MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013159	TCG	2	6	38461	38466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054126
1002	NC_013159	AGTCG	2	10	38475	38484	20 %	20 %	40 %	20 %	257054126
1003	NC_013159	GCCC	2	8	38488	38495	0 %	0 %	25 %	75 %	257054126
1004	NC_013159	CAC	2	6	38553	38558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054126
1005	NC_013159	CAC	2	6	38609	38614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054126
1006	NC_013159	CGC	2	6	38649	38654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054126
1007	NC_013159	CAC	2	6	38670	38675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054126
1008	NC_013159	GCG	2	6	38683	38688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054126
1009	NC_013159	AAC	2	6	38695	38700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054126
1010	NC_013159	CGC	2	6	38798	38803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_013159	GTC	2	6	38813	38818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013159	GCC	2	6	38841	38846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_013159	GAA	2	6	38886	38891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013159	TGA	2	6	38940	38945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054127
1015	NC_013159	GTG	2	6	38993	38998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054127
1016	NC_013159	TGG	2	6	39003	39008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054127
1017	NC_013159	GAC	2	6	39060	39065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1018	NC_013159	GA	3	6	39066	39071	50 %	0 %	50 %	0 %	257054127
1019	NC_013159	GCC	2	6	39124	39129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054127
1020	NC_013159	CGT	2	6	39159	39164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1021	NC_013159	CCGG	2	8	39197	39204	0 %	0 %	50 %	50 %	257054127
1022	NC_013159	GCC	2	6	39211	39216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054127
1023	NC_013159	GCC	2	6	39226	39231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054127
1024	NC_013159	CTG	3	9	39232	39240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1025	NC_013159	CCA	2	6	39254	39259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054127
1026	NC_013159	GCG	2	6	39270	39275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054127
1027	NC_013159	ACC	2	6	39292	39297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054127
1028	NC_013159	CGG	2	6	39307	39312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054127
1029	NC_013159	GCC	2	6	39562	39567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054127
1030	NC_013159	CTGTCC	2	12	39598	39609	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257054127
1031	NC_013159	CTG	2	6	39625	39630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1032	NC_013159	GCC	2	6	39664	39669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054127
1033	NC_013159	GGCT	2	8	39671	39678	0 %	25 %	50 %	25 %	257054127
1034	NC_013159	GGTC	2	8	39683	39690	0 %	25 %	50 %	25 %	257054127
1035	NC_013159	TCG	2	6	39797	39802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1036	NC_013159	ACG	2	6	39818	39823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1037	NC_013159	CCG	2	6	39903	39908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054127
1038	NC_013159	CTT	2	6	40026	40031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054127
1039	NC_013159	GAC	2	6	40036	40041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054127
1040	NC_013159	CCT	2	6	40128	40133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_013159	TG	3	6	40138	40143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013159	TGCT	2	8	40210	40217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_013159	GT	3	6	40286	40291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013159	CTCC	2	8	40314	40321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1045	NC_013159	ACG	2	6	40333	40338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013159	T	6	6	40370	40375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_013159	GT	3	6	40377	40382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013159	GGC	2	6	40437	40442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013159	GAG	2	6	40467	40472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013159	CTT	2	6	40493	40498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013159	AGGA	2	8	40512	40519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013159	CGC	2	6	40551	40556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054128
1053	NC_013159	G	6	6	40590	40595	0 %	0 %	100 %	0 %	257054128
1054	NC_013159	CCG	2	6	40658	40663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054128
1055	NC_013159	TCG	2	6	40691	40696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054128
1056	NC_013159	GTC	2	6	40772	40777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013159	ATC	2	6	40787	40792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_013159	CGAA	2	8	40800	40807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_013159	GAC	2	6	40835	40840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013159	TTG	2	6	40902	40907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013159	GGTC	2	8	41008	41015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_013159	TCG	2	6	41024	41029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013159	CGG	2	6	41034	41039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013159	TCG	2	6	41100	41105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013159	TTC	2	6	41156	41161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013159	CCG	2	6	41285	41290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_013159	GCCG	2	8	41316	41323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_013159	GCCC	2	8	41327	41334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1069	NC_013159	GTG	2	6	41528	41533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013159	TTC	2	6	41626	41631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013159	CAG	2	6	41756	41761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1072	NC_013159	GC	3	6	41782	41787	0 %	0 %	50 %	50 %	257054129
1073	NC_013159	TCG	2	6	41788	41793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1074	NC_013159	AACG	2	8	41870	41877	50 %	0 %	25 %	25 %	257054129
1075	NC_013159	CGT	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1076	NC_013159	ACC	2	6	41910	41915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054129
1077	NC_013159	TGCG	2	8	41953	41960	0 %	25 %	50 %	25 %	257054129
1078	NC_013159	TGC	2	6	42079	42084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1079	NC_013159	TC	3	6	42107	42112	0 %	50 %	0 %	50 %	257054129
1080	NC_013159	GGC	2	6	42194	42199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054129
1081	NC_013159	CGAC	2	8	42230	42237	25 %	0 %	25 %	50 %	257054129
