MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 671

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013770	GAG	2	6	19752	19757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807128
502	NC_013770	TAG	2	6	19793	19798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807128
503	NC_013770	TTA	2	6	19800	19805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
504	NC_013770	ATT	2	6	19838	19843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
505	NC_013770	TC	3	6	19867	19872	0 %	50 %	0 %	50 %	284807128
506	NC_013770	AGT	2	6	19878	19883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807128
507	NC_013770	TAC	2	6	19885	19890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807128
508	NC_013770	TAG	2	6	19917	19922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807128
509	NC_013770	AATGT	2	10	19967	19976	40 %	40 %	20 %	0 %	284807128
510	NC_013770	TAT	2	6	19995	20000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
511	NC_013770	TCATAC	2	12	20060	20071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807128
512	NC_013770	GTA	2	6	20090	20095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807128
513	NC_013770	AT	4	8	20119	20126	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
514	NC_013770	AATA	2	8	20127	20134	75 %	25 %	0 %	0 %	284807128
515	NC_013770	TGT	2	6	20137	20142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807128
516	NC_013770	ATT	2	6	20143	20148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
517	NC_013770	CTT	2	6	20208	20213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807128
518	NC_013770	AGG	2	6	20224	20229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807128
519	NC_013770	AT	3	6	20237	20242	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
520	NC_013770	GCTG	2	8	20245	20252	0 %	25 %	50 %	25 %	284807128
521	NC_013770	TTA	2	6	20318	20323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
522	NC_013770	TGT	2	6	20377	20382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807128
523	NC_013770	T	6	6	20389	20394	0 %	100 %	0 %	0 %	284807128
524	NC_013770	GTT	2	6	20450	20455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807128
525	NC_013770	ATTA	2	8	20467	20474	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
526	NC_013770	TAC	2	6	20494	20499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807128
527	NC_013770	TA	3	6	20500	20505	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
528	NC_013770	AGG	2	6	20512	20517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807128
529	NC_013770	CCAG	2	8	20524	20531	25 %	0 %	25 %	50 %	284807128
530	NC_013770	ATT	2	6	20576	20581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
531	NC_013770	TTTA	2	8	20611	20618	25 %	75 %	0 %	0 %	284807128
532	NC_013770	TAGTGT	2	12	20637	20648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284807128
533	NC_013770	ATG	2	6	20654	20659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807128
534	NC_013770	AAT	2	6	20687	20692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807128
535	NC_013770	ATT	2	6	20714	20719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
536	NC_013770	TGT	2	6	20760	20765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807128
537	NC_013770	TCC	2	6	20944	20949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807128
538	NC_013770	GAA	2	6	20972	20977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807128
539	NC_013770	TAT	4	12	21025	21036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807128
540	NC_013770	TCT	2	6	21058	21063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807128
541	NC_013770	TGA	2	6	21132	21137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807128
542	NC_013770	A	6	6	21143	21148	100 %	0 %	0 %	0 %	284807128
543	NC_013770	ATTTTT	2	12	21182	21193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284807128
544	NC_013770	AATAT	2	10	21267	21276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013770	GTG	2	6	21284	21289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013770	TTC	2	6	21320	21325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013770	TTC	3	9	21346	21354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013770	CTAGT	2	10	21425	21434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
549	NC_013770	GGT	2	6	21445	21450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013770	TAT	2	6	21455	21460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013770	ATTT	2	8	21466	21473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013770	GAT	2	6	21492	21497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013770	ATA	2	6	21529	21534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013770	AGA	2	6	21569	21574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013770	GATA	2	8	21633	21640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013770	ACA	2	6	21654	21659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013770	GAT	2	6	21690	21695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013770	TAA	2	6	21707	21712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013770	TCT	2	6	21716	21721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_013770	ATA	2	6	21819	21824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013770	TTTC	2	8	21825	21832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_013770	A	6	6	21845	21850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013770	A	6	6	21857	21862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013770	A	7	7	21880	21886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013770	TAT	2	6	21917	21922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013770	ATT	2	6	21964	21969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013770	A	6	6	21971	21976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013770	TAACA	2	10	22026	22035	60 %	20 %	0 %	20 %	284807129
569	NC_013770	TAT	2	6	22067	22072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807129
570	NC_013770	TGT	2	6	22104	22109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807129
571	NC_013770	ATA	2	6	22151	22156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807129
572	NC_013770	GAT	2	6	22186	22191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807129
573	NC_013770	TTA	2	6	22225	22230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807129
574	NC_013770	T	6	6	22262	22267	0 %	100 %	0 %	0 %	284807129
575	NC_013770	GAG	2	6	22404	22409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807129
576	NC_013770	GTT	2	6	22476	22481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807130
577	NC_013770	CTT	2	6	22493	22498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807130
578	NC_013770	TAG	2	6	22506	22511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807130
579	NC_013770	ATC	2	6	22533	22538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807130
580	NC_013770	T	6	6	22655	22660	0 %	100 %	0 %	0 %	284807130
581	NC_013770	TAA	2	6	22685	22690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807130
582	NC_013770	TAT	2	6	22691	22696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807130
583	NC_013770	TAT	2	6	22703	22708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807130
