MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013159	CTG	2	6	98176	98181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054180
2502	NC_013159	TCT	2	6	98244	98249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054180
2503	NC_013159	GA	3	6	98380	98385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_013159	TCGG	2	8	98401	98408	0 %	25 %	50 %	25 %	257054181
2505	NC_013159	GAT	2	6	98424	98429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054181
2506	NC_013159	CAC	2	6	98453	98458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054181
2507	NC_013159	TCC	2	6	98509	98514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054181
2508	NC_013159	GAC	2	6	98553	98558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2509	NC_013159	GT	3	6	98576	98581	0 %	50 %	50 %	0 %	257054181
2510	NC_013159	CGT	2	6	98588	98593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2511	NC_013159	GGCCGC	2	12	98664	98675	0 %	0 %	50 %	50 %	257054181
2512	NC_013159	TCG	2	6	98719	98724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2513	NC_013159	CAC	2	6	98775	98780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054181
2514	NC_013159	CG	3	6	98826	98831	0 %	0 %	50 %	50 %	257054181
2515	NC_013159	TCG	2	6	98872	98877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2516	NC_013159	CGG	2	6	98909	98914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054181
2517	NC_013159	GTG	2	6	98917	98922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054181
2518	NC_013159	CGC	2	6	98972	98977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054181
2519	NC_013159	CG	3	6	99006	99011	0 %	0 %	50 %	50 %	257054181
2520	NC_013159	CGA	2	6	99070	99075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2521	NC_013159	CGGG	2	8	99076	99083	0 %	0 %	75 %	25 %	257054181
2522	NC_013159	ACG	2	6	99092	99097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2523	NC_013159	CG	3	6	99134	99139	0 %	0 %	50 %	50 %	257054181
2524	NC_013159	CAG	2	6	99144	99149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2525	NC_013159	GAT	2	6	99182	99187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054181
2526	NC_013159	GCG	2	6	99192	99197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054181
2527	NC_013159	GCC	2	6	99207	99212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054181
2528	NC_013159	CTC	2	6	99228	99233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054181
2529	NC_013159	GCA	2	6	99299	99304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2530	NC_013159	CTG	2	6	99331	99336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2531	NC_013159	CCG	2	6	99341	99346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054181
2532	NC_013159	CGC	2	6	99357	99362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054181
2533	NC_013159	TCC	2	6	99376	99381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054181
2534	NC_013159	AGC	3	9	99406	99414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2535	NC_013159	CGT	2	6	99452	99457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2536	NC_013159	CTC	2	6	99459	99464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054181
2537	NC_013159	ATGGA	2	10	99482	99491	40 %	20 %	40 %	0 %	257054181
2538	NC_013159	GTT	2	6	99510	99515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054181
2539	NC_013159	CGG	2	6	99529	99534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054181
2540	NC_013159	GCA	3	9	99554	99562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054181
2541	NC_013159	TGG	2	6	99629	99634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054181
2542	NC_013159	CGCGG	2	10	99699	99708	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2543	NC_013159	TCC	2	6	99897	99902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054182
2544	NC_013159	GTG	2	6	99918	99923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054182
2545	NC_013159	CGC	2	6	99940	99945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054182
2546	NC_013159	C	6	6	99945	99950	0 %	0 %	0 %	100 %	257054182
2547	NC_013159	CGG	2	6	99970	99975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054182
2548	NC_013159	TGA	2	6	100018	100023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054182
2549	NC_013159	CCT	2	6	100042	100047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_013159	ACGTG	2	10	100123	100132	20 %	20 %	40 %	20 %	257054183
2551	NC_013159	GCG	2	6	100143	100148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054183
2552	NC_013159	CGA	2	6	100153	100158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054183
2553	NC_013159	CGA	2	6	100162	100167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054183
2554	NC_013159	AGC	2	6	100173	100178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054183
2555	NC_013159	CCA	2	6	100436	100441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054183
2556	NC_013159	AGA	2	6	100504	100509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054183
2557	NC_013159	CGC	2	6	100532	100537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054183
2558	NC_013159	CAG	2	6	100619	100624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054183
2559	NC_013159	CAC	2	6	100658	100663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054183
2560	NC_013159	AGT	2	6	100668	100673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054183
2561	NC_013159	GCT	2	6	100729	100734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054183
2562	NC_013159	GCA	2	6	100753	100758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054183
2563	NC_013159	GCG	2	6	100788	100793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054183
2564	NC_013159	CCA	2	6	100831	100836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054183
2565	NC_013159	TCG	2	6	100844	100849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_013159	A	6	6	100941	100946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_013159	CTT	2	6	101006	101011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_013159	A	6	6	101046	101051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_013159	GAA	2	6	101055	101060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_013159	GCC	2	6	101106	101111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054184
2571	NC_013159	CTG	2	6	101114	101119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2572	NC_013159	CGC	2	6	101150	101155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054184
2573	NC_013159	TCT	2	6	101159	101164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054184
2574	NC_013159	CGC	2	6	101169	101174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054184
2575	NC_013159	ATC	2	6	101179	101184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054184
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2577	NC_013159	GTC	2	6	101257	101262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2578	NC_013159	TAC	2	6	101278	101283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054184
2579	NC_013159	CGA	2	6	101361	101366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2580	NC_013159	GGA	2	6	101367	101372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054184
