MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013159	ACC	2	6	137612	137617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054212
3502	NC_013159	TCG	2	6	137747	137752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054212
3503	NC_013159	ACG	2	6	137758	137763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054212
3504	NC_013159	CAC	2	6	137764	137769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054212
3505	NC_013159	ATC	2	6	137870	137875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054212
3506	NC_013159	CGTG	2	8	137917	137924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_013159	TCC	2	6	137937	137942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054213
3508	NC_013159	GGA	2	6	137944	137949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054213
3509	NC_013159	GGT	2	6	137952	137957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054213
3510	NC_013159	GCC	2	6	137960	137965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3511	NC_013159	GCC	2	6	137981	137986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3512	NC_013159	GAG	2	6	137987	137992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054213
3513	NC_013159	ACC	2	6	138021	138026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054213
3514	NC_013159	GCC	2	6	138080	138085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3515	NC_013159	AG	3	6	138164	138169	50 %	0 %	50 %	0 %	257054213
3516	NC_013159	CGA	2	6	138181	138186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054213
3517	NC_013159	TGGGTG	2	12	138210	138221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054213
3518	NC_013159	ACG	2	6	138237	138242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054213
3519	NC_013159	CTG	2	6	138323	138328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054213
3520	NC_013159	ACGG	2	8	138332	138339	25 %	0 %	50 %	25 %	257054213
3521	NC_013159	ACT	2	6	138345	138350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054213
3522	NC_013159	GTAC	2	8	138354	138361	25 %	25 %	25 %	25 %	257054213
3523	NC_013159	CGG	2	6	138366	138371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054213
3524	NC_013159	TGCG	2	8	138395	138402	0 %	25 %	50 %	25 %	257054213
3525	NC_013159	CGC	2	6	138414	138419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3526	NC_013159	CGC	2	6	138427	138432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3527	NC_013159	GAT	2	6	138445	138450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054213
3528	NC_013159	CGC	2	6	138457	138462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3529	NC_013159	ACG	2	6	138485	138490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054213
3530	NC_013159	GGGA	2	8	138501	138508	25 %	0 %	75 %	0 %	257054213
3531	NC_013159	GTG	2	6	138523	138528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054213
3532	NC_013159	GGC	2	6	138547	138552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054213
3533	NC_013159	CGA	2	6	138559	138564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054213
3534	NC_013159	GCC	2	6	138566	138571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3535	NC_013159	CGGG	2	8	138580	138587	0 %	0 %	75 %	25 %	257054213
3536	NC_013159	CGC	2	6	138616	138621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3537	NC_013159	GGGCC	2	10	138667	138676	0 %	0 %	60 %	40 %	257054213
3538	NC_013159	GTG	3	9	138698	138706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054213
3539	NC_013159	GGA	2	6	138754	138759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054213
3540	NC_013159	CGC	2	6	138763	138768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054213
3541	NC_013159	GGC	2	6	138803	138808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054213
3542	NC_013159	GTC	2	6	138871	138876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_013159	GCG	2	6	138936	138941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_013159	CGC	2	6	139008	139013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_013159	GTC	2	6	139111	139116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054214
3546	NC_013159	TTC	2	6	139126	139131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054214
3547	NC_013159	GCCA	2	8	139156	139163	25 %	0 %	25 %	50 %	257054214
3548	NC_013159	CGG	2	6	139206	139211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054214
3549	NC_013159	TTC	2	6	139411	139416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054214
3550	NC_013159	CGA	2	6	139434	139439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054214
3551	NC_013159	CAG	2	6	139459	139464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054214
3552	NC_013159	GAA	2	6	139491	139496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054214
3553	NC_013159	GGA	2	6	139500	139505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054214
3554	NC_013159	GACC	2	8	139578	139585	25 %	0 %	25 %	50 %	257054214
3555	NC_013159	ATC	2	6	139606	139611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054214
3556	NC_013159	CAA	2	6	139638	139643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054214