584	NC_013770	G	6	6	22750	22755	0 %	0 %	100 %	0 %	284807130
585	NC_013770	TAG	2	6	22760	22765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807130
586	NC_013770	CTT	2	6	22780	22785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807130
587	NC_013770	GGA	2	6	22832	22837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807130
588	NC_013770	ATT	2	6	22943	22948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807130
589	NC_013770	TAT	2	6	22954	22959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807130
590	NC_013770	ATA	2	6	22970	22975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013770	GAA	2	6	23079	23084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807131
592	NC_013770	AGA	2	6	23162	23167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807131
593	NC_013770	A	6	6	23279	23284	100 %	0 %	0 %	0 %	284807131
594	NC_013770	GGA	2	6	23302	23307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807131
595	NC_013770	TTC	2	6	23380	23385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013770	CTC	2	6	23429	23434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_013770	TTA	2	6	23459	23464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013770	TAAG	2	8	23511	23518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013770	TTTAC	2	10	23587	23596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_013770	TTCT	2	8	23602	23609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_013770	TAT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013770	TAA	2	6	23648	23653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013770	AATA	2	8	23659	23666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013770	GAG	2	6	23672	23677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013770	TAA	2	6	23715	23720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013770	GAATT	2	10	23743	23752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013770	ATT	2	6	23805	23810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013770	ATA	2	6	23826	23831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013770	ATG	2	6	23850	23855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013770	AGA	2	6	23856	23861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013770	ATA	2	6	23874	23879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013770	ATTT	2	8	23886	23893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013770	CTC	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_013770	GAA	2	6	23929	23934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013770	AGT	2	6	23943	23948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013770	TCT	2	6	24057	24062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013770	TGA	2	6	24070	24075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013770	AAC	2	6	24081	24086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013770	AT	4	8	24152	24159	50 %	50 %	0 %	0 %	284807132
620	NC_013770	TGA	2	6	24211	24216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807132
621	NC_013770	ACA	2	6	24253	24258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807132
622	NC_013770	AGC	2	6	24320	24325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284807132
623	NC_013770	CTT	2	6	24385	24390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013770	TTAA	2	8	24558	24565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013770	GGTT	2	8	24573	24580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013770	AC	4	8	24636	24643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013770	CTAA	2	8	24682	24689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_013770	A	6	6	24695	24700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013770	ATT	2	6	24705	24710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013770	AAG	2	6	24806	24811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013770	AAG	2	6	24871	24876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013770	TC	3	6	24946	24951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_013770	ATG	2	6	24958	24963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013770	GAA	2	6	25021	25026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013770	CAA	2	6	25070	25075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013770	GAA	2	6	25078	25083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013770	CT	3	6	25140	25145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_013770	TA	3	6	25153	25158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013770	GCG	2	6	25168	25173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013770	TATT	2	8	25220	25227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_013770	AGT	2	6	25233	25238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_013770	A	6	6	25245	25250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_013770	CGC	3	9	25316	25324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_013770	TTC	2	6	25384	25389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_013770	AAT	2	6	25467	25472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_013770	CAA	2	6	25493	25498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_013770	AGA	2	6	25547	25552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
648	NC_013770	ATT	2	6	25553	25558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_013770	AGA	2	6	25569	25574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_013770	ACA	2	6	25602	25607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_013770	GGA	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
652	NC_013770	TTC	2	6	25642	25647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_013770	GAG	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
654	NC_013770	GAG	2	6	25728	25733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
655	NC_013770	CTT	2	6	25734	25739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_013770	TAT	2	6	25776	25781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_013770	CAG	2	6	25828	25833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284807133
658	NC_013770	ACT	2	6	25835	25840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807133
659	NC_013770	GAA	2	6	25863	25868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807133
660	NC_013770	AAT	2	6	25924	25929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807134
661	NC_013770	TCT	3	9	25938	25946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807134
662	NC_013770	TTC	2	6	25979	25984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807134
663	NC_013770	ATG	2	6	26123	26128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807134
664	NC_013770	TC	3	6	26241	26246	0 %	50 %	0 %	50 %	284807135
665	NC_013770	AT	3	6	26321	26326	50 %	50 %	0 %	0 %	284807135
666	NC_013770	TCC	2	6	26353	26358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807135
667	NC_013770	TC	3	6	26372	26377	0 %	50 %	0 %	50 %	284807135
668	NC_013770	TTA	2	6	26462	26467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807135
669	NC_013770	TCC	2	6	26502	26507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
670	NC_013770	TTC	2	6	26538	26543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_013770	AAGA	2	8	26569	26576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

< Previous 12Next >