MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013959	AAT	2	6	209338	209343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_013959	TCC	2	6	209359	209364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_013959	AAC	2	6	209451	209456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_013959	A	7	7	209492	209498	100 %	0 %	0 %	0 %	291612661
4505	NC_013959	ACA	2	6	209701	209706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612661
4506	NC_013959	ATCA	2	8	209714	209721	50 %	25 %	0 %	25 %	291612661
4507	NC_013959	GC	3	6	209766	209771	0 %	0 %	50 %	50 %	291612661
4508	NC_013959	CCG	3	9	209785	209793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612661
4509	NC_013959	CAG	2	6	209795	209800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612661
4510	NC_013959	GCC	3	9	209825	209833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612662
4511	NC_013959	CGC	2	6	209976	209981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612662
4512	NC_013959	GCC	2	6	209990	209995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612662
4513	NC_013959	TGC	2	6	210152	210157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612662
4514	NC_013959	AGC	2	6	210254	210259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612662
4515	NC_013959	GCC	2	6	210366	210371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4516	NC_013959	GGC	2	6	210375	210380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612663
4517	NC_013959	GC	3	6	210591	210596	0 %	0 %	50 %	50 %	291612663
4518	NC_013959	CAT	2	6	210602	210607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612663
4519	NC_013959	GCC	2	6	210675	210680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4520	NC_013959	AAC	2	6	210681	210686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612663
4521	NC_013959	AGC	2	6	210697	210702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4522	NC_013959	GAAG	2	8	210788	210795	50 %	0 %	50 %	0 %	291612663
4523	NC_013959	GCT	2	6	210869	210874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4524	NC_013959	CAG	2	6	210885	210890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4525	NC_013959	TGC	2	6	210931	210936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4526	NC_013959	TGC	2	6	211021	211026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4527	NC_013959	CG	3	6	211027	211032	0 %	0 %	50 %	50 %	291612663
4528	NC_013959	GC	3	6	211046	211051	0 %	0 %	50 %	50 %	291612663
4529	NC_013959	CGC	2	6	211059	211064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4530	NC_013959	CCAG	2	8	211069	211076	25 %	0 %	25 %	50 %	291612663
4531	NC_013959	CGCTG	2	10	211252	211261	0 %	20 %	40 %	40 %	291612663
4532	NC_013959	TCT	2	6	211291	211296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612663
4533	NC_013959	CGA	2	6	211337	211342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4534	NC_013959	GCATCA	2	12	211369	211380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291612663
4535	NC_013959	GC	3	6	211407	211412	0 %	0 %	50 %	50 %	291612663
4536	NC_013959	CAT	2	6	211415	211420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612663
4537	NC_013959	CCA	2	6	211430	211435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612663
4538	NC_013959	GCC	2	6	211509	211514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4539	NC_013959	ACA	2	6	211615	211620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612663
4540	NC_013959	CCGC	2	8	211622	211629	0 %	0 %	25 %	75 %	291612663
4541	NC_013959	TCA	2	6	211676	211681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612663
4542	NC_013959	GCC	2	6	211752	211757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4543	NC_013959	AC	3	6	211788	211793	50 %	0 %	0 %	50 %	291612663
4544	NC_013959	GCC	2	6	211921	211926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4545	NC_013959	CAA	2	6	211952	211957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612663
4546	NC_013959	GCA	2	6	211979	211984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4547	NC_013959	GCC	2	6	211989	211994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4548	NC_013959	GC	3	6	212003	212008	0 %	0 %	50 %	50 %	291612663
4549	NC_013959	GC	3	6	212024	212029	0 %	0 %	50 %	50 %	291612663
4550	NC_013959	GCCGAA	2	12	212043	212054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4551	NC_013959	GAA	3	9	212052	212060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612663
4552	NC_013959	CAG	2	6	212088	212093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4553	NC_013959	CGC	2	6	212198	212203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612663
4554	NC_013959	GCTG	2	8	212254	212261	0 %	25 %	50 %	25 %	291612663
4555	NC_013959	AGA	2	6	212278	212283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612663
4556	NC_013959	CGA	2	6	212324	212329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4557	NC_013959	GCT	2	6	212364	212369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612663
4558	NC_013959	CAG	2	6	212387	212392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_013959	A	6	6	212444	212449	100 %	0 %	0 %	0 %	291612664
4560	NC_013959	AGCC	2	8	212527	212534	25 %	0 %	25 %	50 %	291612664
4561	NC_013959	GC	3	6	212617	212622	0 %	0 %	50 %	50 %	291612664
4562	NC_013959	GCA	2	6	212737	212742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612664
4563	NC_013959	CGA	2	6	212758	212763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612664
4564	NC_013959	CTGC	2	8	212773	212780	0 %	25 %	25 %	50 %	291612664
4565	NC_013959	TGG	2	6	212847	212852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612664
4566	NC_013959	CGCC	2	8	212878	212885	0 %	0 %	25 %	75 %	291612664
4567	NC_013959	CAG	2	6	212896	212901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612664
