MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 plasmid pSROS01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013596	GC	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	271972121
2	NC_013596	GC	3	6	1504	1509	0 %	0 %	50 %	50 %	271972121
3	NC_013596	TC	3	6	1735	1740	0 %	50 %	0 %	50 %	271972121
4	NC_013596	CG	3	6	2126	2131	0 %	0 %	50 %	50 %	271972121
5	NC_013596	GC	3	6	2194	2199	0 %	0 %	50 %	50 %	271972121
6	NC_013596	GC	3	6	2346	2351	0 %	0 %	50 %	50 %	271972121
7	NC_013596	CG	3	6	2354	2359	0 %	0 %	50 %	50 %	271972121
8	NC_013596	GC	3	6	2607	2612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013596	CG	3	6	5835	5840	0 %	0 %	50 %	50 %	271972124
10	NC_013596	GC	3	6	6704	6709	0 %	0 %	50 %	50 %	271972127
11	NC_013596	CG	3	6	7049	7054	0 %	0 %	50 %	50 %	271972127
12	NC_013596	CG	3	6	8111	8116	0 %	0 %	50 %	50 %	271972130
13	NC_013596	GC	3	6	8222	8227	0 %	0 %	50 %	50 %	271972130
14	NC_013596	GC	3	6	8261	8266	0 %	0 %	50 %	50 %	271972130
15	NC_013596	CG	3	6	8379	8384	0 %	0 %	50 %	50 %	271972130
16	NC_013596	CG	3	6	8624	8629	0 %	0 %	50 %	50 %	271972130
17	NC_013596	GC	3	6	9353	9358	0 %	0 %	50 %	50 %	271972130
18	NC_013596	GC	3	6	11139	11144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013596	GC	3	6	11242	11247	0 %	0 %	50 %	50 %	271972134
20	NC_013596	GC	3	6	11415	11420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013596	GC	3	6	11438	11443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013596	AC	3	6	12130	12135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013596	CG	3	6	14170	14175	0 %	0 %	50 %	50 %	271972137
24	NC_013596	AC	3	6	15329	15334	50 %	0 %	0 %	50 %	271972139
25	NC_013596	AG	3	6	15574	15579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013596	GC	3	6	17091	17096	0 %	0 %	50 %	50 %	271972141
27	NC_013596	TC	3	6	17216	17221	0 %	50 %	0 %	50 %	271972142
28	NC_013596	GC	3	6	17287	17292	0 %	0 %	50 %	50 %	271972142
29	NC_013596	AG	3	6	17846	17851	50 %	0 %	50 %	0 %	271972142
30	NC_013596	AT	3	6	17889	17894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013596	CT	3	6	17912	17917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013596	GC	3	6	19548	19553	0 %	0 %	50 %	50 %	271972144
33	NC_013596	GC	3	6	20363	20368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013596	TC	3	6	20528	20533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013596	CG	3	6	20804	20809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013596	GC	3	6	21102	21107	0 %	0 %	50 %	50 %	271972145
37	NC_013596	CG	3	6	21312	21317	0 %	0 %	50 %	50 %	271972145
38	NC_013596	GT	3	6	21403	21408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013596	CG	3	6	21670	21675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013596	GC	3	6	23979	23984	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
41	NC_013596	CG	3	6	24051	24056	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
42	NC_013596	CA	3	6	24490	24495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013596	AC	3	6	24542	24547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013596	GC	4	8	24616	24623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013596	GC	4	8	24915	24922	0 %	0 %	50 %	50 %	271972147
46	NC_013596	CG	3	6	25293	25298	0 %	0 %	50 %	50 %	271972147
47	NC_013596	GC	3	6	25431	25436	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
48	NC_013596	GC	3	6	26049	26054	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
49	NC_013596	GC	3	6	27473	27478	0 %	0 %	50 %	50 %	271972149
50	NC_013596	GC	3	6	27799	27804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013596	GC	3	6	27842	27847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.