MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	TA	3	6	267	272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013518	TC	3	6	883	888	0 %	50 %	0 %	50 %	268793184
3	NC_013518	TA	3	6	1203	1208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013518	AT	3	6	1810	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	268793185
5	NC_013518	TA	3	6	2190	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013518	AT	3	6	2509	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	268793186
7	NC_013518	AT	3	6	2552	2557	50 %	50 %	0 %	0 %	268793186
8	NC_013518	AT	3	6	2834	2839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013518	AT	3	6	2856	2861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013518	AT	3	6	2870	2875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013518	AC	3	6	3294	3299	50 %	0 %	0 %	50 %	268793187
12	NC_013518	AT	3	6	3399	3404	50 %	50 %	0 %	0 %	268793187
13	NC_013518	TA	3	6	3554	3559	50 %	50 %	0 %	0 %	268793188
14	NC_013518	CT	4	8	4588	4595	0 %	50 %	0 %	50 %	268793190
15	NC_013518	AT	4	8	4990	4997	50 %	50 %	0 %	0 %	268793190
16	NC_013518	AT	3	6	5121	5126	50 %	50 %	0 %	0 %	268793190
17	NC_013518	CA	4	8	5335	5342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013518	TC	3	6	5747	5752	0 %	50 %	0 %	50 %	268793191
19	NC_013518	TA	3	6	5821	5826	50 %	50 %	0 %	0 %	268793191
20	NC_013518	CT	3	6	5957	5962	0 %	50 %	0 %	50 %	268793191
21	NC_013518	AT	3	6	6097	6102	50 %	50 %	0 %	0 %	268793191
22	NC_013518	AT	3	6	6410	6415	50 %	50 %	0 %	0 %	268793191
23	NC_013518	TA	3	6	6553	6558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013518	AT	3	6	6955	6960	50 %	50 %	0 %	0 %	268793192
25	NC_013518	TA	3	6	6962	6967	50 %	50 %	0 %	0 %	268793192
26	NC_013518	CT	3	6	7234	7239	0 %	50 %	0 %	50 %	268793193
27	NC_013518	TA	3	6	7695	7700	50 %	50 %	0 %	0 %	268793193
28	NC_013518	TA	3	6	7795	7800	50 %	50 %	0 %	0 %	268793193
29	NC_013518	TA	4	8	8078	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	268793194
30	NC_013518	AC	3	6	8540	8545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013518	TA	3	6	8552	8557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013518	TA	3	6	8579	8584	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
33	NC_013518	TA	3	6	8651	8656	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
34	NC_013518	TA	3	6	8663	8668	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
35	NC_013518	AT	3	6	9273	9278	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
36	NC_013518	TA	3	6	9901	9906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013518	TC	3	6	9972	9977	0 %	50 %	0 %	50 %	268793196
38	NC_013518	AT	5	10	10321	10330	50 %	50 %	0 %	0 %	268793197
39	NC_013518	CT	3	6	10611	10616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013518	AT	3	6	10731	10736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013518	TA	3	6	10782	10787	50 %	50 %	0 %	0 %	268793198
42	NC_013518	AC	3	6	11065	11070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013518	CA	3	6	12230	12235	50 %	0 %	0 %	50 %	268793200
44	NC_013518	AT	3	6	12513	12518	50 %	50 %	0 %	0 %	268793200
45	NC_013518	AT	3	6	12676	12681	50 %	50 %	0 %	0 %	268793200
46	NC_013518	AT	3	6	12947	12952	50 %	50 %	0 %	0 %	268793201
47	NC_013518	AT	3	6	13147	13152	50 %	50 %	0 %	0 %	268793201
48	NC_013518	TA	3	6	13261	13266	50 %	50 %	0 %	0 %	268793202
49	NC_013518	TA	3	6	13864	13869	50 %	50 %	0 %	0 %	268793202
50	NC_013518	CT	3	6	13965	13970	0 %	50 %	0 %	50 %	268793202
51	NC_013518	CT	3	6	14167	14172	0 %	50 %	0 %	50 %	268793203
52	NC_013518	AG	3	6	14303	14308	50 %	0 %	50 %	0 %	268793203
53	NC_013518	TG	3	6	14372	14377	0 %	50 %	50 %	0 %	268793203
54	NC_013518	TA	4	8	15373	15380	50 %	50 %	0 %	0 %	268793204
55	NC_013518	TA	3	6	15411	15416	50 %	50 %	0 %	0 %	268793204
56	NC_013518	CT	3	6	15713	15718	0 %	50 %	0 %	50 %	268793204
57	NC_013518	TC	3	6	15844	15849	0 %	50 %	0 %	50 %	268793204
58	NC_013518	AT	3	6	15923	15928	50 %	50 %	0 %	0 %	268793204
59	NC_013518	TA	3	6	16201	16206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013518	TA	3	6	17028	17033	50 %	50 %	0 %	0 %	268793206
61	NC_013518	TA	3	6	17198	17203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013518	TA	4	8	17297	17304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013518	TA	3	6	17306	17311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013518	AT	3	6	17756	17761	50 %	50 %	0 %	0 %	268793208
65	NC_013518	AT	5	10	17870	17879	50 %	50 %	0 %	0 %	268793208
66	NC_013518	TA	3	6	17985	17990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013518	GA	3	6	19196	19201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013518	AT	3	6	19223	19228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013518	TA	3	6	19467	19472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013518	CT	3	6	19901	19906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013518	TA	3	6	20538	20543	50 %	50 %	0 %	0 %	268793211
72	NC_013518	TA	3	6	20924	20929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013518	TC	3	6	20963	20968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013518	TC	3	6	21202	21207	0 %	50 %	0 %	50 %	268793212
75	NC_013518	TA	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
76	NC_013518	AT	3	6	22075	22080	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
77	NC_013518	AT	3	6	22205	22210	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
78	NC_013518	TA	3	6	23154	23159	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
79	NC_013518	TA	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
