MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 2369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	CATTA	2	10	623	632	40 %	40 %	0 %	20 %	289549372
2	NC_013893	AATTG	2	10	1189	1198	40 %	40 %	20 %	0 %	289549373
3	NC_013893	AAATG	2	10	3204	3213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013893	ATAAA	2	10	8702	8711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013893	CCCCA	2	10	9046	9055	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_013893	TTGCT	2	10	9058	9067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013893	ACTAA	2	10	9224	9233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013893	AAATT	2	10	11467	11476	60 %	40 %	0 %	0 %	289549385
9	NC_013893	TTATT	2	10	11639	11648	20 %	80 %	0 %	0 %	289549386
10	NC_013893	TAAAT	2	10	11884	11893	60 %	40 %	0 %	0 %	289549387
11	NC_013893	TGTTT	2	10	13578	13587	0 %	80 %	20 %	0 %	289549389
12	NC_013893	AGAAA	2	10	14703	14712	80 %	0 %	20 %	0 %	289549390
13	NC_013893	TTATC	2	10	15343	15352	20 %	60 %	0 %	20 %	289549391
14	NC_013893	TACAA	2	10	15422	15431	60 %	20 %	0 %	20 %	289549391
15	NC_013893	TTTTG	2	10	16874	16883	0 %	80 %	20 %	0 %	289549392
16	NC_013893	TTCTA	2	10	16889	16898	20 %	60 %	0 %	20 %	289549392
17	NC_013893	TAAAA	2	10	17049	17058	80 %	20 %	0 %	0 %	289549393
18	NC_013893	TAAAT	2	10	20596	20605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013893	AAAAG	2	10	21459	21468	80 %	0 %	20 %	0 %	289549397
20	NC_013893	ATAAA	2	10	22456	22465	80 %	20 %	0 %	0 %	289549399
21	NC_013893	ACAAA	3	15	24966	24980	80 %	0 %	0 %	20 %	289549401
22	NC_013893	TTTAT	2	10	25783	25792	20 %	80 %	0 %	0 %	289549402
23	NC_013893	TTTTG	2	10	29596	29605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013893	TATTT	2	10	29652	29661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013893	AGTTA	2	10	30155	30164	40 %	40 %	20 %	0 %	289549407
26	NC_013893	TAGAA	2	10	30610	30619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013893	AGTAA	2	10	30637	30646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013893	TGGTG	2	10	30936	30945	0 %	40 %	60 %	0 %	289549408
29	NC_013893	TTGGC	2	10	31264	31273	0 %	40 %	40 %	20 %	289549408
30	NC_013893	TGTAT	2	10	31299	31308	20 %	60 %	20 %	0 %	289549408
31	NC_013893	GATGC	2	10	32981	32990	20 %	20 %	40 %	20 %	289549409
32	NC_013893	GTTCA	2	10	33252	33261	20 %	40 %	20 %	20 %	289549409
33	NC_013893	CATCA	2	10	34620	34629	40 %	20 %	0 %	40 %	289549409
34	NC_013893	TTTCA	2	10	34728	34737	20 %	60 %	0 %	20 %	289549409
35	NC_013893	AAGTA	2	10	36720	36729	60 %	20 %	20 %	0 %	289549409
36	NC_013893	GCATC	2	10	37073	37082	20 %	20 %	20 %	40 %	289549409
37	NC_013893	AAATT	2	10	39965	39974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013893	TAAAT	2	10	42724	42733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013893	ATAAA	2	10	43636	43645	80 %	20 %	0 %	0 %	289549416
40	NC_013893	GAAAT	2	10	45191	45200	60 %	20 %	20 %	0 %	289549417
41	NC_013893	ACGAA	2	10	48867	48876	60 %	0 %	20 %	20 %	289549421
42	NC_013893	AGTTG	2	10	50578	50587	20 %	40 %	40 %	0 %	289549422
43	NC_013893	TAAAT	2	10	54872	54881	60 %	40 %	0 %	0 %	289549428
44	NC_013893	ATTTT	2	10	57619	57628	20 %	80 %	0 %	0 %	289549429
45	NC_013893	TTATT	2	10	58883	58892	20 %	80 %	0 %	0 %	289549429
46	NC_013893	TGATG	2	10	62534	62543	20 %	40 %	40 %	0 %	289549432
