MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN04

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013734	CTTT	2	8	8	15	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013734	CAGCA	2	10	22	31	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013734	GCC	2	6	61	66	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013734	ATC	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013734	A	7	7	85	91	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013734	ACA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013734	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013734	A	7	7	175	181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013734	CGG	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013734	CTAA	2	8	266	273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013734	GCC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013734	GTTTTT	2	12	315	326	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013734	T	8	8	322	329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013734	TC	3	6	336	341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013734	T	9	9	405	413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013734	ACA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013734	GAG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013734	AAC	2	6	465	470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013734	ATTAA	2	10	480	489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013734	GT	3	6	511	516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013734	GT	3	6	532	537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013734	GT	3	6	553	558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013734	GT	3	6	574	579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013734	GT	3	6	596	601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013734	TTA	2	6	640	645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013734	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005940
27	NC_013734	CCAG	2	8	781	788	25 %	0 %	25 %	50 %	284005940
28	NC_013734	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005940
29	NC_013734	GGC	2	6	924	929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005940
30	NC_013734	CTTA	2	8	1020	1027	25 %	50 %	0 %	25 %	284005940
31	NC_013734	TTTGA	2	10	1028	1037	20 %	60 %	20 %	0 %	284005940
32	NC_013734	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005940
33	NC_013734	GAA	2	6	1205	1210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005940
34	NC_013734	AG	3	6	1236	1241	50 %	0 %	50 %	0 %	284005940
35	NC_013734	ATCA	2	8	1265	1272	50 %	25 %	0 %	25 %	284005940
36	NC_013734	AAAG	2	8	1306	1313	75 %	0 %	25 %	0 %	284005940
37	NC_013734	AGT	2	6	1363	1368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005940
38	NC_013734	GGC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005940
39	NC_013734	AAG	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005940
40	NC_013734	CAA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005940
41	NC_013734	A	6	6	1630	1635	100 %	0 %	0 %	0 %	284005940
42	NC_013734	GTA	2	6	1660	1665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005941
43	NC_013734	ATT	2	6	1674	1679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005941
44	NC_013734	CAAA	2	8	1919	1926	75 %	0 %	0 %	25 %	284005941
45	NC_013734	AGC	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005941
46	NC_013734	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005941
47	NC_013734	GAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005942
48	NC_013734	CAA	3	9	2004	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005942
49	NC_013734	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	284005943
50	NC_013734	CG	3	6	2121	2126	0 %	0 %	50 %	50 %	284005943
51	NC_013734	TCG	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005943
52	NC_013734	CCGG	2	8	2243	2250	0 %	0 %	50 %	50 %	284005943
53	NC_013734	TGC	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005943
54	NC_013734	CCG	2	6	2325	2330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005943
55	NC_013734	TC	4	8	2354	2361	0 %	50 %	0 %	50 %	284005943
56	NC_013734	TCCAA	2	10	2367	2376	40 %	20 %	0 %	40 %	284005943
57	NC_013734	CCA	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005943
58	NC_013734	GAC	2	6	2404	2409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005943
59	NC_013734	CCA	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005943
60	NC_013734	ATC	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005943
61	NC_013734	CAC	2	6	2688	2693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005943
62	NC_013734	TTC	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005944
63	NC_013734	GCT	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005944
64	NC_013734	C	6	6	2959	2964	0 %	0 %	0 %	100 %	284005944
65	NC_013734	GGT	2	6	3041	3046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005944
66	NC_013734	TCA	2	6	3145	3150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005944
67	NC_013734	TGC	3	9	3162	3170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005944
68	NC_013734	GTA	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005944
69	NC_013734	CGT	2	6	3232	3237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005944
70	NC_013734	CAC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005944
71	NC_013734	CCG	2	6	3409	3414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005944
72	NC_013734	CAG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005944
73	NC_013734	TGT	2	6	3550	3555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005944
74	NC_013734	CAG	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005944
75	NC_013734	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005944
76	NC_013734	CGG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005945
77	NC_013734	GCA	2	6	3642	3647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005945
78	NC_013734	TGC	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005945
79	NC_013734	GGGCCT	2	12	3771	3782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284005945