80	NC_013518	AT	3	6	23734	23739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013518	TA	3	6	24194	24199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013518	AT	3	6	24582	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	268793215
83	NC_013518	AT	3	6	24645	24650	50 %	50 %	0 %	0 %	268793215
84	NC_013518	AT	3	6	25312	25317	50 %	50 %	0 %	0 %	268793216
85	NC_013518	AC	3	6	25455	25460	50 %	0 %	0 %	50 %	268793216
86	NC_013518	TC	3	6	25486	25491	0 %	50 %	0 %	50 %	268793216
87	NC_013518	TC	3	6	25667	25672	0 %	50 %	0 %	50 %	268793216
88	NC_013518	AT	3	6	25816	25821	50 %	50 %	0 %	0 %	268793216
89	NC_013518	AT	3	6	26005	26010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013518	AT	3	6	26782	26787	50 %	50 %	0 %	0 %	268793217
91	NC_013518	AT	3	6	27671	27676	50 %	50 %	0 %	0 %	268793218
92	NC_013518	TA	3	6	27718	27723	50 %	50 %	0 %	0 %	268793218
93	NC_013518	AT	3	6	28042	28047	50 %	50 %	0 %	0 %	268793218
94	NC_013518	AT	4	8	28642	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	268793220
95	NC_013518	AT	3	6	29581	29586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013518	AT	3	6	29731	29736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013518	TC	3	6	29746	29751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013518	AT	4	8	30067	30074	50 %	50 %	0 %	0 %	268793221
99	NC_013518	TA	3	6	30759	30764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013518	AT	3	6	31985	31990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013518	AT	4	8	31993	32000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013518	AT	5	10	32009	32018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013518	TC	3	6	33278	33283	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
104	NC_013518	TC	3	6	33316	33321	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
105	NC_013518	AT	3	6	33385	33390	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
106	NC_013518	TG	3	6	33431	33436	0 %	50 %	50 %	0 %	268793224
107	NC_013518	AT	3	6	35281	35286	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
108	NC_013518	TC	3	6	35463	35468	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
109	NC_013518	AT	3	6	35488	35493	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
110	NC_013518	TA	3	6	35507	35512	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
111	NC_013518	AT	3	6	35568	35573	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
112	NC_013518	AT	3	6	35752	35757	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
113	NC_013518	AT	3	6	36990	36995	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
114	NC_013518	CT	3	6	37154	37159	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
115	NC_013518	TA	3	6	37399	37404	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
116	NC_013518	AT	3	6	37774	37779	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
117	NC_013518	TC	3	6	38957	38962	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
118	NC_013518	AC	3	6	39625	39630	50 %	0 %	0 %	50 %	268793224
119	NC_013518	AT	3	6	39984	39989	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
120	NC_013518	TA	3	6	39999	40004	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
121	NC_013518	CT	3	6	40026	40031	0 %	50 %	0 %	50 %	268793225
122	NC_013518	TA	3	6	40046	40051	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
123	NC_013518	AT	3	6	40075	40080	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
124	NC_013518	TA	3	6	40625	40630	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
125	NC_013518	CT	3	6	40828	40833	0 %	50 %	0 %	50 %	268793225
126	NC_013518	TA	3	6	41249	41254	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
127	NC_013518	TA	3	6	41264	41269	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
128	NC_013518	CT	3	6	41496	41501	0 %	50 %	0 %	50 %	268793225
129	NC_013518	TC	3	6	41625	41630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013518	TA	3	6	41735	41740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013518	TA	3	6	42010	42015	50 %	50 %	0 %	0 %	268793226
132	NC_013518	AT	3	6	42264	42269	50 %	50 %	0 %	0 %	268793226
133	NC_013518	TA	3	6	42646	42651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013518	GA	3	6	42836	42841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013518	CT	3	6	42855	42860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013518	TA	3	6	43112	43117	50 %	50 %	0 %	0 %	268793227
137	NC_013518	AT	3	6	43435	43440	50 %	50 %	0 %	0 %	268793228
138	NC_013518	AT	3	6	43692	43697	50 %	50 %	0 %	0 %	268793228
139	NC_013518	TA	3	6	44033	44038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013518	CA	3	6	44433	44438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013518	TA	4	8	45817	45824	50 %	50 %	0 %	0 %	268793230
142	NC_013518	AT	3	6	47187	47192	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
143	NC_013518	AT	3	6	47752	47757	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
144	NC_013518	TA	3	6	47974	47979	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
145	NC_013518	AT	3	6	48115	48120	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
146	NC_013518	AT	3	6	48141	48146	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
147	NC_013518	TA	3	6	48525	48530	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
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149	NC_013518	AT	3	6	49599	49604	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
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155	NC_013518	TA	3	6	53876	53881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.