2581	NC_013159	GGTCT	2	10	101431	101440	0 %	40 %	40 %	20 %	257054184
2582	NC_013159	CG	3	6	101488	101493	0 %	0 %	50 %	50 %	257054184
2583	NC_013159	GTC	2	6	101584	101589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2584	NC_013159	AAG	2	6	101620	101625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054184
2585	NC_013159	ATCC	2	8	101634	101641	25 %	25 %	0 %	50 %	257054184
2586	NC_013159	GGCT	2	8	101680	101687	0 %	25 %	50 %	25 %	257054184
2587	NC_013159	CGC	2	6	101706	101711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054184
2588	NC_013159	GTC	2	6	101713	101718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2589	NC_013159	GTT	2	6	101724	101729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054184
2590	NC_013159	TGC	2	6	101759	101764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2591	NC_013159	GTG	2	6	101824	101829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054184
2592	NC_013159	GCT	2	6	101847	101852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2593	NC_013159	CAT	2	6	101856	101861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054184
2594	NC_013159	GGT	2	6	101865	101870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054184
2595	NC_013159	CAACAT	2	12	101904	101915	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257054184
2596	NC_013159	TGA	2	6	101930	101935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054184
2597	NC_013159	GTT	2	6	101964	101969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054184
2598	NC_013159	ACC	2	6	102037	102042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054184
2599	NC_013159	TGG	2	6	102103	102108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054184
2600	NC_013159	TCG	2	6	102125	102130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2601	NC_013159	CG	3	6	102141	102146	0 %	0 %	50 %	50 %	257054184
2602	NC_013159	CG	3	6	102152	102157	0 %	0 %	50 %	50 %	257054184
2603	NC_013159	TCG	2	6	102176	102181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2604	NC_013159	TGC	2	6	102188	102193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2605	NC_013159	CGG	2	6	102234	102239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054184
2606	NC_013159	GTT	2	6	102258	102263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054184
2607	NC_013159	TGG	2	6	102278	102283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054184
2608	NC_013159	CGT	2	6	102323	102328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2609	NC_013159	TTC	2	6	102400	102405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054184
2610	NC_013159	GTG	2	6	102433	102438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054184
2611	NC_013159	TCC	2	6	102448	102453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054184
2612	NC_013159	GGC	2	6	102454	102459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054184
2613	NC_013159	CCG	2	6	102469	102474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054184
2614	NC_013159	GCCGTC	2	12	102511	102522	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257054184
2615	NC_013159	GCT	2	6	102525	102530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2616	NC_013159	CGG	2	6	102537	102542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054184
2617	NC_013159	GC	3	6	102548	102553	0 %	0 %	50 %	50 %	257054184
2618	NC_013159	ATC	2	6	102619	102624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054184
2619	NC_013159	GCG	2	6	102646	102651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054184
2620	NC_013159	AGC	2	6	102683	102688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2621	NC_013159	CGA	2	6	102717	102722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054184
2622	NC_013159	TGG	2	6	102728	102733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054184
2623	NC_013159	GCGGG	2	10	102768	102777	0 %	0 %	80 %	20 %	257054184
2624	NC_013159	GT	3	6	102813	102818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_013159	GCG	2	6	102819	102824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_013159	TCCG	2	8	102828	102835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_013159	CGC	2	6	102841	102846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_013159	TCG	2	6	102867	102872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054185
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2631	NC_013159	GTC	3	9	102971	102979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054185
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2635	NC_013159	TGAG	2	8	103174	103181	25 %	25 %	50 %	0 %	257054185
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2650	NC_013159	G	6	6	103618	103623	0 %	0 %	100 %	0 %	257054185
2651	NC_013159	GAC	2	6	103630	103635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054185
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2653	NC_013159	TTCG	2	8	103759	103766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2654	NC_013159	CTA	2	6	103767	103772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2656	NC_013159	CGA	2	6	103852	103857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054186
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2697	NC_013159	GAC	2	6	105292	105297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2732	NC_013159	CCGG	2	8	106802	106809	0 %	0 %	50 %	50 %	257054189
2733	NC_013159	TCG	2	6	106818	106823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054189
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2866	NC_013159	GTCGGG	2	12	111612	111623	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	257054191
2867	NC_013159	GTC	2	6	111627	111632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054191
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2985	NC_013159	CGC	2	6	116355	116360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054196
2986	NC_013159	CGG	2	6	116366	116371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054196
2987	NC_013159	GAC	2	6	116382	116387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054196
2988	NC_013159	GCCG	2	8	116396	116403	0 %	0 %	50 %	50 %	257054196
2989	NC_013159	CCA	2	6	116411	116416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054196
2990	NC_013159	CGC	2	6	116457	116462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054196
2991	NC_013159	GGTCC	2	10	116532	116541	0 %	20 %	40 %	40 %	257054196
2992	NC_013159	CGATC	2	10	116639	116648	20 %	20 %	20 %	40 %	257054196
2993	NC_013159	TGA	2	6	116681	116686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054196
2994	NC_013159	GAT	2	6	116688	116693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054196
2995	NC_013159	CAG	2	6	116721	116726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054196
2996	NC_013159	GC	3	6	116762	116767	0 %	0 %	50 %	50 %	257054196
2997	NC_013159	CAG	2	6	116784	116789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054196
2998	NC_013159	GC	4	8	116812	116819	0 %	0 %	50 %	50 %	257054196
2999	NC_013159	CCG	2	6	116842	116847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054196
3000	NC_013159	TCC	2	6	116869	116874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054196

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