80	NC_013734	GGGC	2	8	3913	3920	0 %	0 %	75 %	25 %	284005945
81	NC_013734	ACC	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005945
82	NC_013734	CTT	2	6	3928	3933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005945
83	NC_013734	CGGA	2	8	3945	3952	25 %	0 %	50 %	25 %	284005945
84	NC_013734	G	6	6	3999	4004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013734	AAC	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013734	T	6	6	4044	4049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013734	TGGC	2	8	4062	4069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013734	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013734	TAA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013734	AT	3	6	4187	4192	50 %	50 %	0 %	0 %	284005946
91	NC_013734	TAC	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005946
92	NC_013734	CAG	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005946
93	NC_013734	CTA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005946
94	NC_013734	ACA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005946
95	NC_013734	CAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005946
96	NC_013734	ACA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013734	AAC	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013734	CAG	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005948
99	NC_013734	GGA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005948
100	NC_013734	CAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005948
101	NC_013734	GTC	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005948
102	NC_013734	CCA	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005948
103	NC_013734	TCTA	2	8	5621	5628	25 %	50 %	0 %	25 %	284005948
104	NC_013734	ACT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005948
105	NC_013734	AT	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	284005948
106	NC_013734	TG	3	6	5843	5848	0 %	50 %	50 %	0 %	284005949
107	NC_013734	GTAGCC	2	12	5946	5957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284005949
108	NC_013734	GACCC	2	10	5967	5976	20 %	0 %	20 %	60 %	284005949
109	NC_013734	TTG	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005949
110	NC_013734	CGG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005949
111	NC_013734	GGC	2	6	6056	6061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005949
112	NC_013734	A	8	8	6070	6077	100 %	0 %	0 %	0 %	284005949
113	NC_013734	AGT	2	6	6192	6197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005949
114	NC_013734	CAG	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005949
115	NC_013734	CAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005949
116	NC_013734	TGG	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005949
117	NC_013734	TGT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005949
118	NC_013734	ATG	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013734	GTAG	2	8	6671	6678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013734	ACG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013734	GACA	2	8	6703	6710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013734	TAA	2	6	6714	6719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013734	T	6	6	6753	6758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013734	CGA	2	6	6763	6768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013734	TAA	2	6	6804	6809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013734	ACT	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013734	A	6	6	6980	6985	100 %	0 %	0 %	0 %	284005950
128	NC_013734	GAG	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005950
129	NC_013734	TCAG	2	8	7087	7094	25 %	25 %	25 %	25 %	284005950
130	NC_013734	CTA	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005950
131	NC_013734	GCA	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
132	NC_013734	TCA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005950
133	NC_013734	CAG	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
134	NC_013734	GGA	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005950
135	NC_013734	GCC	2	6	7290	7295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005950
136	NC_013734	CAG	3	9	7362	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
137	NC_013734	AT	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	284005950
138	NC_013734	CTC	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005950
139	NC_013734	CAG	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
140	NC_013734	GGC	2	6	7542	7547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005950
141	NC_013734	GGA	2	6	7566	7571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005950
142	NC_013734	AGGG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	75 %	0 %	284005950
143	NC_013734	GGC	2	6	7590	7595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005950
144	NC_013734	TCAT	2	8	7602	7609	25 %	50 %	0 %	25 %	284005950
145	NC_013734	GCG	2	6	7621	7626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005950
146	NC_013734	GGT	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005950
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150	NC_013734	ATC	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005951
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158	NC_013734	ACT	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_013734	CTGCA	2	10	9539	9548	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_013734	CGG	2	6	9552	9557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_013734	TGCAG	2	10	9569	9578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_013734	AAT	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013734	AAG	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013734	CTT	2	6	9866	9871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_013734	TGA	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013734	GAA	2	6	9902	9907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013734	ACTA	2	8	9941	9948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.