MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerobacter thermophilus DSM 20745 chromosome 2

Total Repeats: 32261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_013524	TCC	2	6	1242464	1242469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269929418
32003	NC_013524	CAT	2	6	1242510	1242515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269929418
32004	NC_013524	GAT	2	6	1242519	1242524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929418
32005	NC_013524	GCA	2	6	1242620	1242625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929418
32006	NC_013524	GAT	2	6	1242633	1242638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929418
32007	NC_013524	GCG	2	6	1242656	1242661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929418
32008	NC_013524	GCCT	2	8	1242732	1242739	0 %	25 %	25 %	50 %	269929418
32009	NC_013524	GGC	2	6	1242761	1242766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929418
32010	NC_013524	CGG	3	9	1242831	1242839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929418
32011	NC_013524	CCA	2	6	1242858	1242863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269929418
32012	NC_013524	CG	3	6	1242912	1242917	0 %	0 %	50 %	50 %	269929418
32013	NC_013524	CTGGTG	2	12	1242982	1242993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269929418
32014	NC_013524	CCT	2	6	1243038	1243043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269929418
32015	NC_013524	GAC	2	6	1243078	1243083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929418
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32017	NC_013524	CCG	2	6	1243119	1243124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929418
32018	NC_013524	CGGG	2	8	1243139	1243146	0 %	0 %	75 %	25 %	269929418
32019	NC_013524	CGA	2	6	1243203	1243208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929418
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32022	NC_013524	CTG	2	6	1243306	1243311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929418
32023	NC_013524	TCCG	2	8	1243366	1243373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32024	NC_013524	GTGG	2	8	1243376	1243383	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32025	NC_013524	CGG	2	6	1243385	1243390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32026	NC_013524	GGC	2	6	1243395	1243400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32029	NC_013524	CGG	2	6	1243470	1243475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32030	NC_013524	CGC	2	6	1243493	1243498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32031	NC_013524	CCA	2	6	1243517	1243522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32032	NC_013524	GCG	2	6	1243570	1243575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32033	NC_013524	GCC	2	6	1243582	1243587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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32035	NC_013524	GC	3	6	1243671	1243676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32036	NC_013524	CCTG	2	8	1243681	1243688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32037	NC_013524	GCC	2	6	1243752	1243757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929419
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32052	NC_013524	AGA	2	6	1244168	1244173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269929419
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32055	NC_013524	GC	3	6	1244232	1244237	0 %	0 %	50 %	50 %	269929419
32056	NC_013524	GAC	2	6	1244256	1244261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929419
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32062	NC_013524	GTA	2	6	1244616	1244621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929419
32063	NC_013524	CGG	2	6	1244672	1244677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929419
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32067	NC_013524	CA	3	6	1244848	1244853	50 %	0 %	0 %	50 %	269929420
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32095	NC_013524	GCC	2	6	1245739	1245744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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32100	NC_013524	CGA	2	6	1246020	1246025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929421
32101	NC_013524	GTG	2	6	1246033	1246038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269929421
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32106	NC_013524	GCG	2	6	1246276	1246281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929421
32107	NC_013524	GGCGA	2	10	1246371	1246380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32108	NC_013524	CGC	2	6	1246388	1246393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32109	NC_013524	GTCC	2	8	1246432	1246439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32110	NC_013524	AGGG	2	8	1246472	1246479	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32111	NC_013524	TCG	2	6	1246504	1246509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32112	NC_013524	CGA	2	6	1246520	1246525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32113	NC_013524	ACCG	2	8	1246551	1246558	25 %	0 %	25 %	50 %	269929422
32114	NC_013524	CG	3	6	1246588	1246593	0 %	0 %	50 %	50 %	269929422
32115	NC_013524	TGA	2	6	1246618	1246623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929422
32116	NC_013524	TCG	2	6	1246624	1246629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32117	NC_013524	TGC	3	9	1246642	1246650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32118	NC_013524	GC	3	6	1246697	1246702	0 %	0 %	50 %	50 %	269929422
32119	NC_013524	CGC	3	9	1246708	1246716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929422
32120	NC_013524	CTGATC	2	12	1246776	1246787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269929422
32121	NC_013524	ATG	2	6	1246797	1246802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929422
32122	NC_013524	CGC	2	6	1246831	1246836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929422
32123	NC_013524	CGG	2	6	1246907	1246912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929422
32124	NC_013524	CTT	2	6	1246913	1246918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269929422
