MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_013959	AAG	2	6	253936	253941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612725
5503	NC_013959	ATC	2	6	253978	253983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612725
5504	NC_013959	AAC	2	6	254068	254073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612725
5505	NC_013959	CGA	2	6	254135	254140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5506	NC_013959	CCA	2	6	254195	254200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612725
5507	NC_013959	TCA	2	6	254228	254233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612725
5508	NC_013959	GAA	2	6	254263	254268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612725
5509	NC_013959	GAA	2	6	254358	254363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612726
5510	NC_013959	GTG	2	6	254392	254397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612726
5511	NC_013959	CGA	2	6	254421	254426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612726
5512	NC_013959	CAC	3	9	254499	254507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612726
5513	NC_013959	GAT	2	6	254545	254550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612726
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5515	NC_013959	GAA	2	6	254679	254684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612726
5516	NC_013959	CAGC	2	8	254694	254701	25 %	0 %	25 %	50 %	291612726
5517	NC_013959	GAA	2	6	254742	254747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612726
5518	NC_013959	GCTG	2	8	254775	254782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_013959	GCC	2	6	254963	254968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612727
5520	NC_013959	GCA	2	6	255015	255020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612727
5521	NC_013959	GC	3	6	255024	255029	0 %	0 %	50 %	50 %	291612727
5522	NC_013959	GGCT	3	12	255044	255055	0 %	25 %	50 %	25 %	291612727
5523	NC_013959	CAT	2	6	255062	255067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612727
5524	NC_013959	TATC	2	8	255094	255101	25 %	50 %	0 %	25 %	291612727
5525	NC_013959	CTG	2	6	255242	255247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612727
5526	NC_013959	TATC	2	8	255358	255365	25 %	50 %	0 %	25 %	291612727
5527	NC_013959	TCG	2	6	255393	255398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612727
5528	NC_013959	GAT	2	6	255409	255414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612727
5529	NC_013959	GCC	2	6	255437	255442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612727
5530	NC_013959	GC	3	6	255500	255505	0 %	0 %	50 %	50 %	291612727
5531	NC_013959	CAT	2	6	255565	255570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612727
5532	NC_013959	CGAG	2	8	255619	255626	25 %	0 %	50 %	25 %	291612727
5533	NC_013959	TCG	2	6	255660	255665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612727
5534	NC_013959	GTG	2	6	255749	255754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612727
5535	NC_013959	GC	3	6	255770	255775	0 %	0 %	50 %	50 %	291612727
5536	NC_013959	GAAG	2	8	255787	255794	50 %	0 %	50 %	0 %	291612727
5537	NC_013959	TCA	2	6	255801	255806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612727
5538	NC_013959	CG	3	6	255846	255851	0 %	0 %	50 %	50 %	291612727
5539	NC_013959	AACGCC	2	12	255891	255902	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291612727
5540	NC_013959	CTG	2	6	255929	255934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612727
5541	NC_013959	CAA	2	6	255988	255993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612727
5542	NC_013959	CCCA	2	8	256007	256014	25 %	0 %	0 %	75 %	291612727
5543	NC_013959	CGAA	2	8	256035	256042	50 %	0 %	25 %	25 %	291612727
5544	NC_013959	AGCG	2	8	256132	256139	25 %	0 %	50 %	25 %	291612728
5545	NC_013959	TTG	2	6	256159	256164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612728
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5548	NC_013959	GC	3	6	256218	256223	0 %	0 %	50 %	50 %	291612728
5549	NC_013959	GGT	2	6	256236	256241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612728
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5551	NC_013959	AGC	2	6	256364	256369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612728
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5554	NC_013959	GGC	2	6	256464	256469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612728
5555	NC_013959	ATGT	2	8	256495	256502	25 %	50 %	25 %	0 %	291612728
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5557	NC_013959	CAT	2	6	256590	256595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612728
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5559	NC_013959	CACC	2	8	256833	256840	25 %	0 %	0 %	75 %	291612728
5560	NC_013959	GCA	2	6	256881	256886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612728
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5563	NC_013959	CGC	2	6	256965	256970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612728
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5571	NC_013959	GC	3	6	257258	257263	0 %	0 %	50 %	50 %	291612729
5572	NC_013959	AGTGC	2	10	257269	257278	20 %	20 %	40 %	20 %	291612729
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5587	NC_013959	AAG	2	6	258071	258076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_013959	AT	3	6	258117	258122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_013959	GGC	2	6	258134	258139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_013959	GTT	2	6	258158	258163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_013959	CTC	2	6	258201	258206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_013959	T	8	8	258235	258242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_013959	GC	3	6	258309	258314	0 %	0 %	50 %	50 %	291612730
5594	NC_013959	CTG	2	6	258336	258341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612730
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5596	NC_013959	GTC	2	6	258408	258413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612730
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5601	NC_013959	TTG	2	6	258712	258717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612730
5602	NC_013959	TCA	2	6	258737	258742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612730
5603	NC_013959	AGC	2	6	258748	258753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612730
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5605	NC_013959	GCG	4	12	258940	258951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612730
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5608	NC_013959	CCAG	2	8	259063	259070	25 %	0 %	25 %	50 %	291612730
5609	NC_013959	CGG	2	6	259073	259078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612730
5610	NC_013959	CGG	2	6	259102	259107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612730
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5988	NC_013959	GAT	2	6	277222	277227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612745
5989	NC_013959	GAA	2	6	277252	277257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612745
5990	NC_013959	CCG	2	6	277331	277336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612745
5991	NC_013959	TCG	3	9	277367	277375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612745
5992	NC_013959	GCG	2	6	277377	277382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612745
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5994	NC_013959	TGG	2	6	277467	277472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612745
5995	NC_013959	CGT	2	6	277497	277502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612745
5996	NC_013959	GGT	2	6	277564	277569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612745
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5998	NC_013959	CAG	2	6	277613	277618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612745
5999	NC_013959	GGC	2	6	277768	277773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612745
6000	NC_013959	TGG	2	6	277827	277832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612745

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