MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_013159	GTG	2	6	273726	273731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054351
7003	NC_013159	TGC	2	6	273781	273786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054351
7004	NC_013159	AGG	2	6	273841	273846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054351
7005	NC_013159	GGT	2	6	273847	273852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054351
7006	NC_013159	CGT	2	6	273866	273871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054351
7007	NC_013159	GCCAG	2	10	273898	273907	20 %	0 %	40 %	40 %	257054351
7008	NC_013159	GGC	2	6	273947	273952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_013159	CTG	2	6	274044	274049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054352
7010	NC_013159	CTG	2	6	274086	274091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054352
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7012	NC_013159	TGC	2	6	274246	274251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054352
7013	NC_013159	CTCG	2	8	274259	274266	0 %	25 %	25 %	50 %	257054352
7014	NC_013159	GTT	2	6	274298	274303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054352
7015	NC_013159	GGT	2	6	274331	274336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054352
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7017	NC_013159	GCCAC	2	10	274399	274408	20 %	0 %	20 %	60 %	257054352
7018	NC_013159	GTT	2	6	274436	274441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054352
7019	NC_013159	GTC	2	6	274458	274463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054352
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7022	NC_013159	TCG	2	6	274534	274539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054352
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7031	NC_013159	TCCG	2	8	274873	274880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_013159	CG	3	6	274948	274953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_013159	GCC	2	6	275021	275026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054353
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7038	NC_013159	GACC	2	8	275300	275307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_013159	GCGTG	2	10	275315	275324	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7040	NC_013159	AAG	2	6	275337	275342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_013159	AAG	2	6	275361	275366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7056	NC_013159	ACG	2	6	276262	276267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054354
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7060	NC_013159	CGACT	2	10	276467	276476	20 %	20 %	20 %	40 %	257054354
7061	NC_013159	GAC	2	6	276507	276512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054354
7062	NC_013159	CGA	2	6	276525	276530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054354
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7064	NC_013159	GGCCC	2	10	276585	276594	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7065	NC_013159	CGAAC	2	10	276629	276638	40 %	0 %	20 %	40 %	257054355
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7089	NC_013159	TGCGA	2	10	277606	277615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7118	NC_013159	CGG	2	6	278717	278722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054357
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7122	NC_013159	GTG	3	9	278828	278836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054357
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7124	NC_013159	CGG	2	6	278923	278928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054357
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7126	NC_013159	TG	3	6	278958	278963	0 %	50 %	50 %	0 %	257054357
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7221	NC_013159	ACT	2	6	282795	282800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7230	NC_013159	CGGCCG	2	12	283126	283137	0 %	0 %	50 %	50 %	257054361
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7234	NC_013159	GAC	2	6	283416	283421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054361
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7239	NC_013159	TGC	2	6	283552	283557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054361
7240	NC_013159	GGCG	2	8	283637	283644	0 %	0 %	75 %	25 %	257054361
7241	NC_013159	TGA	2	6	283722	283727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054361
7242	NC_013159	CGC	2	6	283795	283800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054362
7243	NC_013159	TGC	2	6	283815	283820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7244	NC_013159	GCA	2	6	283828	283833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7245	NC_013159	GAC	2	6	283838	283843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7246	NC_013159	TGC	2	6	283857	283862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7247	NC_013159	CGT	2	6	283894	283899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7248	NC_013159	CGG	2	6	283912	283917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054362
7249	NC_013159	CGG	2	6	283965	283970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054362
7250	NC_013159	GTC	2	6	284054	284059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7251	NC_013159	GCA	2	6	284127	284132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7252	NC_013159	GAC	2	6	284152	284157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7253	NC_013159	GGT	2	6	284215	284220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054362
