963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612495
622	NC_013959	CCA	2	6	28979	28984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612495
623	NC_013959	AGC	2	6	28985	28990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612495
624	NC_013959	GC	3	6	29107	29112	0 %	0 %	50 %	50 %	291612495
625	NC_013959	CTG	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612495
626	NC_013959	GCG	2	6	29186	29191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612495
627	NC_013959	CGA	2	6	29238	29243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612495
628	NC_013959	ATG	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612495
629	NC_013959	CGAC	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	291612496
630	NC_013959	GCAG	2	8	29401	29408	25 %	0 %	50 %	25 %	291612496
631	NC_013959	GGA	2	6	29509	29514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612496
632	NC_013959	CGC	2	6	29527	29532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612496
633	NC_013959	GAA	2	6	29543	29548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612496
634	NC_013959	CAT	2	6	29560	29565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612496
635	NC_013959	ACGGC	2	10	29598	29607	20 %	0 %	40 %	40 %	291612496
636	NC_013959	CG	3	6	29641	29646	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
637	NC_013959	CG	3	6	29658	29663	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
638	NC_013959	CTG	2	6	29666	29671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
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642	NC_013959	ACG	2	6	29850	29855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
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644	NC_013959	CGGCA	2	10	29927	29936	20 %	0 %	40 %	40 %	291612496
645	NC_013959	GCT	2	6	29938	29943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
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647	NC_013959	GAC	3	9	29993	30001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
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659	NC_013959	GCC	2	6	30673	30678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612496
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661	NC_013959	GAA	2	6	30820	30825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612496
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664	NC_013959	CGCT	2	8	30911	30918	0 %	25 %	25 %	50 %	291612496
665	NC_013959	ACG	2	6	30975	30980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
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669	NC_013959	GAC	2	6	31202	31207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
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672	NC_013959	CAG	2	6	31415	31420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
673	NC_013959	AT	3	6	31476	31481	50 %	50 %	0 %	0 %	291612496
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675	NC_013959	GC	3	6	31572	31577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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682	NC_013959	CAT	2	6	31833	31838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612497
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705	NC_013959	GCGG	2	8	32833	32840	0 %	0 %	75 %	25 %	291612498
706	NC_013959	GGCG	2	8	32853	32860	0 %	0 %	75 %	25 %	291612498
707	NC_013959	CCCAT	2	10	32899	32908	20 %	20 %	0 %	60 %	291612498
708	NC_013959	GCG	2	6	33001	33006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612498
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722	NC_013959	GCA	2	6	33861	33866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612499
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724	NC_013959	CTGG	2	8	33901	33908	0 %	25 %	50 %	25 %	291612499
725	NC_013959	AACA	2	8	33923	33930	75 %	0 %	0 %	25 %	291612499
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736	NC_013959	CGA	2	6	34395	34400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612500
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745	NC_013959	CTT	2	6	34837	34842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612501
746	NC_013959	GCA	2	6	34935	34940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612501
747	NC_013959	GATC	2	8	34959	34966	25 %	25 %	25 %	25 %	291612501
748	NC_013959	GGT	2	6	34975	34980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612501
749	NC_013959	CAA	2	6	34990	34995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612501
750	NC_013959	GGC	2	6	35007	35012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612501
751	NC_013959	GC	3	6	35011	35016	0 %	0 %	50 %	50 %	291612501
752	NC_013959	T	7	7	35047	35053	0 %	100 %	0 %	0 %	291612501
753	NC_013959	GTT	2	6	35115	35120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612501
754	NC_013959	AGG	2	6	35143	35148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612501
755	NC_013959	CCAC	2	8	35184	35191	25 %	0 %	0 %	75 %	291612501
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