1082	NC_013159	GTGC	2	8	42246	42253	0 %	25 %	50 %	25 %	257054129
1083	NC_013159	CGC	2	6	42335	42340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054129
1084	NC_013159	CAC	2	6	42407	42412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054129
1085	NC_013159	TCA	2	6	42430	42435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054129
1086	NC_013159	GTCACC	2	12	42453	42464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257054129
1087	NC_013159	CCG	2	6	42487	42492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054129
1088	NC_013159	CCG	2	6	42532	42537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054129
1089	NC_013159	GACCGC	2	12	42569	42580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257054129
1090	NC_013159	TCG	2	6	42604	42609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1091	NC_013159	CGA	2	6	42659	42664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1092	NC_013159	CAC	2	6	42665	42670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054129
1093	NC_013159	AAGGCC	2	12	42675	42686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054129
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1095	NC_013159	GGA	2	6	42725	42730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054129
1096	NC_013159	ACC	2	6	42732	42737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054129
1097	NC_013159	GCA	2	6	42764	42769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1098	NC_013159	GGA	2	6	42818	42823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054129
1099	NC_013159	TGG	2	6	42877	42882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054129
1100	NC_013159	CCG	2	6	42883	42888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054129
1101	NC_013159	CGG	2	6	42892	42897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054129
1102	NC_013159	CTG	2	6	42903	42908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054129
1103	NC_013159	GAA	2	6	42920	42925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054129
1104	NC_013159	GCC	2	6	42965	42970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_013159	GTG	2	6	42987	42992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013159	GGC	2	6	42995	43000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013159	TCG	2	6	43011	43016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013159	CG	3	6	43112	43117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_013159	G	6	6	43127	43132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013159	GTT	2	6	43216	43221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054130
1111	NC_013159	GGC	2	6	43222	43227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054130
1112	NC_013159	GTG	2	6	43250	43255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054130
1113	NC_013159	GAC	2	6	43286	43291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054130
1114	NC_013159	CGAGCG	2	12	43293	43304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257054130
1115	NC_013159	TCGACG	2	12	43407	43418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054130
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1117	NC_013159	TCGG	2	8	43504	43511	0 %	25 %	50 %	25 %	257054130
1118	NC_013159	CGC	2	6	43576	43581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054130
1119	NC_013159	AC	3	6	43597	43602	50 %	0 %	0 %	50 %	257054130
1120	NC_013159	CGAGG	2	10	43612	43621	20 %	0 %	60 %	20 %	257054130
1121	NC_013159	GTGA	2	8	43661	43668	25 %	25 %	50 %	0 %	257054130
1122	NC_013159	GGT	2	6	43742	43747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054130
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1125	NC_013159	GAG	2	6	43889	43894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054130
1126	NC_013159	CGG	2	6	43918	43923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054130
1127	NC_013159	G	6	6	43934	43939	0 %	0 %	100 %	0 %	257054130
1128	NC_013159	CGC	2	6	43945	43950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054130
1129	NC_013159	GCC	2	6	43951	43956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054130
1130	NC_013159	CGC	2	6	43959	43964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054130
1131	NC_013159	CGT	2	6	43986	43991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054130
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1238	NC_013159	CCT	2	6	48016	48021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1239	NC_013159	GCG	2	6	48091	48096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1240	NC_013159	C	6	6	48141	48146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1241	NC_013159	CCGA	2	8	48169	48176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1242	NC_013159	ACCG	2	8	48193	48200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1243	NC_013159	ACCG	2	8	48204	48211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1244	NC_013159	GCC	2	6	48218	48223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1247	NC_013159	TCCC	2	8	48435	48442	0 %	25 %	0 %	75 %	257054133
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1251	NC_013159	CGGC	2	8	48519	48526	0 %	0 %	50 %	50 %	257054133
1252	NC_013159	GTG	2	6	48535	48540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054133
1253	NC_013159	ACC	2	6	48607	48612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054133
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1255	NC_013159	GCC	2	6	48715	48720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054133
1256	NC_013159	GGC	2	6	48747	48752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054133
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1259	NC_013159	CCG	2	6	48842	48847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054133
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1364	NC_013159	CGG	2	6	53338	53343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1365	NC_013159	GCC	2	6	53379	53384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1366	NC_013159	GAA	2	6	53417	53422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1367	NC_013159	GCCG	2	8	53475	53482	0 %	0 %	50 %	50 %	257054138
1368	NC_013159	GTC	2	6	53501	53506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054138
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1370	NC_013159	GCC	2	6	53581	53586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054138
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1373	NC_013159	CGT	2	6	53772	53777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054138
1374	NC_013159	CGG	2	6	53881	53886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054139
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1376	NC_013159	GCCGT	2	10	53932	53941	0 %	20 %	40 %	40 %	257054139
1377	NC_013159	CGA	2	6	53956	53961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054139
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