4568	NC_013959	GGT	2	6	212914	212919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612664
4569	NC_013959	AGC	2	6	212964	212969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612664
4570	NC_013959	GC	3	6	213146	213151	0 %	0 %	50 %	50 %	291612664
4571	NC_013959	CTG	2	6	213332	213337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612665
4572	NC_013959	AGC	2	6	213429	213434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612665
4573	NC_013959	GAA	2	6	213454	213459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612665
4574	NC_013959	CAC	2	6	213460	213465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612665
4575	NC_013959	CCGCAT	2	12	213466	213477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291612665
4576	NC_013959	GC	3	6	213481	213486	0 %	0 %	50 %	50 %	291612665
4577	NC_013959	ATC	2	6	213521	213526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612665
4578	NC_013959	TGG	2	6	213531	213536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612665
4579	NC_013959	GAC	2	6	213542	213547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612665
4580	NC_013959	GC	3	6	213548	213553	0 %	0 %	50 %	50 %	291612665
4581	NC_013959	CGTG	2	8	213583	213590	0 %	25 %	50 %	25 %	291612665
4582	NC_013959	GCG	2	6	213599	213604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612665
4583	NC_013959	CCTC	2	8	213642	213649	0 %	25 %	0 %	75 %	291612665
4584	NC_013959	TGG	2	6	213671	213676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612665
4585	NC_013959	GC	3	6	213804	213809	0 %	0 %	50 %	50 %	291612666
4586	NC_013959	GGC	2	6	213816	213821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612666
4587	NC_013959	CAC	2	6	213864	213869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612666
4588	NC_013959	CGC	2	6	213918	213923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612666
4589	NC_013959	CAC	2	6	213996	214001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612666
4590	NC_013959	ACCA	2	8	214017	214024	50 %	0 %	0 %	50 %	291612666
4591	NC_013959	TGCC	2	8	214053	214060	0 %	25 %	25 %	50 %	291612666
4592	NC_013959	ATG	2	6	214086	214091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612666
4593	NC_013959	AGGC	2	8	214122	214129	25 %	0 %	50 %	25 %	291612667
4594	NC_013959	GC	3	6	214166	214171	0 %	0 %	50 %	50 %	291612667
4595	NC_013959	ATC	2	6	214194	214199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612667
4596	NC_013959	TGG	3	9	214204	214212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612667
4597	NC_013959	CGG	2	6	214313	214318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612667
4598	NC_013959	ACT	2	6	214413	214418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612668
4599	NC_013959	TGC	2	6	214452	214457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612668
4600	NC_013959	CAT	2	6	214486	214491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612668
4601	NC_013959	ATC	2	6	214529	214534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612668
4602	NC_013959	CAGC	2	8	214549	214556	25 %	0 %	25 %	50 %	291612668
4603	NC_013959	CGC	2	6	214565	214570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612668
4604	NC_013959	GCA	2	6	214646	214651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612668
4605	NC_013959	GCC	2	6	214655	214660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612669
4606	NC_013959	ACG	2	6	214679	214684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612669
4607	NC_013959	ATG	2	6	214840	214845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612669
4608	NC_013959	AAGG	2	8	214872	214879	50 %	0 %	50 %	0 %	291612669
4609	NC_013959	GCT	2	6	215034	215039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612670
4610	NC_013959	ATC	2	6	215045	215050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612670
4611	NC_013959	GTG	2	6	215074	215079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612670
4612	NC_013959	TAC	2	6	215111	215116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612670
4613	NC_013959	AAG	2	6	215120	215125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612670
4614	NC_013959	CCG	2	6	215286	215291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612670
4615	NC_013959	CTA	2	6	215374	215379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612670
4616	NC_013959	CCT	2	6	215402	215407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612671
4617	NC_013959	GCG	2	6	215417	215422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612671
4618	NC_013959	GC	4	8	215459	215466	0 %	0 %	50 %	50 %	291612671
4619	NC_013959	GCT	2	6	215511	215516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612671
4620	NC_013959	CTG	2	6	215581	215586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612671
4621	NC_013959	GCT	2	6	215592	215597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612671
4622	NC_013959	ACT	2	6	215657	215662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612671
4623	NC_013959	GGC	2	6	215664	215669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612671
4624	NC_013959	CTG	2	6	215734	215739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612671
4625	NC_013959	ATC	2	6	215743	215748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612671
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4632	NC_013959	AGC	2	6	215904	215909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612671
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4637	NC_013959	ACG	2	6	216073	216078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612672
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4639	NC_013959	ACTGGT	2	12	216190	216201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291612672
4640	NC_013959	CAG	2	6	216275	216280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612672
