MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 214473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013595	CCG	2	6	35	40	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013595	CCG	2	6	43	48	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013595	GGC	2	6	174	179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013595	ATC	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013595	GGA	2	6	342	347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013595	CAG	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
7	NC_013595	GGT	2	6	486	491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961610
8	NC_013595	GGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
9	NC_013595	GCC	2	6	578	583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
10	NC_013595	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961610
11	NC_013595	GCC	2	6	669	674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
12	NC_013595	GCA	2	6	702	707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
13	NC_013595	CAC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961610
14	NC_013595	CCG	2	6	790	795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
15	NC_013595	CGG	2	6	884	889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
16	NC_013595	CGG	2	6	911	916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
17	NC_013595	GCG	2	6	923	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
18	NC_013595	CTC	2	6	962	967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961610
19	NC_013595	CGG	2	6	1020	1025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
20	NC_013595	GCC	2	6	1144	1149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
21	NC_013595	CTG	2	6	1228	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961610
22	NC_013595	ACG	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
23	NC_013595	GGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
24	NC_013595	TCA	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961610
25	NC_013595	GAC	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
26	NC_013595	AGG	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
27	NC_013595	TTC	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961610
28	NC_013595	CAA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961610
29	NC_013595	AGC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
30	NC_013595	GGA	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
31	NC_013595	GCC	2	6	1572	1577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
32	NC_013595	AAG	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271961610
33	NC_013595	AGG	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
34	NC_013595	GCC	2	6	1633	1638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
35	NC_013595	CCA	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961610
36	NC_013595	CCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
37	NC_013595	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
38	NC_013595	CAG	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
39	NC_013595	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
40	NC_013595	CGT	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961610
41	NC_013595	CAC	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961610
42	NC_013595	AGC	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
43	NC_013595	ATC	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013595	AAC	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013595	AGG	2	6	2657	2662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013595	CCG	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961611
47	NC_013595	GCG	2	6	2856	2861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961611
48	NC_013595	CTC	2	6	2891	2896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961611
49	NC_013595	TCG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
50	NC_013595	GTC	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
51	NC_013595	GGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961611
52	NC_013595	CGA	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
53	NC_013595	GCC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961611
54	NC_013595	GAC	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
55	NC_013595	CGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961611
56	NC_013595	CGG	2	6	3334	3339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961611
57	NC_013595	CAC	3	9	3382	3390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
58	NC_013595	TCG	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
59	NC_013595	CGA	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
60	NC_013595	GTC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
61	NC_013595	CGA	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
62	NC_013595	ACC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
63	NC_013595	ACC	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
64	NC_013595	CCA	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
65	NC_013595	CGG	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961611
66	NC_013595	GAC	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
67	NC_013595	GGA	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013595	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961612
69	NC_013595	GCG	2	6	3998	4003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961612
70	NC_013595	CGG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961612
71	NC_013595	GAC	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961612
72	NC_013595	TCG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961612
73	NC_013595	ATC	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961612
74	NC_013595	CCG	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961612
75	NC_013595	CCG	2	6	4386	4391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961612
76	NC_013595	CTC	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961612
77	NC_013595	GGA	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961612
78	NC_013595	TCC	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961612
79	NC_013595	GAT	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013595	GGC	2	6	4681	4686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
81	NC_013595	ACG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961613
82	NC_013595	TCG	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
83	NC_013595	CGG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
84	NC_013595	TGG	2	6	4778	4783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961613
85	NC_013595	GAG	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
86	NC_013595	CTG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
87	NC_013595	CGG	2	6	4896	4901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
88	NC_013595	GAC	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961613
89	NC_013595	CGC	2	6	4932	4937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961613
90	NC_013595	AAG	2	6	4951	4956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271961613
91	NC_013595	GCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
92	NC_013595	GCG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
93	NC_013595	CGG	2	6	5025	5030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
94	NC_013595	GAG	2	6	5083	5088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
95	NC_013595	GGC	2	6	5089	5094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
96	NC_013595	ATG	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961613
97	NC_013595	GCT	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
98	NC_013595	CGT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
99	NC_013595	GGC	2	6	5246	5251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
100	NC_013595	GCT	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
101	NC_013595	CGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961613
102	NC_013595	GGC	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
103	NC_013595	TCA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961613
104	NC_013595	CCG	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961613
105	NC_013595	AGG	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
106	NC_013595	GTC	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
107	NC_013595	CGG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
108	NC_013595	AGG	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
109	NC_013595	CGT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
110	NC_013595	GCC	2	6	5565	5570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961613
111	NC_013595	CAC	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013595	CGC	2	6	5648	5653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013595	CCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013595	GCA	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013595	GCG	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
116	NC_013595	CGG	2	6	6119	6124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
117	NC_013595	GCT	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
118	NC_013595	GCG	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
119	NC_013595	CGA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
120	NC_013595	CTG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
121	NC_013595	AGC	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
122	NC_013595	GCG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
123	NC_013595	GCT	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
124	NC_013595	CGG	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
125	NC_013595	GCG	2	6	6397	6402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
126	NC_013595	GGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
127	NC_013595	ACG	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
128	NC_013595	CGC	2	6	6445	6450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961614
129	NC_013595	GCT	2	6	6520	6525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
130	NC_013595	GGC	2	6	6526	6531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
131	NC_013595	TCG	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
132	NC_013595	CGC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961614
133	NC_013595	CGC	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961614
134	NC_013595	CGC	2	6	6607	6612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961614
135	NC_013595	GAG	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961614
136	NC_013595	GGA	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961614
137	NC_013595	CTG	2	6	6689	6694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
138	NC_013595	TCG	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
139	NC_013595	CGA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
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141	NC_013595	CGG	2	6	6865	6870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
142	NC_013595	CGA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
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148	NC_013595	CGG	2	6	7144	7149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961615
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150	NC_013595	GCG	2	6	7185	7190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961615
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152	NC_013595	CCG	2	6	7265	7270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961615
153	NC_013595	CTG	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961615
154	NC_013595	TCG	2	6	7414	7419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961615
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156	NC_013595	GCT	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961615
157	NC_013595	GAG	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961615
158	NC_013595	CGA	2	6	7705	7710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_013595	CAT	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013595	ACG	2	6	7894	7899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_013595	AGG	2	6	7949	7954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013595	ACG	2	6	7971	7976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961616
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168	NC_013595	GTC	2	6	8231	8236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961616
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172	NC_013595	GGT	2	6	8317	8322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961616
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183	NC_013595	GCG	2	6	8706	8711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961616
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211	NC_013595	CCA	2	6	9941	9946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
212	NC_013595	CCG	2	6	10096	10101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961617
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254	NC_013595	CTT	2	6	11611	11616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961617
255	NC_013595	ACG	2	6	11621	11626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
256	NC_013595	CAC	2	6	11630	11635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961617
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258	NC_013595	TTC	2	6	11645	11650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961617
259	NC_013595	CAA	2	6	11653	11658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961617
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261	NC_013595	CGA	2	6	11752	11757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
262	NC_013595	GTC	2	6	11759	11764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
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386	NC_013595	GCT	2	6	18416	18421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961623
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