MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 447

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	TAG	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013770	GTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013770	TTG	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013770	TCT	2	6	401	406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013770	AGG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013770	ATT	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013770	TCA	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013770	TTA	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013770	TCT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013770	ATC	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013770	TAG	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013770	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013770	GTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013770	ATG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013770	GAT	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013770	CTT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013770	TCA	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013770	ATC	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013770	GCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013770	ATA	2	6	1452	1457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013770	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013770	ATG	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	TAG	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013770	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013770	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013770	AGG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013770	TGC	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013770	TTG	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013770	ATG	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013770	GTA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013770	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013770	ATA	2	6	1768	1773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013770	GTA	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013770	AGT	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013770	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013770	TCT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013770	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013770	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013770	AGA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013770	TAT	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013770	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013770	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013770	CAA	2	6	2260	2265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013770	AGA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013770	ATT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013770	CCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013770	CGT	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013770	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013770	CTA	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013770	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013770	AGA	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807104
53	NC_013770	TTC	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807104
54	NC_013770	CTT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807104
55	NC_013770	AGA	2	6	3020	3025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807104
56	NC_013770	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807104
57	NC_013770	TGC	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807104
58	NC_013770	AGG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807104
59	NC_013770	CTT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807105
60	NC_013770	TTG	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807106
61	NC_013770	ATC	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807106
62	NC_013770	TAA	2	6	3810	3815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807106
63	NC_013770	TAT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807106
64	NC_013770	TCT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807106
65	NC_013770	GAA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807106
66	NC_013770	TCC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807106
67	NC_013770	TCT	2	6	4234	4239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807106
68	NC_013770	CGT	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807106
69	NC_013770	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807106
70	NC_013770	TAA	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807106
71	NC_013770	TAA	2	6	4511	4516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
72	NC_013770	TAA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
73	NC_013770	CTT	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
74	NC_013770	CTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807107
75	NC_013770	TGT	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807107
76	NC_013770	AAT	2	6	4776	4781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
77	NC_013770	TTA	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807107
78	NC_013770	TAT	2	6	4914	4919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807107
79	NC_013770	TCC	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807107
80	NC_013770	AAT	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
81	NC_013770	TCT	2	6	5085	5090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
82	NC_013770	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
83	NC_013770	TCT	2	6	5228	5233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013770	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
85	NC_013770	ATA	2	6	5587	5592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807108
86	NC_013770	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
87	NC_013770	CAT	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807108
88	NC_013770	AAG	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
89	NC_013770	CAT	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
90	NC_013770	CTA	2	6	6091	6096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
91	NC_013770	GTA	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807109
92	NC_013770	AAC	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807109
93	NC_013770	AAT	2	6	6172	6177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
94	NC_013770	AAG	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807109
95	NC_013770	AGC	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284807109
96	NC_013770	AGC	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284807109
97	NC_013770	AAT	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
98	NC_013770	ACA	2	6	6457	6462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807109
99	NC_013770	AAT	2	6	6498	6503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
100	NC_013770	AAG	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807109
101	NC_013770	CTA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
102	NC_013770	ACT	2	6	6837	6842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807109
103	NC_013770	AAT	2	6	6877	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807109
104	NC_013770	TCC	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807109
105	NC_013770	GCT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807109
106	NC_013770	CCT	2	6	7134	7139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807109
107	NC_013770	CCA	3	9	7140	7148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284807109
108	NC_013770	TAT	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807109
109	NC_013770	ATT	2	6	7206	7211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807109
110	NC_013770	AAG	2	6	7251	7256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013770	AGG	2	6	7392	7397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013770	CCT	2	6	7448	7453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013770	AAC	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013770	GAG	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013770	TAA	2	6	7655	7660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013770	GGA	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013770	AGG	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013770	TAA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013770	GTT	2	6	7875	7880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013770	AGG	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013770	TGA	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013770	CAC	2	6	8007	8012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013770	CCA	2	6	8099	8104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013770	AGA	2	6	8123	8128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013770	GTT	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013770	AAT	2	6	8171	8176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013770	TCA	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013770	CGT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013770	TTG	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013770	GGA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013770	CTC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013770	CTC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013770	CTA	2	6	8721	8726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013770	TTC	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013770	CCT	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013770	TCG	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013770	TAT	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013770	TAT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013770	TAC	2	6	9166	9171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807110
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394	NC_013770	TTA	2	6	23459	23464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_013770	TAT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_013770	TAA	2	6	23715	23720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_013770	CTC	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NC_013770	GAA	2	6	25078	25083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_013770	GCG	2	6	25168	25173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_013770	AGA	2	6	25569	25574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_013770	ACA	2	6	25602	25607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_013770	GGA	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_013770	TTC	2	6	25642	25647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_013770	GAG	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
434	NC_013770	GAG	2	6	25728	25733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_013770	CTT	2	6	25734	25739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_013770	TTC	2	6	26538	26543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.