7254	NC_013159	GCC	3	9	284234	284242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054362
7255	NC_013159	CGG	2	6	284258	284263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054362
7256	NC_013159	G	6	6	284320	284325	0 %	0 %	100 %	0 %	257054362
7257	NC_013159	TCG	2	6	284337	284342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7258	NC_013159	TCA	2	6	284343	284348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054362
7259	NC_013159	GCC	2	6	284366	284371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054362
7260	NC_013159	CGA	2	6	284437	284442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7261	NC_013159	GTC	4	12	284459	284470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7262	NC_013159	GTG	2	6	284534	284539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054362
7263	NC_013159	CCA	2	6	284652	284657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054362
7264	NC_013159	CAT	2	6	284686	284691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054362
7265	NC_013159	CGA	2	6	284695	284700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7266	NC_013159	CAGCG	2	10	284723	284732	20 %	0 %	40 %	40 %	257054362
7267	NC_013159	CCG	2	6	284733	284738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054362
7268	NC_013159	ACCG	2	8	284743	284750	25 %	0 %	25 %	50 %	257054362
7269	NC_013159	GCC	2	6	284771	284776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054362
7270	NC_013159	GCT	2	6	284794	284799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7271	NC_013159	GGC	2	6	284811	284816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054362
7272	NC_013159	GCG	2	6	284863	284868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054362
7273	NC_013159	CGT	2	6	284869	284874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7274	NC_013159	TGC	2	6	284883	284888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054362
7275	NC_013159	CGC	2	6	284917	284922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054362
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7277	NC_013159	CGG	2	6	285009	285014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054362
7278	NC_013159	GGA	2	6	285137	285142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054363
7279	NC_013159	GGA	2	6	285347	285352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054363
7280	NC_013159	GGAC	2	8	285377	285384	25 %	0 %	50 %	25 %	257054363
7281	NC_013159	GCC	2	6	285401	285406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054363
7282	NC_013159	CGC	2	6	285430	285435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054363
7283	NC_013159	GCTG	2	8	285644	285651	0 %	25 %	50 %	25 %	257054363
7284	NC_013159	CGA	2	6	285665	285670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054363
7285	NC_013159	GTC	2	6	285801	285806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054363
7286	NC_013159	CGC	2	6	285860	285865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054363
7287	NC_013159	CGGTGC	2	12	285974	285985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054363
7288	NC_013159	CGA	3	9	286043	286051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7289	NC_013159	GA	3	6	286053	286058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7290	NC_013159	CGCA	2	8	286074	286081	25 %	0 %	25 %	50 %	257054364
7291	NC_013159	GTCC	2	8	286237	286244	0 %	25 %	25 %	50 %	257054364
7292	NC_013159	GCA	2	6	286341	286346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7293	NC_013159	GGT	2	6	286456	286461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054364
7294	NC_013159	TGC	2	6	286535	286540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7295	NC_013159	GGC	2	6	286566	286571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054364
7296	NC_013159	CTCGC	2	10	286666	286675	0 %	20 %	20 %	60 %	257054364
7297	NC_013159	GCC	2	6	286678	286683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054364
7298	NC_013159	TCG	2	6	286697	286702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7299	NC_013159	TGG	2	6	286709	286714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054364
7300	NC_013159	GTG	2	6	286755	286760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054364
7301	NC_013159	CG	4	8	286766	286773	0 %	0 %	50 %	50 %	257054364
7302	NC_013159	GCC	2	6	286887	286892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054364
7303	NC_013159	CGTG	2	8	286977	286984	0 %	25 %	50 %	25 %	257054364
7304	NC_013159	GGCGA	2	10	287056	287065	20 %	0 %	60 %	20 %	257054364
7305	NC_013159	CGTT	2	8	287080	287087	0 %	50 %	25 %	25 %	257054364
7306	NC_013159	CAT	2	6	287091	287096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054364
7307	NC_013159	CGAG	2	8	287126	287133	25 %	0 %	50 %	25 %	257054364
7308	NC_013159	CTG	2	6	287137	287142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7309	NC_013159	ACG	3	9	287159	287167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7310	NC_013159	TGC	3	9	287189	287197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7311	NC_013159	CGG	2	6	287228	287233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054364
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7313	NC_013159	GTGC	2	8	287284	287291	0 %	25 %	50 %	25 %	257054364
7314	NC_013159	CCG	2	6	287296	287301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054364
7315	NC_013159	CCG	2	6	287303	287308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054364
7316	NC_013159	GAT	2	6	287319	287324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054364
