MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pT181

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013452	ATA	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
2	NC_013452	TAA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
3	NC_013452	TAA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
4	NC_013452	AGA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
5	NC_013452	TAT	2	6	402	407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225768
6	NC_013452	CAC	2	6	435	440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262225768
7	NC_013452	GTT	2	6	455	460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225768
8	NC_013452	TGA	2	6	469	474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225768
9	NC_013452	AAG	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
10	NC_013452	TAA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
11	NC_013452	AAC	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225768
12	NC_013452	GGT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225768
13	NC_013452	TGT	2	6	832	837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225768
14	NC_013452	GCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262225768
15	NC_013452	GAT	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225768
16	NC_013452	GAT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225768
17	NC_013452	TTA	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225768
18	NC_013452	GAA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
19	NC_013452	TAA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
20	NC_013452	AGA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
21	NC_013452	CAA	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225768
22	NC_013452	AAC	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225768
23	NC_013452	CAA	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013452	GAA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013452	TAG	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013452	ATA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013452	TAA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013452	CAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013452	GTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013452	TTC	2	6	2041	2046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262225769
31	NC_013452	ATA	2	6	2196	2201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225769
32	NC_013452	GAT	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225769
33	NC_013452	ACT	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262225769
34	NC_013452	TTA	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225769
35	NC_013452	TAA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225769
36	NC_013452	TGG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225769
37	NC_013452	TGA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225769
38	NC_013452	AGA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225769
39	NC_013452	AGG	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013452	AAT	2	6	2870	2875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013452	TAC	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262225770
42	NC_013452	CAG	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262225770
43	NC_013452	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
44	NC_013452	CTG	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262225770
45	NC_013452	TGG	2	6	3291	3296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225770
46	NC_013452	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225770
47	NC_013452	TTA	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
48	NC_013452	CAA	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225770
49	NC_013452	TAT	2	6	3547	3552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
50	NC_013452	TTA	2	6	3624	3629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
51	NC_013452	TTA	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
52	NC_013452	TGG	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225770
53	NC_013452	TAG	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225770
54	NC_013452	ATG	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225770
55	NC_013452	TGG	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225770
56	NC_013452	ATT	2	6	3883	3888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
57	NC_013452	ACT	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262225770
58	NC_013452	AGT	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225770
59	NC_013452	GAA	3	9	4052	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225770
60	NC_013452	AGG	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262225770
61	NC_013452	ATT	2	6	4185	4190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
62	NC_013452	TTA	2	6	4233	4238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
63	NC_013452	TGT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225770
64	NC_013452	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.