MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 40939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	ATA	2	6	27	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013893	TTA	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013893	AAT	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013893	ATA	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013893	ATT	2	6	234	239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013893	TTA	2	6	266	271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013893	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013893	TAA	2	6	328	333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013893	TCA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013893	AAG	2	6	577	582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549372
11	NC_013893	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549372
12	NC_013893	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549372
13	NC_013893	ATG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549372
14	NC_013893	ATT	2	6	925	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013893	AGT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013893	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013893	GAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013893	TAA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013893	TGT	3	9	1114	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549373
20	NC_013893	GTA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549373
21	NC_013893	AAT	2	6	1155	1160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
22	NC_013893	CAA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549373
23	NC_013893	TTC	2	6	1337	1342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
24	NC_013893	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
25	NC_013893	CAT	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549373
26	NC_013893	TAA	2	6	1437	1442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
27	NC_013893	TTA	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549373
28	NC_013893	ATC	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013893	TAA	2	6	1526	1531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013893	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013893	ATT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013893	TAA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013893	TAA	2	6	1603	1608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
34	NC_013893	TAG	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549374
35	NC_013893	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549374
36	NC_013893	ATA	2	6	1731	1736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
37	NC_013893	AAT	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
38	NC_013893	CTA	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549374
39	NC_013893	TAA	2	6	2042	2047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013893	TAA	2	6	2180	2185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013893	ATT	2	6	2192	2197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013893	ATA	2	6	2250	2255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013893	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013893	GTT	2	6	2292	2297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013893	AGA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549375
46	NC_013893	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549375
47	NC_013893	TCA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
48	NC_013893	ATT	2	6	2541	2546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
49	NC_013893	ATT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
50	NC_013893	TCA	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
51	NC_013893	AAT	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549376
52	NC_013893	TAT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013893	TTA	2	6	2881	2886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013893	GTA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013893	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013893	TAC	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013893	ATG	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549377
58	NC_013893	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
59	NC_013893	TCA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549377
60	NC_013893	ACA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
61	NC_013893	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
62	NC_013893	TTG	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549377
63	NC_013893	GGT	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549377
64	NC_013893	ACA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
65	NC_013893	AAC	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
66	NC_013893	TAA	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549377
67	NC_013893	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
68	NC_013893	AGA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
69	NC_013893	GAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
70	NC_013893	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549378
71	NC_013893	TGT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549378
72	NC_013893	TTC	3	9	4511	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
73	NC_013893	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549378
74	NC_013893	TAT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549378
75	NC_013893	CTT	2	6	4627	4632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
76	NC_013893	TTC	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
77	NC_013893	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549378
78	NC_013893	ATC	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013893	TAA	2	6	4997	5002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013893	GGA	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013893	AGC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
82	NC_013893	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
83	NC_013893	ATG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
84	NC_013893	TCA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
85	NC_013893	AGA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
86	NC_013893	AGA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
87	NC_013893	ACA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
88	NC_013893	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549379
89	NC_013893	GCA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
90	NC_013893	CGT	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549379
91	NC_013893	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
92	NC_013893	AGA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
93	NC_013893	AGA	2	6	5558	5563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
94	NC_013893	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549379
95	NC_013893	AGA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
96	NC_013893	TGA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
97	NC_013893	CAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
98	NC_013893	ATT	3	9	5656	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
99	NC_013893	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
100	NC_013893	TGA	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
101	NC_013893	AGC	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
102	NC_013893	AAC	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
103	NC_013893	TAC	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
104	NC_013893	GGT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013893	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
106	NC_013893	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
107	NC_013893	ATG	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
108	NC_013893	ATG	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
109	NC_013893	TAA	2	6	6655	6660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013893	ACT	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013893	AGT	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013893	CTT	2	6	6941	6946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013893	TGA	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549381
114	NC_013893	TTG	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549381
115	NC_013893	AAT	2	6	7233	7238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
116	NC_013893	TTC	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549381
117	NC_013893	TCG	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
118	NC_013893	TCA	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549381
119	NC_013893	ATA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
120	NC_013893	TTG	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549381
121	NC_013893	AAT	2	6	7637	7642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
122	NC_013893	GCT	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
123	NC_013893	GAA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549381
124	NC_013893	TGC	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
125	NC_013893	ATA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
126	NC_013893	CTT	3	9	8040	8048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013893	ATG	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549382
128	NC_013893	ATG	2	6	8091	8096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549382
129	NC_013893	CAT	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549382
130	NC_013893	ATG	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013893	ATG	2	6	8321	8326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013893	GAT	2	6	8339	8344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013893	ATT	2	6	8388	8393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013893	ACC	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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136	NC_013893	TAA	2	6	8602	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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