MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013959	TCA	2	6	277908	277913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612746
6002	NC_013959	GCG	2	6	277920	277925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612746
6003	NC_013959	CG	3	6	277930	277935	0 %	0 %	50 %	50 %	291612746
6004	NC_013959	GCT	2	6	277948	277953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612746
6005	NC_013959	GCA	2	6	277957	277962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612746
6006	NC_013959	TGC	2	6	278085	278090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612746
6007	NC_013959	GCC	2	6	278098	278103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612746
6008	NC_013959	GGC	2	6	278162	278167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612746
6009	NC_013959	GCG	2	6	278199	278204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612746
6010	NC_013959	GCG	3	9	278217	278225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612746
6011	NC_013959	CGC	2	6	278276	278281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612746
6012	NC_013959	CCG	2	6	278302	278307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612746
6013	NC_013959	CGC	2	6	278362	278367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612746
6014	NC_013959	ACCA	2	8	278435	278442	50 %	0 %	0 %	50 %	291612746
6015	NC_013959	CGA	2	6	278452	278457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612746
6016	NC_013959	CG	3	6	278461	278466	0 %	0 %	50 %	50 %	291612746
6017	NC_013959	CAT	2	6	278467	278472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612746
6018	NC_013959	AACCG	2	10	278496	278505	40 %	0 %	20 %	40 %	291612746
6019	NC_013959	CGA	2	6	278521	278526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612746
6020	NC_013959	ACT	2	6	278547	278552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612746
6021	NC_013959	CCG	2	6	278588	278593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612746
6022	NC_013959	TCGT	2	8	278642	278649	0 %	50 %	25 %	25 %	291612746
6023	NC_013959	GAAT	2	8	278650	278657	50 %	25 %	25 %	0 %	291612746
6024	NC_013959	GGA	2	6	278676	278681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612746
6025	NC_013959	TTG	2	6	278729	278734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612746
6026	NC_013959	CGC	2	6	278773	278778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_013959	GCG	2	6	278782	278787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_013959	TCAA	2	8	278798	278805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_013959	ACC	2	6	278807	278812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_013959	CAGC	2	8	278831	278838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_013959	CTT	2	6	278851	278856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612747
6032	NC_013959	CGC	2	6	278866	278871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612747
6033	NC_013959	GTG	2	6	278954	278959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612747
6034	NC_013959	CGA	2	6	278964	278969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6035	NC_013959	GCA	2	6	278992	278997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6036	NC_013959	CGC	2	6	279042	279047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612747
6037	NC_013959	GCG	2	6	279065	279070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612747
6038	NC_013959	GAC	2	6	279100	279105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6039	NC_013959	CTG	2	6	279121	279126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6040	NC_013959	GCGAT	2	10	279137	279146	20 %	20 %	40 %	20 %	291612747
6041	NC_013959	TCG	2	6	279158	279163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6042	NC_013959	GGC	2	6	279172	279177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612747
6043	NC_013959	TTG	2	6	279194	279199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612747
6044	NC_013959	CG	5	10	279338	279347	0 %	0 %	50 %	50 %	291612747
6045	NC_013959	GCG	2	6	279369	279374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612747
6046	NC_013959	TGG	2	6	279405	279410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612747
6047	NC_013959	TGC	2	6	279462	279467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6048	NC_013959	CG	3	6	279483	279488	0 %	0 %	50 %	50 %	291612747
6049	NC_013959	GCA	2	6	279510	279515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6050	NC_013959	CG	3	6	279543	279548	0 %	0 %	50 %	50 %	291612747
6051	NC_013959	CCTTG	2	10	279561	279570	0 %	40 %	20 %	40 %	291612747
6052	NC_013959	CGC	2	6	279630	279635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612747
6053	NC_013959	GTG	2	6	279760	279765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612747
6054	NC_013959	CTG	2	6	279769	279774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6055	NC_013959	CG	3	6	279804	279809	0 %	0 %	50 %	50 %	291612747
6056	NC_013959	CGG	2	6	279819	279824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612747
6057	NC_013959	GC	3	6	279856	279861	0 %	0 %	50 %	50 %	291612747
6058	NC_013959	GTC	2	6	279868	279873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6059	NC_013959	TTG	2	6	280010	280015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612747
6060	NC_013959	ATG	2	6	280016	280021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612747
6061	NC_013959	TGA	2	6	280095	280100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612747
6062	NC_013959	GCG	2	6	280129	280134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612747
6063	NC_013959	CAG	2	6	280141	280146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6064	NC_013959	TCT	2	6	280155	280160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612747
6065	NC_013959	TGCG	2	8	280322	280329	0 %	25 %	50 %	25 %	291612747
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6068	NC_013959	GCG	2	6	280409	280414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612747
6069	NC_013959	GTC	2	6	280423	280428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
6070	NC_013959	TGT	2	6	280503	280508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612747
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6072	NC_013959	GTC	2	6	280540	280545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612747
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6078	NC_013959	CTGTC	2	10	280778	280787	0 %	40 %	20 %	40 %	291612747
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6091	NC_013959	CCG	2	6	281522	281527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612748
6092	NC_013959	GC	3	6	281565	281570	0 %	0 %	50 %	50 %	291612748
6093	NC_013959	CCG	2	6	281606	281611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612748
6094	NC_013959	CCA	2	6	281625	281630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612748
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6102	NC_013959	TGT	2	6	281846	281851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612748
6103	NC_013959	ATGGTT	2	12	281861	281872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291612748
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6105	NC_013959	GGAT	2	8	281918	281925	25 %	25 %	50 %	0 %	291612749
6106	NC_013959	CGT	2	6	281987	281992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612749
