MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013159	GAACGC	2	12	396638	396649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_013159	CGC	2	6	396768	396773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_013159	GCA	2	6	396793	396798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_013159	AGG	2	6	396808	396813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_013159	GGCGAA	2	12	396824	396835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257054468
10006	NC_013159	ACC	2	6	396897	396902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054468
10007	NC_013159	GCG	2	6	396909	396914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054468
10008	NC_013159	GAG	2	6	396990	396995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054468
10009	NC_013159	GAA	2	6	397094	397099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054468
10010	NC_013159	CGC	2	6	397145	397150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054468
10011	NC_013159	CG	3	6	397193	397198	0 %	0 %	50 %	50 %	257054468
10012	NC_013159	GTG	2	6	397221	397226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054468
10013	NC_013159	TGG	2	6	397246	397251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054468
10014	NC_013159	ACG	2	6	397252	397257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10015	NC_013159	TCG	2	6	397273	397278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10016	NC_013159	GCT	2	6	397295	397300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10017	NC_013159	CGA	2	6	397322	397327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10018	NC_013159	CGA	2	6	397370	397375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10019	NC_013159	CAT	2	6	397391	397396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054468
10020	NC_013159	CGA	2	6	397415	397420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10021	NC_013159	GTC	2	6	397506	397511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10022	NC_013159	CCGG	2	8	397513	397520	0 %	0 %	50 %	50 %	257054468
10023	NC_013159	TCG	2	6	397561	397566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10024	NC_013159	ACC	2	6	397590	397595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054468
10025	NC_013159	CAA	2	6	397616	397621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054468
10026	NC_013159	CGC	2	6	397652	397657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054468
10027	NC_013159	CTG	3	9	397659	397667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054468
10028	NC_013159	CAC	3	9	397721	397729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054468
10029	NC_013159	GCC	2	6	397783	397788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054468
10030	NC_013159	TTC	2	6	397797	397802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054468
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10032	NC_013159	ACA	2	6	397894	397899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054468
10033	NC_013159	ATC	2	6	398004	398009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054468
10034	NC_013159	ACCC	2	8	398019	398026	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10035	NC_013159	GGC	2	6	398081	398086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_013159	GCC	2	6	398122	398127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_013159	CTG	2	6	398128	398133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_013159	CAG	2	6	398347	398352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_013159	GGCC	2	8	398387	398394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_013159	GAG	2	6	398397	398402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_013159	GCCG	2	8	398413	398420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_013159	AGA	2	6	398452	398457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054469
10043	NC_013159	GC	4	8	398503	398510	0 %	0 %	50 %	50 %	257054469
10044	NC_013159	TCG	2	6	398515	398520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054469
10045	NC_013159	GTC	2	6	398547	398552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054469
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10049	NC_013159	GCAC	2	8	398644	398651	25 %	0 %	25 %	50 %	257054469
10050	NC_013159	GCG	2	6	398759	398764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_013159	CGA	2	6	398837	398842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054470
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10053	NC_013159	CGT	2	6	398867	398872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054470
10054	NC_013159	GGCCG	2	10	398876	398885	0 %	0 %	60 %	40 %	257054470
10055	NC_013159	GTG	2	6	398889	398894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054470
10056	NC_013159	GCA	2	6	398905	398910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054470
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10058	NC_013159	C	6	6	399013	399018	0 %	0 %	0 %	100 %	257054470
10059	NC_013159	CCG	2	6	399082	399087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054470
10060	NC_013159	GCAAGG	2	12	399130	399141	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257054470
10061	NC_013159	GCCA	2	8	399186	399193	25 %	0 %	25 %	50 %	257054470
10062	NC_013159	CAA	2	6	399290	399295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054470
10063	NC_013159	GAC	2	6	399302	399307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054470
10064	NC_013159	GTGC	2	8	399330	399337	0 %	25 %	50 %	25 %	257054470
10065	NC_013159	GAG	2	6	399339	399344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054470
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10069	NC_013159	GTG	2	6	399542	399547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054471
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10081	NC_013159	TGC	2	6	399900	399905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054471
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10085	NC_013159	GC	3	6	400066	400071	0 %	0 %	50 %	50 %	257054471
10086	NC_013159	GTC	2	6	400081	400086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054471
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10088	NC_013159	GCT	2	6	400185	400190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054472
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10091	NC_013159	GC	3	6	400359	400364	0 %	0 %	50 %	50 %	257054472
10092	NC_013159	CGG	2	6	400407	400412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054472
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10107	NC_013159	GAAG	2	8	400940	400947	50 %	0 %	50 %	0 %	257054473
10108	NC_013159	GGCC	2	8	401063	401070	0 %	0 %	50 %	50 %	257054473
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10118	NC_013159	CCG	2	6	401396	401401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054474
10119	NC_013159	ATC	2	6	401409	401414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054474
10120	NC_013159	ACG	2	6	401446	401451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054474
10121	NC_013159	TCA	2	6	401473	401478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054474
10122	NC_013159	CGC	3	9	401562	401570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054474
10123	NC_013159	GC	3	6	401574	401579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_013159	AGC	2	6	401593	401598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_013159	CG	3	6	401605	401610	0 %	0 %	50 %	50 %	257054475
10126	NC_013159	CG	3	6	401653	401658	0 %	0 %	50 %	50 %	257054475
10127	NC_013159	GGC	2	6	401764	401769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054475
10128	NC_013159	AAC	2	6	401819	401824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054475
10129	NC_013159	CGA	2	6	401869	401874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054475
10130	NC_013159	CCGC	2	8	401896	401903	0 %	0 %	25 %	75 %	257054475
10131	NC_013159	GTG	2	6	401954	401959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054475
10132	NC_013159	CGG	2	6	401973	401978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054475
