MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

< Previous12...205206207208209210211212213214215216217Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_013159	GGTG	2	8	4304356	4304363	0 %	25 %	75 %	0 %	257057910
108002	NC_013159	TCA	2	6	4304382	4304387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057910
108003	NC_013159	GGA	2	6	4304392	4304397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057910
108004	NC_013159	AGC	2	6	4304402	4304407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057910
108005	NC_013159	GC	3	6	4304406	4304411	0 %	0 %	50 %	50 %	257057910
108006	NC_013159	CAC	2	6	4304472	4304477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057910
108007	NC_013159	CCG	2	6	4304518	4304523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057910
108008	NC_013159	TCA	2	6	4304535	4304540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057910
108009	NC_013159	CTT	2	6	4304565	4304570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057910
108010	NC_013159	GGC	2	6	4304596	4304601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057911
108011	NC_013159	CCA	2	6	4304624	4304629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057911
108012	NC_013159	GGT	2	6	4304631	4304636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057911
108013	NC_013159	CGC	2	6	4304657	4304662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057911
108014	NC_013159	GCC	2	6	4304704	4304709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057911
108015	NC_013159	CCT	2	6	4304723	4304728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057911
108016	NC_013159	GCC	2	6	4304731	4304736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057911
108017	NC_013159	CAC	2	6	4304862	4304867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057911
108018	NC_013159	CGA	2	6	4304918	4304923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057911
108019	NC_013159	CGG	2	6	4304944	4304949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057911
108020	NC_013159	GAG	2	6	4304961	4304966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057911
108021	NC_013159	TTCG	2	8	4305059	4305066	0 %	50 %	25 %	25 %	257057911
108022	NC_013159	GAC	2	6	4305069	4305074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057911
108023	NC_013159	CAG	2	6	4305156	4305161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057911
108024	NC_013159	CAA	2	6	4305164	4305169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057911
108025	NC_013159	CG	3	6	4305186	4305191	0 %	0 %	50 %	50 %	257057911
108026	NC_013159	CGC	2	6	4305210	4305215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057911
108027	NC_013159	TTG	2	6	4305239	4305244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108028	NC_013159	CG	3	6	4305326	4305331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108029	NC_013159	CCG	2	6	4305392	4305397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108030	NC_013159	ACT	2	6	4305440	4305445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057912
108031	NC_013159	CAC	2	6	4305453	4305458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057912
108032	NC_013159	CGC	2	6	4305463	4305468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057912
108033	NC_013159	TCC	2	6	4305475	4305480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057912
108034	NC_013159	CTCGCT	2	12	4305483	4305494	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257057912
108035	NC_013159	CGG	2	6	4305596	4305601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057912
108036	NC_013159	GCT	2	6	4305623	4305628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057912
108037	NC_013159	GACC	2	8	4305746	4305753	25 %	0 %	25 %	50 %	257057912
108038	NC_013159	TCA	2	6	4305766	4305771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057912
108039	NC_013159	CCG	2	6	4305772	4305777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057912
108040	NC_013159	CG	3	6	4305792	4305797	0 %	0 %	50 %	50 %	257057912
108041	NC_013159	CGT	2	6	4305827	4305832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057912
108042	NC_013159	GTC	2	6	4305906	4305911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057912
108043	NC_013159	TCC	2	6	4305942	4305947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057912
108044	NC_013159	TC	3	6	4305983	4305988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108045	NC_013159	TCT	2	6	4306026	4306031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057913
108046	NC_013159	TTC	2	6	4306061	4306066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057913
108047	NC_013159	GCT	2	6	4306087	4306092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057913
108048	NC_013159	CTG	2	6	4306141	4306146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057913
108049	NC_013159	GGC	2	6	4306249	4306254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057913
108050	NC_013159	CTTCCT	2	12	4306266	4306277	0 %	50 %	0 %	50 %	257057913
108051	NC_013159	TCT	2	6	4306284	4306289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057913