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6111	NC_013959	TGG	2	6	282187	282192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612749
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6115	NC_013959	TGC	2	6	282298	282303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612749
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6121	NC_013959	CAC	2	6	282597	282602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612750
6122	NC_013959	TCG	2	6	282697	282702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612750
6123	NC_013959	CGCA	2	8	282714	282721	25 %	0 %	25 %	50 %	291612750
6124	NC_013959	GGC	2	6	282726	282731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612750
6125	NC_013959	CTT	2	6	282788	282793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612750
6126	NC_013959	CG	3	6	283001	283006	0 %	0 %	50 %	50 %	291612750
6127	NC_013959	ACGGTG	2	12	283030	283041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291612750
6128	NC_013959	GAG	2	6	283072	283077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612750
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6130	NC_013959	TGC	2	6	283133	283138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612750
6131	NC_013959	GC	3	6	283142	283147	0 %	0 %	50 %	50 %	291612750
6132	NC_013959	ACAGCG	2	12	283151	283162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612750
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6141	NC_013959	CCG	2	6	283570	283575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612750
6142	NC_013959	GC	3	6	283614	283619	0 %	0 %	50 %	50 %	291612750
6143	NC_013959	GGCA	2	8	283725	283732	25 %	0 %	50 %	25 %	291612750
6144	NC_013959	CGC	2	6	283763	283768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612750
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6149	NC_013959	GAC	2	6	283957	283962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_013959	GCA	2	6	283971	283976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6151	NC_013959	GTC	2	6	284008	284013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6152	NC_013959	AG	3	6	284019	284024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_013959	GCG	2	6	284068	284073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612751
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6180	NC_013959	TCA	2	6	285542	285547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6181	NC_013959	GCA	2	6	285595	285600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6182	NC_013959	TA	3	6	285688	285693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_013959	AT	3	6	285699	285704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6184	NC_013959	GTT	2	6	285756	285761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6186	NC_013959	TCT	2	6	285891	285896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6195	NC_013959	CGA	2	6	286225	286230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612753
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6200	NC_013959	CGG	2	6	286495	286500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612753
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6231	NC_013959	GTC	2	6	287821	287826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612754
6232	NC_013959	GGGAT	2	10	287832	287841	20 %	20 %	60 %	0 %	291612754
6233	NC_013959	CCA	2	6	287843	287848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612754
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6237	NC_013959	CAT	2	6	288177	288182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612754
6238	NC_013959	CAT	2	6	288405	288410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612754
6239	NC_013959	GCA	2	6	288411	288416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612754
6240	NC_013959	GGT	2	6	288417	288422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612754
6241	NC_013959	TC	3	6	288462	288467	0 %	50 %	0 %	50 %	291612754
6242	NC_013959	CGA	2	6	288477	288482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612754
6243	NC_013959	AAG	2	6	288556	288561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612754
6244	NC_013959	CGCTT	2	10	288570	288579	0 %	40 %	20 %	40 %	291612754
6245	NC_013959	CGG	2	6	288666	288671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612754
6246	NC_013959	GAG	2	6	288766	288771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612754
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6259	NC_013959	GCT	2	6	289341	289346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612754
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6364	NC_013959	TGC	2	6	295022	295027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612762
6365	NC_013959	CGC	2	6	295102	295107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612762
6366	NC_013959	TGA	2	6	295185	295190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612762
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6371	NC_013959	TGG	2	6	295454	295459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612762
6372	NC_013959	CGA	2	6	295488	295493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612762
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6377	NC_013959	GAGGC	2	10	295904	295913	20 %	0 %	60 %	20 %	291612762
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6385	NC_013959	TGG	2	6	296173	296178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612763
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6408	NC_013959	GACAC	2	10	297112	297121	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6410	NC_013959	CAGGG	2	10	297136	297145	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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6483	NC_013959	GGA	2	6	300257	300262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612766
6484	NC_013959	CAC	2	6	300284	300289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612766
6485	NC_013959	CGG	2	6	300317	300322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612766
6486	NC_013959	GTG	2	6	300336	300341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612766
6487	NC_013959	CCAT	2	8	300397	300404	25 %	25 %	0 %	50 %	291612766
6488	NC_013959	GCA	2	6	300413	300418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612766
6489	NC_013959	GCA	2	6	300492	300497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6490	NC_013959	TGC	2	6	300531	300536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612767
6491	NC_013959	GCG	2	6	300548	300553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612767
6492	NC_013959	CCGA	2	8	300568	300575	25 %	0 %	25 %	50 %	291612767
6493	NC_013959	GCA	2	6	300613	300618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612767
6494	NC_013959	GCTCAA	2	12	300630	300641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291612767
6495	NC_013959	GCG	2	6	300642	300647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612767
6496	NC_013959	CGCAA	2	10	300650	300659	40 %	0 %	20 %	40 %	291612767
6497	NC_013959	CTCATT	2	12	300664	300675	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	291612767
6498	NC_013959	CAAG	2	8	300730	300737	50 %	0 %	25 %	25 %	291612767
6499	NC_013959	GCAC	2	8	300812	300819	25 %	0 %	25 %	50 %	291612767
6500	NC_013959	CCA	2	6	300896	300901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612767

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