10133	NC_013159	AAG	3	9	402005	402013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054475
10134	NC_013159	AGA	2	6	402035	402040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054476
10135	NC_013159	CAC	2	6	402069	402074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054476
10136	NC_013159	GC	3	6	402168	402173	0 %	0 %	50 %	50 %	257054476
10137	NC_013159	GCC	2	6	402257	402262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054476
10138	NC_013159	GTG	2	6	402263	402268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054476
10139	NC_013159	GAA	2	6	402342	402347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054476
10140	NC_013159	AGC	2	6	402389	402394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054476
10141	NC_013159	CCG	2	6	402414	402419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054476
10142	NC_013159	GTGCA	2	10	402478	402487	20 %	20 %	40 %	20 %	257054476
10143	NC_013159	GGT	2	6	402499	402504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054476
10144	NC_013159	GC	3	6	402561	402566	0 %	0 %	50 %	50 %	257054476
10145	NC_013159	TTC	2	6	402583	402588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054476
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10147	NC_013159	CGG	2	6	402651	402656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054476
10148	NC_013159	GGC	3	9	402681	402689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054476
10149	NC_013159	GCT	2	6	402691	402696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054476
10150	NC_013159	TCC	2	6	402721	402726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054476
10151	NC_013159	CGG	2	6	402727	402732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054476
10152	NC_013159	CGT	3	9	402755	402763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054476
10153	NC_013159	CAGGGT	2	12	402793	402804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257054476
10154	NC_013159	GC	3	6	402806	402811	0 %	0 %	50 %	50 %	257054476
10155	NC_013159	CGA	2	6	402830	402835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054476
10156	NC_013159	GGC	2	6	402852	402857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054476
10157	NC_013159	AGC	2	6	402923	402928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054477
10158	NC_013159	GCC	2	6	402949	402954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054477
10159	NC_013159	AAG	2	6	403117	403122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054477
10160	NC_013159	GTG	2	6	403164	403169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054477
10161	NC_013159	CG	3	6	403249	403254	0 %	0 %	50 %	50 %	257054477
10162	NC_013159	GTG	2	6	403298	403303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054477
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10166	NC_013159	TGC	2	6	403372	403377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054478
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10169	NC_013159	GC	3	6	403466	403471	0 %	0 %	50 %	50 %	257054478
10170	NC_013159	GCGGGA	2	12	403499	403510	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	257054478
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10173	NC_013159	TCG	2	6	403620	403625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054479
10174	NC_013159	TCG	2	6	403650	403655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054479
10175	NC_013159	GAA	2	6	403672	403677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054479
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10178	NC_013159	ACG	2	6	403728	403733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054479
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10181	NC_013159	CGTT	2	8	403861	403868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10182	NC_013159	CAG	2	6	403924	403929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054480
10183	NC_013159	ACA	2	6	403952	403957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054480
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10185	NC_013159	CAT	2	6	404028	404033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054480
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10188	NC_013159	CGC	2	6	404163	404168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054480
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10190	NC_013159	ATC	2	6	404257	404262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054480
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10192	NC_013159	TGAA	2	8	404284	404291	50 %	25 %	25 %	0 %	257054480
10193	NC_013159	GAA	2	6	404295	404300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054481
10194	NC_013159	AAG	2	6	404410	404415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054481
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10217	NC_013159	GACC	2	8	405466	405473	25 %	0 %	25 %	50 %	257054484
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10222	NC_013159	CGT	2	6	405780	405785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054484
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10224	NC_013159	GTG	2	6	405850	405855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054484
10225	NC_013159	CGA	2	6	406006	406011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054485
10226	NC_013159	GCT	2	6	406021	406026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054485
10227	NC_013159	GAC	2	6	406040	406045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054485
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10229	NC_013159	AAC	2	6	406091	406096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054485
10230	NC_013159	TCG	3	9	406098	406106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054485
10231	NC_013159	CGA	2	6	406257	406262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054485
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10234	NC_013159	CAAGGG	2	12	406345	406356	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257054485
10235	NC_013159	CCG	2	6	406381	406386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054485
10236	NC_013159	CGT	2	6	406465	406470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054486
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10358	NC_013159	CCG	2	6	411067	411072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054492
10359	NC_013159	AC	3	6	411098	411103	50 %	0 %	0 %	50 %	257054492
10360	NC_013159	GGA	2	6	411116	411121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054492
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10363	NC_013159	GTC	2	6	411184	411189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10365	NC_013159	GGC	2	6	411341	411346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10366	NC_013159	GT	3	6	411360	411365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10367	NC_013159	GAA	2	6	411422	411427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054493
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10370	NC_013159	GC	3	6	411677	411682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10378	NC_013159	GTC	2	6	411969	411974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10380	NC_013159	CAT	2	6	412127	412132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054495
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10387	NC_013159	AAG	2	6	412404	412409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054495
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10470	NC_013159	TCT	2	6	416462	416467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054501
10471	NC_013159	GC	3	6	416480	416485	0 %	0 %	50 %	50 %	257054501
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10473	NC_013159	ATG	2	6	416583	416588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054501
10474	NC_013159	GATC	2	8	416668	416675	25 %	25 %	25 %	25 %	257054501
10475	NC_013159	GCG	2	6	416924	416929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054501
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