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4642	NC_013959	AGG	2	6	216341	216346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4643	NC_013959	AAAG	2	8	216363	216370	75 %	0 %	25 %	0 %	291612673
4644	NC_013959	GCT	3	9	216414	216422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612673
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4647	NC_013959	CTG	2	6	216553	216558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612673
4648	NC_013959	ACTGGT	2	12	216590	216601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291612673
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4650	NC_013959	AAT	2	6	216730	216735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4651	NC_013959	CG	3	6	216831	216836	0 %	0 %	50 %	50 %	291612674
4652	NC_013959	AAGCA	2	10	216842	216851	60 %	0 %	20 %	20 %	291612674
4653	NC_013959	GGC	2	6	216854	216859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612674
4654	NC_013959	GA	4	8	216916	216923	50 %	0 %	50 %	0 %	291612674
4655	NC_013959	CGC	2	6	216927	216932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612674
4656	NC_013959	GCT	2	6	216970	216975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612674
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4660	NC_013959	CTG	2	6	217228	217233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612675
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4674	NC_013959	CGT	2	6	217830	217835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612675
4675	NC_013959	CTG	2	6	217843	217848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612675
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4678	NC_013959	CTG	2	6	217942	217947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612675
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4680	NC_013959	CCAG	2	8	217976	217983	25 %	0 %	25 %	50 %	291612675
4681	NC_013959	TTC	2	6	218026	218031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612675
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4692	NC_013959	CG	3	6	218407	218412	0 %	0 %	50 %	50 %	291612675
4693	NC_013959	CTG	2	6	218413	218418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612675
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4702	NC_013959	AC	3	6	218830	218835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4703	NC_013959	CGC	2	6	218877	218882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612677
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4705	NC_013959	ACCA	2	8	218899	218906	50 %	0 %	0 %	50 %	291612677
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4708	NC_013959	GCT	2	6	219003	219008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612677
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4711	NC_013959	AAGA	2	8	219085	219092	75 %	0 %	25 %	0 %	291612677
4712	NC_013959	CGA	2	6	219114	219119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612677
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4727	NC_013959	GA	3	6	219666	219671	50 %	0 %	50 %	0 %	291612679
4728	NC_013959	ATG	2	6	219710	219715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612679
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4731	NC_013959	CG	3	6	219933	219938	0 %	0 %	50 %	50 %	291612680
4732	NC_013959	CTG	2	6	220010	220015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612680
4733	NC_013959	TCG	2	6	220029	220034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612680
4734	NC_013959	TG	3	6	220055	220060	0 %	50 %	50 %	0 %	291612680
4735	NC_013959	TGC	2	6	220104	220109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612680
4736	NC_013959	GGC	2	6	220146	220151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612680
4737	NC_013959	GTT	2	6	220177	220182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612680
4738	NC_013959	GC	3	6	220202	220207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4739	NC_013959	GCA	2	6	220296	220301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612681
4740	NC_013959	AAC	2	6	220311	220316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612681
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4742	NC_013959	GCA	2	6	220440	220445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612681
4743	NC_013959	CCG	2	6	220513	220518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612681
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4986	NC_013959	TGC	2	6	230682	230687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612699
4987	NC_013959	GCC	2	6	230735	230740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612699
4988	NC_013959	GATG	2	8	230763	230770	25 %	25 %	50 %	0 %	291612699
4989	NC_013959	TCTGC	2	10	230798	230807	0 %	40 %	20 %	40 %	291612699
4990	NC_013959	GC	3	6	230806	230811	0 %	0 %	50 %	50 %	291612699
4991	NC_013959	GAAT	2	8	230814	230821	50 %	25 %	25 %	0 %	291612699
4992	NC_013959	CCTGCT	2	12	230872	230883	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291612699
4993	NC_013959	GCTG	2	8	230884	230891	0 %	25 %	50 %	25 %	291612699
4994	NC_013959	TGC	2	6	230901	230906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612699
4995	NC_013959	GAA	2	6	230917	230922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612699
4996	NC_013959	CGA	2	6	230982	230987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612699
4997	NC_013959	CAT	2	6	231045	231050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612699
4998	NC_013959	GCC	2	6	231055	231060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612699
4999	NC_013959	GCC	3	9	231109	231117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612699
5000	NC_013959	GAATG	2	10	231150	231159	40 %	20 %	40 %	0 %	291612699

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