MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 82603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	CTG	2	6	11	16	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013159	AGC	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013159	GTC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
4	NC_013159	CAA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054090
5	NC_013159	CTG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
6	NC_013159	CTG	2	6	234	239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
7	NC_013159	AGG	2	6	262	267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
8	NC_013159	GCC	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
9	NC_013159	CGA	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
10	NC_013159	CGC	2	6	454	459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
11	NC_013159	ACG	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
12	NC_013159	ATC	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054090
13	NC_013159	GCC	2	6	572	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
14	NC_013159	TCC	2	6	650	655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054090
15	NC_013159	CCG	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
16	NC_013159	GAC	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
17	NC_013159	CGA	2	6	746	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
18	NC_013159	GCG	3	9	924	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
19	NC_013159	GGA	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
20	NC_013159	TCA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054090
21	NC_013159	CGA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
22	NC_013159	CGC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
23	NC_013159	AGG	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
24	NC_013159	TTC	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054090
25	NC_013159	TCG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
26	NC_013159	TCC	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054090
27	NC_013159	CCG	2	6	1281	1286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
28	NC_013159	GAG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
29	NC_013159	GCC	2	6	1355	1360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
30	NC_013159	GAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054090
31	NC_013159	CGC	2	6	1445	1450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
32	NC_013159	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054090
33	NC_013159	CGG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
34	NC_013159	TTC	2	6	1632	1637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054090
35	NC_013159	GGA	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
36	NC_013159	AAG	2	6	1800	1805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054090
37	NC_013159	GCG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
38	NC_013159	TCG	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013159	TGA	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013159	GCT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013159	TAC	3	9	2438	2446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013159	AGA	3	9	2466	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013159	CAC	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013159	TCA	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013159	TCG	2	6	2713	2718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013159	GCC	2	6	2833	2838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
47	NC_013159	TGG	2	6	2851	2856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054091
48	NC_013159	TCC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054091
49	NC_013159	CCA	2	6	3099	3104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054091
50	NC_013159	GAC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
51	NC_013159	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
52	NC_013159	TCG	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
53	NC_013159	CCG	2	6	3327	3332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
54	NC_013159	CGG	2	6	3348	3353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054091
55	NC_013159	CGC	2	6	3382	3387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
56	NC_013159	CCG	2	6	3402	3407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
57	NC_013159	ACG	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
58	NC_013159	GGT	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054091
59	NC_013159	CCG	2	6	3506	3511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
60	NC_013159	GCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
61	NC_013159	ACT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054091
62	NC_013159	TCG	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
63	NC_013159	GGC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054091
64	NC_013159	GAC	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
65	NC_013159	GGA	3	9	3685	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054091
66	NC_013159	CCG	2	6	3831	3836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
67	NC_013159	AGC	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
68	NC_013159	GTG	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
69	NC_013159	TGG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
70	NC_013159	GTG	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
71	NC_013159	GCG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
72	NC_013159	CGA	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054092
73	NC_013159	GCT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054092
74	NC_013159	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054092
75	NC_013159	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
76	NC_013159	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
77	NC_013159	GGA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054092
78	NC_013159	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
79	NC_013159	CGG	2	6	4791	4796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
80	NC_013159	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054093
81	NC_013159	GGT	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054093
82	NC_013159	GTT	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
83	NC_013159	GGA	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054093
84	NC_013159	ACG	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
85	NC_013159	GAC	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
86	NC_013159	TGC	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
87	NC_013159	TTG	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
88	NC_013159	GAG	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054093
89	NC_013159	ACC	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054093
90	NC_013159	GTT	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
91	NC_013159	AGC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
92	NC_013159	CGT	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
93	NC_013159	TGC	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
94	NC_013159	GAC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
95	NC_013159	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
96	NC_013159	CGA	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
97	NC_013159	CGG	2	6	5917	5922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054093
98	NC_013159	CGA	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
99	NC_013159	CGA	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013159	GGC	2	6	6168	6173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054094
101	NC_013159	CGA	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054094
102	NC_013159	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
103	NC_013159	AAC	2	6	6589	6594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054094
104	NC_013159	TGC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
105	NC_013159	CTG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
106	NC_013159	GAG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013159	GAA	2	6	7091	7096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
108	NC_013159	TCC	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054095
109	NC_013159	CAC	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054095
110	NC_013159	AGG	2	6	7210	7215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
111	NC_013159	CGA	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
112	NC_013159	GTT	2	6	7274	7279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054095
113	NC_013159	GGT	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
114	NC_013159	CGT	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
115	NC_013159	CGA	2	6	7304	7309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
116	NC_013159	GGT	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
117	NC_013159	GGT	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
118	NC_013159	TGG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
119	NC_013159	CGG	2	6	7647	7652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054095
120	NC_013159	CTT	2	6	7667	7672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054095
121	NC_013159	AGG	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
122	NC_013159	CTA	3	9	7769	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
123	NC_013159	GGA	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
124	NC_013159	ACG	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
125	NC_013159	GAG	2	6	7968	7973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
126	NC_013159	GTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
127	NC_013159	AAG	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
128	NC_013159	GAC	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
129	NC_013159	TCA	3	9	8233	8241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
130	NC_013159	GGT	2	6	8325	8330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
131	NC_013159	GAG	2	6	8370	8375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
132	NC_013159	TCG	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
133	NC_013159	CGG	2	6	8404	8409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054095
134	NC_013159	AGG	2	6	8422	8427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
135	NC_013159	ATC	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
136	NC_013159	GAA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
137	NC_013159	AGG	2	6	8518	8523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
138	NC_013159	TCA	2	6	8533	8538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
139	NC_013159	ACG	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
140	NC_013159	GCT	2	6	8645	8650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
141	NC_013159	GTT	3	9	8657	8665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054095
142	NC_013159	TGG	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
143	NC_013159	GCC	2	6	8714	8719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054095
144	NC_013159	CTG	2	6	8787	8792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
145	NC_013159	GAC	2	6	8829	8834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
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147	NC_013159	GTT	2	6	8915	8920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054095
148	NC_013159	CGC	2	6	8939	8944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054095
149	NC_013159	CGA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
150	NC_013159	TCA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
151	NC_013159	GCC	2	6	9114	9119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054096
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153	NC_013159	ACA	2	6	9302	9307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054096
154	NC_013159	GTC	2	6	9319	9324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054096
155	NC_013159	ACC	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054096
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162	NC_013159	GGT	2	6	9622	9627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054096
163	NC_013159	GTC	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054096
164	NC_013159	CGA	2	6	9723	9728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054096
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169	NC_013159	GAG	2	6	9871	9876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054096
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186	NC_013159	CGA	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054096
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232	NC_013159	GCT	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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238	NC_013159	CGG	2	6	12775	12780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
239	NC_013159	GCG	2	6	12804	12809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054098
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252	NC_013159	GAG	2	6	13518	13523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054098
253	NC_013159	CAC	2	6	13608	13613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_013159	AGG	2	6	13630	13635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_013159	GCC	2	6	13649	13654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054099
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384	NC_013159	GAC	2	6	20078	20083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054107
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495	NC_013159	TGC	2	6	25588	25593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_013159	GAG	2	6	25616	25621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013159	GAG	2	6	25639	25644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013159	CGG	2	6	25723	25728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_013159	GCC	2	6	25884	25889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_013159	CGC	2	6	25916	25921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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