MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	TTTC	2	8	40	47	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013453	TAAA	2	8	395	402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013453	GAAT	2	8	511	518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013453	ATTA	2	8	870	877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013453	AGTG	2	8	1421	1428	25 %	25 %	50 %	0 %	262260517
6	NC_013453	TTTC	2	8	1482	1489	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
7	NC_013453	CTTT	2	8	1524	1531	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
8	NC_013453	AACA	2	8	1730	1737	75 %	0 %	0 %	25 %	262260517
9	NC_013453	CTTT	2	8	2407	2414	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
10	NC_013453	TACA	2	8	2480	2487	50 %	25 %	0 %	25 %	262260517
11	NC_013453	CTTA	2	8	2660	2667	25 %	50 %	0 %	25 %	262260517
12	NC_013453	AAAT	2	8	3307	3314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013453	CCTT	2	8	3515	3522	0 %	50 %	0 %	50 %	262260518
14	NC_013453	TCAT	2	8	3562	3569	25 %	50 %	0 %	25 %	262260518
15	NC_013453	CGCC	2	8	3718	3725	0 %	0 %	25 %	75 %	262260519
16	NC_013453	TTCT	2	8	3767	3774	0 %	75 %	0 %	25 %	262260519
17	NC_013453	ACTT	2	8	4026	4033	25 %	50 %	0 %	25 %	262260519
18	NC_013453	TATT	2	8	5626	5633	25 %	75 %	0 %	0 %	262260522
19	NC_013453	GGAA	2	8	5881	5888	50 %	0 %	50 %	0 %	262260523
20	NC_013453	AAAT	2	8	6033	6040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013453	ATTA	2	8	6410	6417	50 %	50 %	0 %	0 %	262260524
22	NC_013453	ACCA	2	8	6909	6916	50 %	0 %	0 %	50 %	262260525
23	NC_013453	ATTG	2	8	6954	6961	25 %	50 %	25 %	0 %	262260525
24	NC_013453	TGTT	2	8	7027	7034	0 %	75 %	25 %	0 %	262260525
25	NC_013453	GAAA	2	8	7211	7218	75 %	0 %	25 %	0 %	262260525
26	NC_013453	AGCT	2	8	7459	7466	25 %	25 %	25 %	25 %	262260525
27	NC_013453	TTAA	2	8	7871	7878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013453	TCAA	2	8	9122	9129	50 %	25 %	0 %	25 %	262260528
29	NC_013453	TTCT	2	8	9216	9223	0 %	75 %	0 %	25 %	262260528
30	NC_013453	TGTT	2	8	9703	9710	0 %	75 %	25 %	0 %	262260528
31	NC_013453	ATTG	2	8	10278	10285	25 %	50 %	25 %	0 %	262260529
32	NC_013453	ATTG	2	8	10611	10618	25 %	50 %	25 %	0 %	262260529
33	NC_013453	ATGA	2	8	10777	10784	50 %	25 %	25 %	0 %	262260529
34	NC_013453	AAAT	2	8	10817	10824	75 %	25 %	0 %	0 %	262260529
35	NC_013453	AGGA	2	8	11316	11323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013453	TGAA	2	8	11334	11341	50 %	25 %	25 %	0 %	262260530
37	NC_013453	TAAA	2	8	11865	11872	75 %	25 %	0 %	0 %	262260531
38	NC_013453	TTGT	2	8	11954	11961	0 %	75 %	25 %	0 %	262260531
39	NC_013453	TGAT	2	8	12477	12484	25 %	50 %	25 %	0 %	262260532
40	NC_013453	ATGT	2	8	12515	12522	25 %	50 %	25 %	0 %	262260532
41	NC_013453	TTCA	2	8	13285	13292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013453	AAAT	2	8	13476	13483	75 %	25 %	0 %	0 %	262260534
43	NC_013453	AAGA	2	8	13823	13830	75 %	0 %	25 %	0 %	262260534
44	NC_013453	CATT	2	8	13935	13942	25 %	50 %	0 %	25 %	262260534
45	NC_013453	GTTT	2	8	13966	13973	0 %	75 %	25 %	0 %	262260534
46	NC_013453	CAAA	2	8	14460	14467	75 %	0 %	0 %	25 %	262260535
47	NC_013453	GAAA	2	8	14649	14656	75 %	0 %	25 %	0 %	262260536
48	NC_013453	AATT	2	8	15114	15121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013453	TTAA	2	8	15380	15387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013453	TGAA	2	8	15479	15486	50 %	25 %	25 %	0 %	262260537
51	NC_013453	ATCT	2	8	15718	15725	25 %	50 %	0 %	25 %	262260537
52	NC_013453	ATTA	2	8	15877	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	262260537
53	NC_013453	GGTT	2	8	16067	16074	0 %	50 %	50 %	0 %	262260537
54	NC_013453	ATAA	2	8	16213	16220	75 %	25 %	0 %	0 %	262260537
55	NC_013453	ATCA	2	8	16956	16963	50 %	25 %	0 %	25 %	262260538

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.