47	NC_013893	AGTAC	2	10	62954	62963	40 %	20 %	20 %	20 %	289549432
48	NC_013893	TTAAT	2	10	63051	63060	40 %	60 %	0 %	0 %	289549432
49	NC_013893	AATAT	2	10	64425	64434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013893	ATTAT	2	10	64886	64895	40 %	60 %	0 %	0 %	289549433
51	NC_013893	TTATT	2	10	65494	65503	20 %	80 %	0 %	0 %	289549434
52	NC_013893	ATTGA	2	10	65902	65911	40 %	40 %	20 %	0 %	289549435
53	NC_013893	AGCTG	2	10	66570	66579	20 %	20 %	40 %	20 %	289549435
54	NC_013893	AAATG	2	10	67323	67332	60 %	20 %	20 %	0 %	289549435
55	NC_013893	TAAAT	2	10	67352	67361	60 %	40 %	0 %	0 %	289549435
56	NC_013893	TGGTT	2	10	67966	67975	0 %	60 %	40 %	0 %	289549436
57	NC_013893	TGCTT	2	10	68497	68506	0 %	60 %	20 %	20 %	289549436
58	NC_013893	TGTTT	2	10	68831	68840	0 %	80 %	20 %	0 %	289549436
59	NC_013893	TATAT	2	10	72023	72032	40 %	60 %	0 %	0 %	289549438
60	NC_013893	ATGAA	2	10	72425	72434	60 %	20 %	20 %	0 %	289549439
61	NC_013893	AAGAT	2	10	75380	75389	60 %	20 %	20 %	0 %	289549442
62	NC_013893	TAAAG	2	10	75808	75817	60 %	20 %	20 %	0 %	289549443
63	NC_013893	ATGTG	2	10	77534	77543	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013893	GCAAT	2	10	79534	79543	40 %	20 %	20 %	20 %	289549446
65	NC_013893	TTTAG	2	10	80394	80403	20 %	60 %	20 %	0 %	289549447
66	NC_013893	TGATC	2	10	82217	82226	20 %	40 %	20 %	20 %	289549449
67	NC_013893	TGTTT	2	10	82296	82305	0 %	80 %	20 %	0 %	289549450
68	NC_013893	TGGGG	2	10	82799	82808	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013893	TGGGG	2	10	82983	82992	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013893	TGGGG	2	10	83166	83175	0 %	20 %	80 %	0 %	289549451
71	NC_013893	AAGCA	2	10	83210	83219	60 %	0 %	20 %	20 %	289549451
72	NC_013893	AACAA	2	10	85840	85849	80 %	0 %	0 %	20 %	289549453
73	NC_013893	GAAAA	2	10	88501	88510	80 %	0 %	20 %	0 %	289549455
74	NC_013893	TTATT	2	10	91319	91328	20 %	80 %	0 %	0 %	289549458
75	NC_013893	TGATG	2	10	94970	94979	20 %	40 %	40 %	0 %	289549461
76	NC_013893	AGTAC	2	10	95390	95399	40 %	20 %	20 %	20 %	289549461
77	NC_013893	TTAAT	2	10	95487	95496	40 %	60 %	0 %	0 %	289549461
78	NC_013893	AATAT	2	10	96861	96870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013893	ATTAT	2	10	97322	97331	40 %	60 %	0 %	0 %	289549462
80	NC_013893	TTATT	2	10	97930	97939	20 %	80 %	0 %	0 %	289549463
81	NC_013893	ATTGA	2	10	98338	98347	40 %	40 %	20 %	0 %	289549464
82	NC_013893	AGCTG	2	10	99006	99015	20 %	20 %	40 %	20 %	289549464
83	NC_013893	AAATG	2	10	99759	99768	60 %	20 %	20 %	0 %	289549464
84	NC_013893	TAAAT	2	10	99788	99797	60 %	40 %	0 %	0 %	289549464
85	NC_013893	TGGTT	2	10	100402	100411	0 %	60 %	40 %	0 %	289549465
86	NC_013893	TGCTT	2	10	100933	100942	0 %	60 %	20 %	20 %	289549465
87	NC_013893	TGTTT	2	10	101267	101276	0 %	80 %	20 %	0 %	289549465
88	NC_013893	TATAT	2	10	104459	104468	40 %	60 %	0 %	0 %	289549467
89	NC_013893	ATGAA	2	10	104861	104870	60 %	20 %	20 %	0 %	289549468
90	NC_013893	AAGAT	2	10	107816	107825	60 %	20 %	20 %	0 %	289549471
91	NC_013893	TAAAG	2	10	108244	108253	60 %	20 %	20 %	0 %	289549472
92	NC_013893	ATGTG	2	10	109970	109979	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013893	GCAAT	2	10	111970	111979	40 %	20 %	20 %	20 %	289549475
94	NC_013893	TTTAG	2	10	112830	112839	20 %	60 %	20 %	0 %	289549476