108052	NC_013159	GCT	2	6	4306302	4306307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057913
108053	NC_013159	GTT	2	6	4306324	4306329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057913
108054	NC_013159	GAA	2	6	4306360	4306365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057913
108055	NC_013159	ACC	2	6	4306376	4306381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057913
108056	NC_013159	CCGG	2	8	4306385	4306392	0 %	0 %	50 %	50 %	257057913
108057	NC_013159	TCA	2	6	4306416	4306421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057913
108058	NC_013159	CG	3	6	4306472	4306477	0 %	0 %	50 %	50 %	257057913
108059	NC_013159	ATC	2	6	4306505	4306510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057913
108060	NC_013159	ACGGC	2	10	4306512	4306521	20 %	0 %	40 %	40 %	257057913
108061	NC_013159	TCC	2	6	4306555	4306560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057913
108062	NC_013159	ACC	2	6	4306561	4306566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057913
108063	NC_013159	GGT	2	6	4306578	4306583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057913
108064	NC_013159	GAA	2	6	4306651	4306656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057913
108065	NC_013159	GCA	2	6	4306725	4306730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057913
108066	NC_013159	CTT	2	6	4306822	4306827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057913
108067	NC_013159	CAG	2	6	4306903	4306908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057913
108068	NC_013159	GTA	2	6	4307023	4307028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057913
108069	NC_013159	CTC	2	6	4307052	4307057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057914
108070	NC_013159	CGG	2	6	4307118	4307123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057914
108071	NC_013159	CGCAG	2	10	4307135	4307144	20 %	0 %	40 %	40 %	257057914
108072	NC_013159	GGC	2	6	4307175	4307180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057914
108073	NC_013159	GCA	3	9	4307285	4307293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057914
108074	NC_013159	GCCG	2	8	4307358	4307365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108075	NC_013159	GGA	2	6	4307405	4307410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057915
108076	NC_013159	CAGTCG	2	12	4307417	4307428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257057915
108077	NC_013159	CTCG	2	8	4307462	4307469	0 %	25 %	25 %	50 %	257057915
108078	NC_013159	GCA	2	6	4307478	4307483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057915
108079	NC_013159	ACG	2	6	4307580	4307585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057915
108080	NC_013159	CAC	2	6	4307606	4307611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057915
108081	NC_013159	GCA	2	6	4307653	4307658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057915
108082	NC_013159	CGG	2	6	4307664	4307669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057915
108083	NC_013159	CGC	2	6	4307683	4307688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057915
108084	NC_013159	CACGG	2	10	4307696	4307705	20 %	0 %	40 %	40 %	257057915
108085	NC_013159	CGC	2	6	4307718	4307723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057915
108086	NC_013159	CAG	2	6	4307734	4307739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057915
108087	NC_013159	CGC	2	6	4307746	4307751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057915
108088	NC_013159	CGT	2	6	4307757	4307762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108089	NC_013159	CGA	2	6	4307792	4307797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057916
108090	NC_013159	CGG	2	6	4307810	4307815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057916
108091	NC_013159	TCCGCA	2	12	4307844	4307855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257057916
108092	NC_013159	CG	4	8	4307873	4307880	0 %	0 %	50 %	50 %	257057916
108093	NC_013159	CGA	2	6	4307882	4307887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057916
108094	NC_013159	GCG	2	6	4307938	4307943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108095	NC_013159	ACC	2	6	4307956	4307961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108096	NC_013159	GCC	2	6	4308016	4308021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108097	NC_013159	CTG	2	6	4308056	4308061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108098	NC_013159	GCC	2	6	4308100	4308105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057917
108099	NC_013159	GCA	2	6	4308129	4308134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057917
108100	NC_013159	GCC	2	6	4308169	4308174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057917
108101	NC_013159	CG	3	6	4308195	4308200	0 %	0 %	50 %	50 %	257057917
108102	NC_013159	CCG	2	6	4308230	4308235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057917

< Previous12...205206207208209210211212213214215216217Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.