MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012926	AAAT	2	8	193478	193485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012926	TAA	2	6	193501	193506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012926	TATTG	2	10	193524	193533	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012926	ATT	2	6	193668	193673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754823
4005	NC_012926	T	7	7	193691	193697	0 %	100 %	0 %	0 %	253754823
4006	NC_012926	GTG	2	6	193785	193790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754823
4007	NC_012926	TGG	2	6	193954	193959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754823
4008	NC_012926	GAAT	2	8	194060	194067	50 %	25 %	25 %	0 %	253754823
4009	NC_012926	TAA	2	6	194099	194104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754823
4010	NC_012926	CCTG	2	8	194192	194199	0 %	25 %	25 %	50 %	253754823
4011	NC_012926	GAA	2	6	194222	194227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754823
4012	NC_012926	GATA	2	8	194300	194307	50 %	25 %	25 %	0 %	253754823
4013	NC_012926	GGAAA	2	10	194397	194406	60 %	0 %	40 %	0 %	253754823
4014	NC_012926	CTT	2	6	194421	194426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754823
4015	NC_012926	GAG	2	6	194433	194438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754823
4016	NC_012926	A	6	6	194501	194506	100 %	0 %	0 %	0 %	253754823
4017	NC_012926	TA	3	6	194578	194583	50 %	50 %	0 %	0 %	253754823
4018	NC_012926	GAA	2	6	194628	194633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754823
4019	NC_012926	A	7	7	194723	194729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012926	GCCA	2	8	194766	194773	25 %	0 %	25 %	50 %	253754824
4021	NC_012926	GAAAAA	2	12	194802	194813	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	253754824
4022	NC_012926	GCAG	2	8	194832	194839	25 %	0 %	50 %	25 %	253754824
4023	NC_012926	AGG	2	6	194887	194892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754824
4024	NC_012926	CTGGT	2	10	194893	194902	0 %	40 %	40 %	20 %	253754824
4025	NC_012926	CCAGA	2	10	194946	194955	40 %	0 %	20 %	40 %	253754824
4026	NC_012926	ATT	2	6	195008	195013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754824
4027	NC_012926	TCAG	2	8	195095	195102	25 %	25 %	25 %	25 %	253754824
4028	NC_012926	TTA	2	6	195164	195169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012926	ATC	2	6	195280	195285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_012926	TGA	2	6	195290	195295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012926	T	6	6	195296	195301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012926	TAAA	2	8	195358	195365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012926	GTT	2	6	195366	195371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012926	ACA	2	6	195372	195377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_012926	TAT	2	6	195408	195413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754825
4036	NC_012926	TCA	2	6	195468	195473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754825
4037	NC_012926	AAG	2	6	195515	195520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754825
4038	NC_012926	AGA	2	6	195552	195557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754825
4039	NC_012926	GTA	2	6	195574	195579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754825
4040	NC_012926	TAG	2	6	195680	195685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754825
4041	NC_012926	TGG	2	6	195687	195692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754825
4042	NC_012926	GCAG	2	8	195694	195701	25 %	0 %	50 %	25 %	253754825
4043	NC_012926	TTTA	2	8	195704	195711	25 %	75 %	0 %	0 %	253754825
4044	NC_012926	CAG	3	9	195845	195853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754825
4045	NC_012926	TGGC	2	8	195893	195900	0 %	25 %	50 %	25 %	253754825
4046	NC_012926	CAG	2	6	195994	195999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754825
4047	NC_012926	A	6	6	196022	196027	100 %	0 %	0 %	0 %	253754825
4048	NC_012926	T	6	6	196072	196077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012926	TAA	2	6	196092	196097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012926	TAAA	2	8	196100	196107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012926	CTT	2	6	196167	196172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754826
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4053	NC_012926	TGG	2	6	196346	196351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754826
4054	NC_012926	GTA	2	6	196428	196433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754826
4055	NC_012926	CAG	2	6	196488	196493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754826
4056	NC_012926	TGA	2	6	196543	196548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754826
4057	NC_012926	GAT	2	6	196560	196565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754826
4058	NC_012926	AAT	2	6	196674	196679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754826
4059	NC_012926	GAA	2	6	196713	196718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754826
4060	NC_012926	AAG	2	6	196747	196752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754826
4061	NC_012926	CTC	2	6	196756	196761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754826
4062	NC_012926	ATC	2	6	196770	196775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754826