7317	NC_013159	GGGT	2	8	287331	287338	0 %	25 %	75 %	0 %	257054364
7318	NC_013159	CGT	3	9	287357	287365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7319	NC_013159	CG	3	6	287406	287411	0 %	0 %	50 %	50 %	257054364
7320	NC_013159	AGC	2	6	287489	287494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054364
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7322	NC_013159	GCC	3	9	287562	287570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054364
7323	NC_013159	CGT	2	6	287590	287595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054364
7324	NC_013159	TCC	2	6	287596	287601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054364
7325	NC_013159	TCTTCC	2	12	287602	287613	0 %	50 %	0 %	50 %	257054364
7326	NC_013159	TCG	2	6	287725	287730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054365
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7330	NC_013159	TCG	2	6	287808	287813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054365
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7332	NC_013159	AC	3	6	287866	287871	50 %	0 %	0 %	50 %	257054365
7333	NC_013159	GCC	2	6	287891	287896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054365
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7337	NC_013159	ACG	2	6	288126	288131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054365
7338	NC_013159	AGGCCG	2	12	288168	288179	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257054365
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7341	NC_013159	CGA	2	6	288244	288249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054365
7342	NC_013159	ACACCG	2	12	288258	288269	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257054365
7343	NC_013159	CAG	2	6	288365	288370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054365
7344	NC_013159	CGT	2	6	288469	288474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054365
7345	NC_013159	GGC	3	9	288478	288486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054365
7346	NC_013159	ACCGGT	2	12	288496	288507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054365
7347	NC_013159	GGC	2	6	288508	288513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054365
7348	NC_013159	ACA	2	6	288516	288521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054365
7349	NC_013159	GAT	2	6	288538	288543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054365
7350	NC_013159	GCC	3	9	288551	288559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054365
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7352	NC_013159	AGC	2	6	288712	288717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054366
7353	NC_013159	GAC	2	6	288735	288740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054366
7354	NC_013159	CCT	2	6	288775	288780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054366
7355	NC_013159	ACC	2	6	288806	288811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054366
7356	NC_013159	GCA	2	6	288890	288895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054366
7357	NC_013159	TCG	2	6	288901	288906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054366
7358	NC_013159	TGT	2	6	288979	288984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054366
7359	NC_013159	GTT	2	6	288989	288994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054366
7360	NC_013159	GTT	2	6	289019	289024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054366
7361	NC_013159	CG	3	6	289064	289069	0 %	0 %	50 %	50 %	257054366
7362	NC_013159	ATC	2	6	289095	289100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054366
7363	NC_013159	TGC	3	9	289102	289110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054366
7364	NC_013159	GCTGTT	2	12	289112	289123	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257054366
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7482	NC_013159	CGG	2	6	293023	293028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054372
7483	NC_013159	CCGGG	2	10	293110	293119	0 %	0 %	60 %	40 %	257054372
7484	NC_013159	GC	3	6	293127	293132	0 %	0 %	50 %	50 %	257054372
7485	NC_013159	CTGGG	2	10	293156	293165	0 %	20 %	60 %	20 %	257054372
7486	NC_013159	CGC	2	6	293206	293211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054372
7487	NC_013159	CGG	2	6	293295	293300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054372
7488	NC_013159	CGGT	2	8	293313	293320	0 %	25 %	50 %	25 %	257054372
7489	NC_013159	GCG	2	6	293321	293326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054372
7490	NC_013159	GGT	2	6	293366	293371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054372
7491	NC_013159	TGC	3	9	293373	293381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054372
7492	NC_013159	TCG	2	6	293382	293387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054372
7493	NC_013159	CGA	2	6	293496	293501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054373
7494	NC_013159	CGC	2	6	293504	293509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054373
7495	NC_013159	GTT	2	6	293649	293654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054373
7496	NC_013159	CAG	2	6	293677	293682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054373
7497	NC_013159	TGG	2	6	293710	293715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054373
7498	NC_013159	G	6	6	293714	293719	0 %	0 %	100 %	0 %	257054373
7499	NC_013159	GCT	2	6	293721	293726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054373
7500	NC_013159	TTC	2	6	293740	293745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054373

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