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32127	NC_013524	TCG	2	6	1247038	1247043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929422
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32129	NC_013524	GTC	2	6	1247100	1247105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32130	NC_013524	ACG	2	6	1247122	1247127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32131	NC_013524	TCG	2	6	1247164	1247169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929422
32132	NC_013524	CCT	2	6	1247267	1247272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269929422
32133	NC_013524	GCC	2	6	1247320	1247325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929422
32134	NC_013524	GC	3	6	1247359	1247364	0 %	0 %	50 %	50 %	269929422
32135	NC_013524	GTGC	2	8	1247649	1247656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32136	NC_013524	CGG	2	6	1247694	1247699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32137	NC_013524	GCGG	2	8	1247715	1247722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32138	NC_013524	GAG	2	6	1247724	1247729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32139	NC_013524	GTG	2	6	1247741	1247746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32140	NC_013524	GAT	2	6	1247824	1247829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32141	NC_013524	TGA	2	6	1247888	1247893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32142	NC_013524	TG	3	6	1247930	1247935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32143	NC_013524	ACC	2	6	1247963	1247968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32144	NC_013524	TTC	2	6	1248011	1248016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32145	NC_013524	ATC	2	6	1248052	1248057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32146	NC_013524	AGG	2	6	1248203	1248208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32147	NC_013524	GAG	2	6	1248256	1248261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269929423
32148	NC_013524	TAC	2	6	1248295	1248300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269929423
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32151	NC_013524	TCG	2	6	1248476	1248481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929423
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32153	NC_013524	GTG	2	6	1248501	1248506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269929423
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32189	NC_013524	CGA	2	6	1249536	1249541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929423
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32192	NC_013524	GTC	2	6	1249627	1249632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929423
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32200	NC_013524	CG	3	6	1250008	1250013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32201	NC_013524	GT	3	6	1250024	1250029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32202	NC_013524	CGA	2	6	1250045	1250050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
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32229	NC_013524	GAC	2	6	1251231	1251236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
32230	NC_013524	CGC	2	6	1251365	1251370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32231	NC_013524	GT	3	6	1251384	1251389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32232	NC_013524	CG	3	6	1251420	1251425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32233	NC_013524	GCC	2	6	1251529	1251534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32234	NC_013524	GCT	2	6	1251535	1251540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32235	NC_013524	GCG	2	6	1251645	1251650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32236	NC_013524	GCCC	2	8	1251694	1251701	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32237	NC_013524	TG	3	6	1251703	1251708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32238	NC_013524	GCCG	2	8	1251714	1251721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32239	NC_013524	CGG	2	6	1251726	1251731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32240	NC_013524	GCT	2	6	1251744	1251749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32241	NC_013524	GAG	2	6	1251766	1251771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32242	NC_013524	ATG	2	6	1251776	1251781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929425
32243	NC_013524	GC	3	6	1251876	1251881	0 %	0 %	50 %	50 %	269929425
32244	NC_013524	CCA	2	6	1251898	1251903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269929425
32245	NC_013524	CGT	2	6	1251913	1251918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929425
32246	NC_013524	ACG	2	6	1252023	1252028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929425
32247	NC_013524	ATCGAG	2	12	1252061	1252072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269929425
32248	NC_013524	GCGA	2	8	1252106	1252113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32249	NC_013524	TGGG	2	8	1252125	1252132	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32250	NC_013524	GTG	2	6	1252151	1252156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32251	NC_013524	CCG	2	6	1252169	1252174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32252	NC_013524	GTG	2	6	1252191	1252196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32253	NC_013524	GCC	2	6	1252235	1252240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32254	NC_013524	CAA	2	6	1252249	1252254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32255	NC_013524	GCCA	2	8	1252374	1252381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32256	NC_013524	GTA	2	6	1252414	1252419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32257	NC_013524	C	6	6	1252435	1252440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32258	NC_013524	CGG	2	6	1252450	1252455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32259	NC_013524	G	6	6	1252551	1252556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32260	NC_013524	CACC	2	8	1252568	1252575	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32261	NC_013524	CGTA	2	8	1252722	1252729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.