3557	NC_013159	ACC	2	6	139715	139720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054214
3558	NC_013159	ACT	2	6	139748	139753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054214
3559	NC_013159	GGC	2	6	139835	139840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054214
3560	NC_013159	CGAC	2	8	139985	139992	25 %	0 %	25 %	50 %	257054214
3561	NC_013159	GAC	3	9	140032	140040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054214
3562	NC_013159	TAC	2	6	140047	140052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054214
3563	NC_013159	GAA	2	6	140106	140111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054214
3564	NC_013159	GTAC	2	8	140153	140160	25 %	25 %	25 %	25 %	257054214
3565	NC_013159	ACA	2	6	140210	140215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054214
3566	NC_013159	TCGA	2	8	140257	140264	25 %	25 %	25 %	25 %	257054214
3567	NC_013159	GTGA	2	8	140294	140301	25 %	25 %	50 %	0 %	257054215
3568	NC_013159	GAG	2	6	140303	140308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054215
3569	NC_013159	CGCC	2	8	140325	140332	0 %	0 %	25 %	75 %	257054215
3570	NC_013159	CTC	2	6	140348	140353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054215
3571	NC_013159	GC	3	6	140365	140370	0 %	0 %	50 %	50 %	257054215
3572	NC_013159	CG	3	6	140374	140379	0 %	0 %	50 %	50 %	257054215
3573	NC_013159	CGT	3	9	140383	140391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054215
3574	NC_013159	GCC	2	6	140396	140401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054215
3575	NC_013159	CT	3	6	140408	140413	0 %	50 %	0 %	50 %	257054215
3576	NC_013159	TGG	2	6	140454	140459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054215
3577	NC_013159	CCG	2	6	140499	140504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054215
3578	NC_013159	GC	3	6	140520	140525	0 %	0 %	50 %	50 %	257054215
3579	NC_013159	GGC	2	6	140562	140567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054215
3580	NC_013159	GCC	2	6	140651	140656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054215
3581	NC_013159	GCTGT	2	10	140657	140666	0 %	40 %	40 %	20 %	257054215
3582	NC_013159	TGCC	2	8	140694	140701	0 %	25 %	25 %	50 %	257054215
3583	NC_013159	GCC	2	6	140707	140712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054215
3584	NC_013159	TC	3	6	140721	140726	0 %	50 %	0 %	50 %	257054215
3585	NC_013159	CGAC	2	8	140751	140758	25 %	0 %	25 %	50 %	257054215
3586	NC_013159	GCC	2	6	140771	140776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054215
3587	NC_013159	GGT	2	6	140780	140785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054215
3588	NC_013159	CGG	2	6	140791	140796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054215
3589	NC_013159	ACG	2	6	140833	140838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054215
3590	NC_013159	TGAG	2	8	140840	140847	25 %	25 %	50 %	0 %	257054215
3591	NC_013159	GCT	2	6	140892	140897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054216
3592	NC_013159	ACGGC	2	10	140923	140932	20 %	0 %	40 %	40 %	257054216
3593	NC_013159	GAA	2	6	140946	140951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054216
3594	NC_013159	TCGT	2	8	141040	141047	0 %	50 %	25 %	25 %	257054216
3595	NC_013159	TCA	2	6	141065	141070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054216
3596	NC_013159	ACG	2	6	141071	141076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054216
3597	NC_013159	CG	3	6	141097	141102	0 %	0 %	50 %	50 %	257054216
3598	NC_013159	CGA	2	6	141107	141112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054216
3599	NC_013159	CGC	2	6	141129	141134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054216
3600	NC_013159	CGG	2	6	141167	141172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054216
3601	NC_013159	TTC	2	6	141178	141183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054216
3602	NC_013159	TCT	2	6	141204	141209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054216
3603	NC_013159	TTG	2	6	141223	141228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054216
3604	NC_013159	TGG	2	6	141236	141241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054216
3605	NC_013159	TCG	2	6	141308	141313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054216
3606	NC_013159	GGT	2	6	141343	141348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054216
3607	NC_013159	GTTCG	2	10	141396	141405	0 %	40 %	40 %	20 %	257054216
3608	NC_013159	TGG	2	6	141413	141418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054216
3609	NC_013159	GAA	2	6	141483	141488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054216
3610	NC_013159	CGG	2	6	141527	141532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054216
3611	NC_013159	CAG	2	6	141571	141576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054216
3612	NC_013159	GAG	2	6	141682	141687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054216
3613	NC_013159	GTC	2	6	141733	141738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054216
3614	NC_013159	TAC	2	6	141754	141759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054216
3615	NC_013159	CGG	3	9	141945	141953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054217