4063	NC_012926	CTT	2	6	196820	196825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754826
4064	NC_012926	AAAG	2	8	196841	196848	75 %	0 %	25 %	0 %	253754826
4065	NC_012926	GTCAAG	2	12	196909	196920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253754826
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4067	NC_012926	ATT	2	6	196975	196980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754826
4068	NC_012926	AGCAG	2	10	196994	197003	40 %	0 %	40 %	20 %	253754826
4069	NC_012926	GTA	2	6	197042	197047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754826
4070	NC_012926	TAG	2	6	197106	197111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754827
4071	NC_012926	TGG	2	6	197168	197173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754827
4072	NC_012926	ATG	2	6	197175	197180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754827
4073	NC_012926	AAC	2	6	197224	197229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754827
4074	NC_012926	ATTC	2	8	197279	197286	25 %	50 %	0 %	25 %	253754827
4075	NC_012926	GGA	2	6	197305	197310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754827
4076	NC_012926	CAG	2	6	197331	197336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754827
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4078	NC_012926	CAG	2	6	197430	197435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754827
4079	NC_012926	GCT	2	6	197449	197454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754827
4080	NC_012926	GAA	2	6	197511	197516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754827
4081	NC_012926	ATT	2	6	197583	197588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754827
4082	NC_012926	TGAT	2	8	197661	197668	25 %	50 %	25 %	0 %	253754827
4083	NC_012926	TGA	2	6	197707	197712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754827
4084	NC_012926	TGA	2	6	197721	197726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754827
4085	NC_012926	AAAATC	2	12	197744	197755	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	253754828
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4087	NC_012926	TGA	2	6	197775	197780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754828
4088	NC_012926	TTGATT	2	12	197814	197825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	253754828
4089	NC_012926	T	6	6	197849	197854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_012926	AAACG	2	10	197955	197964	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4091	NC_012926	GTTG	2	8	197993	198000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012926	T	7	7	198004	198010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012926	TGC	2	6	198062	198067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754829
4094	NC_012926	AT	3	6	198085	198090	50 %	50 %	0 %	0 %	253754829
4095	NC_012926	ATT	2	6	198116	198121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754829
4096	NC_012926	ATTG	2	8	198142	198149	25 %	50 %	25 %	0 %	253754829
4097	NC_012926	CAA	2	6	198151	198156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754829
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4100	NC_012926	TAA	2	6	198205	198210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754829
4101	NC_012926	T	8	8	198214	198221	0 %	100 %	0 %	0 %	253754829
4102	NC_012926	A	6	6	198261	198266	100 %	0 %	0 %	0 %	253754829
4103	NC_012926	T	6	6	198283	198288	0 %	100 %	0 %	0 %	253754829
4104	NC_012926	AAT	2	6	198290	198295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754829
4105	NC_012926	ACA	2	6	198327	198332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754829
4106	NC_012926	TCT	2	6	198345	198350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754829
4107	NC_012926	ATT	2	6	198410	198415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754829
4108	NC_012926	AAG	2	6	198472	198477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754829
4109	NC_012926	ACT	2	6	198492	198497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754829
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4111	NC_012926	TTTTG	2	10	198526	198535	0 %	80 %	20 %	0 %	253754829
4112	NC_012926	A	6	6	198554	198559	100 %	0 %	0 %	0 %	253754829
4113	NC_012926	GAACA	2	10	198561	198570	60 %	0 %	20 %	20 %	253754829
4114	NC_012926	AATA	2	8	198587	198594	75 %	25 %	0 %	0 %	253754829
4115	NC_012926	AAAT	2	8	198711	198718	75 %	25 %	0 %	0 %	253754829
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4119	NC_012926	ATTT	2	8	198851	198858	25 %	75 %	0 %	0 %	253754829
4120	NC_012926	TAA	2	6	198991	198996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754829
4121	NC_012926	GTC	2	6	198997	199002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754829
4122	NC_012926	TAC	2	6	199003	199008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754829
4123	NC_012926	T	8	8	199055	199062	0 %	100 %	0 %	0 %	253754829
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4125	NC_012926	TAAA	2	8	199153	199160	75 %	25 %	0 %	0 %	253754829
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4494	NC_012926	T	6	6	216614	216619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_012926	AAT	2	6	216629	216634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754840
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