MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	AT	3	6	65	70	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013770	AG	3	6	1332	1337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013770	TA	3	6	2467	2472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013770	TC	3	6	2631	2636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013770	AT	3	6	3368	3373	50 %	50 %	0 %	0 %	284807105
7	NC_013770	TA	3	6	3446	3451	50 %	50 %	0 %	0 %	284807105
8	NC_013770	TA	3	6	3891	3896	50 %	50 %	0 %	0 %	284807106
9	NC_013770	TC	3	6	4035	4040	0 %	50 %	0 %	50 %	284807106
10	NC_013770	TA	3	6	4424	4429	50 %	50 %	0 %	0 %	284807106
11	NC_013770	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
12	NC_013770	TA	4	8	4618	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
13	NC_013770	AT	3	6	4674	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
14	NC_013770	TA	3	6	4935	4940	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
15	NC_013770	AT	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
16	NC_013770	GA	3	6	5158	5163	50 %	0 %	50 %	0 %	284807107
17	NC_013770	CT	3	6	7437	7442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013770	AG	3	6	8241	8246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013770	TA	4	8	8960	8967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013770	TA	3	6	10851	10856	50 %	50 %	0 %	0 %	284807111
21	NC_013770	CT	3	6	11472	11477	0 %	50 %	0 %	50 %	284807112
22	NC_013770	AT	4	8	11739	11746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013770	TA	4	8	11796	11803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	AC	3	6	11825	11830	50 %	0 %	0 %	50 %	284807113
25	NC_013770	AG	3	6	12308	12313	50 %	0 %	50 %	0 %	284807114
26	NC_013770	TC	4	8	13169	13176	0 %	50 %	0 %	50 %	284807117
27	NC_013770	AT	3	6	13328	13333	50 %	50 %	0 %	0 %	284807117
28	NC_013770	TC	3	6	13434	13439	0 %	50 %	0 %	50 %	284807117
29	NC_013770	GA	3	6	14457	14462	50 %	0 %	50 %	0 %	284807119
30	NC_013770	AG	3	6	15328	15333	50 %	0 %	50 %	0 %	284807121
31	NC_013770	AG	3	6	15550	15555	50 %	0 %	50 %	0 %	284807122
32	NC_013770	AG	3	6	15716	15721	50 %	0 %	50 %	0 %	284807122
33	NC_013770	AG	3	6	16900	16905	50 %	0 %	50 %	0 %	284807125
34	NC_013770	GA	3	6	18234	18239	50 %	0 %	50 %	0 %	284807126
35	NC_013770	AT	3	6	18276	18281	50 %	50 %	0 %	0 %	284807126
36	NC_013770	TC	3	6	18400	18405	0 %	50 %	0 %	50 %	284807127
37	NC_013770	TA	5	10	18555	18564	50 %	50 %	0 %	0 %	284807127
38	NC_013770	AT	3	6	18565	18570	50 %	50 %	0 %	0 %	284807127
39	NC_013770	TC	4	8	18686	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	284807127
40	NC_013770	AC	3	6	18980	18985	50 %	0 %	0 %	50 %	284807127
41	NC_013770	AT	3	6	19357	19362	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
42	NC_013770	CT	3	6	19523	19528	0 %	50 %	0 %	50 %	284807128
43	NC_013770	TC	3	6	19867	19872	0 %	50 %	0 %	50 %	284807128
44	NC_013770	AT	4	8	20119	20126	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
45	NC_013770	AT	3	6	20237	20242	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
46	NC_013770	TA	3	6	20500	20505	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
47	NC_013770	AT	4	8	24152	24159	50 %	50 %	0 %	0 %	284807132
48	NC_013770	AC	4	8	24636	24643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013770	TC	3	6	24946	24951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013770	CT	3	6	25140	25145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013770	TA	3	6	25153	25158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013770	TC	3	6	26241	26246	0 %	50 %	0 %	50 %	284807135
53	NC_013770	AT	3	6	26321	26326	50 %	50 %	0 %	0 %	284807135
54	NC_013770	TC	3	6	26372	26377	0 %	50 %	0 %	50 %	284807135

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.