3616	NC_013159	CAGC	2	8	141973	141980	25 %	0 %	25 %	50 %	257054217
3617	NC_013159	AGA	2	6	142001	142006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054217
3618	NC_013159	GAA	2	6	142063	142068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054217
3619	NC_013159	CAC	2	6	142126	142131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054217
3620	NC_013159	CGT	3	9	142167	142175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054217
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3622	NC_013159	CGG	2	6	142188	142193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054217
3623	NC_013159	CCGGCG	2	12	142325	142336	0 %	0 %	50 %	50 %	257054217
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3744	NC_013159	TCG	2	6	146696	146701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054219
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3762	NC_013159	TG	3	6	147554	147559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3763	NC_013159	CGA	2	6	147616	147621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3772	NC_013159	CTC	2	6	147799	147804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3773	NC_013159	AGG	3	9	147819	147827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3774	NC_013159	GAG	2	6	147837	147842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3775	NC_013159	CGG	2	6	147851	147856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3776	NC_013159	CCG	2	6	147922	147927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3780	NC_013159	CGA	2	6	148056	148061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3786	NC_013159	TCG	2	6	148298	148303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054221
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3839	NC_013159	CCGG	2	8	150349	150356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3840	NC_013159	GCA	2	6	150426	150431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054222
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3852	NC_013159	GGGC	2	8	151016	151023	0 %	0 %	75 %	25 %	257054222
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3856	NC_013159	AGC	4	12	151100	151111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054222
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3858	NC_013159	TCG	2	6	151315	151320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054223
3859	NC_013159	CCT	2	6	151337	151342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054223
3860	NC_013159	TGA	2	6	151421	151426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054223
3861	NC_013159	AGT	2	6	151439	151444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054223
3862	NC_013159	GCG	2	6	151461	151466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054223
3863	NC_013159	TCC	2	6	151486	151491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054223
3864	NC_013159	GGA	2	6	151520	151525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054223
3865	NC_013159	GCA	2	6	151559	151564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054223
3866	NC_013159	GGT	2	6	151574	151579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054223
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3905	NC_013159	GGA	2	6	153167	153172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3955	NC_013159	CTG	2	6	155282	155287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3975	NC_013159	GTC	2	6	156085	156090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054226
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3983	NC_013159	CTC	2	6	156768	156773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3984	NC_013159	AGA	2	6	156774	156779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3985	NC_013159	CTG	2	6	156788	156793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3986	NC_013159	GTC	2	6	156855	156860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3987	NC_013159	GTT	2	6	156903	156908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3988	NC_013159	GGGTC	2	10	156967	156976	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3989	NC_013159	GGAA	2	8	156989	156996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_013159	GA	4	8	157044	157051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_013159	CGG	2	6	157053	157058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_013159	GACA	2	8	157104	157111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3993	NC_013159	TGA	2	6	157160	157165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_013159	AGA	2	6	157335	157340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_013159	CGG	2	6	157369	157374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_013159	TGA	2	6	157410	157415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_013159	GCG	2	6	157470	157475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_013159	AGCG	2	8	157495	157502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3999	NC_013159	TCC	2	6	157515	157520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4000	NC_013159	CGT	2	6	157533	157538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054228

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