95	NC_013893	TGATC	2	10	114653	114662	20 %	40 %	20 %	20 %	289549478
96	NC_013893	TGTTT	2	10	114732	114741	0 %	80 %	20 %	0 %	289549479
97	NC_013893	TGGGG	2	10	115235	115244	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013893	TGGGG	2	10	115419	115428	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013893	TGGGG	2	10	115602	115611	0 %	20 %	80 %	0 %	289549480
100	NC_013893	AAGCA	2	10	115646	115655	60 %	0 %	20 %	20 %	289549480
101	NC_013893	AACAA	2	10	118276	118285	80 %	0 %	0 %	20 %	289549482
102	NC_013893	GAAAA	2	10	120937	120946	80 %	0 %	20 %	0 %	289549484
103	NC_013893	TTGCG	2	10	123573	123582	0 %	40 %	40 %	20 %	289549487
104	NC_013893	TATCT	2	10	123923	123932	20 %	60 %	0 %	20 %	289549487
105	NC_013893	TAAAA	2	10	124930	124939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013893	TGAAA	2	10	125455	125464	60 %	20 %	20 %	0 %	289549489
107	NC_013893	CGATA	2	10	125975	125984	40 %	20 %	20 %	20 %	289549490
108	NC_013893	AGTTA	2	10	127125	127134	40 %	40 %	20 %	0 %	289549491
109	NC_013893	ATATC	2	10	127656	127665	40 %	40 %	0 %	20 %	289549492
110	NC_013893	TATTT	2	10	128108	128117	20 %	80 %	0 %	0 %	289549493
111	NC_013893	TAAAA	2	10	128652	128661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013893	TTTAA	2	10	128663	128672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013893	GGTTG	2	10	128799	128808	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013893	GGCTA	2	10	129935	129944	20 %	20 %	40 %	20 %	289549495
115	NC_013893	ATTTA	2	10	131613	131622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013893	ATCAA	2	10	132199	132208	60 %	20 %	0 %	20 %	289549498
117	NC_013893	TTTGT	2	10	132557	132566	0 %	80 %	20 %	0 %	289549498
118	NC_013893	ATATT	2	10	132647	132656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013893	GAAGT	2	10	133078	133087	40 %	20 %	40 %	0 %	289549499
120	NC_013893	GATTG	2	10	134123	134132	20 %	40 %	40 %	0 %	289549500
121	NC_013893	AGAAA	2	10	134656	134665	80 %	0 %	20 %	0 %	289549500
122	NC_013893	CTATG	2	10	135654	135663	20 %	40 %	20 %	20 %	289549501
123	NC_013893	GATTG	2	10	135974	135983	20 %	40 %	40 %	0 %	289549501
124	NC_013893	ATTAC	2	10	136176	136185	40 %	40 %	0 %	20 %	289549501
125	NC_013893	ATCAA	2	10	136869	136878	60 %	20 %	0 %	20 %	289549502
126	NC_013893	ATTTA	2	10	137608	137617	40 %	60 %	0 %	0 %	289549503
127	NC_013893	TATTT	2	10	138203	138212	20 %	80 %	0 %	0 %	289549503
128	NC_013893	GTATT	2	10	148451	148460	20 %	60 %	20 %	0 %	289549512
129	NC_013893	AATGA	2	10	152226	152235	60 %	20 %	20 %	0 %	289549515
130	NC_013893	CAATT	2	10	154049	154058	40 %	40 %	0 %	20 %	289549516
131	NC_013893	GTATG	2	10	154867	154876	20 %	40 %	40 %	0 %	289549517
132	NC_013893	TAGAA	2	10	155750	155759	60 %	20 %	20 %	0 %	289549517
133	NC_013893	TTAGA	2	10	156112	156121	40 %	40 %	20 %	0 %	289549518
134	NC_013893	GTGCT	2	10	159474	159483	0 %	40 %	40 %	20 %	289549521
135	NC_013893	AATGC	2	10	160871	160880	40 %	20 %	20 %	20 %	289549522
136	NC_013893	AAAAG	2	10	161099	161108	80 %	0 %	20 %	0 %	289549523
137	NC_013893	TTTAC	2	10	163749	163758	20 %	60 %	0 %	20 %	289549525
138	NC_013893	TAAAA	2	10	164397	164406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_013893	TAAAT	2	10	170268	170277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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